蛋白質(zhì)是生命功能的直接體現(xiàn)者,近幾年來(lái),蛋白質(zhì)組研究越來(lái)越多的體現(xiàn)在多種疾病機(jī)理的闡明,為科研問(wèn)題攻克提供理論根據(jù)和解決途徑。通過(guò)蛋白質(zhì)組比較分析,找到特異性的蛋白,成為新藥物設(shè)計(jì)的分子靶點(diǎn),為疾病的早期診斷提供分子標(biāo)志。然而生物體內(nèi)的蛋白組學(xué)是一個(gè)非常復(fù)雜的體系。近幾年來(lái),由于質(zhì)譜技術(shù)的發(fā)展,讓我們對(duì)生物體內(nèi)蛋白組的認(rèn)識(shí)更加***和準(zhǔn)確。尤其基于TimsTOF Pro系列質(zhì)譜儀,被稱(chēng)為4D蛋白組學(xué)技術(shù)為蛋白組學(xué)提供全新的覆蓋深度和通量,為精細(xì)醫(yī)療提供**技術(shù)支持力量。歐易生物、鹿明生物助力您的4D蛋白組學(xué)研究。上海 -蛋白質(zhì)組學(xué)-提供高效檢測(cè)分析服務(wù)。內(nèi)蒙古磷酸化蛋白組學(xué)聚類(lèi)熱圖運(yùn)用生物技術(shù)...
2021年10月,中國(guó)科學(xué)院上海營(yíng)養(yǎng)與健康研究所武愛(ài)波研究員課題組在《Ecotoxicology and Environmental Safety》(IF:6.291)發(fā)表了題為“Mycotoxin deoxynivalenol affects myoblast differentiation via downregulating cytoskeleton and ECM-integrin-FAK-RAC-PAK signaling pathway"的研究成果,通過(guò)轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法,探究了脫氧雪腐鐮刀菌烯醇(簡(jiǎn)稱(chēng):DON,俗稱(chēng)嘔吐***)對(duì)成肌細(xì)胞分化的影響,發(fā)現(xiàn)了DON處理使得細(xì)...
蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)研究案例:作為一種常見(jiàn)的******,脫氧雪腐鐮刀菌烯醇(DON)在田間或加工和儲(chǔ)存過(guò)程中會(huì)污染谷物和飼料。DON在動(dòng)物中會(huì)引起厭食和生長(zhǎng)遲緩在內(nèi)的一系列不良反應(yīng)。本文作者使用轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)對(duì)鼠C2C12細(xì)胞進(jìn)行了研究,分析DON對(duì)成肌細(xì)胞分化的影響。研究結(jié)果表明,DON通過(guò)下調(diào)細(xì)胞骨架和ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信號(hào)通路來(lái)影響成肌細(xì)胞的分化。本文研究體現(xiàn)了組學(xué)技術(shù)在機(jī)制研究中的重要作用。中文標(biāo)題:霉菌***脫氧雪腐鐮刀菌烯醇通過(guò)下調(diào)細(xì)胞骨架和ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信號(hào)通路影響成肌細(xì)胞分化研究對(duì)象:脫氧雪腐鐮刀菌烯醇、C2...
中文標(biāo)題:肉桂酸和肉桂醛改善肝葡萄糖脂代謝的機(jī)制:多組學(xué)提供的見(jiàn)解研究對(duì)象:小鼠發(fā)表期刊:FrontiersinNutrition影響因子:6.576發(fā)表時(shí)間:2022年1月11日合作單位:北京中醫(yī)藥大學(xué)健康培養(yǎng)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京中醫(yī)藥大學(xué)健康栽培北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京中醫(yī)藥大學(xué)科學(xué)技術(shù)系運(yùn)用組學(xué)關(guān)鍵技術(shù):轉(zhuǎn)錄組學(xué)、DIA蛋白組學(xué)、PRM靶向蛋白驗(yàn)證(皆由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持)。目前,改善飲食被認(rèn)為是**安全有效的***和預(yù)防代謝性疾病的方法,其中肉桂(主要是肉桂屬植物八角肉桂和桂皮)及其成分被證明具有多種***作用,包括抗糖尿病、減輕體重、低脂血癥和增強(qiáng)胰島素敏感性。因此,使用膳食...
