TMTpro-16plex等標(biāo)記試劑已經(jīng)發(fā)布一年，廣受科研工作者喜愛(ài)。但是，對(duì)于6組3重復(fù)、3組6重復(fù)的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)，16plex卻難以滿足。TMTpro? 18-plex標(biāo)記蛋白組會(huì)是更好的選擇方式。其中基于質(zhì)譜儀平臺(tái)的蛋白組學(xué)近年來(lái)備受青睞，穩(wěn)定同位素標(biāo)記策略也被廣泛應(yīng)用于多重定量蛋白質(zhì)組學(xué)中。鹿明生物推出Thermo Scientific? TMTpro? 18-plex標(biāo)記蛋白組，18個(gè)樣本以內(nèi)，可實(shí)現(xiàn)一次標(biāo)記和分級(jí)，避免了多批次標(biāo)記引入的批次效應(yīng)，能***提升樣本的數(shù)據(jù)質(zhì)量。同時(shí)對(duì)更多蛋白質(zhì)鑒定和定量，提供了樣本的多通路處理水平。這個(gè)技術(shù)可謂是2021年的又一創(chuàng)新技術(shù)。單細(xì)胞組學(xué) 單細(xì)胞...

通過(guò)蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜鑒定、PRM靶向鑒定、iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)等研究方法，發(fā)現(xiàn)了N-豆蔻?；诟闻K**發(fā)生中發(fā)揮重要作用，揭示了NMT1的N-豆蔻?；种瓶?*發(fā)生的NDP，并通過(guò)干擾泛素化來(lái)刺激促**發(fā)生的NUP機(jī)制。為靶向N-豆蔻?；蚇MT1可能有助于***肝*提供了理論依據(jù)。中文標(biāo)題：NMT1依賴于POTEE發(fā)生N-豆蔻?；⑼ㄟ^(guò)差異調(diào)節(jié)靶標(biāo)的泛素化來(lái)刺激肝臟**的發(fā)生研究對(duì)象：細(xì)胞、小鼠、人**組織發(fā)表期刊：FrontiersinOncology影響因子：6.244發(fā)表時(shí)間：2021年5月合作單位：上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬上海兒童醫(yī)學(xué)中心運(yùn)用生物技術(shù)：iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)、P...

4D蛋白質(zhì)組學(xué)：2022年3月，牛津大學(xué)Julian C. Knight教授課題組在cell發(fā)表的題為“A blood atlas of COVID-19 defines hallmarks of disease severity and specificity”的研究成果，通過(guò)4D蛋白質(zhì)組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組技術(shù)、流式技術(shù)、單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)等研究方法，為不同COVID-19嚴(yán)重程度的患者提供了一個(gè)綜合的多組圖譜，并將其與流感和敗血癥患者與健康志愿者進(jìn)行了綜合比較，將支持未來(lái)的COVID-19藥物開(kāi)發(fā)、臨床試驗(yàn)設(shè)計(jì)和個(gè)性化藥物方法。中文標(biāo)題：COVID-19的血液圖譜定義了疾病嚴(yán)重程度和特異性的特征研究對(duì)...

通過(guò)蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜鑒定、PRM靶向鑒定、iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)等研究方法，發(fā)現(xiàn)了N-豆蔻?；诟闻K**發(fā)生中發(fā)揮重要作用，揭示了NMT1的N-豆蔻?；种瓶?*發(fā)生的NDP，并通過(guò)干擾泛素化來(lái)刺激促**發(fā)生的NUP機(jī)制。為靶向N-豆蔻?；蚇MT1可能有助于***肝*提供了理論依據(jù)。中文標(biāo)題：NMT1依賴于POTEE發(fā)生N-豆蔻?；⑼ㄟ^(guò)差異調(diào)節(jié)靶標(biāo)的泛素化來(lái)刺激肝臟**的發(fā)生研究對(duì)象：細(xì)胞、小鼠、人**組織發(fā)表期刊：FrontiersinOncology影響因子：6.244發(fā)表時(shí)間：2021年5月合作單位：上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬上海兒童醫(yī)學(xué)中心運(yùn)用生物技術(shù)：iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)、P...

