3篇經(jīng)典的蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)在水產(chǎn)動物中的研究。水產(chǎn)動物的研究不僅是保障我國海水養(yǎng)殖業(yè)的健康可持續(xù)發(fā)展，同時(shí)可為良種創(chuàng)制、海洋環(huán)境研究、生態(tài)研究等提供重要理論基礎(chǔ)和技術(shù)支撐~因此在水產(chǎn)生物研究方面蛋白組學(xué)、代謝組學(xué)在其中起到什么作用呢？期望這3篇經(jīng)典文章能給您思路~中文標(biāo)題：CO2誘導(dǎo)的海洋酸化損害了太平洋牡蠣對金氏弧菌的免疫功能:細(xì)胞和蛋白質(zhì)組學(xué)的綜合研究研究對象：牡蠣發(fā)表期刊：ScienceoftheTotalEnvironment影響因子：6.551合作單位：中國科學(xué)院海岸帶研究所運(yùn)用歐易/鹿明生物技術(shù)：iTRAQ標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)（由鹿明生物提供技術(shù)支持）修飾蛋白質(zhì)組試劑及服務(wù)，蛋白質(zhì)組學(xué)解決方案。內(nèi)蒙古蛋白組學(xué)測定樣本價(jià)格
通過磷酸化蛋白質(zhì)組定量鑒定了1244個磷酸化蛋白質(zhì)，其中474個（38%）在**組織中***增加，183個（15%）***下降。三種蛋白亞型中磷酸化蛋白組學(xué)的比較結(jié)果揭示了亞型特異性的活性激酶。進(jìn)一步對差異改變的磷酸化位點(diǎn)的研究顯示，在S-I中觀察到參與黏附的底物升高和參與RNA轉(zhuǎn)運(yùn)的底物減少。而基于timsTOF Pro離子淌度4D蛋白質(zhì)組技術(shù)，是對蛋白組學(xué)+磷酸化組學(xué)的雙重升級，可實(shí)現(xiàn)快速采集、更高的靈敏度和特異性，**臨床蛋白質(zhì)組學(xué)在定性數(shù)量更多、定量更準(zhǔn)確、位點(diǎn)鑒定更精確、樣本需求量更低、檢測周期更短等性能上***提升，從蛋白質(zhì)表達(dá)和修飾雙重角度更好地發(fā)揮發(fā)掘分子調(diào)控機(jī)制、發(fā)現(xiàn)疾病分子分型以及發(fā)掘生物標(biāo)志物等多重作用。天津蛋白組學(xué)測序后通路分析歐易鹿明生物基于質(zhì)譜技術(shù),生物信息學(xué)方法,提供蛋白質(zhì)組學(xué)。
作者運(yùn)用iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)對種子發(fā)育過程中蛋白質(zhì)表達(dá)的定量比較，同時(shí)進(jìn)行GO和KEGG通路富集分析。結(jié)果表明所有鑒定的蛋白被分為29類，主要涉及翻譯和碳水化合物代謝。并且作者繪制了p值小于0.01的前20條KEGG通路的氣泡圖。在三對比較中，普遍富集的途徑包括脂肪酸降解、苯丙素生物合成和脂肪酸代謝。其中，參與α-亞麻酸代謝的DAPs在S3 vs. S1組和S4 vs. S1組中都非常活躍。為了評估轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組之間的一致性，以及了解轉(zhuǎn)錄后的mRNA在蛋白質(zhì)水平上是如何表現(xiàn)的，作者進(jìn)行了RNA-seq和iTRAQ分析的聯(lián)合分析。證明DEGs和DAPs參與類黃酮的生物合成和脂肪酸代謝。
蛋白質(zhì)組定量到了10,529種蛋白質(zhì)，磷酸化蛋白質(zhì)組定量到了來自9,832個磷酸化蛋白的62,879個磷酸化位點(diǎn)。基因組確定了包括TP53、KRAS、FGFR2、IDH1/2、BAP1、ARID1A和PBRM1在內(nèi)的16個***改變的**驅(qū)動基因（圖1A）。與西方iCCA人群隊(duì)列相比，本文隊(duì)列顯示出更高的KRAS突變頻率和更低的IDH1、ARID1A和TERT突變頻率（圖1B）。在FU-iCCA隊(duì)列中觀察到黃曲霉***和馬兜鈴酸特征（圖1C）。通過比較具有或不具有黃曲霉***特征的所有**的多組學(xué)數(shù)據(jù)，發(fā)現(xiàn)具有黃曲霉***特征的**顯示出DNA修復(fù)和細(xì)胞周期通路的上調(diào)以及細(xì)胞凋亡、***炎癥和免疫通路的下調(diào)（圖1E）。進(jìn)一步分析顯示，TP53突變與黃曲霉***特征***相關(guān)（圖1F和1G）。蛋白質(zhì)組學(xué) 找歐易生物-生物標(biāo)志物、機(jī)制研究一站式服務(wù)。
運(yùn)用生物技術(shù)：磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)（歐易鹿明提供）：2022年1月，***醫(yī)學(xué)研究院生物工程研究所鐘輝研究員、魏從文副研究員和秦成峰研究員，廣西醫(yī)科大學(xué)附屬**醫(yī)院吳飛翔教授等為共同通訊作（一作：萬祿明、鄧永強(qiáng)、柯躍華、麻恩浩、楊歡、林浩天）在Nature Metabolism期刊發(fā)表的題為“GP73 is a glucogenic hormone contributing to SARS-CoV-2-induced hyperglycemia”的研究成果，通過磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)、LC-MS靶向代謝組學(xué)等研究方法，發(fā)現(xiàn)了一個全新的糖異生調(diào)控***——GP73，***會誘導(dǎo)GP73的產(chǎn)生和分泌，從而導(dǎo)致過度的糖異生。蛋白質(zhì)組學(xué)生物標(biāo)志物&機(jī)制研究一站式服務(wù)。浙江dia蛋白組學(xué)sci投稿
一文了解DIA、TMT/iTRAQ、傳統(tǒng)Label free蛋白組學(xué)區(qū)別在哪。內(nèi)蒙古蛋白組學(xué)測定樣本價(jià)格
4D蛋白組學(xué)：tims TOF Pro2依賴于雙捕集離子淌度（TIMS）和同步累積連續(xù)碎裂（PASEF）數(shù)據(jù)采集模式兩大創(chuàng)新技術(shù)，可實(shí)現(xiàn)快速采集、更高的靈敏度和特異性。同時(shí)，其配備了***一代雙 TIMS 分析器，離子容量可提高三倍，比較大限度地提高了離子傳輸效率和靈敏度，讓蛋白質(zhì)組學(xué)分析再上一個新的臺階，鹿明生物同時(shí)配備了Evosep One高通量色譜使其在短梯度下也能實(shí)現(xiàn)蛋白深度覆蓋，結(jié)果更精細(xì)，也成為轉(zhuǎn)化組學(xué)應(yīng)用不可或缺的工具。更高掃描速度：助力臨床大隊(duì)列項(xiàng)目研究，更高覆蓋深度：助力蛋白組鑒定到更多的蛋白數(shù)量，超高靈敏度：助力微量樣本蛋白組分析，鑒定更可信：助力蛋白或化合物更高可信度的鑒定。內(nèi)蒙古蛋白組學(xué)測定樣本價(jià)格
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