蛋白質(zhì)組學(xué)(由鹿明生物提供技術(shù)支持);2021年8月,中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所趙春華和韓欽課題組在Aging and disease期刊發(fā)表了題為“MSC-derived Exosomes can Enhance the Angiogenesis of Human Brain MECs and show Therapeutic Potential in a Mouse Model of Parkinson's Disease”的研究成果,通過(guò)蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法,發(fā)現(xiàn)了間充質(zhì)干細(xì)胞衍生的外泌體可以通過(guò)增加ICAM1的表達(dá)來(lái)促人腦MECs血管生成,并減輕MPP+對(duì)細(xì)胞的損傷,***間充質(zhì)干細(xì)胞...
采用RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析和DIA蛋白質(zhì)組學(xué)分析,研究了AC和AL對(duì)db/db小鼠的影響。轉(zhuǎn)錄組分析共鑒定出16812種不同的蛋白質(zhì)編碼轉(zhuǎn)錄本。其中,2837個(gè)(約16.9%)在正常組和對(duì)照組之間有***差異,表明db/db小鼠在轉(zhuǎn)錄水平上與野生型小鼠***不同。與對(duì)照組相比,共有3749個(gè)基因因攝入AC而發(fā)生***改變(2201個(gè)下調(diào),1548個(gè)上調(diào)),560個(gè)基因(430個(gè)下調(diào),130個(gè)上調(diào))因攝入AL而發(fā)生***改變(圖3B)。DIA蛋白質(zhì)組學(xué)分析鑒定出2729種蛋白質(zhì)。正常組和對(duì)照組之間共發(fā)現(xiàn)1059個(gè)(約占總鑒定蛋白質(zhì)的38.8%)DEPs,AC處理有230個(gè)蛋白質(zhì)發(fā)生***變化...
3篇經(jīng)典的蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)在水產(chǎn)動(dòng)物中的研究。水產(chǎn)動(dòng)物的研究不僅是保障我國(guó)海水養(yǎng)殖業(yè)的健康可持續(xù)發(fā)展,同時(shí)可為良種創(chuàng)制、海洋環(huán)境研究、生態(tài)研究等提供重要理論基礎(chǔ)和技術(shù)支撐~因此在水產(chǎn)生物研究方面蛋白組學(xué)、代謝組學(xué)在其中起到什么作用呢?期望這3篇經(jīng)典文章能給您思路~中文標(biāo)題:CO2誘導(dǎo)的海洋酸化損害了太平洋牡蠣對(duì)金氏弧菌的免疫功能:細(xì)胞和蛋白質(zhì)組學(xué)的綜合研究研究對(duì)象:牡蠣發(fā)表期刊:ScienceoftheTotalEnvironment影響因子:6.551合作單位:中國(guó)科學(xué)院海岸帶研究所運(yùn)用歐易/鹿明生物技術(shù):iTRAQ標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)(由鹿明生物提供技術(shù)支持)修飾蛋白質(zhì)組試劑及服務(wù),蛋白質(zhì)...
TMTpro-16plex等標(biāo)記試劑已經(jīng)發(fā)布一年,廣受科研工作者喜愛(ài)。但是,對(duì)于6組3重復(fù)、3組6重復(fù)的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì),16plex卻難以滿(mǎn)足。TMTpro? 18-plex標(biāo)記蛋白組會(huì)是更好的選擇方式。其中基于質(zhì)譜儀平臺(tái)的蛋白組學(xué)近年來(lái)備受青睞,穩(wěn)定同位素標(biāo)記策略也被廣泛應(yīng)用于多重定量蛋白質(zhì)組學(xué)中。鹿明生物推出Thermo Scientific? TMTpro? 18-plex標(biāo)記蛋白組,18個(gè)樣本以?xún)?nèi),可實(shí)現(xiàn)一次標(biāo)記和分級(jí),避免了多批次標(biāo)記引入的批次效應(yīng),能***提升樣本的數(shù)據(jù)質(zhì)量。同時(shí)對(duì)更多蛋白質(zhì)鑒定和定量,提供了樣本的多通路處理水平。這個(gè)技術(shù)可謂是2021年的又一創(chuàng)新技術(shù)。蛋白組學(xué)翻譯后修飾...