為了驗(yàn)證TMT蛋白組學(xué)數(shù)據(jù)，作者選擇了18個(gè)與蓮種胚脫水保護(hù)功能密切相關(guān)的候選DEPs進(jìn)行PRM蛋白靶向驗(yàn)證。PRM鑒定了18個(gè)候選DEPs。這些蛋白質(zhì)的表達(dá)模式在PRM和TMT的定量結(jié)果之間顯示出類似的趨勢(shì)。然而，PRM檢測(cè)到的蛋白豐度的倍數(shù)變化值要大于TMT數(shù)據(jù)。這一結(jié)果在很大程度上支持了TMT數(shù)據(jù)的可靠性?；赥MT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)的生物信息學(xué)分析，對(duì)脅迫生理指標(biāo)進(jìn)行了測(cè)定，以驗(yàn)證蓮種胚脫水的保護(hù)機(jī)制。在快速脫水階段，REC和MDA含量的變化與RWC相反，它們的水平迅速增加（圖6A，B）。ABA含量在快速脫水和脫水成熟階段前略有增加（圖6C）。上蛋白組學(xué)研究必看的經(jīng)典綜述。天津定量蛋白...

為了驗(yàn)證TMT蛋白組學(xué)數(shù)據(jù)，作者選擇了18個(gè)與蓮種胚脫水保護(hù)功能密切相關(guān)的候選DEPs進(jìn)行PRM蛋白靶向驗(yàn)證。PRM鑒定了18個(gè)候選DEPs。這些蛋白質(zhì)的表達(dá)模式在PRM和TMT的定量結(jié)果之間顯示出類似的趨勢(shì)。然而，PRM檢測(cè)到的蛋白豐度的倍數(shù)變化值要大于TMT數(shù)據(jù)。這一結(jié)果在很大程度上支持了TMT數(shù)據(jù)的可靠性?；赥MT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)的生物信息學(xué)分析，對(duì)脅迫生理指標(biāo)進(jìn)行了測(cè)定，以驗(yàn)證蓮種胚脫水的保護(hù)機(jī)制。在快速脫水階段，REC和MDA含量的變化與RWC相反，它們的水平迅速增加（圖6A，B）。ABA含量在快速脫水和脫水成熟階段前略有增加（圖6C）。上蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析蛋白質(zhì)組學(xué)三大基本技術(shù)...

隨著質(zhì)譜技術(shù)的飛速發(fā)展，特別是離子淌度的引入，增加了一個(gè)新的分離維度，將蛋白質(zhì)組研究推進(jìn)到全新的“4D蛋白質(zhì)組”層面，打破了基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)研究的瓶頸，大幅度的提高掃描速度和檢測(cè)靈敏度，帶來(lái)蛋白質(zhì)組學(xué)在鑒定深度、檢測(cè)周期、定量準(zhǔn)確性等性能的***提升，可以更好的解決大隊(duì)列、復(fù)雜體系以及微量樣本的檢測(cè)。相比于timsTOF Pro，timsTOF Pro 2 配備了***一代雙TIMS分析器，離子容量可提高三倍。經(jīng)過(guò)簡(jiǎn)化的離子透鏡比較大限度地提高了離子傳輸效率和靈敏度，為4D-多組學(xué)建立了新的標(biāo)準(zhǔn)。CCS 值的加入讓組學(xué)結(jié)果更精細(xì)，也使timsTOF Pro 2成為轉(zhuǎn)化組學(xué)應(yīng)用不可或缺的工具...

4D蛋白質(zhì)組學(xué)：2022年3月，牛津大學(xué)Julian C. Knight教授課題組在cell發(fā)表的題為“A blood atlas of COVID-19 defines hallmarks of disease severity and specificity”的研究成果，通過(guò)4D蛋白質(zhì)組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組技術(shù)、流式技術(shù)、單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)等研究方法，為不同COVID-19嚴(yán)重程度的患者提供了一個(gè)綜合的多組圖譜，并將其與流感和敗血癥患者與健康志愿者進(jìn)行了綜合比較，將支持未來(lái)的COVID-19藥物開(kāi)發(fā)、臨床試驗(yàn)設(shè)計(jì)和個(gè)性化藥物方法。中文標(biāo)題：COVID-19的血液圖譜定義了疾病嚴(yán)重程度和特異性的特征研究對(duì)...

