蛋白組學(xué)研究實用案例:東南大學(xué)醫(yī)學(xué)院院長劉必成教授領(lǐng)導(dǎo)的腎臟病研究所在Science advances期刊發(fā)表了題為“Extracellular vesicle–encapsulated IL-10 as novel nanotherapeutics against ischemic AKI"的研究成果,通過蛋白組學(xué)+多層組學(xué)研究方法,建立IL-10細胞囊泡高表達模型的構(gòu)建,提出并驗證了IL-10細胞外囊泡的靶向缺血性腎損傷的假說,探究了IL-10細胞外囊泡作為新型納米藥物的機理。中文標題:細胞外囊泡包裹的IL-10作為抗缺血性急性腎損傷的新型納米療法研究方向:新藥研發(fā)及其機制研究發(fā)表期刊:S...
label-free蛋白定量策略進行蛋白組學(xué)的***分析。肺腺*(lungadenocarcinoma,LUAD)是肺*的一種,屬于非小細胞*,早期一般沒有明顯的臨床癥狀,且易發(fā)生轉(zhuǎn)移。肺腺*(LUAD)的基因組研究提高了對該**生物學(xué)的理解,加速了靶向***的進程。中國科學(xué)家選取了103例未經(jīng)***的中國肺腺*患者的原位肺腺*組織及其相應(yīng)的*旁組織(NAT)(樣本策略),利用基于質(zhì)譜的label-free蛋白定量策略進行蛋白組學(xué)的***分析。從多維度揭示疾病重要分子特征對蛋白質(zhì)組、磷酸化蛋白質(zhì)組、轉(zhuǎn)錄組和全外顯子組測序數(shù)據(jù)的綜合分析揭示了**相關(guān)特征,如**相關(guān)蛋白變異、特有的蛋白質(zhì)組特征以...
本文為中國科學(xué)院海岸帶研究所趙建民課題組在ScienceoftheTotalEnvironment期刊發(fā)表了的文章,通過iTRAQ標記定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究弧菌***加劇了海洋酸化造成的牡蠣免疫抑制效應(yīng)。海洋酸化可能增加海洋軟體動物疾病加劇的風(fēng)險。從而將產(chǎn)生重大的經(jīng)濟和生態(tài)影響,因此本研究結(jié)果具有重要的指導(dǎo)意義。在本研究中,研究者將太平洋牡蠣暴露于酸化海水(約2000ppm)中28天,然后用金氏弧菌進行***處理,以此研究海洋酸化是否會影響牡蠣對病原菌***的免疫反應(yīng)。此外,利用基于iTRAQ的定量蛋白質(zhì)組學(xué)方法,對牡蠣鰓這一潛在的造血部位進行了研究,以分析對OA和金氏弧菌共同作用較敏感的生理過程...
定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究:2022年2月,上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所鮑大鵬研究員課題組在《FrontiersinMicrobiology》期刊發(fā)表的題為“OxidativeStressandAutophagyAreImportantProcessesinPostRipenessandBrownFilmFormationinMyceliumofLentinulaedodes”的研究成果,通過iTRAQ標記定量蛋白組學(xué)、GC-MS非靶向代謝組學(xué)等技術(shù)對香菇菌絲進行定量蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)氧化應(yīng)激和自噬是香菇菌絲后熟轉(zhuǎn)色重要過程,并對其在蛋白質(zhì)組和代謝組水平上的分子機制有了新的認識。涉及的歐易...
蛋白質(zhì)是生命活動的主要執(zhí)行者,而蛋白質(zhì)磷酸化修飾是生物體內(nèi)**重要的共價修飾方式之一,真核生物體內(nèi)有超過三分之一的蛋白可以發(fā)生磷酸化修飾。蛋白質(zhì)的磷酸化和去磷酸化這一可逆過程調(diào)節(jié)著包括細胞增殖、發(fā)育、分化、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、細胞凋亡、神經(jīng)活動、肌肉收縮及**發(fā)生等過程在內(nèi)的所有生命活動。單一的磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)只能解釋蛋白磷酸化水平發(fā)生的變化,而[黃金搭檔]——蛋白質(zhì)組與磷酸化蛋白質(zhì)組聯(lián)合分析,則在揭示疾病相關(guān)特性、篩選疾病生物標志物、尋找藥物靶點等方面發(fā)揮了更加重要的作用。修飾蛋白質(zhì)組試-蛋白質(zhì)組學(xué) 解決方案。江西外泌體蛋白組學(xué)檢測4D蛋白組學(xué):tims TOF Pro2依賴于雙捕集離子淌度(TIMS...