通過(guò)蛋白質(zhì)組學(xué)+轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法,發(fā)現(xiàn)大黃素引發(fā)外泌體通過(guò)抑制代謝通路來(lái)減少肺泡巨噬細(xì)胞的活化和改善肺部炎癥的特征,探究了外泌體在參與炎癥相關(guān)***損傷中的重要作用,為大黃素可以通過(guò)減少胰腺外泌體介導(dǎo)的肺泡巨噬細(xì)胞活化來(lái)減輕嚴(yán)重急性胰腺炎相關(guān)的急性肺損傷提供依據(jù)。中文標(biāo)題:大黃素通過(guò)抑制胰腺外泌體介導(dǎo)的肺泡巨噬細(xì)胞活化減輕嚴(yán)重急性胰腺炎相關(guān)的急性肺損傷研究對(duì)象:大鼠血漿外泌體發(fā)表期刊:ActaPharmaceuticaSinicaB影響因子:11.413發(fā)表時(shí)間:2021年10月合作單位:四川大學(xué)華西醫(yī)院運(yùn)用生物技術(shù):TMT標(biāo)記定量蛋白組學(xué)(由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)歐易鹿明生物...
iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)技術(shù)研究方法:2021年7月,海南大學(xué)園藝園林學(xué)院吳友根教授課題組等在《Horticulture Research》期刊發(fā)表了題為“Integrative iTRAQ-based proteomic and transcriptomic analysis reveals the accumulation patterns of key metabolites associated with oilquality during seed ripening of Camellia oleifera”的研究成果,通過(guò)RNA測(cè)序(RNA-seq)和iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)技...
作者進(jìn)行了綜合分析,將蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)中的***生物標(biāo)志物合并到通路分析中,并確定了半乳糖代謝、戊糖和葡萄糖醛酸鹽相互轉(zhuǎn)化、檸檬酸鹽循環(huán)和**酸代謝這幾種途徑。然后結(jié)合蛋白質(zhì)和代謝標(biāo)志物來(lái)預(yù)測(cè)DKD狀態(tài)。五種機(jī)器學(xué)習(xí)模型表明,組合模型提高了DKD預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確性和穩(wěn)定性。圖中展示了RF的結(jié)果??偟膩?lái)說(shuō),組合多組學(xué)標(biāo)志物模型是一種強(qiáng)有力的提高DKD診斷的方法。1.蛋白組學(xué)結(jié)果表明,α2-巨球蛋白、組織蛋白酶D和CD324可作為檢測(cè)DKD進(jìn)展的潛在生物標(biāo)志物。2.代謝組學(xué)結(jié)果表明,半乳糖代謝和甘油脂代謝是DKD的主要代謝途徑,此外甘油-3-半乳糖苷可作為預(yù)測(cè)DKD的**標(biāo)志物。3.蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)...
通過(guò)蛋白質(zhì)組學(xué)分析檢測(cè)了經(jīng)M-Exos處理的HBMECs的改變。外泌體***了HBMECs,在0、24和48小時(shí)各種基因的表達(dá)增加(圖2A)。此外,熱圖分析揭示了不同表達(dá)的功能基因,包括與炎癥、細(xì)胞增殖、免疫調(diào)節(jié)和血管生成相關(guān)的因素(圖2B-E)。時(shí)序分析表明,HBMECs中標(biāo)記基因的上調(diào)與炎癥因子IL3RA有關(guān),增殖相關(guān)蛋白CD40和免疫調(diào)節(jié)因子TNFRSF10C(圖2F-H)。作者主要研究外泌體是否促進(jìn)人腦微血管內(nèi)皮細(xì)胞的血管生成能力,因此初步驗(yàn)證了M-Exos***后血管生成相關(guān)基因的表達(dá)。蛋白質(zhì)印跡結(jié)果顯示血管生成相關(guān)基因FlK1和ANGPT1的表達(dá)明顯增強(qiáng)(圖2I)。綜上所述,結(jié)果證...