蛋白組學(xué)技術(shù)可以提供細(xì)胞狀態(tài)和調(diào)控的功能信息，本研究建立了單細(xì)胞蛋白組學(xué)方法，實(shí)現(xiàn)了高靈敏度的蛋白組學(xué)檢測(cè)。該技術(shù)有助于揭示疾病的發(fā)病機(jī)制，探討預(yù)后和風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)的不同腎臟疾病亞型中的蛋白組學(xué)異質(zhì)性和獨(dú)特的蛋白標(biāo)志物，為藥物靶點(diǎn)***提供希望。大規(guī)模單細(xì)胞分析對(duì)于捕獲復(fù)雜細(xì)胞系統(tǒng)中的生物異質(zhì)性至關(guān)重要，但*基于RNA技術(shù)的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)并不能很好地**蛋白質(zhì)水平上的變化。而單細(xì)胞蛋白組學(xué)技術(shù)能夠從蛋白質(zhì)水平上破譯細(xì)胞機(jī)制并且獲得更多的信息。蛋白組學(xué)研究必看的經(jīng)典綜述。遼寧蛋白組學(xué)火山圖4D蛋白質(zhì)組學(xué)分析發(fā)現(xiàn)，不同的病因和疾病的嚴(yán)重程度中蛋白表達(dá)存在差異。嚴(yán)重的疾病同急性期的蛋白的增加，補(bǔ)體系統(tǒng)...

采用TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)對(duì)三個(gè)脫水特殊階段（21、27和40DAP）的新鮮蓮種胎進(jìn)行了蛋白質(zhì)組學(xué)分析，共鑒定了5,477個(gè)蛋白質(zhì)。對(duì)測(cè)試樣本進(jìn)行了PCA分析，結(jié)果顯示，不同組間樣品具有很好的區(qū)分，每組的三個(gè)重復(fù)樣本被聚集在一起。PCA的前兩個(gè)成分占總方差的70％以上（圖2A）。三個(gè)試驗(yàn)組之間共有815個(gè)差異表達(dá)蛋白。其中，198個(gè)（32%）和198個(gè)（26%）蛋白質(zhì)豐度增加，而420個(gè)（68%）和558個(gè)（74%）蛋白質(zhì)豐度在27DAP和40DAP組分別下降（圖2B）。只有30個(gè)蛋白質(zhì)的豐度在27DAP和40DAP組之間具有***變化（圖2C）。TMT/iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué) 差異...

本研究采用串聯(lián)質(zhì)量標(biāo)簽（TMT）標(biāo)記的蛋白質(zhì)組學(xué)和平行反應(yīng)監(jiān)測(cè)（PRM）技術(shù)，對(duì)蓮子脫水過(guò)程中的生理調(diào)控網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行了深入研究表明，碳水化合物代謝（包括糖酵解/糖異成、半乳糖代謝、淀粉和蔗糖代謝、磷酸戊糖途徑和細(xì)胞壁組織）、ER中的蛋白質(zhì)加工、DNA修復(fù)和抗氧化事件對(duì)蓮種胎脫水有積極的反應(yīng)。在蓮種胚脫水過(guò)程中，非酶促抗氧化劑和戊糖磷酸和維生素E作為主要的抗氧化劑，在脫水過(guò)程中維持荷花胚胎的REDOX平衡。這些結(jié)果為揭示荷花胚胎脫水保護(hù)機(jī)制的生理學(xué)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)提供了酶途徑在抗氧化保護(hù)中起著主要作用。應(yīng)激生理學(xué)檢測(cè)表明，H2O2是誘發(fā)氧化應(yīng)激損傷的主要活性氧（ROS）成分，谷胱甘肽新的見(jiàn)解。研究機(jī)構(gòu),提供...

