為了更好地了解DON對(duì)C2C12細(xì)胞分化的影響，作者進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的整合分析。共鑒定了149個(gè)共同的***差異基因（co-DEG），其中91%被共下調(diào)（圖3A）。15%的co-DEG屬于真核細(xì)胞骨架，其中大部分屬于肌動(dòng)蛋白絲，少數(shù)是中間絲和微管的成分。對(duì)co-DEG進(jìn)行GO分析，生物學(xué)過程富集了“骨骼肌肌球蛋白粗絲組裝”和“快肌纖維收縮的正向調(diào)節(jié)”條目。細(xì)胞組分中富集的**個(gè)條目是“纖維蛋白原復(fù)合物”、“細(xì)胞外空間”、“細(xì)胞外基質(zhì)”、“細(xì)胞外區(qū)域”和“蛋白質(zhì)細(xì)胞外基質(zhì)”，這些都是細(xì)胞外成分（圖3B）。結(jié)果表明，DON主要影響肌肉成分的組成和功能以及多種細(xì)胞外成分的表達(dá)。通路富集分析富集到了“ECM-受體相互作用”、“蛋白質(zhì)消化和吸收”、“人**瘤病毒***”和“粘著斑”等通路。蛋白質(zhì)組學(xué)多組學(xué)分析蛋白質(zhì)組學(xué)研究進(jìn)展。吉林dia蛋白組學(xué)價(jià)格
通過蛋白質(zhì)組學(xué)分析檢測(cè)了經(jīng)M-Exos處理的HBMECs的改變。外泌體***了HBMECs，在0、24和48小時(shí)各種基因的表達(dá)增加(圖2A)。此外，熱圖分析揭示了不同表達(dá)的功能基因，包括與炎癥、細(xì)胞增殖、免疫調(diào)節(jié)和血管生成相關(guān)的因素(圖2B-E)。時(shí)序分析表明，HBMECs中標(biāo)記基因的上調(diào)與炎癥因子IL3RA有關(guān)，增殖相關(guān)蛋白CD40和免疫調(diào)節(jié)因子TNFRSF10C(圖2F-H)。作者主要研究外泌體是否促進(jìn)人腦微血管內(nèi)皮細(xì)胞的血管生成能力，因此初步驗(yàn)證了M-Exos***后血管生成相關(guān)基因的表達(dá)。蛋白質(zhì)印跡結(jié)果顯示血管生成相關(guān)基因FlK1和ANGPT1的表達(dá)明顯增強(qiáng)(圖2I)。綜上所述，結(jié)果證實(shí)了M-Exos誘導(dǎo)了人腦微血管內(nèi)皮細(xì)胞的功能改變。江蘇tmt蛋白組學(xué)定性蛋白組學(xué)近期研究進(jìn)展的盤點(diǎn)。
采用RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析和DIA蛋白質(zhì)組學(xué)分析，研究了AC和AL對(duì)db/db小鼠的影響。轉(zhuǎn)錄組分析共鑒定出16812種不同的蛋白質(zhì)編碼轉(zhuǎn)錄本。其中，2837個(gè)（約16.9%）在正常組和對(duì)照組之間有***差異，表明db/db小鼠在轉(zhuǎn)錄水平上與野生型小鼠***不同。與對(duì)照組相比，共有3749個(gè)基因因攝入AC而發(fā)生***改變（2201個(gè)下調(diào)，1548個(gè)上調(diào)），560個(gè)基因（430個(gè)下調(diào)，130個(gè)上調(diào)）因攝入AL而發(fā)生***改變（圖3B）。DIA蛋白質(zhì)組學(xué)分析鑒定出2729種蛋白質(zhì)。正常組和對(duì)照組之間共發(fā)現(xiàn)1059個(gè)（約占總鑒定蛋白質(zhì)的38.8%）DEPs，AC處理有230個(gè)蛋白質(zhì)發(fā)生***變化（109個(gè)上調(diào)，121個(gè)下調(diào)），AL處理有211個(gè)蛋白質(zhì)發(fā)生***變化（116個(gè)上調(diào)，95個(gè)下調(diào)）。
通過磷酸化蛋白質(zhì)組定量鑒定了1244個(gè)磷酸化蛋白質(zhì)，其中474個(gè)（38%）在**組織中***增加，183個(gè)（15%）***下降。三種蛋白亞型中磷酸化蛋白組學(xué)的比較結(jié)果揭示了亞型特異性的活性激酶。進(jìn)一步對(duì)差異改變的磷酸化位點(diǎn)的研究顯示，在S-I中觀察到參與黏附的底物升高和參與RNA轉(zhuǎn)運(yùn)的底物減少。而基于timsTOF Pro離子淌度4D蛋白質(zhì)組技術(shù)，是對(duì)蛋白組學(xué)+磷酸化組學(xué)的雙重升級(jí)，可實(shí)現(xiàn)快速采集、更高的靈敏度和特異性，**臨床蛋白質(zhì)組學(xué)在定性數(shù)量更多、定量更準(zhǔn)確、位點(diǎn)鑒定更精確、樣本需求量更低、檢測(cè)周期更短等性能上***提升，從蛋白質(zhì)表達(dá)和修飾雙重角度更好地發(fā)揮發(fā)掘分子調(diào)控機(jī)制、發(fā)現(xiàn)疾病分子分型以及發(fā)掘生物標(biāo)志物等多重作用。單細(xì)胞蛋白組學(xué)之質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù) 。
