蛋白組學(xué)研究實用案例：東南大學(xué)醫(yī)學(xué)院院長劉必成教授領(lǐng)導(dǎo)的腎臟病研究所在Science advances期刊發(fā)表了題為“Extracellular vesicle–encapsulated IL-10 as novel nanotherapeutics against ischemic AKI"的研究成果，通過蛋白組學(xué)+多層組學(xué)研究方法，建立IL-10細(xì)胞囊泡高表達模型的構(gòu)建，提出并驗證了IL-10細(xì)胞外囊泡的靶向缺血性腎損傷的假說，探究了IL-10細(xì)胞外囊泡作為新型納米藥物的機理。中文標(biāo)題：細(xì)胞外囊泡包裹的IL-10作為抗缺血性急性腎損傷的新型納米療法研究方向：新藥研發(fā)及其機制研究發(fā)表期刊：Scienceadvances影響因子：14.136發(fā)表單位：中國南京東南大學(xué)附屬中大醫(yī)院腎內(nèi)科運用生物技術(shù)：LC-MS/MS蛋白組學(xué)（由鹿明生物提供技術(shù)支持）蛋白質(zhì)組學(xué)生物標(biāo)志物&機制研究一站式服務(wù)。福建定量蛋白組學(xué) 費用
蛋白質(zhì)組定量到了10,529種蛋白質(zhì)，磷酸化蛋白質(zhì)組定量到了來自9,832個磷酸化蛋白的62,879個磷酸化位點?；蚪M確定了包括TP53、KRAS、FGFR2、IDH1/2、BAP1、ARID1A和PBRM1在內(nèi)的16個***改變的**驅(qū)動基因（圖1A）。與西方iCCA人群隊列相比，本文隊列顯示出更高的KRAS突變頻率和更低的IDH1、ARID1A和TERT突變頻率（圖1B）。在FU-iCCA隊列中觀察到黃曲霉***和馬兜鈴酸特征（圖1C）。通過比較具有或不具有黃曲霉***特征的所有**的多組學(xué)數(shù)據(jù)，發(fā)現(xiàn)具有黃曲霉***特征的**顯示出DNA修復(fù)和細(xì)胞周期通路的上調(diào)以及細(xì)胞凋亡、***炎癥和免疫通路的下調(diào)（圖1E）。進一步分析顯示，TP53突變與黃曲霉***特征***相關(guān)（圖1F和1G）。吉林蛋白組學(xué) 生信分析一文了解DIA、TMT/iTRAQ、傳統(tǒng)Label free蛋白組學(xué)區(qū)別在哪。
作者使用通過單細(xì)胞蛋白組學(xué)產(chǎn)生的數(shù)據(jù)來觀察在腎小球細(xì)胞或近端腎小管中***豐富的蛋白質(zhì)細(xì)胞。208個Glom富集區(qū)蛋白富含囊泡中間運輸和細(xì)胞成分組織調(diào)節(jié)作為其**重要的生物學(xué)過程，細(xì)胞骨架蛋白結(jié)合和肌動蛋白結(jié)合是**重要的分子功能，肌動蛋白細(xì)胞骨架是**豐富的細(xì)胞成分。富含247個PT的蛋白質(zhì)主要集中在小分子代謝過程和藥物代謝過程中。在**重要的分子功能中，這些蛋白質(zhì)的氧化還原酶活性和催化活性豐富。*在GLOM切片中發(fā)現(xiàn)的67種蛋白質(zhì)中，有41種已被報導(dǎo)存在于腎臟中，在這41種蛋白質(zhì)中，18種(43.9%)與單細(xì)胞蛋白組學(xué)結(jié)果一致，23種(56.1%)在GLOM中與小管相比沒有增加。
并通過蛋白質(zhì)組學(xué)和時間序列分析在血管生成中發(fā)揮著關(guān)鍵作用（圖3E）。時間序列分析表明，外出刺激后ICAM1表達增加（圖3F）。此外，當(dāng)ICAM1在HBMECs中時，血管形成容量***降低（圖3I/j）。這些結(jié)果表明M-Exos通過增加HBMECs中的ICAM1的表達來調(diào)節(jié)血管生成。蛋白質(zhì)組學(xué)分析發(fā)現(xiàn)的差異表達蛋白與多種神經(jīng)退行性疾病相關(guān)，包括帕金森病、阿爾茨海默病和亨廷頓病(圖6B)。本研究運用蛋白質(zhì)組學(xué)，蛋白質(zhì)印跡，免疫熒光、免疫組化等分析了源自MSCs的外泌體可以使人腦微血管內(nèi)皮細(xì)胞(HBMECs)保持活躍狀態(tài)，有利于血管生成。應(yīng)用PD小鼠模型發(fā)現(xiàn)MSCs的外泌體可以促進PD的恢復(fù)。結(jié)果可以為MSCs衍生的外泌體在PD***方面提供可能性。修飾蛋白質(zhì)組試劑及服務(wù)，蛋白質(zhì)組學(xué)解決方案。
在本研究中，利用iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)方法對東京野茉莉種子發(fā)育的4個時間點采樣進行蛋白質(zhì)組學(xué)分析。獲得了2338個蛋白和1473個DEPs。Mfuzz聚類分析顯示，在種子發(fā)育過程中，轉(zhuǎn)錄本和蛋白質(zhì)組之間存在相當(dāng)大的時序一致性。在四個發(fā)育時期中，花后70天（種子發(fā)育活躍期）是視為東京野茉莉種仁發(fā)育的關(guān)鍵時期：在該階段與脂肪酸生物合成相關(guān)的功能基因和酶蛋白均達到表達峰值，同時種仁內(nèi)部大部分營養(yǎng)物質(zhì)開始迅速積累。通過轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)綜合分析油脂合成的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，乙酰CoA羧化酶和**酸脫氫酶兩個酶體系處于中心位置，在脂肪酸的合成過程中具有主導(dǎo)作用。蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析蛋白質(zhì)組學(xué)三大基本技術(shù)。福建蛋白組學(xué)檢測技術(shù)
蛋白質(zhì)組學(xué)的特點蛋白質(zhì)組和蛋白質(zhì)組學(xué)的概念。福建定量蛋白組學(xué) 費用
3篇經(jīng)典的蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)在水產(chǎn)動物中的研究。水產(chǎn)動物的研究不僅是保障我國海水養(yǎng)殖業(yè)的健康可持續(xù)發(fā)展，同時可為良種創(chuàng)制、海洋環(huán)境研究、生態(tài)研究等提供重要理論基礎(chǔ)和技術(shù)支撐~因此在水產(chǎn)生物研究方面蛋白組學(xué)、代謝組學(xué)在其中起到什么作用呢？期望這3篇經(jīng)典文章能給您思路~中文標(biāo)題：CO2誘導(dǎo)的海洋酸化損害了太平洋牡蠣對金氏弧菌的免疫功能:細(xì)胞和蛋白質(zhì)組學(xué)的綜合研究研究對象：牡蠣發(fā)表期刊：ScienceoftheTotalEnvironment影響因子：6.551合作單位：中國科學(xué)院海岸帶研究所運用歐易/鹿明生物技術(shù)：iTRAQ標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)（由鹿明生物提供技術(shù)支持）福建定量蛋白組學(xué) 費用
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