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2021年10月,中國科學院上海營養(yǎng)與健康研究所武愛波研究員課題組在《Ecotoxicology and Environmental Safety》(IF:6.291)發(fā)表了題為“Mycotoxin deoxynivalenol affects myoblast differentiation via downregulating cytoskeleton and ECM-integrin-FAK-RAC-PAK signaling pathway"的研究成果,通過轉(zhuǎn)錄組學和蛋白質(zhì)組學研究方法,探究了脫氧雪腐鐮刀菌烯醇(簡稱:DON,俗稱嘔吐***)對成肌細胞分化的影響,發(fā)現(xiàn)了DON處理使得細胞骨架蛋白和細胞外基質(zhì)蛋白表達下調(diào),并抑制ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信號通路的機理,為食品和飼料污染的防治提供了理論依據(jù)。其中轉(zhuǎn)錄組學和蛋白組學由歐易/鹿明生物提供技術支持。蛋白驗證新技術-PRM,平行反應監(jiān)視蛋白組學。吉林蛋白組學檢測一次多少錢
蛋白質(zhì)組定量到了10,529種蛋白質(zhì),磷酸化蛋白質(zhì)組定量到了來自9,832個磷酸化蛋白的62,879個磷酸化位點。基因組確定了包括TP53、KRAS、FGFR2、IDH1/2、BAP1、ARID1A和PBRM1在內(nèi)的16個***改變的**驅(qū)動基因(圖1A)。與西方iCCA人群隊列相比,本文隊列顯示出更高的KRAS突變頻率和更低的IDH1、ARID1A和TERT突變頻率(圖1B)。在FU-iCCA隊列中觀察到黃曲霉***和馬兜鈴酸特征(圖1C)。通過比較具有或不具有黃曲霉***特征的所有**的多組學數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)具有黃曲霉***特征的**顯示出DNA修復和細胞周期通路的上調(diào)以及細胞凋亡、***炎癥和免疫通路的下調(diào)(圖1E)。進一步分析顯示,TP53突變與黃曲霉***特征***相關(圖1F和1G)。山東蛋白組學 差異表達分析歐易生物鹿明生物蛋白組學聯(lián)合分析。
蛋白組學技術是以蛋白質(zhì)組為研究對象,研究細胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學。DIA作為一種新的質(zhì)譜數(shù)據(jù)采集方式穩(wěn)定性高,覆蓋度廣的優(yōu)點。DIA蛋白組學技術已經(jīng)越來越多的疾病研究中發(fā)揮重大作用。本研究通過DIA蛋白組學技術分析了8個SAPHO病人和8個健康人的蛋白表達譜。蛋白表達的相關性圖顯示組內(nèi)相關性良好,差異蛋白的PCA圖顯示兩組得到明顯的區(qū)分。蛋白質(zhì)組學通過研究生物樣本中蛋白質(zhì)組成和變化,從而推動疾病的病理機制研究,為臨床診斷和預后提供潛在生物標志物。
蛋白質(zhì)組學研究方法研究案例:2021年10月,中國科學院上海營養(yǎng)與健康研究所武愛波研究員課題組在Ecotoxicology and Environmental Safety發(fā)表了題為“Mycotoxin deoxynivalenol affects myoblast differentiation via downregulating cytoskeleton and ECM-integrin-FAK-RAC-PAK signaling pathway"的研究成果,通過轉(zhuǎn)錄組學和蛋白質(zhì)組學研究方法,探究了脫氧雪腐鐮刀菌烯醇(DON)對成肌細胞分化的影響,發(fā)現(xiàn)了DON處理使得細胞骨架蛋白和細胞外基質(zhì)蛋白表達下調(diào),并抑制ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信號通路的機理,為食品和飼料污染的防治提供了理論依據(jù)。歐易鹿明生物蛋白質(zhì)研究技術。
隨著美國臨床蛋白質(zhì)組**分析項目(CPTAC)和中國人類蛋白質(zhì)組計劃(CNHPP)等大型蛋白質(zhì)組學研究計劃的推進,發(fā)表了一系列**的大規(guī)模人群多組學分析文章[2,3]。這些高分文章通過基因組學、轉(zhuǎn)錄組學、蛋白質(zhì)組學、磷酸化蛋白質(zhì)組學、代謝組學、微生物組學等技術,在上百例的病例樣本中***表征了某種**的分子特征。對比這些文章,可以發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)在多組學數(shù)據(jù)分析中逐漸成為**結(jié)果,且蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)分析有些共同特點,即:1)基于蛋白質(zhì)組進行**分子分型2)分析不同亞型患者的臨床特征3)免疫、代謝、突變、微生物等**領域研究熱點在不同亞型中的差別分析4)篩選亞型特征分子作為預后標志物或潛在的藥靶進行驗證或機制研究該文是樊嘉院士/周虎研究員/高大明研究員/**教授團隊繼2019年Cell發(fā)表的肝細胞*多組學研究后,同樣基于蛋白質(zhì)組為**的多組學聯(lián)合分析策略,進一步闡釋了蛋白質(zhì)組學驅(qū)動精細醫(yī)學的優(yōu)勢,為**的發(fā)***展機制、分子分型、預后監(jiān)測和個性化***策略提供新思路。扎根蛋白組學臨床科研基礎研究領域,多年項目服務經(jīng)驗。遼寧蛋白組學和代謝組學
單細胞蛋白組學之質(zhì)譜流式細胞技術。吉林蛋白組學檢測一次多少錢
label-free蛋白定量策略進行蛋白組學的***分析。肺腺*(lungadenocarcinoma,LUAD)是肺*的一種,屬于非小細胞*,早期一般沒有明顯的臨床癥狀,且易發(fā)生轉(zhuǎn)移。肺腺*(LUAD)的基因組研究提高了對該**生物學的理解,加速了靶向***的進程。中國科學家選取了103例未經(jīng)***的中國肺腺*患者的原位肺腺*組織及其相應的*旁組織(NAT)(樣本策略),利用基于質(zhì)譜的label-free蛋白定量策略進行蛋白組學的***分析。從多維度揭示疾病重要分子特征對蛋白質(zhì)組、磷酸化蛋白質(zhì)組、轉(zhuǎn)錄組和全外顯子組測序數(shù)據(jù)的綜合分析揭示了**相關特征,如**相關蛋白變異、特有的蛋白質(zhì)組特征以及早期患者或EGFR和TP53突變患者的臨床結(jié)果。吉林蛋白組學檢測一次多少錢
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