iTRAQ標記蛋白組學(xué)研究方法:2021年12月歐易/鹿明生物合作客戶甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)孫萬倉教授課題組在Scientific Reports期刊發(fā)表的題為 “iTRAQ-Based Quantitative Proteome Analysis Insights into Cold Stress of Winter Turnip Rapa (Brassica rapa L.) Grown in the Field ”的研究成果,通過iTRAQ標記蛋白組學(xué)+轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法,探究了莖尖分生組織的形態(tài)對冬油菜低溫耐受性中的作用。中文標題:iTRAQ標記蛋白質(zhì)組學(xué)分析揭示了低溫脅迫對田間生長冬油菜的影響研...
本研究通過生理和蛋白質(zhì)組學(xué)分析在冬油菜中鑒定了大量的冷脅迫響應(yīng)蛋白。探討了冬油菜耐凍性增強的機理和低溫脅迫對冬油菜形態(tài)和生理生化變化的影響。文章以耐凍型Longyou 7和冷敏感型Lenox為材料,通過iTRAQ標記蛋白組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析,揭示了谷胱甘肽轉(zhuǎn)移酶活性、碳水化合物結(jié)合和谷胱甘肽結(jié)合、代謝過程及IAA反應(yīng)與冷應(yīng)激反應(yīng)密切相關(guān),鑒定出了Longyou 7和Lenox之間的DAPs,這些DAPs參與氨基酸、碳水化合物、脂質(zhì)和能量代謝,對提高冬油菜的耐凍性發(fā)揮了重要作用。蛋白質(zhì)組學(xué),Label Free/iTRAQ/dia/MRM/PRM。遼寧蛋白組學(xué) 多少錢TMT蛋白質(zhì)組學(xué)探究案例:20...
2021年10月,中國科學(xué)院上海營養(yǎng)與健康研究所武愛波研究員課題組在《Ecotoxicology and Environmental Safety》(IF:6.291)發(fā)表了題為“Mycotoxin deoxynivalenol affects myoblast differentiation via downregulating cytoskeleton and ECM-integrin-FAK-RAC-PAK signaling pathway"的研究成果,通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法,探究了脫氧雪腐鐮刀菌烯醇(簡稱:DON,俗稱嘔吐***)對成肌細胞分化的影響,發(fā)現(xiàn)了DON處理使得細...
蛋白組學(xué)研究案例:2022年1月,歐易/鹿明生物合作客戶北京中醫(yī)藥大學(xué)教育部中醫(yī)養(yǎng)生學(xué)重點實驗室劉銅華教授課題組在Frontiers in Nutrition期刊發(fā)表了題為 “Mechanisms for Improving Hepatic Glucolipid Metabolism by Cinnamic Acid and Cinnamic Aldehyde: An Insight Provided by Multi-Omics ”的研究成果,通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法,發(fā)現(xiàn)了肉桂酸(AC)和肉桂醛(AL)在改善葡萄糖脂代謝中的特征,探究了其代謝作用機理。為預(yù)防和***代謝紊亂等疾病提...
TMT蛋白質(zhì)組學(xué)探究案例:2021年9月,安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)張照亮教授課題組在Journal of Agricultural and Food Chemistry期刊發(fā)表了題為“Nitrogen-Regulated Theanine and Flavonoid Biosynthesis in Tea Plant Roots: Protein-Level Regulation Revealed by Multiomics Analyses”的研究成果,通過TMT蛋白質(zhì)組學(xué)和泛素化蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法,發(fā)現(xiàn)了氮缺乏條件下茶樹根部響應(yīng)的差異表達蛋白和泛素化蛋白質(zhì),為茶氨酸和黃酮類生物合成的調(diào)控提供了新的見解...
隨著質(zhì)譜技術(shù)的飛速發(fā)展,特別是離子淌度的引入,增加了一個新的分離維度,將蛋白質(zhì)組研究推進到全新的“4D蛋白質(zhì)組”層面,打破了基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)研究的瓶頸,大幅度的提高掃描速度和檢測靈敏度,帶來蛋白質(zhì)組學(xué)在鑒定深度、檢測周期、定量準確性等性能的***提升,可以更好的解決大隊列、復(fù)雜體系以及微量樣本的檢測。相比于timsTOF Pro,timsTOF Pro 2 配備了***一代雙TIMS分析器,離子容量可提高三倍。經(jīng)過簡化的離子透鏡比較大限度地提高了離子傳輸效率和靈敏度,為4D-多組學(xué)建立了新的標準。CCS 值的加入讓組學(xué)結(jié)果更精細,也使timsTOF Pro 2成為轉(zhuǎn)化組學(xué)應(yīng)用不可或缺的工具...
