蛋白組學(xué)技術(shù)是以蛋白質(zhì)組為研究對象,研究細(xì)胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學(xué)。DIA作為一種新的質(zhì)譜數(shù)據(jù)采集方式穩(wěn)定性高,覆蓋度廣的優(yōu)點。DIA蛋白組學(xué)技術(shù)已經(jīng)越來越多的疾病研究中發(fā)揮重大作用。本研究通過DIA蛋白組學(xué)技術(shù)分析了8個SAPHO病人和8個健康人的蛋白表達譜。蛋白表達的相關(guān)性圖顯示組內(nèi)相關(guān)性良好,差異蛋白的PCA圖顯示兩組得到明顯的區(qū)分。蛋白質(zhì)組學(xué)通過研究生物樣本中蛋白質(zhì)組成和變化,從而推動疾病的病理機制研究,為臨床診斷和預(yù)后提供潛在生物標(biāo)志物。蛋白質(zhì)組學(xué)測序 蛋白組學(xué)技術(shù)缺點。山東蛋白組學(xué)結(jié)果怎么分析
iTRAQ標(biāo)記蛋白組學(xué)研究方法:2021年12月歐易/鹿明生物合作客戶甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)孫萬倉教授課題組在Scientific Reports期刊發(fā)表的題為 “iTRAQ-Based Quantitative Proteome Analysis Insights into Cold Stress of Winter Turnip Rapa (Brassica rapa L.) Grown in the Field ”的研究成果,通過iTRAQ標(biāo)記蛋白組學(xué)+轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法,探究了莖尖分生組織的形態(tài)對冬油菜低溫耐受性中的作用。中文標(biāo)題:iTRAQ標(biāo)記蛋白質(zhì)組學(xué)分析揭示了低溫脅迫對田間生長冬油菜的影響研究對象:白菜型冬油菜發(fā)表期刊:ScientificReports影響因子:4.17福建蛋白組學(xué) 數(shù)據(jù)分析蛋白組學(xué)翻譯后修飾篩選,檢測,鑒定,定性,定量。
作者運用iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)對種子發(fā)育過程中蛋白質(zhì)表達的定量比較,同時進行GO和KEGG通路富集分析。結(jié)果表明所有鑒定的蛋白被分為29類,主要涉及翻譯和碳水化合物代謝。并且作者繪制了p值小于0.01的前20條KEGG通路的氣泡圖。在三對比較中,普遍富集的途徑包括脂肪酸降解、苯丙素生物合成和脂肪酸代謝。其中,參與α-亞麻酸代謝的DAPs在S3 vs. S1組和S4 vs. S1組中都非常活躍。為了評估轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組之間的一致性,以及了解轉(zhuǎn)錄后的mRNA在蛋白質(zhì)水平上是如何表現(xiàn)的,作者進行了RNA-seq和iTRAQ分析的聯(lián)合分析。證明DEGs和DAPs參與類黃酮的生物合成和脂肪酸代謝。
蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)分析鑒定出了幾種參與肝葡萄糖脂代謝的蛋白質(zhì)(ACC、FASN、SCD1、CPT1A、GLUT2、GK、GS、G6Pase、PEPCK)。此外,AC顯示出抑制脂肪生成酶(ACC,F(xiàn)ASN和SCD1)表達的趨勢,同時***上調(diào)了GLUT2。與對照組相比,AC***增加了PEPCK的表達,兩種化學(xué)物質(zhì)對G6Pase均無***影響(圖4A)。PRM蛋白靶向驗證測定結(jié)果與蛋白質(zhì)組變化相一致,這進一步證實了蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)中蛋白質(zhì)的表達(圖4B)。轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)聯(lián)合分析結(jié)果顯示AC和AL***改善了線粒體功能。GSEA分析顯示,處理組的氧化磷酸化(OXPHOS)通路***上調(diào),AC組和AL組的富集得分分別為0.826和0.535。修飾蛋白質(zhì)組試-蛋白質(zhì)組學(xué) 解決方案。
