廣東蛋白組學(xué)和基因組學(xué)的差異

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-08-04

iTRAQ標(biāo)記蛋白組學(xué)研究方法:2021年12月歐易/鹿明生物合作客戶甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)孫萬(wàn)倉(cāng)教授課題組在Scientific Reports期刊發(fā)表的題為 “iTRAQ-Based Quantitative Proteome Analysis Insights into Cold Stress of Winter Turnip Rapa (Brassica rapa L.) Grown in the Field ”的研究成果,通過iTRAQ標(biāo)記蛋白組學(xué)+轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法,探究了莖尖分生組織的形態(tài)對(duì)冬油菜低溫耐受性中的作用。中文標(biāo)題:iTRAQ標(biāo)記蛋白質(zhì)組學(xué)分析揭示了低溫脅迫對(duì)田間生長(zhǎng)冬油菜的影響研究對(duì)象:白菜型冬油菜發(fā)表期刊:ScientificReports影響因子:4.17蛋白組學(xué)研究必看的經(jīng)典綜述。廣東蛋白組學(xué)和基因組學(xué)的差異

采用TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)對(duì)三個(gè)脫水特殊階段(21、27和40DAP)的新鮮蓮種胎進(jìn)行了蛋白質(zhì)組學(xué)分析,共鑒定了5,477個(gè)蛋白質(zhì)。對(duì)測(cè)試樣本進(jìn)行了PCA分析,結(jié)果顯示,不同組間樣品具有很好的區(qū)分,每組的三個(gè)重復(fù)樣本被聚集在一起。PCA的前兩個(gè)成分占總方差的70%以上(圖2A)。三個(gè)試驗(yàn)組之間共有815個(gè)差異表達(dá)蛋白。其中,198個(gè)(32%)和198個(gè)(26%)蛋白質(zhì)豐度增加,而420個(gè)(68%)和558個(gè)(74%)蛋白質(zhì)豐度在27DAP和40DAP組分別下降(圖2B)。只有30個(gè)蛋白質(zhì)的豐度在27DAP和40DAP組之間具有***變化(圖2C)。福建做蛋白組學(xué)多少錢一站式服務(wù),研究不同生物體在不同時(shí)刻/狀態(tài)下蛋白質(zhì)表達(dá)的變化。

運(yùn)用生物技術(shù):磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)(歐易鹿明提供):2022年1月,***醫(yī)學(xué)研究院生物工程研究所鐘輝研究員、魏從文副研究員和秦成峰研究員,廣西醫(yī)科大學(xué)附屬**醫(yī)院吳飛翔教授等為共同通訊作(一作:萬(wàn)祿明、鄧永強(qiáng)、柯躍華、麻恩浩、楊歡、林浩天)在Nature Metabolism期刊發(fā)表的題為“GP73 is a glucogenic hormone contributing to SARS-CoV-2-induced hyperglycemia”的研究成果,通過磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)、LC-MS靶向代謝組學(xué)等研究方法,發(fā)現(xiàn)了一個(gè)全新的糖異生調(diào)控***——GP73,***會(huì)誘導(dǎo)GP73的產(chǎn)生和分泌,從而導(dǎo)致過度的糖異生。

作者進(jìn)行了綜合分析,將蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)中的***生物標(biāo)志物合并到通路分析中,并確定了半乳糖代謝、戊糖和葡萄糖醛酸鹽相互轉(zhuǎn)化、檸檬酸鹽循環(huán)和**酸代謝這幾種途徑。然后結(jié)合蛋白質(zhì)和代謝標(biāo)志物來(lái)預(yù)測(cè)DKD狀態(tài)。五種機(jī)器學(xué)習(xí)模型表明,組合模型提高了DKD預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確性和穩(wěn)定性。圖中展示了RF的結(jié)果??偟膩?lái)說(shuō),組合多組學(xué)標(biāo)志物模型是一種強(qiáng)有力的提高DKD診斷的方法。1.蛋白組學(xué)結(jié)果表明,α2-巨球蛋白、組織蛋白酶D和CD324可作為檢測(cè)DKD進(jìn)展的潛在生物標(biāo)志物。2.代謝組學(xué)結(jié)果表明,半乳糖代謝和甘油脂代謝是DKD的主要代謝途徑,此外甘油-3-半乳糖苷可作為預(yù)測(cè)DKD的**標(biāo)志物。3.蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)的組合可以提高預(yù)測(cè)和診斷DKD的準(zhǔn)確性和穩(wěn)定性。血清綜合組學(xué)的生物標(biāo)志物可用于DKD的預(yù)警和診斷。該研究為優(yōu)化DKD的管理提供了數(shù)據(jù)資源。蛋白組學(xué)技術(shù)對(duì)腎錯(cuò)構(gòu)瘤尿液差異蛋白的研究。

蛋白質(zhì)是生命活動(dòng)的主要執(zhí)行者,而蛋白質(zhì)磷酸化修飾是生物體內(nèi)**重要的共價(jià)修飾方式之一,真核生物體內(nèi)有超過三分之一的蛋白可以發(fā)生磷酸化修飾。蛋白質(zhì)的磷酸化和去磷酸化這一可逆過程調(diào)節(jié)著包括細(xì)胞增殖、發(fā)育、分化、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞凋亡、神經(jīng)活動(dòng)、肌肉收縮及**發(fā)生等過程在內(nèi)的所有生命活動(dòng)。單一的磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)只能解釋蛋白磷酸化水平發(fā)生的變化,而[黃金搭檔]——蛋白質(zhì)組與磷酸化蛋白質(zhì)組聯(lián)合分析,則在揭示疾病相關(guān)特性、篩選疾病生物標(biāo)志物、尋找藥物靶點(diǎn)等方面發(fā)揮了更加重要的作用。單細(xì)胞蛋白組學(xué)之質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù) 。安徽定量蛋白組學(xué)價(jià)格

蛋白質(zhì)組學(xué)測(cè)序 蛋白組學(xué)技術(shù)缺點(diǎn)。廣東蛋白組學(xué)和基因組學(xué)的差異

本研究通過生理和蛋白質(zhì)組學(xué)分析在冬油菜中鑒定了大量的冷脅迫響應(yīng)蛋白。探討了冬油菜耐凍性增強(qiáng)的機(jī)理和低溫脅迫對(duì)冬油菜形態(tài)和生理生化變化的影響。文章以耐凍型Longyou 7和冷敏感型Lenox為材料,通過iTRAQ標(biāo)記蛋白組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析,揭示了谷胱甘肽轉(zhuǎn)移酶活性、碳水化合物結(jié)合和谷胱甘肽結(jié)合、代謝過程及IAA反應(yīng)與冷應(yīng)激反應(yīng)密切相關(guān),鑒定出了Longyou 7和Lenox之間的DAPs,這些DAPs參與氨基酸、碳水化合物、脂質(zhì)和能量代謝,對(duì)提高冬油菜的耐凍性發(fā)揮了重要作用。廣東蛋白組學(xué)和基因組學(xué)的差異

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