本研究采用串聯(lián)質(zhì)量標簽（TMT）標記的蛋白質(zhì)組學(xué)和平行反應(yīng)監(jiān)測（PRM）技術(shù)，對蓮子脫水過程中的生理調(diào)控網(wǎng)絡(luò)進行了深入研究表明，碳水化合物代謝（包括糖酵解/糖異成、半乳糖代謝、淀粉和蔗糖代謝、磷酸戊糖途徑和細胞壁組織）、ER中的蛋白質(zhì)加工、DNA修復(fù)和抗氧化事件對蓮種胎脫水有積極的反應(yīng)。在蓮種胚脫水過程中，非酶促抗氧化劑和戊糖磷酸和維生素E作為主要的抗氧化劑，在脫水過程中維持荷花胚胎的REDOX平衡。這些結(jié)果為揭示荷花胚胎脫水保護機制的生理學(xué)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)提供了酶途徑在抗氧化保護中起著主要作用。應(yīng)激生理學(xué)檢測表明，H2O2是誘發(fā)氧化應(yīng)激損傷的主要活性氧（ROS）成分，谷胱甘肽新的見解。走近蛋白組學(xué)之蛋白組學(xué)常見問題答疑解惑。遼寧蛋白組學(xué)植物
4D蛋白質(zhì)組學(xué)分析發(fā)現(xiàn)，不同的病因和疾病的嚴重程度中蛋白表達存在差異。嚴重的疾病同急性期的蛋白的增加，補體系統(tǒng)蛋白及功能相關(guān)的蛋白相關(guān)；通過COVID-19和健康組對比，發(fā)現(xiàn)了49%的差異分析物；和膿毒癥相比，G-CSF，IL-8等在嚴重的COVID-19患者中含量更低；蛋白和臨床相關(guān)性分析則發(fā)現(xiàn)臨床特征和某些蛋白呈強相關(guān)性。本研究通過4D蛋白組學(xué)技術(shù)結(jié)合其他組學(xué)技術(shù)及免疫技術(shù)，確定了COVID-19免疫特征和宿主反應(yīng)等相關(guān)因素，并為進一步COVID-19的***打下了良好的基礎(chǔ)。福建蛋白組學(xué)測序和轉(zhuǎn)錄組測序修飾蛋白質(zhì)組試-蛋白質(zhì)組學(xué) 解決方案。
蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法研究案例：2021年10月，中國科學(xué)院上海營養(yǎng)與健康研究所武愛波研究員課題組在Ecotoxicology and Environmental Safety發(fā)表了題為“Mycotoxin deoxynivalenol affects myoblast differentiation via downregulating cytoskeleton and ECM-integrin-FAK-RAC-PAK signaling pathway"的研究成果，通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法，探究了脫氧雪腐鐮刀菌烯醇（DON）對成肌細胞分化的影響，發(fā)現(xiàn)了DON處理使得細胞骨架蛋白和細胞外基質(zhì)蛋白表達下調(diào)，并抑制ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信號通路的機理，為食品和飼料污染的防治提供了理論依據(jù)。
蛋白質(zhì)組學(xué)、磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)研究案例：2021年12月30日復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院樊嘉院士、中國科學(xué)院上海藥物研究所周虎研究員、中國科學(xué)院分子細胞科學(xué)***創(chuàng)新中心高大明研究員、復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院**教授課題組合作在Cancer Cell上發(fā)表題為“Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究論文，通過基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)、微生物組學(xué)研究方法對262例肝內(nèi)膽管*（iCCA）患者的配對**和*旁組織進行了分析，通過繪制肝內(nèi)膽管*的多維分子圖譜為進一步鑒定iCCA的分子發(fā)病機制、分子分型、預(yù)后等提供了寶貴的資源。蛋白組學(xué)問題解答知乎都做不到哦。
蛋白組學(xué)技術(shù)可以提供細胞狀態(tài)和調(diào)控的功能信息，本研究建立了單細胞蛋白組學(xué)方法，實現(xiàn)了高靈敏度的蛋白組學(xué)檢測。該技術(shù)有助于揭示疾病的發(fā)病機制，探討預(yù)后和風(fēng)險相關(guān)的不同腎臟疾病亞型中的蛋白組學(xué)異質(zhì)性和獨特的蛋白標志物，為藥物靶點***提供希望。大規(guī)模單細胞分析對于捕獲復(fù)雜細胞系統(tǒng)中的生物異質(zhì)性至關(guān)重要，但*基于RNA技術(shù)的單細胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)并不能很好地**蛋白質(zhì)水平上的變化。而單細胞蛋白組學(xué)技術(shù)能夠從蛋白質(zhì)水平上破譯細胞機制并且獲得更多的信息。蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析蛋白質(zhì)組學(xué)三大基本技術(shù)。安徽蛋白組學(xué)kegg分析
蛋白質(zhì)組學(xué),修飾蛋白質(zhì)組,蛋白·修飾·代謝。遼寧蛋白組學(xué)植物
為了確定TMT AD蛋白網(wǎng)絡(luò)模塊是否也存在于其他的隊列和大腦區(qū)域，使用 TMT標記定量蛋白質(zhì)組學(xué)多個隊列的所有組織，為每個隊列生成蛋白質(zhì)共表達網(wǎng)絡(luò)，并評估了 AD 網(wǎng)絡(luò)模塊是否保留在每個隊列和大腦區(qū)域中。發(fā)現(xiàn)幾乎所有的 TMT AD 網(wǎng)絡(luò)模塊都保留在隊列和大腦區(qū)域（圖2b）。阿爾茨海默病(AD)是一種神經(jīng)系統(tǒng)退行性疾病，其病因至今尚不清楚。本文從蛋白組學(xué)方向出發(fā)，建立蛋白共表達網(wǎng)絡(luò)，綜合轉(zhuǎn)錄組學(xué)結(jié)果，解析疾病相關(guān)的蛋白組學(xué)模塊或能為AD提供可靠的生物標志物，并為治療帶來希望。遼寧蛋白組學(xué)植物
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