上海植物代謝組學(xué)研究進展

來源: 發(fā)布時間:2022-11-02

GC-MS代謝組學(xué)和 LC-MS代謝組學(xué)研究:鹽度的變化會影響甲殼類動物的生長、***和疾病狀態(tài)。文章作者通過非靶代謝組學(xué)對青蟹適應(yīng)鹽度急性下降過程中的代謝變化進行了研究,利用GC-MS和LC-MS數(shù)據(jù)聯(lián)合分析了青蟹應(yīng)對鹽度急性下降情況的主要代謝途徑。研究結(jié)果表明,在急性低鹽脅迫下,青蟹通過甘油磷脂代謝物調(diào)節(jié)生物膜的結(jié)構(gòu)發(fā)生變化,然后通過ABCs轉(zhuǎn)運蛋白運輸氨基酸和碳水化合物,實現(xiàn)細胞內(nèi)外的滲透平衡。此項研究體現(xiàn)了組學(xué)技術(shù)在機制研究中的重要作用。王春琳課題組深耕青蟹研究,近些年來探索青蟹對環(huán)境的適應(yīng)變化也在各大期刊上發(fā)表:項目文章|iTRAQ蛋白組學(xué)助力寧波大學(xué)越冬期間擬穴青蟹代謝變化研究項目文章|兩篇背靠背,王春琳、王歡課題組揭示擬穴青蟹適應(yīng)鹽度驟降的代謝機理代謝組學(xué)一個樣本多少錢?代謝組學(xué)可信耐服務(wù)公司。上海植物代謝組學(xué)研究進展

GC-MS非靶向代謝組學(xué)yan'j2021年11月,上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬新華醫(yī)院馮麗萍教授課題組在Science of the Total Environment期刊發(fā)表了題為“Transcriptomics integrated with metabolomics reveals the effect of  Bisphenol F (BPF) exposure on intestinal inflflammation ”的研究成果,通過GC-MS非靶向代謝組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法,發(fā)現(xiàn)了BPF暴露的腸道毒性的特征,探究了可能的發(fā)病機理。

中文標(biāo)題:轉(zhuǎn)錄組學(xué)結(jié)合代謝組學(xué)揭示了雙酚F(BPF)暴露對腸道炎癥的影響研究對象:人結(jié)腸粘膜上皮細胞系(NCM460)發(fā)表期刊:ScienceoftheTotalEnvironment影響因子:7.963發(fā)表時間:2021年11月合作單位:上海交通大學(xué)附屬新華醫(yī)院運用生物技術(shù):GC-MS非靶向代謝組學(xué)(由鹿明生物提供技術(shù)支持)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、qRT-PCR 浙江代謝組學(xué)代謝通路非靶向代謝組學(xué) 土壤非靶向代謝組學(xué) 脂質(zhì)組學(xué)研究。

GC-MS非靶向代謝組:隨著納米材料的產(chǎn)業(yè)化,各種形式的納米材料將以不同途徑進入人們的生活,納米材料的生物安全性問題正受到世界各國科學(xué)家的***關(guān)注,本篇為2020年2月,南京大學(xué)環(huán)境學(xué)院課題組在Environmental Science & Technology雜志(IF=9.028)發(fā)表題為“Silver Nanoparticles Alter Soil Microbial Community Compositions and Metabolite Profiles in Unplanted and Cucumber-planted Soil”的研究論文。該研究運用16S rRNA基因測序、GC-MS非靶向代謝組技術(shù)對土壤微生物組和代謝組學(xué)分析技術(shù)的獨特結(jié)合,提供了對AgNPs生態(tài)影響的全新視角,***了解了AgNPs暴露對土壤微生物的影響。標(biāo)題:銀納米顆粒改變種植和未種植黃瓜土壤中的微生物群落組成和代謝物譜期刊:EnvironmentalScience&Technology影響因子:9.028發(fā)表時間:2020年2月合作單位:南京大學(xué)環(huán)境學(xué)院運用生物技術(shù):16SrRNA基因測序、GC-MS非靶向代謝組(由鹿明生物提供技術(shù)支持)。