并通過(guò)蛋白質(zhì)組學(xué)和時(shí)間序列分析在血管生成中發(fā)揮著關(guān)鍵作用（圖3E）。時(shí)間序列分析表明，外出刺激后ICAM1表達(dá)增加（圖3F）。此外，當(dāng)ICAM1在HBMECs中時(shí)，血管形成容量***降低（圖3I/j）。這些結(jié)果表明M-Exos通過(guò)增加HBMECs中的ICAM1的表達(dá)來(lái)調(diào)節(jié)血管生成。蛋白質(zhì)組學(xué)分析發(fā)現(xiàn)的差異表達(dá)蛋白與多種神經(jīng)退行性疾病相關(guān)，包括帕金森病、阿爾茨海默病和亨廷頓病(圖6B)。本研究運(yùn)用蛋白質(zhì)組學(xué)，蛋白質(zhì)印跡，免疫熒光、免疫組化等分析了源自MSCs的外泌體可以使人腦微血管內(nèi)皮細(xì)胞(HBMECs)保持活躍狀態(tài)，有利于血管生成。應(yīng)用PD小鼠模型發(fā)現(xiàn)MSCs的外泌體可以促進(jìn)PD的恢復(fù)。結(jié)果可...

本文為中國(guó)科學(xué)院海岸帶研究所趙建民課題組在ScienceoftheTotalEnvironment期刊發(fā)表了的文章，通過(guò)iTRAQ標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究弧菌***加劇了海洋酸化造成的牡蠣免疫抑制效應(yīng)。海洋酸化可能增加海洋軟體動(dòng)物疾病加劇的風(fēng)險(xiǎn)。從而將產(chǎn)生重大的經(jīng)濟(jì)和生態(tài)影響，因此本研究結(jié)果具有重要的指導(dǎo)意義。在本研究中，研究者將太平洋牡蠣暴露于酸化海水（約2000ppm）中28天，然后用金氏弧菌進(jìn)行***處理，以此研究海洋酸化是否會(huì)影響牡蠣對(duì)病原菌***的免疫反應(yīng)。此外，利用基于iTRAQ的定量蛋白質(zhì)組學(xué)方法，對(duì)牡蠣鰓這一潛在的造血部位進(jìn)行了研究，以分析對(duì)OA和金氏弧菌共同作用較敏感的生理過(guò)程...

iTRAQ標(biāo)記蛋白組學(xué)研究方法：2021年12月歐易/鹿明生物合作客戶甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)孫萬(wàn)倉(cāng)教授課題組在Scientific Reports期刊發(fā)表的題為 “iTRAQ-Based Quantitative Proteome Analysis Insights into Cold Stress of Winter Turnip Rapa (Brassica rapa L.) Grown in the Field ”的研究成果，通過(guò)iTRAQ標(biāo)記蛋白組學(xué)+轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法，探究了莖尖分生組織的形態(tài)對(duì)冬油菜低溫耐受性中的作用。中文標(biāo)題：iTRAQ標(biāo)記蛋白質(zhì)組學(xué)分析揭示了低溫脅迫對(duì)田間生長(zhǎng)冬油菜的影響研...

蛋白質(zhì)磷酸化修飾是指在磷酸化激酶的作用下將ATP的磷酸基轉(zhuǎn)移到蛋白質(zhì)特定氨基酸上的過(guò)程，是生物體內(nèi)**為常見(jiàn)、**為重要的翻譯后修飾之一。生物體內(nèi)蛋白質(zhì)的磷酸化修飾是一個(gè)瞬時(shí)且可逆的過(guò)程，通過(guò)磷酸化修飾可以改變蛋白質(zhì)空間構(gòu)象，從而影響蛋白質(zhì)的定位、活性及其與其他蛋白的相互作用上海鹿明生物科技有限公司多年來(lái)，一直專注于生命科學(xué)和生命技術(shù)領(lǐng)域，是國(guó)內(nèi)早期開(kāi)展以蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)為基礎(chǔ)的多層組學(xué)整合實(shí)驗(yàn)與分析的團(tuán)隊(duì)。影響因子：13.511發(fā)表時(shí)間：2022-01-06發(fā)表單位：***醫(yī)學(xué)研究院生物工程研究所運(yùn)用生物技術(shù)：磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)（歐易鹿明提供）、LC-MS靶向代謝組學(xué)蛋白質(zhì)組與代謝組聯(lián)合分析...