蛋白組學(xué)技術(shù)是以蛋白質(zhì)組為研究對(duì)象,研究細(xì)胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學(xué)。DIA作為一種新的質(zhì)譜數(shù)據(jù)采集方式穩(wěn)定性高,覆蓋度廣的優(yōu)點(diǎn)。DIA蛋白組學(xué)技術(shù)已經(jīng)越來(lái)越多的疾病研究中發(fā)揮重大作用。本研究通過(guò)DIA蛋白組學(xué)技術(shù)分析了8個(gè)SAPHO病人和8個(gè)健康人的蛋白表達(dá)譜。蛋白表達(dá)的相關(guān)性圖顯示組內(nèi)相關(guān)性良好,差異蛋白的PCA圖顯示兩組得到明顯的區(qū)分。蛋白質(zhì)組學(xué)通過(guò)研究生物樣本中蛋白質(zhì)組成和變化,從而推動(dòng)疾病的病理機(jī)制研究,為臨床診斷和預(yù)后提供潛在生物標(biāo)志物。蛋白質(zhì)組學(xué)測(cè)序 蛋白組學(xué)技術(shù)缺點(diǎn)。山東蛋白組學(xué)結(jié)果怎么分析iTRAQ標(biāo)記蛋白組學(xué)研究方法:2021年12月歐易/鹿明生物合作客戶(hù)...
蛋白質(zhì)組學(xué)、磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)研究案例:2021年12月30日復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院樊嘉院士、中國(guó)科學(xué)院上海藥物研究所周虎研究員、中國(guó)科學(xué)院分子細(xì)胞科學(xué)***創(chuàng)新中心高大明研究員、復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院**教授課題組合作在Cancer Cell上發(fā)表題為“Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究論文,通過(guò)基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)、微生物組學(xué)研究方法對(duì)262例肝內(nèi)膽管*(iCCA)患者的配對(duì)**和*旁...
為了更好地了解DON對(duì)C2C12細(xì)胞分化的影響,作者進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的整合分析。共鑒定了149個(gè)共同的***差異基因(co-DEG),其中91%被共下調(diào)(圖3A)。15%的co-DEG屬于真核細(xì)胞骨架,其中大部分屬于肌動(dòng)蛋白絲,少數(shù)是中間絲和微管的成分。對(duì)co-DEG進(jìn)行GO分析,生物學(xué)過(guò)程富集了“骨骼肌肌球蛋白粗絲組裝”和“快肌纖維收縮的正向調(diào)節(jié)”條目。細(xì)胞組分中富集的**個(gè)條目是“纖維蛋白原復(fù)合物”、“細(xì)胞外空間”、“細(xì)胞外基質(zhì)”、“細(xì)胞外區(qū)域”和“蛋白質(zhì)細(xì)胞外基質(zhì)”,這些都是細(xì)胞外成分(圖3B)。結(jié)果表明,DON主要影響肌肉成分的組成和功能以及多種細(xì)胞外成分的表達(dá)。通路富集分析...
作者進(jìn)行了綜合分析,將蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)中的***生物標(biāo)志物合并到通路分析中,并確定了半乳糖代謝、戊糖和葡萄糖醛酸鹽相互轉(zhuǎn)化、檸檬酸鹽循環(huán)和**酸代謝這幾種途徑。然后結(jié)合蛋白質(zhì)和代謝標(biāo)志物來(lái)預(yù)測(cè)DKD狀態(tài)。五種機(jī)器學(xué)習(xí)模型表明,組合模型提高了DKD預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確性和穩(wěn)定性。圖中展示了RF的結(jié)果??偟膩?lái)說(shuō),組合多組學(xué)標(biāo)志物模型是一種強(qiáng)有力的提高DKD診斷的方法。1.蛋白組學(xué)結(jié)果表明,α2-巨球蛋白、組織蛋白酶D和CD324可作為檢測(cè)DKD進(jìn)展的潛在生物標(biāo)志物。2.代謝組學(xué)結(jié)果表明,半乳糖代謝和甘油脂代謝是DKD的主要代謝途徑,此外甘油-3-半乳糖苷可作為預(yù)測(cè)DKD的**標(biāo)志物。3.蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)...
蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)研究案例:作為一種常見(jiàn)的******,脫氧雪腐鐮刀菌烯醇(DON)在田間或加工和儲(chǔ)存過(guò)程中會(huì)污染谷物和飼料。DON在動(dòng)物中會(huì)引起厭食和生長(zhǎng)遲緩在內(nèi)的一系列不良反應(yīng)。本文作者使用轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)對(duì)鼠C2C12細(xì)胞進(jìn)行了研究,分析DON對(duì)成肌細(xì)胞分化的影響。研究結(jié)果表明,DON通過(guò)下調(diào)細(xì)胞骨架和ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信號(hào)通路來(lái)影響成肌細(xì)胞的分化。本文研究體現(xiàn)了組學(xué)技術(shù)在機(jī)制研究中的重要作用。中文標(biāo)題:霉菌***脫氧雪腐鐮刀菌烯醇通過(guò)下調(diào)細(xì)胞骨架和ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信號(hào)通路影響成肌細(xì)胞分化研究對(duì)象:脫氧雪腐鐮刀菌烯醇、C2...
作者進(jìn)行了綜合分析,將蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)中的***生物標(biāo)志物合并到通路分析中,并確定了半乳糖代謝、戊糖和葡萄糖醛酸鹽相互轉(zhuǎn)化、檸檬酸鹽循環(huán)和**酸代謝這幾種途徑。然后結(jié)合蛋白質(zhì)和代謝標(biāo)志物來(lái)預(yù)測(cè)DKD狀態(tài)。五種機(jī)器學(xué)習(xí)模型表明,組合模型提高了DKD預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確性和穩(wěn)定性。圖中展示了RF的結(jié)果??偟膩?lái)說(shuō),組合多組學(xué)標(biāo)志物模型是一種強(qiáng)有力的提高DKD診斷的方法。1.蛋白組學(xué)結(jié)果表明,α2-巨球蛋白、組織蛋白酶D和CD324可作為檢測(cè)DKD進(jìn)展的潛在生物標(biāo)志物。2.代謝組學(xué)結(jié)果表明,半乳糖代謝和甘油脂代謝是DKD的主要代謝途徑,此外甘油-3-半乳糖苷可作為預(yù)測(cè)DKD的**標(biāo)志物。3.蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)...
為了更好地了解DON對(duì)C2C12細(xì)胞分化的影響,作者進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的整合分析。共鑒定了149個(gè)共同的***差異基因(co-DEG),其中91%被共下調(diào)(圖3A)。15%的co-DEG屬于真核細(xì)胞骨架,其中大部分屬于肌動(dòng)蛋白絲,少數(shù)是中間絲和微管的成分。對(duì)co-DEG進(jìn)行GO分析,生物學(xué)過(guò)程富集了“骨骼肌肌球蛋白粗絲組裝”和“快肌纖維收縮的正向調(diào)節(jié)”條目。細(xì)胞組分中富集的**個(gè)條目是“纖維蛋白原復(fù)合物”、“細(xì)胞外空間”、“細(xì)胞外基質(zhì)”、“細(xì)胞外區(qū)域”和“蛋白質(zhì)細(xì)胞外基質(zhì)”,這些都是細(xì)胞外成分(圖3B)。結(jié)果表明,DON主要影響肌肉成分的組成和功能以及多種細(xì)胞外成分的表達(dá)。通路富集分析...
作者通過(guò)泛素化蛋白組學(xué)分析鑒定了茶樹(shù)作根中的泛素化蛋白質(zhì)。中文標(biāo)題:氮調(diào)節(jié)茶樹(shù)根中茶氨酸和黃酮類(lèi)化合物的生物合成:多組學(xué)分析揭示的蛋白質(zhì)水平調(diào)節(jié)研究對(duì)象:茶樹(shù)根發(fā)表期刊:JournalofAgriculturalandFoodChemistry影響因子:5.279發(fā)表時(shí)間:2021年9月1日發(fā)表單位:安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)運(yùn)用生物技術(shù):TMT蛋白質(zhì)組學(xué)、泛素化蛋白質(zhì)組學(xué)(其中部分?jǐn)?shù)據(jù)分析由鹿明生物提供技術(shù)支持)。本文分析了氮缺乏下茶樹(shù)根部的茶氨酸和黃酮類(lèi)代謝,通過(guò)蛋白質(zhì)組和泛素化蛋白質(zhì)組結(jié)合轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)探索了調(diào)節(jié)機(jī)制。本文的多組學(xué)數(shù)據(jù)整合分析思路值得借鑒。走近蛋白組學(xué)之蛋白組學(xué)常見(jiàn)問(wèn)題答疑解惑。遼寧蛋白組...