單細胞蛋白組學(xué)研究方法:2020年9月,加州大學(xué)的MinnieM.Sarwal課題組在FrontiersinMedicine發(fā)表的題為“Near-Single-CellProteomicsProfilingoftheProximalTubularandGlomerulusoftheNormalHumanKidney”的研究成果,通過單細胞蛋白組學(xué)研究方法,分析正常人近端腎小管和腎小球區(qū)域的腎臟細胞,研究為解開急性和慢性腎臟疾病病因和腎臟亞細胞功能擾動提供依據(jù)。中文標題:正常人腎臟近端腎小管和腎小球的單細胞蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究對象:人體腎臟組織發(fā)表期刊:FrontiersinMedicine影響因...
為了更好地了解DON對C2C12細胞分化的影響,作者進行了轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的整合分析。共鑒定了149個共同的***差異基因(co-DEG),其中91%被共下調(diào)(圖3A)。15%的co-DEG屬于真核細胞骨架,其中大部分屬于肌動蛋白絲,少數(shù)是中間絲和微管的成分。對co-DEG進行GO分析,生物學(xué)過程富集了“骨骼肌肌球蛋白粗絲組裝”和“快肌纖維收縮的正向調(diào)節(jié)”條目。細胞組分中富集的**個條目是“纖維蛋白原復(fù)合物”、“細胞外空間”、“細胞外基質(zhì)”、“細胞外區(qū)域”和“蛋白質(zhì)細胞外基質(zhì)”,這些都是細胞外成分(圖3B)。結(jié)果表明,DON主要影響肌肉成分的組成和功能以及多種細胞外成分的表達。通路富集分析...
蛋白質(zhì)是生命活動的主要執(zhí)行者,而蛋白質(zhì)磷酸化修飾是生物體內(nèi)**重要的共價修飾方式之一,真核生物體內(nèi)有超過三分之一的蛋白可以發(fā)生磷酸化修飾。蛋白質(zhì)的磷酸化和去磷酸化這一可逆過程調(diào)節(jié)著包括細胞增殖、發(fā)育、分化、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、細胞凋亡、神經(jīng)活動、肌肉收縮及**發(fā)生等過程在內(nèi)的所有生命活動。單一的磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)只能解釋蛋白磷酸化水平發(fā)生的變化,而[黃金搭檔]——蛋白質(zhì)組與磷酸化蛋白質(zhì)組聯(lián)合分析,則在揭示疾病相關(guān)特性、篩選疾病生物標志物、尋找藥物靶點等方面發(fā)揮了更加重要的作用。蛋白組+代謝組+脂質(zhì)組-數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)。廣東靶向蛋白組學(xué)iTRAQ標記定量蛋白組學(xué)技術(shù)研究方法:2021年7月,海南大學(xué)園藝園林學(xué)院...
本研究采用串聯(lián)質(zhì)量標簽(TMT)標記的蛋白質(zhì)組學(xué)和平行反應(yīng)監(jiān)測(PRM)技術(shù),對蓮子脫水過程中的生理調(diào)控網(wǎng)絡(luò)進行了深入研究表明,碳水化合物代謝(包括糖酵解/糖異成、半乳糖代謝、淀粉和蔗糖代謝、磷酸戊糖途徑和細胞壁組織)、ER中的蛋白質(zhì)加工、DNA修復(fù)和抗氧化事件對蓮種胎脫水有積極的反應(yīng)。在蓮種胚脫水過程中,非酶促抗氧化劑和戊糖磷酸和維生素E作為主要的抗氧化劑,在脫水過程中維持荷花胚胎的REDOX平衡。這些結(jié)果為揭示荷花胚胎脫水保護機制的生理學(xué)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)提供了酶途徑在抗氧化保護中起著主要作用。應(yīng)激生理學(xué)檢測表明,H2O2是誘發(fā)氧化應(yīng)激損傷的主要活性氧(ROS)成分,谷胱甘肽新的見解。歐易鹿明生物蛋...