蛋白組學(xué)研究實(shí)用案例：東南大學(xué)醫(yī)學(xué)院院長劉必成教授領(lǐng)導(dǎo)的腎臟病研究所在Science advances期刊發(fā)表了題為“Extracellular vesicle–encapsulated IL-10 as novel nanotherapeutics against ischemic AKI"的研究成果，通過蛋白組學(xué)+多層組學(xué)研究方法，建立IL-10細(xì)胞囊泡高表達(dá)模型的構(gòu)建，提出并驗(yàn)證了IL-10細(xì)胞外囊泡的靶向缺血性腎損傷的假說，探究了IL-10細(xì)胞外囊泡作為新型納米藥物的機(jī)理。中文標(biāo)題：細(xì)胞外囊泡包裹的IL-10作為抗缺血性急性腎損傷的新型納米療法研究方向：新藥研發(fā)及其機(jī)制研究發(fā)表期刊：Scienceadvances影響因子：14.136發(fā)表單位：中國南京東南大學(xué)附屬中大醫(yī)院腎內(nèi)科運(yùn)用生物技術(shù)：LC-MS/MS蛋白組學(xué)（由鹿明生物提供技術(shù)支持）蛋白組學(xué)—精選文章推薦。山東蛋白組學(xué)結(jié)果可靠嗎
蛋白質(zhì)組學(xué)生物標(biāo)志物&機(jī)制研究一站式服務(wù)。吉林dia蛋白組學(xué)價(jià)格
TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究案例：2021年12月威爾康奈爾醫(yī)學(xué)中心和紀(jì)念斯隆凱特琳**中心的Linda T. Vahdat 和 Vivek Mittal教授課題組在Nature Communications期刊發(fā)表的題為 “Copper depletion modulates mitochondrial oxidative phosphorylation to impair triple negative breast cancer metastasis”的研究成果，通過蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)研究方法，發(fā)現(xiàn)了高度轉(zhuǎn)移性 SOX2/OCT4+ 細(xì)胞的離散亞群表現(xiàn)出細(xì)胞內(nèi)銅水平升高特征，探究了TM 介導(dǎo)的復(fù)合物 IV 失活確定為 SOX2/OCT4+ 細(xì)胞群中的主要代謝缺陷，AMPK/mTORC1 能量傳感器為重要的下游途徑。描繪了銅-代謝-轉(zhuǎn)移軸，為高風(fēng)險(xiǎn)三陰性乳腺*患者的下一代治療方法提供了理論依據(jù)。中文標(biāo)題：銅耗竭調(diào)節(jié)線粒體氧化磷酸化以損害三陰性乳腺*轉(zhuǎn)移研究對(duì)象：高風(fēng)險(xiǎn)三陰性乳腺*(TNBC)發(fā)表期刊：NatureCommunications影響因子：14.919發(fā)表時(shí)間：2021年12月合作單位：紀(jì)念斯隆凱特琳**中心，Sandra和EdwardMeyer**中心運(yùn)用關(guān)鍵生物技術(shù)：TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)和靶向代謝組學(xué)吉林dia蛋白組學(xué)價(jià)格
上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司位于聯(lián)航路1188號(hào)25幢，交通便利，環(huán)境優(yōu)美，是一家服務(wù)型企業(yè)。是一家私營合伙企業(yè)企業(yè)，隨著市場(chǎng)的發(fā)展和生產(chǎn)的需求，與多家企業(yè)合作研究，在原有產(chǎn)品的基礎(chǔ)上經(jīng)過不斷改進(jìn)，追求新型，在強(qiáng)化內(nèi)部管理，完善結(jié)構(gòu)調(diào)整的同時(shí)，良好的質(zhì)量、合理的價(jià)格、完善的服務(wù)，在業(yè)界受到寬泛好評(píng)。公司業(yè)務(wù)涵蓋科研服務(wù)，科研檢測(cè)，學(xué)術(shù)研究，技術(shù)咨詢，價(jià)格合理，品質(zhì)有保證，深受廣大客戶的歡迎。歐易生物以創(chuàng)造***產(chǎn)品及服務(wù)的理念，打造高指標(biāo)的服務(wù)，引導(dǎo)行業(yè)的發(fā)展。