本研究采用串聯(lián)質(zhì)量標(biāo)簽（TMT）標(biāo)記的蛋白質(zhì)組學(xué)和平行反應(yīng)監(jiān)測(cè)（PRM）技術(shù)，對(duì)蓮子脫水過(guò)程中的生理調(diào)控網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行了深入研究表明，碳水化合物代謝（包括糖酵解/糖異成、半乳糖代謝、淀粉和蔗糖代謝、磷酸戊糖途徑和細(xì)胞壁組織）、ER中的蛋白質(zhì)加工、DNA修復(fù)和抗氧化事件對(duì)蓮種胎脫水有積極的反應(yīng)。在蓮種胚脫水過(guò)程中，非酶促抗氧化劑和戊糖磷酸和維生素E作為主要的抗氧化劑，在脫水過(guò)程中維持荷花胚胎的REDOX平衡。這些結(jié)果為揭示荷花胚胎脫水保護(hù)機(jī)制的生理學(xué)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)提供了酶途徑在抗氧化保護(hù)中起著主要作用。應(yīng)激生理學(xué)檢測(cè)表明，H2O2是誘發(fā)氧化應(yīng)激損傷的主要活性氧（ROS）成分，谷胱甘肽新的見(jiàn)解。走近蛋白組學(xué)之...

TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究案例：2021年12月威爾康奈爾醫(yī)學(xué)中心和紀(jì)念斯隆凱特琳**中心的Linda T. Vahdat 和 Vivek Mittal教授課題組在Nature Communications期刊發(fā)表的題為 “Copper depletion modulates mitochondrial oxidative phosphorylation to impair triple negative breast cancer metastasis”的研究成果，通過(guò)蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)研究方法，發(fā)現(xiàn)了高度轉(zhuǎn)移性 SOX2/OCT4+ 細(xì)胞的離散亞群表現(xiàn)出細(xì)胞內(nèi)銅水平升高特征，探究了TM...

綜上所述，本研究應(yīng)用RNA-seq轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)合iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)，探討油茶種子不同成熟期儲(chǔ)量積累的動(dòng)態(tài)變化。此外，作者還探討了黃酮類化合物和脂肪酸的生物合成和代謝可能的調(diào)控機(jī)制。許多功能轉(zhuǎn)錄本(16530)和蛋白質(zhì)物種(1228)的模式發(fā)生了***變化，其中317個(gè)DAPs被轉(zhuǎn)錄組結(jié)果覆蓋。結(jié)合結(jié)構(gòu)基因(蛋白)或轉(zhuǎn)錄因子的表達(dá)譜及相應(yīng)化合物的含量，對(duì)重要代謝產(chǎn)物的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行了探討。結(jié)果表明，黃酮類化合物的合成能力在種子成熟過(guò)程中逐漸減弱，而脂肪酸的合成能力則先升高后下降。蛋白組學(xué)翻譯后修飾篩選,檢測(cè),鑒定,定性,定量。吉林蛋白組學(xué)研究雜志轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)分析作者通過(guò)轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白...

通過(guò)蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜鑒定、PRM靶向鑒定、iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)等研究方法，發(fā)現(xiàn)了N-豆蔻酰化在肝臟**發(fā)生中發(fā)揮重要作用，揭示了NMT1的N-豆蔻酰化抑制抗**發(fā)生的NDP，并通過(guò)干擾泛素化來(lái)刺激促**發(fā)生的NUP機(jī)制。為靶向N-豆蔻?；蚇MT1可能有助于***肝*提供了理論依據(jù)。中文標(biāo)題：NMT1依賴于POTEE發(fā)生N-豆蔻酰化并通過(guò)差異調(diào)節(jié)靶標(biāo)的泛素化來(lái)刺激肝臟**的發(fā)生研究對(duì)象：細(xì)胞、小鼠、人**組織發(fā)表期刊：FrontiersinOncology影響因子：6.244發(fā)表時(shí)間：2021年5月合作單位：上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬上海兒童醫(yī)學(xué)中心運(yùn)用生物技術(shù)：iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)、P...