2021年10月,中國科學(xué)院上海營養(yǎng)與健康研究所武愛波研究員課題組在《Ecotoxicology and Environmental Safety》(IF:6.291)發(fā)表了題為“Mycotoxin deoxynivalenol affects myoblast differentiation via downregulating cytoskeleton and ECM-integrin-FAK-RAC-PAK signaling pathway"的研究成果,通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法,探究了脫氧雪腐鐮刀菌烯醇(簡稱:DON,俗稱嘔吐***)對成肌細胞分化的影響,發(fā)現(xiàn)了DON處理使得細...
作者進行了綜合分析,將蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)中的***生物標志物合并到通路分析中,并確定了半乳糖代謝、戊糖和葡萄糖醛酸鹽相互轉(zhuǎn)化、檸檬酸鹽循環(huán)和**酸代謝這幾種途徑。然后結(jié)合蛋白質(zhì)和代謝標志物來預(yù)測DKD狀態(tài)。五種機器學(xué)習(xí)模型表明,組合模型提高了DKD預(yù)測的準確性和穩(wěn)定性。圖中展示了RF的結(jié)果??偟膩碚f,組合多組學(xué)標志物模型是一種強有力的提高DKD診斷的方法。1.蛋白組學(xué)結(jié)果表明,α2-巨球蛋白、組織蛋白酶D和CD324可作為檢測DKD進展的潛在生物標志物。2.代謝組學(xué)結(jié)果表明,半乳糖代謝和甘油脂代謝是DKD的主要代謝途徑,此外甘油-3-半乳糖苷可作為預(yù)測DKD的**標志物。3.蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)...
iTRAQ標記定量蛋白組學(xué)技術(shù)研究方法:2021年7月,海南大學(xué)園藝園林學(xué)院吳友根教授課題組等在《Horticulture Research》期刊發(fā)表了題為“Integrative iTRAQ-based proteomic and transcriptomic analysis reveals the accumulation patterns of key metabolites associated with oilquality during seed ripening of Camellia oleifera”的研究成果,通過RNA測序(RNA-seq)和iTRAQ標記定量蛋白組學(xué)技...
蛋白質(zhì)組學(xué)、磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)研究案例:2021年12月30日復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院樊嘉院士、中國科學(xué)院上海藥物研究所周虎研究員、中國科學(xué)院分子細胞科學(xué)***創(chuàng)新中心高大明研究員、復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院**教授課題組合作在Cancer Cell上發(fā)表題為“Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究論文,通過基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)、微生物組學(xué)研究方法對262例肝內(nèi)膽管*(iCCA)患者的配對**和*旁...
本研究采用串聯(lián)質(zhì)量標簽(TMT)標記的蛋白質(zhì)組學(xué)和平行反應(yīng)監(jiān)測(PRM)技術(shù),對蓮子脫水過程中的生理調(diào)控網(wǎng)絡(luò)進行了深入研究表明,碳水化合物代謝(包括糖酵解/糖異成、半乳糖代謝、淀粉和蔗糖代謝、磷酸戊糖途徑和細胞壁組織)、ER中的蛋白質(zhì)加工、DNA修復(fù)和抗氧化事件對蓮種胎脫水有積極的反應(yīng)。在蓮種胚脫水過程中,非酶促抗氧化劑和戊糖磷酸和維生素E作為主要的抗氧化劑,在脫水過程中維持荷花胚胎的REDOX平衡。這些結(jié)果為揭示荷花胚胎脫水保護機制的生理學(xué)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)提供了酶途徑在抗氧化保護中起著主要作用。應(yīng)激生理學(xué)檢測表明,H2O2是誘發(fā)氧化應(yīng)激損傷的主要活性氧(ROS)成分,谷胱甘肽新的見解。蛋白組+代謝組...
蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法研究案例:2021年10月,中國科學(xué)院上海營養(yǎng)與健康研究所武愛波研究員課題組在Ecotoxicology and Environmental Safety發(fā)表了題為“Mycotoxin deoxynivalenol affects myoblast differentiation via downregulating cytoskeleton and ECM-integrin-FAK-RAC-PAK signaling pathway"的研究成果,通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法,探究了脫氧雪腐鐮刀菌烯醇(DON)對成肌細胞分化的影響,發(fā)現(xiàn)了DON處理使得細胞骨架蛋白和細胞外...
