采用RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析和DIA蛋白質(zhì)組學(xué)分析，研究了AC和AL對(duì)db/db小鼠的影響。轉(zhuǎn)錄組分析共鑒定出16812種不同的蛋白質(zhì)編碼轉(zhuǎn)錄本。其中，2837個(gè)（約16.9%）在正常組和對(duì)照組之間有***差異，表明db/db小鼠在轉(zhuǎn)錄水平上與野生型小鼠***不同。與對(duì)照組相比，共有3749個(gè)基因因攝入AC而發(fā)生***改變（2201個(gè)下調(diào)，1548個(gè)上調(diào)），560個(gè)基因（430個(gè)下調(diào)，130個(gè)上調(diào)）因攝入AL而發(fā)生***改變（圖3B）。DIA蛋白質(zhì)組學(xué)分析鑒定出2729種蛋白質(zhì)。正常組和對(duì)照組之間共發(fā)現(xiàn)1059個(gè)（約占總鑒定蛋白質(zhì)的38.8%）DEPs，AC處理有230個(gè)蛋白質(zhì)發(fā)生***變化（109個(gè)上調(diào)，121個(gè)下調(diào)），AL處理有211個(gè)蛋白質(zhì)發(fā)生***變化（116個(gè)上調(diào)，95個(gè)下調(diào)）。蛋白質(zhì)是生命所必需的，具有結(jié)構(gòu)、代謝、運(yùn)輸、免疫、信號(hào)和調(diào)節(jié)等許多作用。內(nèi)蒙古做蛋白組學(xué)哪家公司比較好
作者運(yùn)用iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)對(duì)種子發(fā)育過(guò)程中蛋白質(zhì)表達(dá)的定量比較，同時(shí)進(jìn)行GO和KEGG通路富集分析。結(jié)果表明所有鑒定的蛋白被分為29類，主要涉及翻譯和碳水化合物代謝。并且作者繪制了p值小于0.01的前20條KEGG通路的氣泡圖。在三對(duì)比較中，普遍富集的途徑包括脂肪酸降解、苯丙素生物合成和脂肪酸代謝。其中，參與α-亞麻酸代謝的DAPs在S3 vs. S1組和S4 vs. S1組中都非?；钴S。為了評(píng)估轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組之間的一致性，以及了解轉(zhuǎn)錄后的mRNA在蛋白質(zhì)水平上是如何表現(xiàn)的，作者進(jìn)行了RNA-seq和iTRAQ分析的聯(lián)合分析。證明DEGs和DAPs參與類黃酮的生物合成和脂肪酸代謝。內(nèi)蒙古tmt蛋白組學(xué)標(biāo)記試劑盒蛋白質(zhì)組學(xué)-選歐易生物-專注蛋白質(zhì)量檢測(cè)-高效快捷。
TMTpro-16plex等標(biāo)記試劑已經(jīng)發(fā)布一年，廣受科研工作者喜愛(ài)。但是，對(duì)于6組3重復(fù)、3組6重復(fù)的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)，16plex卻難以滿足。TMTpro? 18-plex標(biāo)記蛋白組會(huì)是更好的選擇方式。其中基于質(zhì)譜儀平臺(tái)的蛋白組學(xué)近年來(lái)備受青睞，穩(wěn)定同位素標(biāo)記策略也被廣泛應(yīng)用于多重定量蛋白質(zhì)組學(xué)中。鹿明生物推出Thermo Scientific? TMTpro? 18-plex標(biāo)記蛋白組，18個(gè)樣本以內(nèi)，可實(shí)現(xiàn)一次標(biāo)記和分級(jí)，避免了多批次標(biāo)記引入的批次效應(yīng)，能***提升樣本的數(shù)據(jù)質(zhì)量。同時(shí)對(duì)更多蛋白質(zhì)鑒定和定量，提供了樣本的多通路處理水平。這個(gè)技術(shù)可謂是2021年的又一創(chuàng)新技術(shù)。
綜上所述，本研究應(yīng)用RNA-seq轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)合iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)，探討油茶種子不同成熟期儲(chǔ)量積累的動(dòng)態(tài)變化。此外，作者還探討了黃酮類化合物和脂肪酸的生物合成和代謝可能的調(diào)控機(jī)制。許多功能轉(zhuǎn)錄本(16530)和蛋白質(zhì)物種(1228)的模式發(fā)生了***變化，其中317個(gè)DAPs被轉(zhuǎn)錄組結(jié)果覆蓋。結(jié)合結(jié)構(gòu)基因(蛋白)或轉(zhuǎn)錄因子的表達(dá)譜及相應(yīng)化合物的含量，對(duì)重要代謝產(chǎn)物的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行了探討。結(jié)果表明，黃酮類化合物的合成能力在種子成熟過(guò)程中逐漸減弱，而脂肪酸的合成能力則先升高后下降。隨著蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)的發(fā)展，蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)分析的方法也將同樣快速發(fā)展。
本文為中國(guó)科學(xué)院海岸帶研究所趙建民課題組在ScienceoftheTotalEnvironment期刊發(fā)表了的文章，通過(guò)iTRAQ標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究弧菌***加劇了海洋酸化造成的牡蠣免疫抑制效應(yīng)。海洋酸化可能增加海洋軟體動(dòng)物疾病加劇的風(fēng)險(xiǎn)。從而將產(chǎn)生重大的經(jīng)濟(jì)和生態(tài)影響，因此本研究結(jié)果具有重要的指導(dǎo)意義。在本研究中，研究者將太平洋牡蠣暴露于酸化海水（約2000ppm）中28天，然后用金氏弧菌進(jìn)行***處理，以此研究海洋酸化是否會(huì)影響牡蠣對(duì)病原菌***的免疫反應(yīng)。此外，利用基于iTRAQ的定量蛋白質(zhì)組學(xué)方法，對(duì)牡蠣鰓這一潛在的造血部位進(jìn)行了研究，以分析對(duì)OA和金氏弧菌共同作用較敏感的生理過(guò)程。蛋白質(zhì)組學(xué)研究涉及給定細(xì)胞、組織和/或生物體的整個(gè)蛋白質(zhì)譜的分離、鑒定、定性、定量和功能表征。安徽rpms蛋白組學(xué)
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蛋白組學(xué)技術(shù)可以提供細(xì)胞狀態(tài)和調(diào)控的功能信息，本研究建立了單細(xì)胞蛋白組學(xué)方法，實(shí)現(xiàn)了高靈敏度的蛋白組學(xué)檢測(cè)。該技術(shù)有助于揭示疾病的發(fā)病機(jī)制，探討預(yù)后和風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)的不同腎臟疾病亞型中的蛋白組學(xué)異質(zhì)性和獨(dú)特的蛋白標(biāo)志物，為藥物靶點(diǎn)***提供希望。大規(guī)模單細(xì)胞分析對(duì)于捕獲復(fù)雜細(xì)胞系統(tǒng)中的生物異質(zhì)性至關(guān)重要，但*基于RNA技術(shù)的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)并不能很好地**蛋白質(zhì)水平上的變化。而單細(xì)胞蛋白組學(xué)技術(shù)能夠從蛋白質(zhì)水平上破譯細(xì)胞機(jī)制并且獲得更多的信息。內(nèi)蒙古做蛋白組學(xué)哪家公司比較好
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