為了更好地了解DON對C2C12細胞分化的影響，作者進行了轉(zhuǎn)錄組學和蛋白質(zhì)組學的整合分析。共鑒定了149個共同的***差異基因（co-DEG），其中91%被共下調(diào)（圖3A）。15%的co-DEG屬于真核細胞骨架，其中大部分屬于肌動蛋白絲，少數(shù)是中間絲和微管的成分。對co-DEG進行GO分析，生物學過程富集了“骨骼肌肌球蛋白粗絲組裝”和“快肌纖維收縮的正向調(diào)節(jié)”條目。細胞組分中富集的**個條目是“纖維蛋白原復合物”、“細胞外空間”、“細胞外基質(zhì)”、“細胞外區(qū)域”和“蛋白質(zhì)細胞外基質(zhì)”，這些都是細胞外成分（圖3B）。結(jié)果表明，DON主要影響肌肉成分的組成和功能以及多種細胞外成分的表達。通路富集分析富集到了“ECM-受體相互作用”、“蛋白質(zhì)消化和吸收”、“人**瘤病毒***”和“粘著斑”等通路。歐易生物鹿明生物蛋白組學聯(lián)合分析。遼寧蛋白組學是幾代測序
定量蛋白質(zhì)組學研究：2022年2月，上海市農(nóng)業(yè)科學院食用菌研究所鮑大鵬研究員課題組在《FrontiersinMicrobiology》期刊發(fā)表的題為“OxidativeStressandAutophagyAreImportantProcessesinPostRipenessandBrownFilmFormationinMyceliumofLentinulaedodes”的研究成果，通過iTRAQ標記定量蛋白組學、GC-MS非靶向代謝組學等技術(shù)對香菇菌絲進行定量蛋白質(zhì)組學和代謝組學分析，發(fā)現(xiàn)氧化應激和自噬是香菇菌絲后熟轉(zhuǎn)色重要過程，并對其在蛋白質(zhì)組和代謝組水平上的分子機制有了新的認識。涉及的歐易/鹿明生物服務(wù)產(chǎn)品：iTRAQ標記定量蛋白組學、GC-MS非靶向代謝組學山東植物蛋白組學研究修飾蛋白質(zhì)組試劑及服務(wù)，蛋白質(zhì)組學解決方案。
本研究采用串聯(lián)質(zhì)量標簽（TMT）標記的蛋白質(zhì)組學和平行反應監(jiān)測（PRM）技術(shù)，對蓮子脫水過程中的生理調(diào)控網(wǎng)絡(luò)進行了深入研究表明，碳水化合物代謝（包括糖酵解/糖異成、半乳糖代謝、淀粉和蔗糖代謝、磷酸戊糖途徑和細胞壁組織）、ER中的蛋白質(zhì)加工、DNA修復和抗氧化事件對蓮種胎脫水有積極的反應。在蓮種胚脫水過程中，非酶促抗氧化劑和戊糖磷酸和維生素E作為主要的抗氧化劑，在脫水過程中維持荷花胚胎的REDOX平衡。這些結(jié)果為揭示荷花胚胎脫水保護機制的生理學調(diào)控網(wǎng)絡(luò)提供了酶途徑在抗氧化保護中起著主要作用。應激生理學檢測表明，H2O2是誘發(fā)氧化應激損傷的主要活性氧（ROS）成分，谷胱甘肽新的見解。
單細胞蛋白組學研究方法：2020年9月，加州大學的MinnieM.Sarwal課題組在FrontiersinMedicine發(fā)表的題為“Near-Single-CellProteomicsProfilingoftheProximalTubularandGlomerulusoftheNormalHumanKidney”的研究成果，通過單細胞蛋白組學研究方法，分析正常人近端腎小管和腎小球區(qū)域的腎臟細胞，研究為解開急性和慢性腎臟疾病病因和腎臟亞細胞功能擾動提供依據(jù)。中文標題：正常人腎臟近端腎小管和腎小球的單細胞蛋白質(zhì)組學分析研究對象：人體腎臟組織發(fā)表期刊：FrontiersinMedicine影響因子：5.091發(fā)表時間：2020年9月運用重點組學技術(shù)：單細胞蛋白質(zhì)組學技術(shù)蛋白質(zhì)組學,蛋白質(zhì)組分析,專業(yè)的多組學聯(lián)合分析。
運用生物技術(shù)：TMT標記定量蛋白質(zhì)組學、PRM蛋白靶向驗證由鹿明生物提供技術(shù)支持：2021年12月，上海交通大學張荻課題組在Frontiers in Plant Science發(fā)表題為 TMT-Based Quantitative Proteomic Analysis Reveals the Physiological Regulatory Networks of Embryo Dehydration Protection in Lotus(Nelumbo nucifera)的研究成果，通過TMT標記蛋白質(zhì)組學和平行反應監(jiān)測蛋白靶向驗證(PRM)技術(shù)研究方法，構(gòu)建了蓮花胚胎脫水保護的生理調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。為揭示荷花種子長壽的脫水保護機制提供了新的見解。蛋白組學常見研究模式,蛋白樣本準備注意事項以及經(jīng)典案例解讀。山東植物蛋白組學研究
蛋白組學技術(shù)對腎錯構(gòu)瘤尿液差異蛋白的研究。遼寧蛋白組學是幾代測序
TMT蛋白質(zhì)組學探究案例：2021年9月，安徽農(nóng)業(yè)大學張照亮教授課題組在Journal of Agricultural and Food Chemistry期刊發(fā)表了題為“Nitrogen-Regulated Theanine and Flavonoid Biosynthesis in Tea Plant Roots: Protein-Level Regulation Revealed by Multiomics Analyses”的研究成果，通過TMT蛋白質(zhì)組學和泛素化蛋白質(zhì)組學研究方法，發(fā)現(xiàn)了氮缺乏條件下茶樹根部響應的差異表達蛋白和泛素化蛋白質(zhì)，為茶氨酸和黃酮類生物合成的調(diào)控提供了新的見解，為茶樹翻譯后修飾調(diào)控次生代謝的研究提供了理論依據(jù)。遼寧蛋白組學是幾代測序
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