蛋白組學(xué)技術(shù)可以提供細胞狀態(tài)和調(diào)控的功能信息,本研究建立了單細胞蛋白組學(xué)方法,實現(xiàn)了高靈敏度的蛋白組學(xué)檢測。該技術(shù)有助于揭示疾病的發(fā)病機制,探討預(yù)后和風(fēng)險相關(guān)的不同腎臟疾病亞型中的蛋白組學(xué)異質(zhì)性和獨特的蛋白標志物,為藥物靶點***提供希望。大規(guī)模單細胞分析對于捕獲復(fù)雜細胞系統(tǒng)中的生物異質(zhì)性至關(guān)重要,但*基于RNA技術(shù)的單細胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)并不能很好地**蛋白質(zhì)水平上的變化。而單細胞蛋白組學(xué)技術(shù)能夠從蛋白質(zhì)水平上破譯細胞機制并且獲得更多的信息。一文了解DIA、TMT/iTRAQ、傳統(tǒng)Label free蛋白組學(xué)區(qū)別在哪。天津蛋白組學(xué)質(zhì)譜檢測原理label-free蛋白定量策略進行蛋白組學(xué)的***分...
本研究通過生理和蛋白質(zhì)組學(xué)分析在冬油菜中鑒定了大量的冷脅迫響應(yīng)蛋白。探討了冬油菜耐凍性增強的機理和低溫脅迫對冬油菜形態(tài)和生理生化變化的影響。文章以耐凍型Longyou 7和冷敏感型Lenox為材料,通過iTRAQ標記蛋白組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析,揭示了谷胱甘肽轉(zhuǎn)移酶活性、碳水化合物結(jié)合和谷胱甘肽結(jié)合、代謝過程及IAA反應(yīng)與冷應(yīng)激反應(yīng)密切相關(guān),鑒定出了Longyou 7和Lenox之間的DAPs,這些DAPs參與氨基酸、碳水化合物、脂質(zhì)和能量代謝,對提高冬油菜的耐凍性發(fā)揮了重要作用。蛋白組學(xué)方案為組學(xué)研究涉及的樣本獲取,前處理,數(shù)據(jù)采集到分析的各個環(huán)節(jié)提供自動化。遼寧蛋白組學(xué)質(zhì)譜分析價格蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)分...
蛋白質(zhì)組定量到了10,529種蛋白質(zhì),磷酸化蛋白質(zhì)組定量到了來自9,832個磷酸化蛋白的62,879個磷酸化位點?;蚪M確定了包括TP53、KRAS、FGFR2、IDH1/2、BAP1、ARID1A和PBRM1在內(nèi)的16個***改變的**驅(qū)動基因(圖1A)。與西方iCCA人群隊列相比,本文隊列顯示出更高的KRAS突變頻率和更低的IDH1、ARID1A和TERT突變頻率(圖1B)。在FU-iCCA隊列中觀察到黃曲霉***和馬兜鈴酸特征(圖1C)。通過比較具有或不具有黃曲霉***特征的所有**的多組學(xué)數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)具有黃曲霉***特征的**顯示出DNA修復(fù)和細胞周期通路的上調(diào)以及細胞凋亡、***炎癥和...
中文標題:肉桂酸和肉桂醛改善肝葡萄糖脂代謝的機制:多組學(xué)提供的見解研究對象:小鼠發(fā)表期刊:FrontiersinNutrition影響因子:6.576發(fā)表時間:2022年1月11日合作單位:北京中醫(yī)藥大學(xué)健康培養(yǎng)教育部重點實驗室,北京中醫(yī)藥大學(xué)健康栽培北京市重點實驗室,北京中醫(yī)藥大學(xué)科學(xué)技術(shù)系運用組學(xué)關(guān)鍵技術(shù):轉(zhuǎn)錄組學(xué)、DIA蛋白組學(xué)、PRM靶向蛋白驗證(皆由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持)。目前,改善飲食被認為是**安全有效的***和預(yù)防代謝性疾病的方法,其中肉桂(主要是肉桂屬植物八角肉桂和桂皮)及其成分被證明具有多種***作用,包括抗糖尿病、減輕體重、低脂血癥和增強胰島素敏感性。因此,使用膳食...
