作者進(jìn)行了綜合分析,將蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)中的***生物標(biāo)志物合并到通路分析中,并確定了半乳糖代謝、戊糖和葡萄糖醛酸鹽相互轉(zhuǎn)化、檸檬酸鹽循環(huán)和**酸代謝這幾種途徑。然后結(jié)合蛋白質(zhì)和代謝標(biāo)志物來預(yù)測DKD狀態(tài)。五種機(jī)器學(xué)習(xí)模型表明,組合模型提高了DKD預(yù)測的準(zhǔn)確性和穩(wěn)定性。圖中展示了RF的結(jié)果。總的來說,組合多組學(xué)標(biāo)志物模型是一種強(qiáng)有力的提高DKD診斷的方法。1.蛋白組學(xué)結(jié)果表明,α2-巨球蛋白、組織蛋白酶D和CD324可作為檢測DKD進(jìn)展的潛在生物標(biāo)志物。2.代謝組學(xué)結(jié)果表明,半乳糖代謝和甘油脂代謝是DKD的主要代謝途徑,此外甘油-3-半乳糖苷可作為預(yù)測DKD的**標(biāo)志物。3.蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)的組合可以提高預(yù)測和診斷DKD的準(zhǔn)確性和穩(wěn)定性。血清綜合組學(xué)的生物標(biāo)志物可用于DKD的預(yù)警和診斷。該研究為優(yōu)化DKD的管理提供了數(shù)據(jù)資源。單細(xì)胞蛋白組學(xué)之質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù) 。安徽蛋白組學(xué)測定樣本價格
iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)技術(shù)研究方法:2021年7月,海南大學(xué)園藝園林學(xué)院吳友根教授課題組等在《Horticulture Research》期刊發(fā)表了題為“Integrative iTRAQ-based proteomic and transcriptomic analysis reveals the accumulation patterns of key metabolites associated with oilquality during seed ripening of Camellia oleifera”的研究成果,通過RNA測序(RNA-seq)和iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)技術(shù)研究方法,發(fā)現(xiàn)了油茶種子成熟過程中與油質(zhì)相關(guān)關(guān)鍵代謝產(chǎn)物的積累模式特征,探究了不同成熟度油茶轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組譜機(jī)理,描繪了海南油茶種子成熟過程的動態(tài)變化圖譜。為該樹種的遺傳改良提供了理論依據(jù)。山東蛋白組學(xué)測序上海蛋白組學(xué)檢測一個樣多少錢。
蛋白組學(xué)技術(shù)是以蛋白質(zhì)組為研究對象,研究細(xì)胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學(xué)。DIA作為一種新的質(zhì)譜數(shù)據(jù)采集方式穩(wěn)定性高,覆蓋度廣的優(yōu)點(diǎn)。DIA蛋白組學(xué)技術(shù)已經(jīng)越來越多的疾病研究中發(fā)揮重大作用。本研究通過DIA蛋白組學(xué)技術(shù)分析了8個SAPHO病人和8個健康人的蛋白表達(dá)譜。蛋白表達(dá)的相關(guān)性圖顯示組內(nèi)相關(guān)性良好,差異蛋白的PCA圖顯示兩組得到明顯的區(qū)分。蛋白質(zhì)組學(xué)通過研究生物樣本中蛋白質(zhì)組成和變化,從而推動疾病的病理機(jī)制研究,為臨床診斷和預(yù)后提供潛在生物標(biāo)志物。
作者通過泛素化蛋白組學(xué)分析鑒定了茶樹作根中的泛素化蛋白質(zhì)。中文標(biāo)題:氮調(diào)節(jié)茶樹根中茶氨酸和黃酮類化合物的生物合成:多組學(xué)分析揭示的蛋白質(zhì)水平調(diào)節(jié)研究對象:茶樹根發(fā)表期刊:JournalofAgriculturalandFoodChemistry影響因子:5.279發(fā)表時間:2021年9月1日發(fā)表單位:安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)運(yùn)用生物技術(shù):TMT蛋白質(zhì)組學(xué)、泛素化蛋白質(zhì)組學(xué)(其中部分?jǐn)?shù)據(jù)分析由鹿明生物提供技術(shù)支持)。本文分析了氮缺乏下茶樹根部的茶氨酸和黃酮類代謝,通過蛋白質(zhì)組和泛素化蛋白質(zhì)組結(jié)合轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)探索了調(diào)節(jié)機(jī)制。本文的多組學(xué)數(shù)據(jù)整合分析思路值得借鑒。一站式服務(wù),研究不同生物體在不同時刻/狀態(tài)下蛋白質(zhì)表達(dá)的變化。
綜上所述,本研究應(yīng)用RNA-seq轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)合iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),探討油茶種子不同成熟期儲量積累的動態(tài)變化。此外,作者還探討了黃酮類化合物和脂肪酸的生物合成和代謝可能的調(diào)控機(jī)制。許多功能轉(zhuǎn)錄本(16530)和蛋白質(zhì)物種(1228)的模式發(fā)生了***變化,其中317個DAPs被轉(zhuǎn)錄組結(jié)果覆蓋。結(jié)合結(jié)構(gòu)基因(蛋白)或轉(zhuǎn)錄因子的表達(dá)譜及相應(yīng)化合物的含量,對重要代謝產(chǎn)物的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行了探討。結(jié)果表明,黃酮類化合物的合成能力在種子成熟過程中逐漸減弱,而脂肪酸的合成能力則先升高后下降。蛋白質(zhì)組與代謝組聯(lián)合分析。安徽蛋白組學(xué)測定樣本價格
蛋白組學(xué)翻譯后修飾篩選,檢測,鑒定,定性,定量。安徽蛋白組學(xué)測定樣本價格
作者運(yùn)用iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)對種子發(fā)育過程中蛋白質(zhì)表達(dá)的定量比較,同時進(jìn)行GO和KEGG通路富集分析。結(jié)果表明所有鑒定的蛋白被分為29類,主要涉及翻譯和碳水化合物代謝。并且作者繪制了p值小于0.01的前20條KEGG通路的氣泡圖。在三對比較中,普遍富集的途徑包括脂肪酸降解、苯丙素生物合成和脂肪酸代謝。其中,參與α-亞麻酸代謝的DAPs在S3 vs. S1組和S4 vs. S1組中都非?;钴S。為了評估轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組之間的一致性,以及了解轉(zhuǎn)錄后的mRNA在蛋白質(zhì)水平上是如何表現(xiàn)的,作者進(jìn)行了RNA-seq和iTRAQ分析的聯(lián)合分析。證明DEGs和DAPs參與類黃酮的生物合成和脂肪酸代謝。安徽蛋白組學(xué)測定樣本價格
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