福建蛋白組學數(shù)據(jù)怎么分析

來源: 發(fā)布時間:2022-08-02

為了更好地了解DON對C2C12細胞分化的影響,作者進行了轉錄組學和蛋白質組學的整合分析。共鑒定了149個共同的***差異基因(co-DEG),其中91%被共下調(圖3A)。15%的co-DEG屬于真核細胞骨架,其中大部分屬于肌動蛋白絲,少數(shù)是中間絲和微管的成分。對co-DEG進行GO分析,生物學過程富集了“骨骼肌肌球蛋白粗絲組裝”和“快肌纖維收縮的正向調節(jié)”條目。細胞組分中富集的**個條目是“纖維蛋白原復合物”、“細胞外空間”、“細胞外基質”、“細胞外區(qū)域”和“蛋白質細胞外基質”,這些都是細胞外成分(圖3B)。結果表明,DON主要影響肌肉成分的組成和功能以及多種細胞外成分的表達。通路富集分析富集到了“ECM-受體相互作用”、“蛋白質消化和吸收”、“人**瘤病毒***”和“粘著斑”等通路。歐易鹿明生物基于質譜技術,生物信息學方法,提供蛋白質組學。福建蛋白組學數(shù)據(jù)怎么分析

本研究采用串聯(lián)質量標簽(TMT)標記的蛋白質組學和平行反應監(jiān)測(PRM)技術,對蓮子脫水過程中的生理調控網(wǎng)絡進行了深入研究表明,碳水化合物代謝(包括糖酵解/糖異成、半乳糖代謝、淀粉和蔗糖代謝、磷酸戊糖途徑和細胞壁組織)、ER中的蛋白質加工、DNA修復和抗氧化事件對蓮種胎脫水有積極的反應。在蓮種胚脫水過程中,非酶促抗氧化劑和戊糖磷酸和維生素E作為主要的抗氧化劑,在脫水過程中維持荷花胚胎的REDOX平衡。這些結果為揭示荷花胚胎脫水保護機制的生理學調控網(wǎng)絡提供了酶途徑在抗氧化保護中起著主要作用。應激生理學檢測表明,H2O2是誘發(fā)氧化應激損傷的主要活性氧(ROS)成分,谷胱甘肽新的見解。吉林蛋白組學英語蛋白質組學ppt 蛋白組學測序一個多少錢。

蛋白質組學技術研究案例:作為一種常見的******,脫氧雪腐鐮刀菌烯醇(DON)在田間或加工和儲存過程中會污染谷物和飼料。DON在動物中會引起厭食和生長遲緩在內(nèi)的一系列不良反應。本文作者使用轉錄組學和蛋白質組學技術對鼠C2C12細胞進行了研究,分析DON對成肌細胞分化的影響。研究結果表明,DON通過下調細胞骨架和ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信號通路來影響成肌細胞的分化。本文研究體現(xiàn)了組學技術在機制研究中的重要作用。中文標題:霉菌***脫氧雪腐鐮刀菌烯醇通過下調細胞骨架和ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信號通路影響成肌細胞分化研究對象:脫氧雪腐鐮刀菌烯醇、C2C12細胞發(fā)表期刊:EcotoxicologyandEnvironmentalSafety影響因子:6.291發(fā)表時間:2021年10月發(fā)表單位:中國科學院上海營養(yǎng)與健康研究所運用生物技術:轉錄組學和蛋白質組學(由歐易/鹿明生物提供技術支持)、免疫熒光、免疫印跡、PCR

作者使用通過單細胞蛋白組學產(chǎn)生的數(shù)據(jù)來觀察在腎小球細胞或近端腎小管中***豐富的蛋白質細胞。208個Glom富集區(qū)蛋白富含囊泡中間運輸和細胞成分組織調節(jié)作為其**重要的生物學過程,細胞骨架蛋白結合和肌動蛋白結合是**重要的分子功能,肌動蛋白細胞骨架是**豐富的細胞成分。富含247個PT的蛋白質主要集中在小分子代謝過程和藥物代謝過程中。在**重要的分子功能中,這些蛋白質的氧化還原酶活性和催化活性豐富。*在GLOM切片中發(fā)現(xiàn)的67種蛋白質中,有41種已被報導存在于腎臟中,在這41種蛋白質中,18種(43.9%)與單細胞蛋白組學結果一致,23種(56.1%)在GLOM中與小管相比沒有增加。靶向蛋白質組學,信號通路蛋白靶點高通量分析。

蛋白質組學研究方法研究案例:2021年10月,中國科學院上海營養(yǎng)與健康研究所武愛波研究員課題組在Ecotoxicology and Environmental Safety發(fā)表了題為“Mycotoxin deoxynivalenol affects myoblast differentiation via downregulating cytoskeleton and ECM-integrin-FAK-RAC-PAK signaling pathway"的研究成果,通過轉錄組學和蛋白質組學研究方法,探究了脫氧雪腐鐮刀菌烯醇(DON)對成肌細胞分化的影響,發(fā)現(xiàn)了DON處理使得細胞骨架蛋白和細胞外基質蛋白表達下調,并抑制ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信號通路的機理,為食品和飼料污染的防治提供了理論依據(jù)。蛋白組學問題解答知乎都做不到哦。廣東蛋白組學定義

單細胞蛋白組學之質譜流式細胞技術。福建蛋白組學數(shù)據(jù)怎么分析

中文標題:肉桂酸和肉桂醛改善肝葡萄糖脂代謝的機制:多組學提供的見解研究對象:小鼠發(fā)表期刊:FrontiersinNutrition影響因子:6.576發(fā)表時間:2022年1月11日合作單位:北京中醫(yī)藥大學健康培養(yǎng)教育部重點實驗室,北京中醫(yī)藥大學健康栽培北京市重點實驗室,北京中醫(yī)藥大學科學技術系運用組學關鍵技術:轉錄組學、DIA蛋白組學、PRM靶向蛋白驗證(皆由歐易/鹿明生物提供技術支持)。目前,改善飲食被認為是**安全有效的***和預防代謝性疾病的方法,其中肉桂(主要是肉桂屬植物八角肉桂和桂皮)及其成分被證明具有多種***作用,包括抗糖尿病、減輕體重、低脂血癥和增強胰島素敏感性。因此,使用膳食補充劑和來自肉桂的化學物質來控制血糖和血脂可能成為***代謝類疾病的新方法。福建蛋白組學數(shù)據(jù)怎么分析

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