遼寧蛋白組學(xué) 數(shù)據(jù)分析

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-07-19

2022年2月,亞特蘭大埃默里大學(xué)醫(yī)學(xué)院的Erik C. B. Johnson課題組在Nature neuroscience發(fā)表了題為 “Large-scale deep multi-layer analysis of Alzheimer’s disease brain reveals strong proteomic disease-related changes not observed at the RNA level”的研究成果,通過(guò)基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)的研究方法,揭示了新的與AD相關(guān)的蛋白共表達(dá)模塊,部分模塊在RNA的網(wǎng)絡(luò)中不存在。這為開(kāi)發(fā)疾病***的潛在靶點(diǎn)提供依據(jù),為臨床的蛋白質(zhì)組研究提供重要價(jià)值。蛋白質(zhì)組與代謝組聯(lián)合分析。遼寧蛋白組學(xué) 數(shù)據(jù)分析

蛋白組學(xué)技術(shù)可以提供細(xì)胞狀態(tài)和調(diào)控的功能信息,本研究建立了單細(xì)胞蛋白組學(xué)方法,實(shí)現(xiàn)了高靈敏度的蛋白組學(xué)檢測(cè)。該技術(shù)有助于揭示疾病的發(fā)病機(jī)制,探討預(yù)后和風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)的不同腎臟疾病亞型中的蛋白組學(xué)異質(zhì)性和獨(dú)特的蛋白標(biāo)志物,為藥物靶點(diǎn)***提供希望。大規(guī)模單細(xì)胞分析對(duì)于捕獲復(fù)雜細(xì)胞系統(tǒng)中的生物異質(zhì)性至關(guān)重要,但*基于RNA技術(shù)的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)并不能很好地**蛋白質(zhì)水平上的變化。而單細(xì)胞蛋白組學(xué)技術(shù)能夠從蛋白質(zhì)水平上破譯細(xì)胞機(jī)制并且獲得更多的信息。遼寧蛋白組學(xué) 數(shù)據(jù)分析蛋白質(zhì)組學(xué)生物標(biāo)志物&機(jī)制研究一站式服務(wù)。

本文為了探究其潛在的分子機(jī)制,作者運(yùn)用RNA測(cè)序(RNA-seq)和iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué),對(duì)不同成熟度水平的油脂種子進(jìn)行了研究。不僅揭示了關(guān)鍵候選基因和蛋白質(zhì)的時(shí)間特異性表達(dá),而且為該樹(shù)種的遺傳改良提供了科學(xué)依據(jù)。中文標(biāo)題:基于iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)聯(lián)合分析揭示油茶種子成熟過(guò)程中油質(zhì)相關(guān)的關(guān)鍵代謝產(chǎn)物的積累研究對(duì)象:油茶種子發(fā)表期刊:HorticultureResearch影響因子:6.793發(fā)表時(shí)間:2021.07.01發(fā)表單位:海南大學(xué)園藝園林學(xué)院運(yùn)用生物技術(shù):RNA測(cè)序(RNA-seq)和iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白組學(xué)文章中iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持

本研究采用串聯(lián)質(zhì)量標(biāo)簽(TMT)標(biāo)記的蛋白質(zhì)組學(xué)和平行反應(yīng)監(jiān)測(cè)(PRM)技術(shù),對(duì)蓮子脫水過(guò)程中的生理調(diào)控網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行了深入研究表明,碳水化合物代謝(包括糖酵解/糖異成、半乳糖代謝、淀粉和蔗糖代謝、磷酸戊糖途徑和細(xì)胞壁組織)、ER中的蛋白質(zhì)加工、DNA修復(fù)和抗氧化事件對(duì)蓮種胎脫水有積極的反應(yīng)。在蓮種胚脫水過(guò)程中,非酶促抗氧化劑和戊糖磷酸和維生素E作為主要的抗氧化劑,在脫水過(guò)程中維持荷花胚胎的REDOX平衡。這些結(jié)果為揭示荷花胚胎脫水保護(hù)機(jī)制的生理學(xué)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)提供了酶途徑在抗氧化保護(hù)中起著主要作用。應(yīng)激生理學(xué)檢測(cè)表明,H2O2是誘發(fā)氧化應(yīng)激損傷的主要活性氧(ROS)成分,谷胱甘肽新的見(jiàn)解。label free蛋白組學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)原理。