本研究采用串聯(lián)質(zhì)量標(biāo)簽(TMT)標(biāo)記的蛋白質(zhì)組學(xué)和平行反應(yīng)監(jiān)測(cè)(PRM)技術(shù),對(duì)蓮子脫水過(guò)程中的生理調(diào)控網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行了深入研究表明,碳水化合物代謝(包括糖酵解/糖異成、半乳糖代謝、淀粉和蔗糖代謝、磷酸戊糖途徑和細(xì)胞壁組織)、ER中的蛋白質(zhì)加工、DNA修復(fù)和抗氧化事件對(duì)蓮種胎脫水有積極的反應(yīng)。在蓮種胚脫水過(guò)程中,非酶促抗氧化劑和戊糖磷酸和維生素E作為主要的抗氧化劑,在脫水過(guò)程中維持荷花胚胎的REDOX平衡。這些結(jié)果為揭示荷花胚胎脫水保護(hù)機(jī)制的生理學(xué)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)提供了酶途徑在抗氧化保護(hù)中起著主要作用。應(yīng)激生理學(xué)檢測(cè)表明,H2O2是誘發(fā)氧化應(yīng)激損傷的主要活性氧(ROS)成分,谷胱甘肽新的見(jiàn)解。修飾蛋白質(zhì)組試...
作者使用通過(guò)單細(xì)胞蛋白組學(xué)產(chǎn)生的數(shù)據(jù)來(lái)觀察在腎小球細(xì)胞或近端腎小管中***豐富的蛋白質(zhì)細(xì)胞。208個(gè)Glom富集區(qū)蛋白富含囊泡中間運(yùn)輸和細(xì)胞成分組織調(diào)節(jié)作為其**重要的生物學(xué)過(guò)程,細(xì)胞骨架蛋白結(jié)合和肌動(dòng)蛋白結(jié)合是**重要的分子功能,肌動(dòng)蛋白細(xì)胞骨架是**豐富的細(xì)胞成分。富含247個(gè)PT的蛋白質(zhì)主要集中在小分子代謝過(guò)程和藥物代謝過(guò)程中。在**重要的分子功能中,這些蛋白質(zhì)的氧化還原酶活性和催化活性豐富。*在GLOM切片中發(fā)現(xiàn)的67種蛋白質(zhì)中,有41種已被報(bào)導(dǎo)存在于腎臟中,在這41種蛋白質(zhì)中,18種(43.9%)與單細(xì)胞蛋白組學(xué)結(jié)果一致,23種(56.1%)在GLOM中與小管相比沒(méi)有增加。蛋白組學(xué)—...
運(yùn)用生物技術(shù):TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)、PRM蛋白靶向驗(yàn)證由鹿明生物提供技術(shù)支持:2021年12月,上海交通大學(xué)張荻課題組在Frontiers in Plant Science發(fā)表題為 TMT-Based Quantitative Proteomic Analysis Reveals the Physiological Regulatory Networks of Embryo Dehydration Protection in Lotus(Nelumbo nucifera)的研究成果,通過(guò)TMT標(biāo)記蛋白質(zhì)組學(xué)和平行反應(yīng)監(jiān)測(cè)蛋白靶向驗(yàn)證(PRM)技術(shù)研究方法,構(gòu)建了蓮花胚胎脫水保護(hù)的生理調(diào)控網(wǎng)...