作者進(jìn)行了綜合分析，將蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)中的***生物標(biāo)志物合并到通路分析中，并確定了半乳糖代謝、戊糖和葡萄糖醛酸鹽相互轉(zhuǎn)化、檸檬酸鹽循環(huán)和**酸代謝這幾種途徑。然后結(jié)合蛋白質(zhì)和代謝標(biāo)志物來(lái)預(yù)測(cè)DKD狀態(tài)。五種機(jī)器學(xué)習(xí)模型表明，組合模型提高了DKD預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確性和穩(wěn)定性。圖中展示了RF的結(jié)果。總的來(lái)說(shuō)，組合多組學(xué)標(biāo)志物模型是一種強(qiáng)有力的提高DKD診斷的方法。1.蛋白組學(xué)結(jié)果表明，α2-巨球蛋白、組織蛋白酶D和CD324可作為檢測(cè)DKD進(jìn)展的潛在生物標(biāo)志物。2.代謝組學(xué)結(jié)果表明，半乳糖代謝和甘油脂代謝是DKD的主要代謝途徑，此外甘油-3-半乳糖苷可作為預(yù)測(cè)DKD的**標(biāo)志物。3.蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)...

通過(guò)蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜鑒定、PRM靶向鑒定、iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)等研究方法，發(fā)現(xiàn)了N-豆蔻?；诟闻K**發(fā)生中發(fā)揮重要作用，揭示了NMT1的N-豆蔻?；种瓶?*發(fā)生的NDP，并通過(guò)干擾泛素化來(lái)刺激促**發(fā)生的NUP機(jī)制。為靶向N-豆蔻酰化和NMT1可能有助于***肝*提供了理論依據(jù)。中文標(biāo)題：NMT1依賴于POTEE發(fā)生N-豆蔻?；⑼ㄟ^(guò)差異調(diào)節(jié)靶標(biāo)的泛素化來(lái)刺激肝臟**的發(fā)生研究對(duì)象：細(xì)胞、小鼠、人**組織發(fā)表期刊：FrontiersinOncology影響因子：6.244發(fā)表時(shí)間：2021年5月合作單位：上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬上海兒童醫(yī)學(xué)中心運(yùn)用生物技術(shù)：iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)、P...

4D蛋白質(zhì)組學(xué)分析發(fā)現(xiàn)，不同的病因和疾病的嚴(yán)重程度中蛋白表達(dá)存在差異。嚴(yán)重的疾病同急性期的蛋白的增加，補(bǔ)體系統(tǒng)蛋白及功能相關(guān)的蛋白相關(guān)；通過(guò)COVID-19和健康組對(duì)比，發(fā)現(xiàn)了49%的差異分析物；和膿毒癥相比，G-CSF，IL-8等在嚴(yán)重的COVID-19患者中含量更低；蛋白和臨床相關(guān)性分析則發(fā)現(xiàn)臨床特征和某些蛋白呈強(qiáng)相關(guān)性。本研究通過(guò)4D蛋白組學(xué)技術(shù)結(jié)合其他組學(xué)技術(shù)及免疫技術(shù)，確定了COVID-19免疫特征和宿主反應(yīng)等相關(guān)因素，并為進(jìn)一步COVID-19的***打下了良好的基礎(chǔ)。蛋白組學(xué)常見(jiàn)研究模式 | 蛋白質(zhì)組專題_鹿明生物。福建蛋白組學(xué)質(zhì)譜分析隨著質(zhì)譜技術(shù)的飛速發(fā)展，特別是離子淌度的引入...

蛋白質(zhì)組學(xué)(由鹿明生物提供技術(shù)支持)；2021年8月，中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所趙春華和韓欽課題組在Aging and disease期刊發(fā)表了題為“MSC-derived Exosomes can Enhance the Angiogenesis of Human Brain MECs and show Therapeutic Potential in a Mouse Model of Parkinson's Disease”的研究成果，通過(guò)蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法，發(fā)現(xiàn)了間充質(zhì)干細(xì)胞衍生的外泌體可以通過(guò)增加ICAM1的表達(dá)來(lái)促人腦MECs血管生成，并減輕MPP+對(duì)細(xì)胞的損傷，***間充質(zhì)干細(xì)胞...

