吉林蛋白組學(xué) 期刊

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-08-03

TMT蛋白質(zhì)組學(xué)探究案例:2021年9月,安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)張照亮教授課題組在Journal of Agricultural and Food Chemistry期刊發(fā)表了題為“Nitrogen-Regulated Theanine and Flavonoid Biosynthesis in Tea Plant Roots: Protein-Level Regulation Revealed by Multiomics Analyses”的研究成果,通過(guò)TMT蛋白質(zhì)組學(xué)和泛素化蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法,發(fā)現(xiàn)了氮缺乏條件下茶樹根部響應(yīng)的差異表達(dá)蛋白和泛素化蛋白質(zhì),為茶氨酸和黃酮類生物合成的調(diào)控提供了新的見(jiàn)解,為茶樹翻譯后修飾調(diào)控次生代謝的研究提供了理論依據(jù)。蛋白質(zhì)組學(xué)測(cè)序 蛋白組學(xué)技術(shù)缺點(diǎn)。吉林蛋白組學(xué) 期刊

運(yùn)用生物技術(shù):磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)(歐易鹿明提供):2022年1月,***醫(yī)學(xué)研究院生物工程研究所鐘輝研究員、魏從文副研究員和秦成峰研究員,廣西醫(yī)科大學(xué)附屬**醫(yī)院吳飛翔教授等為共同通訊作(一作:萬(wàn)祿明、鄧永強(qiáng)、柯躍華、麻恩浩、楊歡、林浩天)在Nature Metabolism期刊發(fā)表的題為“GP73 is a glucogenic hormone contributing to SARS-CoV-2-induced hyperglycemia”的研究成果,通過(guò)磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)、LC-MS靶向代謝組學(xué)等研究方法,發(fā)現(xiàn)了一個(gè)全新的糖異生調(diào)控***——GP73,***會(huì)誘導(dǎo)GP73的產(chǎn)生和分泌,從而導(dǎo)致過(guò)度的糖異生。福建定量蛋白組學(xué)多少錢一次單細(xì)胞組學(xué) 單細(xì)胞蛋白組學(xué) 蛋白質(zhì)組學(xué) 。

在本研究中,利用iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)方法對(duì)東京野茉莉種子發(fā)育的4個(gè)時(shí)間點(diǎn)采樣進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)分析。獲得了2338個(gè)蛋白和1473個(gè)DEPs。Mfuzz聚類分析顯示,在種子發(fā)育過(guò)程中,轉(zhuǎn)錄本和蛋白質(zhì)組之間存在相當(dāng)大的時(shí)序一致性。在四個(gè)發(fā)育時(shí)期中,花后70天(種子發(fā)育活躍期)是視為東京野茉莉種仁發(fā)育的關(guān)鍵時(shí)期:在該階段與脂肪酸生物合成相關(guān)的功能基因和酶蛋白均達(dá)到表達(dá)峰值,同時(shí)種仁內(nèi)部大部分營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)開(kāi)始迅速積累。通過(guò)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)綜合分析油脂合成的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),乙酰CoA羧化酶和**酸脫氫酶兩個(gè)酶體系處于中心位置,在脂肪酸的合成過(guò)程中具有主導(dǎo)作用。

蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)分析鑒定出了幾種參與肝葡萄糖脂代謝的蛋白質(zhì)(ACC、FASN、SCD1、CPT1A、GLUT2、GK、GS、G6Pase、PEPCK)。此外,AC顯示出抑制脂肪生成酶(ACC,F(xiàn)ASN和SCD1)表達(dá)的趨勢(shì),同時(shí)***上調(diào)了GLUT2。與對(duì)照組相比,AC***增加了PEPCK的表達(dá),兩種化學(xué)物質(zhì)對(duì)G6Pase均無(wú)***影響(圖4A)。PRM蛋白靶向驗(yàn)證測(cè)定結(jié)果與蛋白質(zhì)組變化相一致,這進(jìn)一步證實(shí)了蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)中蛋白質(zhì)的表達(dá)(圖4B)。轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)聯(lián)合分析結(jié)果顯示AC和AL***改善了線粒體功能。GSEA分析顯示,處理組的氧化磷酸化(OXPHOS)通路***上調(diào),AC組和AL組的富集得分分別為0.826和0.535。蛋白質(zhì)組學(xué),蛋白質(zhì)組分析,專業(yè)的多組學(xué)聯(lián)合分析。

iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)技術(shù)研究方法:2021年7月,海南大學(xué)園藝園林學(xué)院吳友根教授課題組等在《Horticulture Research》期刊發(fā)表了題為“Integrative iTRAQ-based proteomic and transcriptomic analysis reveals the accumulation patterns of key metabolites associated with oilquality during seed ripening of Camellia oleifera”的研究成果,通過(guò)RNA測(cè)序(RNA-seq)和iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)技術(shù)研究方法,發(fā)現(xiàn)了油茶種子成熟過(guò)程中與油質(zhì)相關(guān)關(guān)鍵代謝產(chǎn)物的積累模式特征,探究了不同成熟度油茶轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組譜機(jī)理,描繪了海南油茶種子成熟過(guò)程的動(dòng)態(tài)變化圖譜。為該樹種的遺傳改良提供了理論依據(jù)。label free蛋白組學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)原理。福建定量蛋白組學(xué)多少錢一次

蛋白組學(xué)研究組織,血液,植物,尿液,動(dòng)物,細(xì)胞樣品,酵母,微生物.。吉林蛋白組學(xué) 期刊

蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法研究案例:2021年10月,中國(guó)科學(xué)院上海營(yíng)養(yǎng)與健康研究所武愛(ài)波研究員課題組在Ecotoxicology and Environmental Safety發(fā)表了題為“Mycotoxin deoxynivalenol affects myoblast differentiation via downregulating cytoskeleton and ECM-integrin-FAK-RAC-PAK signaling pathway"的研究成果,通過(guò)轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法,探究了脫氧雪腐鐮刀菌烯醇(DON)對(duì)成肌細(xì)胞分化的影響,發(fā)現(xiàn)了DON處理使得細(xì)胞骨架蛋白和細(xì)胞外基質(zhì)蛋白表達(dá)下調(diào),并抑制ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信號(hào)通路的機(jī)理,為食品和飼料污染的防治提供了理論依據(jù)。吉林蛋白組學(xué) 期刊

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