作者通過iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)鑒定敲低NMT1后發(fā)生變化的蛋白質(zhì)。結(jié)果鑒定到三種上調(diào)蛋白(LXN,RPL29andFAU)和六種下調(diào)蛋白(NMT1,MTPN,AHSG,ALB,GON7andTF)(圖2A)。作者將這些蛋白質(zhì)分別命名為N-豆蔻?;抡{(diào)蛋白(NDP)和上調(diào)蛋白(NUP)。有趣的是,敲低NMT1會減少NDP和NUP的N-豆蔻?;^表達NMT1會誘導(dǎo)NDP和NUP的N-豆蔻?;▓D2B)。在小鼠模型中,敲除NMT1會導(dǎo)致NDP和NUP的去N-豆蔻?;?,這可以通過在肝臟中表達外源性NMT1來部分逆轉(zhuǎn)(圖2C)。這些發(fā)現(xiàn)表明,盡管NMT1對NDP和NUP的表達起著相反的作用,但NM...
label-free蛋白定量策略進行蛋白組學(xué)的***分析。肺腺*(lungadenocarcinoma,LUAD)是肺*的一種,屬于非小細胞*,早期一般沒有明顯的臨床癥狀,且易發(fā)生轉(zhuǎn)移。肺腺*(LUAD)的基因組研究提高了對該**生物學(xué)的理解,加速了靶向***的進程。中國科學(xué)家選取了103例未經(jīng)***的中國肺腺*患者的原位肺腺*組織及其相應(yīng)的*旁組織(NAT)(樣本策略),利用基于質(zhì)譜的label-free蛋白定量策略進行蛋白組學(xué)的***分析。從多維度揭示疾病重要分子特征對蛋白質(zhì)組、磷酸化蛋白質(zhì)組、轉(zhuǎn)錄組和全外顯子組測序數(shù)據(jù)的綜合分析揭示了**相關(guān)特征,如**相關(guān)蛋白變異、特有的蛋白質(zhì)組特征以...
本文為了探究其潛在的分子機制,作者運用RNA測序(RNA-seq)和iTRAQ標記定量蛋白組學(xué),對不同成熟度水平的油脂種子進行了研究。不僅揭示了關(guān)鍵候選基因和蛋白質(zhì)的時間特異性表達,而且為該樹種的遺傳改良提供了科學(xué)依據(jù)。中文標題:基于iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)聯(lián)合分析揭示油茶種子成熟過程中油質(zhì)相關(guān)的關(guān)鍵代謝產(chǎn)物的積累研究對象:油茶種子發(fā)表期刊:HorticultureResearch影響因子:6.793發(fā)表時間:2021.07.01發(fā)表單位:海南大學(xué)園藝園林學(xué)院運用生物技術(shù):RNA測序(RNA-seq)和iTRAQ標記定量蛋白組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白組學(xué)文章中iTRAQ標記定量蛋白組學(xué)由歐易/...
本研究采用串聯(lián)質(zhì)量標簽(TMT)標記的蛋白質(zhì)組學(xué)和平行反應(yīng)監(jiān)測(PRM)技術(shù),對蓮子脫水過程中的生理調(diào)控網(wǎng)絡(luò)進行了深入研究表明,碳水化合物代謝(包括糖酵解/糖異成、半乳糖代謝、淀粉和蔗糖代謝、磷酸戊糖途徑和細胞壁組織)、ER中的蛋白質(zhì)加工、DNA修復(fù)和抗氧化事件對蓮種胎脫水有積極的反應(yīng)。在蓮種胚脫水過程中,非酶促抗氧化劑和戊糖磷酸和維生素E作為主要的抗氧化劑,在脫水過程中維持荷花胚胎的REDOX平衡。這些結(jié)果為揭示荷花胚胎脫水保護機制的生理學(xué)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)提供了酶途徑在抗氧化保護中起著主要作用。應(yīng)激生理學(xué)檢測表明,H2O2是誘發(fā)氧化應(yīng)激損傷的主要活性氧(ROS)成分,谷胱甘肽新的見解。歐易生物鹿明生...
2022年2月,亞特蘭大埃默里大學(xué)醫(yī)學(xué)院的Erik C. B. Johnson課題組在Nature neuroscience發(fā)表了題為 “Large-scale deep multi-layer analysis of Alzheimer’s disease brain reveals strong proteomic disease-related changes not observed at the RNA level”的研究成果,通過基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、TMT標記定量蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)的研究方法,揭示了新的與AD相關(guān)的蛋白共表達模塊,部分模塊在RNA的網(wǎng)絡(luò)中不存在。這為開發(fā)疾病***...