為了確定TMT AD蛋白網(wǎng)絡(luò)模塊是否也存在于其他的隊(duì)列和大腦區(qū)域,使用 TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)多個(gè)隊(duì)列的所有組織,為每個(gè)隊(duì)列生成蛋白質(zhì)共表達(dá)網(wǎng)絡(luò),并評(píng)估了 AD 網(wǎng)絡(luò)模塊是否保留在每個(gè)隊(duì)列和大腦區(qū)域中。發(fā)現(xiàn)幾乎所有的 TMT AD 網(wǎng)絡(luò)模塊都保留在隊(duì)列和大腦區(qū)域(圖2b)。阿爾茨海默病(AD)是一種神經(jīng)系統(tǒng)退行性疾病,其病因至今尚不清楚。本文從蛋白組學(xué)方向出發(fā),建立蛋白共表達(dá)網(wǎng)絡(luò),綜合轉(zhuǎn)錄組學(xué)結(jié)果,解析疾病相關(guān)的蛋白組學(xué)模塊或能為AD提供可靠的生物標(biāo)志物,并為治療帶來(lái)希望。蛋白組學(xué)—精選文章推薦。遼寧蛋白組學(xué)鑒定iTRAQ標(biāo)記蛋白組學(xué)研究方法:2021年12月歐易/鹿明生物合作客戶(hù)甘肅農(nóng)業(yè)大...
為了更好地了解DON對(duì)C2C12細(xì)胞分化的影響,作者進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的整合分析。共鑒定了149個(gè)共同的***差異基因(co-DEG),其中91%被共下調(diào)(圖3A)。15%的co-DEG屬于真核細(xì)胞骨架,其中大部分屬于肌動(dòng)蛋白絲,少數(shù)是中間絲和微管的成分。對(duì)co-DEG進(jìn)行GO分析,生物學(xué)過(guò)程富集了“骨骼肌肌球蛋白粗絲組裝”和“快肌纖維收縮的正向調(diào)節(jié)”條目。細(xì)胞組分中富集的**個(gè)條目是“纖維蛋白原復(fù)合物”、“細(xì)胞外空間”、“細(xì)胞外基質(zhì)”、“細(xì)胞外區(qū)域”和“蛋白質(zhì)細(xì)胞外基質(zhì)”,這些都是細(xì)胞外成分(圖3B)。結(jié)果表明,DON主要影響肌肉成分的組成和功能以及多種細(xì)胞外成分的表達(dá)。通路富集分析...
通過(guò)蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜鑒定、PRM靶向鑒定、iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)等研究方法,發(fā)現(xiàn)了N-豆蔻酰化在肝臟**發(fā)生中發(fā)揮重要作用,揭示了NMT1的N-豆蔻酰化抑制抗**發(fā)生的NDP,并通過(guò)干擾泛素化來(lái)刺激促**發(fā)生的NUP機(jī)制。為靶向N-豆蔻?;蚇MT1可能有助于***肝*提供了理論依據(jù)。中文標(biāo)題:NMT1依賴(lài)于POTEE發(fā)生N-豆蔻?;⑼ㄟ^(guò)差異調(diào)節(jié)靶標(biāo)的泛素化來(lái)刺激肝臟**的發(fā)生研究對(duì)象:細(xì)胞、小鼠、人**組織發(fā)表期刊:FrontiersinOncology影響因子:6.244發(fā)表時(shí)間:2021年5月合作單位:上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬上海兒童醫(yī)學(xué)中心運(yùn)用生物技術(shù):iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)、P...
蛋白組學(xué)技術(shù)是以蛋白質(zhì)組為研究對(duì)象,研究細(xì)胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學(xué)。DIA作為一種新的質(zhì)譜數(shù)據(jù)采集方式穩(wěn)定性高,覆蓋度廣的優(yōu)點(diǎn)。DIA蛋白組學(xué)技術(shù)已經(jīng)越來(lái)越多的疾病研究中發(fā)揮重大作用。本研究通過(guò)DIA蛋白組學(xué)技術(shù)分析了8個(gè)SAPHO病人和8個(gè)健康人的蛋白表達(dá)譜。蛋白表達(dá)的相關(guān)性圖顯示組內(nèi)相關(guān)性良好,差異蛋白的PCA圖顯示兩組得到明顯的區(qū)分。蛋白質(zhì)組學(xué)通過(guò)研究生物樣本中蛋白質(zhì)組成和變化,從而推動(dòng)疾病的病理機(jī)制研究,為臨床診斷和預(yù)后提供潛在生物標(biāo)志物。蛋白質(zhì)組與代謝組聯(lián)合分析。江西定量蛋白組學(xué)技術(shù)測(cè)什么iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)研究實(shí)用案例:2021年8月,浙江大學(xué)藥學(xué)院何俏軍、羅沛...