代謝組學(xué)數(shù)據(jù)提供了COVID-19患者各階段循環(huán)代謝物特征的綜合觀點,并確定了葡萄糖代謝和尿素循環(huán)的代謝重編程是COVID-19的潛在病理機制。在****病程的不同階段,靶向宿主代謝可能是一種可行的方法。非靶向代謝組學(xué)分析中,發(fā)現(xiàn)隊列中的樣品共鑒定出2466個代謝物峰,負離子模式631個、正離子模式下的1835個;通過篩選,鑒定出240種代謝物。輕癥組的代謝物與正常組部分重合,而重癥組和恢復(fù)組很容易區(qū)分(圖1B)。240個代謝物中有193個與COVID-19***相關(guān)(圖1C)?;鹕綀D顯示了不同組代謝物與正常組相比上調(diào)下調(diào)的情況(圖1D);與正常組對比,***上調(diào)的代謝物:輕癥組有48個,嚴(yán)重組有59個,恢復(fù)組有64個;***下調(diào)的代謝物:輕癥組有33個,重癥組有29個,恢復(fù)組有34個。使用靶向代謝組學(xué)分析;首先根據(jù)發(fā)現(xiàn)隊列中59名受試者的血清代謝物(4個樣本因體積小而被排除);定量到了199種代謝物。根據(jù)不同組的濃度,將199個代謝物分為16個簇;然后根據(jù)恢復(fù)組的代謝物是否恢復(fù)到正常水平將這些簇分為三組。代謝組學(xué)-對生物體內(nèi)所有代謝物進行定量分析。

代謝組學(xué)研究:浙江省農(nóng)科院農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量營養(yǎng)所風(fēng)險評估研究團隊聯(lián)合浙江工業(yè)大學(xué)在農(nóng)藥聯(lián)合暴露效應(yīng)機制研究中取得新進展,作者:楊桂玲,王彥華,李健,王豆,鮑志偉,王強(通訊作者),靳遠詳(共同通訊作者),在Journal of Hazardous Materials期刊發(fā)表了題為“Health risks of chlorothalonil, carbendazim, prochloraz, their binary and ternary mixtures on embryonic and larval zebrafish based on metabolomics analysis”的研究成果,通過代謝組學(xué)+轉(zhuǎn)錄組學(xué)的多組學(xué)整合分析技術(shù)來闡明幾種殺菌劑或其混合物在斑馬魚早期發(fā)育階段的復(fù)雜病理生理和毒性通路。專注代謝組學(xué)研究 歐易生物。上海代謝組學(xué) 價格

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GC-MS非靶向代謝組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法,2021年11月,上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬新華醫(yī)院馮麗萍教授課題組在Science of the Total Environment期刊發(fā)表了題為“Transcriptomics integrated with metabolomics reveals the effect of  Bisphenol F (BPF) exposure on intestinal inflflammation ”的研究成果,通過GC-MS非靶向代謝組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法,發(fā)現(xiàn)了BPF暴露的腸道毒性的特征,探究了可能的發(fā)病機理。中文標(biāo)題:轉(zhuǎn)錄組學(xué)結(jié)合代謝組學(xué)揭示了雙酚F(BPF)暴露對腸道炎癥的影響研究對象:人結(jié)腸粘膜上皮細胞系(NCM460)發(fā)表期刊:ScienceoftheTotalEnvironment影響因子:7.963發(fā)表時間:2021年11月合作單位:上海交通大學(xué)附屬新華醫(yī)院運用生物技術(shù):GC-MS非靶向代謝組學(xué)(由鹿明生物提供技術(shù)支持)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、qRT-PCR上海植物代謝組學(xué)研究進展

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