本文為了探究其潛在的分子機(jī)制，作者運(yùn)用RNA測序（RNA-seq）和iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)，對不同成熟度水平的油脂種子進(jìn)行了研究。不僅揭示了關(guān)鍵候選基因和蛋白質(zhì)的時間特異性表達(dá)，而且為該樹種的遺傳改良提供了科學(xué)依據(jù)。中文標(biāo)題：基于iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)聯(lián)合分析揭示油茶種子成熟過程中油質(zhì)相關(guān)的關(guān)鍵代謝產(chǎn)物的積累研究對象：油茶種子發(fā)表期刊：HorticultureResearch影響因子：6.793發(fā)表時間：2021.07.01發(fā)表單位：海南大學(xué)園藝園林學(xué)院運(yùn)用生物技術(shù)：RNA測序(RNA-seq)和iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白組學(xué)文章中iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持單細(xì)胞蛋白組學(xué)之質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)。上海植物蛋白組學(xué)研究
為了驗證iTRAQ標(biāo)記蛋白組學(xué)分析測定的蛋白積累變化，選擇兩種蛋白進(jìn)行westernblot分析。如圖4A所示，iTRAQ分析中兩種蛋白(RPD3和VMA3)的積累每次均與westernblot數(shù)據(jù)一致。RPD3、TOR1、VMA3和VAC8在基因水平上的相對表達(dá)量與蛋白水平相似，在BF的菌絲中也表達(dá)上調(diào)(圖4B-D)。VAC8在2－1、3－1、4－1組的基因水平上高度上調(diào)。這些結(jié)果表明，這些上調(diào)的表達(dá)蛋白可能是香菇BF形成的重要蛋白。本研究利用標(biāo)記定量(iTRAQ)蛋白質(zhì)組學(xué)、基于氣相色譜-質(zhì)譜的代謝組學(xué)GC-MS非靶向代謝組學(xué)和透射電鏡分析細(xì)胞結(jié)構(gòu)，研究了香菇菌絲后熟轉(zhuǎn)色形成的機(jī)制，并且***證明氧化應(yīng)激和自噬過程是至關(guān)重要，為后續(xù)進(jìn)一步的研究提供了新的見解。上海植物蛋白組學(xué)研究蛋白組學(xué)方案為組學(xué)研究涉及的樣本獲取,前處理,數(shù)據(jù)采集到分析的各個環(huán)節(jié)提供自動化。
通過磷酸化蛋白質(zhì)組定量鑒定了1244個磷酸化蛋白質(zhì)，其中474個（38%）在**組織中***增加，183個（15%）***下降。三種蛋白亞型中磷酸化蛋白組學(xué)的比較結(jié)果揭示了亞型特異性的活性激酶。進(jìn)一步對差異改變的磷酸化位點的研究顯示，在S-I中觀察到參與黏附的底物升高和參與RNA轉(zhuǎn)運(yùn)的底物減少。而基于timsTOF Pro離子淌度4D蛋白質(zhì)組技術(shù)，是對蛋白組學(xué)+磷酸化組學(xué)的雙重升級，可實現(xiàn)快速采集、更高的靈敏度和特異性，**臨床蛋白質(zhì)組學(xué)在定性數(shù)量更多、定量更準(zhǔn)確、位點鑒定更精確、樣本需求量更低、檢測周期更短等性能上***提升，從蛋白質(zhì)表達(dá)和修飾雙重角度更好地發(fā)揮發(fā)掘分子調(diào)控機(jī)制、發(fā)現(xiàn)疾病分子分型以及發(fā)掘生物標(biāo)志物等多重作用。
轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)分析作者通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)分析暴露于DON的C2C12細(xì)胞的差異基因（DEG）。轉(zhuǎn)錄組學(xué)鑒定了2387個DEG，其中72%被下調(diào)。蛋白質(zhì)組學(xué)鑒定出402個DEG，其中74%被下調(diào)。GO和KEGG通路富集分析表明，轉(zhuǎn)錄組學(xué)DEGs參與了“男性主要性征的發(fā)育”、“骨骼肌肌球蛋白粗絲組裝”和“骨骼肌收縮的調(diào)節(jié)”等生物學(xué)過程。**富集的通路是“ECM-受體相互作用”、“人**瘤病毒***”和“蛋白質(zhì)消化吸收”。蛋白質(zhì)組學(xué)分析中，富集到了“肌肉收縮”、“中間絲解聚”和“脂質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)”等生物學(xué)過程。細(xì)胞成分中富集到“細(xì)胞骨架”、“細(xì)胞外基質(zhì)”和“整合素”。KEGG通路富集到“新霉素、卡那霉素和慶大霉素生物合成”、“系統(tǒng)性紅斑狼瘡”、“ECM-受體相互作用”和“蛋白質(zhì)消化和吸收”。前兩條通路與上調(diào)的DEG相關(guān)，而后兩條通路與下調(diào)的DEG相關(guān)，這與轉(zhuǎn)錄組學(xué)結(jié)果一致。蛋白質(zhì)組學(xué)的特點蛋白質(zhì)組和蛋白質(zhì)組學(xué)的概念。
iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)技術(shù)研究方法：2021年7月，海南大學(xué)園藝園林學(xué)院吳友根教授課題組等在《Horticulture Research》期刊發(fā)表了題為“Integrative iTRAQ-based proteomic and transcriptomic analysis reveals the accumulation patterns of key metabolites associated with oilquality during seed ripening of Camellia oleifera”的研究成果，通過RNA測序(RNA-seq)和iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)技術(shù)研究方法，發(fā)現(xiàn)了油茶種子成熟過程中與油質(zhì)相關(guān)關(guān)鍵代謝產(chǎn)物的積累模式特征，探究了不同成熟度油茶轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組譜機(jī)理，描繪了海南油茶種子成熟過程的動態(tài)變化圖譜。為該樹種的遺傳改良提供了理論依據(jù)。蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)簡介及應(yīng)用場景。安徽蛋白組學(xué)在疾病診斷中的應(yīng)用
蛋白質(zhì)組與代謝組聯(lián)合分析。上海植物蛋白組學(xué)研究
通過蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜鑒定、PRM靶向鑒定、iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)等研究方法，發(fā)現(xiàn)了N-豆蔻?；诟闻K**發(fā)生中發(fā)揮重要作用，揭示了NMT1的N-豆蔻酰化抑制抗**發(fā)生的NDP，并通過干擾泛素化來刺激促**發(fā)生的NUP機(jī)制。為靶向N-豆蔻?；蚇MT1可能有助于***肝*提供了理論依據(jù)。中文標(biāo)題：NMT1依賴于POTEE發(fā)生N-豆蔻?；⑼ㄟ^差異調(diào)節(jié)靶標(biāo)的泛素化來刺激肝臟**的發(fā)生研究對象：細(xì)胞、小鼠、人**組織發(fā)表期刊：FrontiersinOncology影響因子：6.244發(fā)表時間：2021年5月合作單位：上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬上海兒童醫(yī)學(xué)中心運(yùn)用生物技術(shù)：iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)、PRM靶向驗證、質(zhì)譜鑒定、qRT-PCR、IHC、WB、IP文章中iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持上海植物蛋白組學(xué)研究
上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司總部位于聯(lián)航路1188號25幢，是一家檢驗檢測服務(wù)。（依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項目，經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動，具體經(jīng)營項目以相關(guān)部門批準(zhǔn)文件或許可證件為準(zhǔn)）一般項目：生物醫(yī)藥產(chǎn)品、生化產(chǎn)品的研發(fā)，醫(yī)藥中間體、化工原料及產(chǎn)品（除危險品化學(xué)品、監(jiān)控化學(xué)品、易制毒化學(xué)品）的研發(fā)、銷售，儀器儀表的銷售，并提供相關(guān)技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù)，會務(wù)服務(wù)，企業(yè)管理咨詢。的公司。歐易生物深耕行業(yè)多年，始終以客戶的需求為向?qū)?，為客戶提?**的科研服務(wù)，科研檢測，學(xué)術(shù)研究，技術(shù)咨詢。歐易生物不斷開拓創(chuàng)新，追求出色，以技術(shù)為先導(dǎo)，以產(chǎn)品為平臺，以應(yīng)用為重點，以服務(wù)為保證，不斷為客戶創(chuàng)造更高價值，提供更優(yōu)服務(wù)。歐易生物始終關(guān)注自身，在風(fēng)云變化的時代，對自身的建設(shè)毫不懈怠，高度的專注與執(zhí)著使歐易生物在行業(yè)的從容而自信。