蛋白組學(xué)技術(shù)是以蛋白質(zhì)組為研究對(duì)象，研究細(xì)胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學(xué)。DIA作為一種新的質(zhì)譜數(shù)據(jù)采集方式穩(wěn)定性高，覆蓋度廣的優(yōu)點(diǎn)。DIA蛋白組學(xué)技術(shù)已經(jīng)越來(lái)越多的疾病研究中發(fā)揮重大作用。本研究通過(guò)DIA蛋白組學(xué)技術(shù)分析了8個(gè)SAPHO病人和8個(gè)健康人的蛋白表達(dá)譜。蛋白表達(dá)的相關(guān)性圖顯示組內(nèi)相關(guān)性良好，差異蛋白的PCA圖顯示兩組得到明顯的區(qū)分。蛋白質(zhì)組學(xué)通過(guò)研究生物樣本中蛋白質(zhì)組成和變化，從而推動(dòng)疾病的病理機(jī)制研究，為臨床診斷和預(yù)后提供潛在生物標(biāo)志物。單細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)，極微量樣本檢測(cè)。山東蛋白組學(xué)的ipa分析本文為了探究其潛在的分子機(jī)制，作者運(yùn)用RNA測(cè)序（RNA-seq）和i...

作者使用通過(guò)單細(xì)胞蛋白組學(xué)產(chǎn)生的數(shù)據(jù)來(lái)觀察在腎小球細(xì)胞或近端腎小管中***豐富的蛋白質(zhì)細(xì)胞。208個(gè)Glom富集區(qū)蛋白富含囊泡中間運(yùn)輸和細(xì)胞成分組織調(diào)節(jié)作為其**重要的生物學(xué)過(guò)程，細(xì)胞骨架蛋白結(jié)合和肌動(dòng)蛋白結(jié)合是**重要的分子功能，肌動(dòng)蛋白細(xì)胞骨架是**豐富的細(xì)胞成分。富含247個(gè)PT的蛋白質(zhì)主要集中在小分子代謝過(guò)程和藥物代謝過(guò)程中。在**重要的分子功能中，這些蛋白質(zhì)的氧化還原酶活性和催化活性豐富。*在GLOM切片中發(fā)現(xiàn)的67種蛋白質(zhì)中，有41種已被報(bào)導(dǎo)存在于腎臟中，在這41種蛋白質(zhì)中，18種(43.9%)與單細(xì)胞蛋白組學(xué)結(jié)果一致，23種(56.1%)在GLOM中與小管相比沒(méi)有增加。一站式服務(wù)...

作者通過(guò)iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)鑒定敲低NMT1后發(fā)生變化的蛋白質(zhì)。結(jié)果鑒定到三種上調(diào)蛋白(LXN,RPL29andFAU)和六種下調(diào)蛋白（NMT1,MTPN,AHSG,ALB,GON7andTF）（圖2A）。作者將這些蛋白質(zhì)分別命名為N-豆蔻?；抡{(diào)蛋白(NDP)和上調(diào)蛋白(NUP)。有趣的是，敲低NMT1會(huì)減少NDP和NUP的N-豆蔻?；?，而過(guò)表達(dá)NMT1會(huì)誘導(dǎo)NDP和NUP的N-豆蔻酰化（圖2B）。在小鼠模型中，敲除NMT1會(huì)導(dǎo)致NDP和NUP的去N-豆蔻酰化，這可以通過(guò)在肝臟中表達(dá)外源性NMT1來(lái)部分逆轉(zhuǎn)（圖2C）。這些發(fā)現(xiàn)表明，盡管NMT1對(duì)NDP和NUP的表達(dá)起著相反的作用，但NM...

