廣東蛋白組學(xué)差異分析

TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究案例：2021年12月威爾康奈爾醫(yī)學(xué)中心和紀(jì)念斯隆凱特琳**中心的Linda T. Vahdat 和 Vivek Mittal教授課題組在Nature Communications期刊發(fā)表的題為 “Copper depletion modulates mitochondrial oxidative phosphorylation to impair triple negative breast cancer metastasis”的研究成果，通過蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)研究方法，發(fā)現(xiàn)了高度轉(zhuǎn)移性 SOX2/OCT4+ 細(xì)胞的離散亞群表現(xiàn)出細(xì)胞內(nèi)銅水平升高特征，探究了TM 介導(dǎo)的復(fù)合物 IV 失活確定為 SOX2/OCT4+ 細(xì)胞群中的主要代謝缺陷，AMPK/mTORC1 能量傳感器為重要的下游途徑。描繪了銅-代謝-轉(zhuǎn)移軸，為高風(fēng)險(xiǎn)三陰性乳腺*患者的下一代治療方法提供了理論依據(jù)。中文標(biāo)題：銅耗竭調(diào)節(jié)線粒體氧化磷酸化以損害三陰性乳腺*轉(zhuǎn)移研究對(duì)象：高風(fēng)險(xiǎn)三陰性乳腺*(TNBC)發(fā)表期刊：NatureCommunications影響因子：14.919發(fā)表時(shí)間：2021年12月合作單位：紀(jì)念斯隆凱特琳**中心，Sandra和EdwardMeyer**中心運(yùn)用關(guān)鍵生物技術(shù)：TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)和靶向代謝組學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)簡(jiǎn)介及應(yīng)用場(chǎng)景。廣東蛋白組學(xué)差異分析

TMT標(biāo)記定量蛋白組學(xué)研究案例：2021年11月，南京中醫(yī)藥大學(xué)附屬醫(yī)院江蘇省中醫(yī)院?jiǎn)挝唬ㄒ蛔鲃⑹芳蜒芯繂T）及其課題組在MolecularMetabolism期刊發(fā)表的題為“Serumintegrativeomicsrevealsthelandscapeofhumandiabetickidneydisease”的研究成果，通過TMT標(biāo)記定量蛋白組學(xué)和GC-MS非靶代謝組學(xué)研究方法，發(fā)現(xiàn)了糖尿病腎?。―KD）特征，篩選了蛋白和代謝容組合生物標(biāo)志物。為優(yōu)化糖尿病腎病（DKD）管理提供了豐富且開放訪問的數(shù)據(jù)資源。中文標(biāo)題：血清綜合組學(xué)揭示人類糖尿病腎病情況研究對(duì)象：人血清發(fā)表期刊：MolecularMetabolism影響因子：7.422發(fā)表時(shí)間：2021年11月1日合作單位：江蘇省中醫(yī)院運(yùn)用生物技術(shù)：TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)、GC-MS非靶向代謝組學(xué)(其中部分工作由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持)、ELISA廣東蛋白組學(xué) 服務(wù)蛋白組學(xué)專業(yè)客服在線為您答疑 。

作者運(yùn)用iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)對(duì)種子發(fā)育過程中蛋白質(zhì)表達(dá)的定量比較，同時(shí)進(jìn)行GO和KEGG通路富集分析。結(jié)果表明所有鑒定的蛋白被分為29類，主要涉及翻譯和碳水化合物代謝。并且作者繪制了p值小于0.01的前20條KEGG通路的氣泡圖。在三對(duì)比較中，普遍富集的途徑包括脂肪酸降解、苯丙素生物合成和脂肪酸代謝。其中，參與α-亞麻酸代謝的DAPs在S3 vs. S1組和S4 vs. S1組中都非常活躍。為了評(píng)估轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組之間的一致性，以及了解轉(zhuǎn)錄后的mRNA在蛋白質(zhì)水平上是如何表現(xiàn)的，作者進(jìn)行了RNA-seq和iTRAQ分析的聯(lián)合分析。證明DEGs和DAPs參與類黃酮的生物合成和脂肪酸代謝。

作者通過iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)鑒定敲低NMT1后發(fā)生變化的蛋白質(zhì)。結(jié)果鑒定到三種上調(diào)蛋白(LXN,RPL29andFAU)和六種下調(diào)蛋白（NMT1,MTPN,AHSG,ALB,GON7andTF）（圖2A）。作者將這些蛋白質(zhì)分別命名為N-豆蔻?；抡{(diào)蛋白(NDP)和上調(diào)蛋白(NUP)。有趣的是，敲低NMT1會(huì)減少NDP和NUP的N-豆蔻?；?，而過表達(dá)NMT1會(huì)誘導(dǎo)NDP和NUP的N-豆蔻?；▓D2B）。在小鼠模型中，敲除NMT1會(huì)導(dǎo)致NDP和NUP的去N-豆蔻?；?，這可以通過在肝臟中表達(dá)外源性NMT1來部分逆轉(zhuǎn)（圖2C）。這些發(fā)現(xiàn)表明，盡管NMT1對(duì)NDP和NUP的表達(dá)起著相反的作用，但NMT1同時(shí)刺激NDP和NUP的N-豆蔻?；abel free蛋白組學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)原理。

4D蛋白質(zhì)組學(xué)分析發(fā)現(xiàn)，不同的病因和疾病的嚴(yán)重程度中蛋白表達(dá)存在差異。嚴(yán)重的疾病同急性期的蛋白的增加，補(bǔ)體系統(tǒng)蛋白及功能相關(guān)的蛋白相關(guān)；通過COVID-19和健康組對(duì)比，發(fā)現(xiàn)了49%的差異分析物；和膿毒癥相比，G-CSF，IL-8等在嚴(yán)重的COVID-19患者中含量更低；蛋白和臨床相關(guān)性分析則發(fā)現(xiàn)臨床特征和某些蛋白呈強(qiáng)相關(guān)性。本研究通過4D蛋白組學(xué)技術(shù)結(jié)合其他組學(xué)技術(shù)及免疫技術(shù)，確定了COVID-19免疫特征和宿主反應(yīng)等相關(guān)因素，并為進(jìn)一步COVID-19的***打下了良好的基礎(chǔ)。單細(xì)胞蛋白組學(xué)之質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)。福建差異蛋白組學(xué)與基因相結(jié)合

定量蛋白質(zhì)組學(xué) 蛋白質(zhì)進(jìn)行質(zhì)譜檢測(cè)未知蛋白進(jìn)行全檢測(cè)。廣東蛋白組學(xué)差異分析

iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)技術(shù)研究方法：2021年7月，海南大學(xué)園藝園林學(xué)院吳友根教授課題組等在《Horticulture Research》期刊發(fā)表了題為“Integrative iTRAQ-based proteomic and transcriptomic analysis reveals the accumulation patterns of key metabolites associated with oilquality during seed ripening of Camellia oleifera”的研究成果，通過RNA測(cè)序(RNA-seq)和iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)技術(shù)研究方法，發(fā)現(xiàn)了油茶種子成熟過程中與油質(zhì)相關(guān)關(guān)鍵代謝產(chǎn)物的積累模式特征，探究了不同成熟度油茶轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組譜機(jī)理，描繪了海南油茶種子成熟過程的動(dòng)態(tài)變化圖譜。為該樹種的遺傳改良提供了理論依據(jù)。廣東蛋白組學(xué)差異分析

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