作者進(jìn)行了綜合分析,將蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)中的***生物標(biāo)志物合并到通路分析中,并確定了半乳糖代謝、戊糖和葡萄糖醛酸鹽相互轉(zhuǎn)化、檸檬酸鹽循環(huán)和**酸代謝這幾種途徑。然后結(jié)合蛋白質(zhì)和代謝標(biāo)志物來(lái)預(yù)測(cè)DKD狀態(tài)。五種機(jī)器學(xué)習(xí)模型表明,組合模型提高了DKD預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確性和穩(wěn)定性。圖中展示了RF的結(jié)果。總的來(lái)說(shuō),組合多組學(xué)標(biāo)志物模型是一種強(qiáng)有力的提高DKD診斷的方法。1.蛋白組學(xué)結(jié)果表明,α2-巨球蛋白、組織蛋白酶D和CD324可作為檢測(cè)DKD進(jìn)展的潛在生物標(biāo)志物。2.代謝組學(xué)結(jié)果表明,半乳糖代謝和甘油脂代謝是DKD的主要代謝途徑,此外甘油-3-半乳糖苷可作為預(yù)測(cè)DKD的**標(biāo)志物。3.蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)的組合可以提高預(yù)測(cè)和診斷DKD的準(zhǔn)確性和穩(wěn)定性。血清綜合組學(xué)的生物標(biāo)志物可用于DKD的預(yù)警和診斷。該研究為優(yōu)化DKD的管理提供了數(shù)據(jù)資源。修飾蛋白質(zhì)組試-蛋白質(zhì)組學(xué) 解決方案。廣東高通量蛋白組學(xué)

定量蛋白質(zhì)組學(xué) 蛋白質(zhì)進(jìn)行質(zhì)譜檢測(cè)未知蛋白進(jìn)行全檢測(cè)。遼寧蛋白組學(xué) 數(shù)據(jù)分析

單細(xì)胞蛋白組學(xué)研究方法:2020年9月,加州大學(xué)的MinnieM.Sarwal課題組在FrontiersinMedicine發(fā)表的題為“Near-Single-CellProteomicsProfilingoftheProximalTubularandGlomerulusoftheNormalHumanKidney”的研究成果,通過(guò)單細(xì)胞蛋白組學(xué)研究方法,分析正常人近端腎小管和腎小球區(qū)域的腎臟細(xì)胞,研究為解開(kāi)急性和慢性腎臟疾病病因和腎臟亞細(xì)胞功能擾動(dòng)提供依據(jù)。中文標(biāo)題:正常人腎臟近端腎小管和腎小球的單細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究對(duì)象:人體腎臟組織發(fā)表期刊:FrontiersinMedicine影響因子:5.091發(fā)表時(shí)間:2020年9月運(yùn)用重點(diǎn)組學(xué)技術(shù):?jiǎn)渭?xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)遼寧蛋白組學(xué) 數(shù)據(jù)分析

上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司是一家檢驗(yàn)檢測(cè)服務(wù)。(依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,經(jīng)相關(guān)部門(mén)批準(zhǔn)后方可開(kāi)展經(jīng)營(yíng)活動(dòng),具體經(jīng)營(yíng)項(xiàng)目以相關(guān)部門(mén)批準(zhǔn)文件或許可證件為準(zhǔn))一般項(xiàng)目:生物醫(yī)藥產(chǎn)品、生化產(chǎn)品的研發(fā),醫(yī)藥中間體、化工原料及產(chǎn)品(除危險(xiǎn)品化學(xué)品、監(jiān)控化學(xué)品、易制毒化學(xué)品)的研發(fā)、銷(xiāo)售,儀器儀表的銷(xiāo)售,并提供相關(guān)技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù),會(huì)務(wù)服務(wù),企業(yè)管理咨詢。的公司,致力于發(fā)展為創(chuàng)新務(wù)實(shí)、誠(chéng)實(shí)可信的企業(yè)。歐易生物擁有一支經(jīng)驗(yàn)豐富、技術(shù)創(chuàng)新的專(zhuān)業(yè)研發(fā)團(tuán)隊(duì),以高度的專(zhuān)注和執(zhí)著為客戶提供科研服務(wù),科研檢測(cè),學(xué)術(shù)研究,技術(shù)咨詢。歐易生物不斷開(kāi)拓創(chuàng)新,追求出色,以技術(shù)為先導(dǎo),以產(chǎn)品為平臺(tái),以應(yīng)用為重點(diǎn),以服務(wù)為保證,不斷為客戶創(chuàng)造更高價(jià)值,提供更優(yōu)服務(wù)。歐易生物始終關(guān)注自身,在風(fēng)云變化的時(shí)代,對(duì)自身的建設(shè)毫不懈怠,高度的專(zhuān)注與執(zhí)著使歐易生物在行業(yè)的從容而自信。