蛋白質(zhì)組學(xué)、磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)研究案例:2021年12月30日復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院樊嘉院士、中國科學(xué)院上海藥物研究所周虎研究員、中國科學(xué)院分子細(xì)胞科學(xué)***創(chuàng)新中心高大明研究員、復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院**教授課題組合作在Cancer Cell上發(fā)表題為“Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究論文,通過基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)、微生物組學(xué)研究方法對262例肝內(nèi)膽管*(iCCA)患者的配對**和*旁組織進行了分析,通過繪制肝內(nèi)膽管*的多維分子圖譜為進一步鑒定iCCA的分子發(fā)病機制、分子分型、預(yù)后等提供了寶貴的資源。蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)簡介及應(yīng)用場景。天津蛋白組學(xué) 公司
蛋白組學(xué)研究必看的經(jīng)典綜述。山東蛋白組學(xué)結(jié)果怎么分析
蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法研究案例:2021年10月,中國科學(xué)院上海營養(yǎng)與健康研究所武愛波研究員課題組在Ecotoxicology and Environmental Safety發(fā)表了題為“Mycotoxin deoxynivalenol affects myoblast differentiation via downregulating cytoskeleton and ECM-integrin-FAK-RAC-PAK signaling pathway"的研究成果,通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法,探究了脫氧雪腐鐮刀菌烯醇(DON)對成肌細(xì)胞分化的影響,發(fā)現(xiàn)了DON處理使得細(xì)胞骨架蛋白和細(xì)胞外基質(zhì)蛋白表達下調(diào),并抑制ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信號通路的機理,為食品和飼料污染的防治提供了理論依據(jù)。山東蛋白組學(xué)結(jié)果怎么分析
上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司是以科研服務(wù),科研檢測,學(xué)術(shù)研究,技術(shù)咨詢研發(fā)、生產(chǎn)、銷售、服務(wù)為一體的檢驗檢測服務(wù)。(依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項目,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動,具體經(jīng)營項目以相關(guān)部門批準(zhǔn)文件或許可證件為準(zhǔn))一般項目:生物醫(yī)藥產(chǎn)品、生化產(chǎn)品的研發(fā),醫(yī)藥中間體、化工原料及產(chǎn)品(除危險品化學(xué)品、監(jiān)控化學(xué)品、易制毒化學(xué)品)的研發(fā)、銷售,儀器儀表的銷售,并提供相關(guān)技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù),會務(wù)服務(wù),企業(yè)管理咨詢。企業(yè),公司成立于2009-03-10,地址在聯(lián)航路1188號25幢。至創(chuàng)始至今,公司已經(jīng)頗有規(guī)模。本公司主要從事科研服務(wù),科研檢測,學(xué)術(shù)研究,技術(shù)咨詢領(lǐng)域內(nèi)的科研服務(wù),科研檢測,學(xué)術(shù)研究,技術(shù)咨詢等產(chǎn)品的研究開發(fā)。擁有一支研發(fā)能力強、成果豐碩的技術(shù)隊伍。公司先后與行業(yè)上游與下游企業(yè)建立了長期合作的關(guān)系。歐易生物致力于開拓國內(nèi)市場,與醫(yī)藥健康行業(yè)內(nèi)企業(yè)建立長期穩(wěn)定的伙伴關(guān)系,公司以產(chǎn)品質(zhì)量及良好的售后服務(wù),獲得客戶及業(yè)內(nèi)的一致好評。上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司以先進工藝為基礎(chǔ)、以產(chǎn)品質(zhì)量為根本、以技術(shù)創(chuàng)新為動力,開發(fā)并推出多項具有競爭力的科研服務(wù),科研檢測,學(xué)術(shù)研究,技術(shù)咨詢產(chǎn)品,確保了在科研服務(wù),科研檢測,學(xué)術(shù)研究,技術(shù)咨詢市場的優(yōu)勢。