采用RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析和DIA蛋白質(zhì)組學(xué)分析,研究了AC和AL對(duì)db/db小鼠的影響。轉(zhuǎn)錄組分析共鑒定出16812種不同的蛋白質(zhì)編碼轉(zhuǎn)錄本。其中,2837個(gè)(約16.9%)在正常組和對(duì)照組之間有***差異,表明db/db小鼠在轉(zhuǎn)錄水平上與野生型小鼠***不同。與對(duì)照組相比,共有3749個(gè)基因因攝入AC而發(fā)生***改變(2201個(gè)下調(diào),1548個(gè)上調(diào)),560個(gè)基因(430個(gè)下調(diào),130個(gè)上調(diào))因攝入AL而發(fā)生***改變(圖3B)。DIA蛋白質(zhì)組學(xué)分析鑒定出2729種蛋白質(zhì)。正常組和對(duì)照組之間共發(fā)現(xiàn)1059個(gè)(約占總鑒定蛋白質(zhì)的38.8%)DEPs,AC處理有230個(gè)蛋白質(zhì)發(fā)生***變化...
為了確定TMT AD蛋白網(wǎng)絡(luò)模塊是否也存在于其他的隊(duì)列和大腦區(qū)域,使用 TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)多個(gè)隊(duì)列的所有組織,為每個(gè)隊(duì)列生成蛋白質(zhì)共表達(dá)網(wǎng)絡(luò),并評(píng)估了 AD 網(wǎng)絡(luò)模塊是否保留在每個(gè)隊(duì)列和大腦區(qū)域中。發(fā)現(xiàn)幾乎所有的 TMT AD 網(wǎng)絡(luò)模塊都保留在隊(duì)列和大腦區(qū)域(圖2b)。阿爾茨海默病(AD)是一種神經(jīng)系統(tǒng)退行性疾病,其病因至今尚不清楚。本文從蛋白組學(xué)方向出發(fā),建立蛋白共表達(dá)網(wǎng)絡(luò),綜合轉(zhuǎn)錄組學(xué)結(jié)果,解析疾病相關(guān)的蛋白組學(xué)模塊或能為AD提供可靠的生物標(biāo)志物,并為治療帶來(lái)希望。蛋白質(zhì)組學(xué),蛋白質(zhì)組分析,專(zhuān)業(yè)的多組學(xué)聯(lián)合分析。山東蛋白組學(xué) 價(jià)格本文為中國(guó)科學(xué)院海岸帶研究所趙建民課題組在Scienc...
為了更好地了解DON對(duì)C2C12細(xì)胞分化的影響,作者進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的整合分析。共鑒定了149個(gè)共同的***差異基因(co-DEG),其中91%被共下調(diào)(圖3A)。15%的co-DEG屬于真核細(xì)胞骨架,其中大部分屬于肌動(dòng)蛋白絲,少數(shù)是中間絲和微管的成分。對(duì)co-DEG進(jìn)行GO分析,生物學(xué)過(guò)程富集了“骨骼肌肌球蛋白粗絲組裝”和“快肌纖維收縮的正向調(diào)節(jié)”條目。細(xì)胞組分中富集的**個(gè)條目是“纖維蛋白原復(fù)合物”、“細(xì)胞外空間”、“細(xì)胞外基質(zhì)”、“細(xì)胞外區(qū)域”和“蛋白質(zhì)細(xì)胞外基質(zhì)”,這些都是細(xì)胞外成分(圖3B)。結(jié)果表明,DON主要影響肌肉成分的組成和功能以及多種細(xì)胞外成分的表達(dá)。通路富集分析...