采用RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析和DIA蛋白質(zhì)組學(xué)分析，研究了AC和AL對(duì)db/db小鼠的影響。轉(zhuǎn)錄組分析共鑒定出16812種不同的蛋白質(zhì)編碼轉(zhuǎn)錄本。其中，2837個(gè)（約16.9%）在正常組和對(duì)照組之間有***差異，表明db/db小鼠在轉(zhuǎn)錄水平上與野生型小鼠***不同。與對(duì)照組相比，共有3749個(gè)基因因攝入AC而發(fā)生***改變（2201個(gè)下調(diào)，1548個(gè)上調(diào)），560個(gè)基因（430個(gè)下調(diào)，130個(gè)上調(diào)）因攝入AL而發(fā)生***改變（圖3B）。DIA蛋白質(zhì)組學(xué)分析鑒定出2729種蛋白質(zhì)。正常組和對(duì)照組之間共發(fā)現(xiàn)1059個(gè)（約占總鑒定蛋白質(zhì)的38.8%）DEPs，AC處理有230個(gè)蛋白質(zhì)發(fā)生***變化...

label-free蛋白定量策略進(jìn)行蛋白組學(xué)的***分析。肺腺*(lungadenocarcinoma，LUAD)是肺*的一種，屬于非小細(xì)胞*，早期一般沒(méi)有明顯的臨床癥狀，且易發(fā)生轉(zhuǎn)移。肺腺*(LUAD)的基因組研究提高了對(duì)該**生物學(xué)的理解，加速了靶向***的進(jìn)程。中國(guó)科學(xué)家選取了103例未經(jīng)***的中國(guó)肺腺*患者的原位肺腺*組織及其相應(yīng)的*旁組織（NAT）（樣本策略），利用基于質(zhì)譜的label-free蛋白定量策略進(jìn)行蛋白組學(xué)的***分析。從多維度揭示疾病重要分子特征對(duì)蛋白質(zhì)組、磷酸化蛋白質(zhì)組、轉(zhuǎn)錄組和全外顯子組測(cè)序數(shù)據(jù)的綜合分析揭示了**相關(guān)特征，如**相關(guān)蛋白變異、特有的蛋白質(zhì)組特征以...

通過(guò)蛋白質(zhì)組學(xué)分析檢測(cè)了經(jīng)M-Exos處理的HBMECs的改變。外泌體***了HBMECs，在0、24和48小時(shí)各種基因的表達(dá)增加(圖2A)。此外，熱圖分析揭示了不同表達(dá)的功能基因，包括與炎癥、細(xì)胞增殖、免疫調(diào)節(jié)和血管生成相關(guān)的因素(圖2B-E)。時(shí)序分析表明，HBMECs中標(biāo)記基因的上調(diào)與炎癥因子IL3RA有關(guān)，增殖相關(guān)蛋白CD40和免疫調(diào)節(jié)因子TNFRSF10C(圖2F-H)。作者主要研究外泌體是否促進(jìn)人腦微血管內(nèi)皮細(xì)胞的血管生成能力，因此初步驗(yàn)證了M-Exos***后血管生成相關(guān)基因的表達(dá)。蛋白質(zhì)印跡結(jié)果顯示血管生成相關(guān)基因FlK1和ANGPT1的表達(dá)明顯增強(qiáng)(圖2I)。綜上所述，結(jié)果證...

通過(guò)蛋白質(zhì)組學(xué)+轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法，發(fā)現(xiàn)大黃素引發(fā)外泌體通過(guò)抑制代謝通路來(lái)減少肺泡巨噬細(xì)胞的活化和改善肺部炎癥的特征，探究了外泌體在參與炎癥相關(guān)***損傷中的重要作用，為大黃素可以通過(guò)減少胰腺外泌體介導(dǎo)的肺泡巨噬細(xì)胞活化來(lái)減輕嚴(yán)重急性胰腺炎相關(guān)的急性肺損傷提供依據(jù)。中文標(biāo)題：大黃素通過(guò)抑制胰腺外泌體介導(dǎo)的肺泡巨噬細(xì)胞活化減輕嚴(yán)重急性胰腺炎相關(guān)的急性肺損傷研究對(duì)象：大鼠血漿外泌體發(fā)表期刊：ActaPharmaceuticaSinicaB影響因子：11.413發(fā)表時(shí)間：2021年10月合作單位：四川大學(xué)華西醫(yī)院運(yùn)用生物技術(shù)：TMT標(biāo)記定量蛋白組學(xué)（由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持）、轉(zhuǎn)錄組學(xué)單細(xì)胞組學(xué) ...