TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究案例：2021年12月威爾康奈爾醫(yī)學(xué)中心和紀(jì)念斯隆凱特琳**中心的Linda T. Vahdat 和 Vivek Mittal教授課題組在Nature Communications期刊發(fā)表的題為 “Copper depletion ...

為了更好地了解DON對(duì)C2C12細(xì)胞分化的影響，作者進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的整合分析。共鑒定了149個(gè)共同的***差異基因（co-DEG），其中91%被共下調(diào)（圖3A）。15%的co-DEG屬于真核細(xì)胞骨架，其中大部分屬于肌動(dòng)蛋白絲，少數(shù)是中間絲和微管的成...

蛋白質(zhì)組學(xué)(由鹿明生物提供技術(shù)支持)；2021年8月，中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所趙春華和韓欽課題組在Aging and disease期刊發(fā)表了題為“MSC-derived Exosomes can Enhance the Angiogenesis of H...

空間代謝組學(xué)：中文標(biāo)題：糞便宏基因組和血清代謝組的整合分析揭示腸道微生物組相關(guān)代謝物在結(jié)直腸*和腺瘤檢測(cè)的作用研究對(duì)象：人糞便、血清、組織發(fā)表期刊：Gut影響因子：23.059發(fā)表時(shí)間：2021年8月發(fā)表單位：國家**中心中國醫(yī)學(xué)院科學(xué)院**醫(yī)院運(yùn)用生物技術(shù)：...

4D蛋白質(zhì)組學(xué)分析發(fā)現(xiàn)，不同的病因和疾病的嚴(yán)重程度中蛋白表達(dá)存在差異。嚴(yán)重的疾病同急性期的蛋白的增加，補(bǔ)體系統(tǒng)蛋白及功能相關(guān)的蛋白相關(guān)；通過COVID-19和健康組對(duì)比，發(fā)現(xiàn)了49%的差異分析物；和膿毒癥相比，G-CSF，IL-8等在嚴(yán)重的COVID-19患者...

酵母單雜交篩選技術(shù):關(guān)于HIV想必大家都不陌生，***HIV病毒后潛伏周期長(zhǎng)，且目前沒有完全的***方法。為了徹底***HIV，不讓其發(fā)病就要從2方面入手：要么消除潛伏***的細(xì)胞，要么防止?jié)摲《镜募?xì)胞被***。也就是需要抑制HIV病毒的轉(zhuǎn)錄。但是關(guān)于HI...

結(jié)果表明，原*基因MYC與SERBP蛋白共同調(diào)節(jié)**生長(zhǎng)所必需的脂肪生成，MYC誘導(dǎo)SREBP1，然后二者共同***脂肪酸合成并利用葡萄糖和谷氨酰胺促進(jìn)脂肪鏈的延伸。小鹿推薦通過空間代謝組學(xué)技術(shù)，能夠觀察到MYC誘導(dǎo)后不同**的體內(nèi)脂質(zhì)組學(xué)變化，準(zhǔn)確地繪制MY...

iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)技術(shù)研究方法：2021年7月，海南大學(xué)園藝園林學(xué)院吳友根教授課題組等在《Horticulture Research》期刊發(fā)表了題為“Integrative iTRAQ-based proteomic and transcriptomi...

利用酵母文庫進(jìn)行雙雜交篩選，結(jié)果顯示 MdBT2 可以與 MdRGL3a 結(jié)合。MdRGL3a 編碼 GA 信號(hào)阻遏物 DELLA 蛋白，主要分布于細(xì)胞核中。MdRGL3a 對(duì)于 GA 處理非常敏感，可以引起其發(fā)生降解，PAC 處理可以提高其穩(wěn)定性。進(jìn)一步的酵...

本篇為2021年8月，國家**中心中國醫(yī)學(xué)院科學(xué)院**醫(yī)院崔巍研究員與專業(yè)多組學(xué)技術(shù)團(tuán)隊(duì)合作在醫(yī)學(xué)一區(qū)消化道領(lǐng)域國際期刊《GUT》期刊發(fā)表了題的研究成果，通過非靶向代謝組、靶向代謝組以及AFADESI-MSI空間代謝組學(xué)(研究方法，整合了宏基因組的數(shù)據(jù)，發(fā)現(xiàn)了...

DIA蛋白組學(xué)：SAPHO綜合征是一種侵犯皮膚和骨骼的炎癥性疾病，其發(fā)病率低，表現(xiàn)形式多樣，診斷困難。2022年1月，由北京中醫(yī)藥大學(xué)課題組在J Proteomics.期刊發(fā)表的題為“Complement system deregulation in SAPH...

AFADESI-MSI空間代謝組學(xué)：1、已落地執(zhí)行項(xiàng)目100+，其中包括藥物在組織中的分布、多種疾病類型和不同處理手段下組織中代謝物的空間成像檢測(cè)。2、檢測(cè)組織樣本類型20+。高準(zhǔn)性的定性算法通過物質(zhì)表達(dá)空間情況、加和離子及同位素峰表達(dá)強(qiáng)度相似性、同位素表達(dá)空...

酵母文庫實(shí)驗(yàn)本研究鑒定了一個(gè)可以與MdMYB9相互作用的蛋白MdTRB1。實(shí)驗(yàn)表明，MdTRB1可以正向調(diào)節(jié)花青素和原花青素的累積。MdTRB1與MdMYB9結(jié)合可以增強(qiáng)后者對(duì)下游基因的轉(zhuǎn)錄***活性。而MdTRB1與MdJAZ1的結(jié)合，可以干擾其與MdMYB...

進(jìn)行了酵母雙雜交文庫的篩選，結(jié)果顯示鈣依賴的種子特異性蛋白激酶SPK可以與OsNF-YB9相互作用，分段截取互作驗(yàn)證顯示OsNF-YB9的N端是互作所必須的（圖a-b），并通過雙熒光分子互補(bǔ)實(shí)驗(yàn)、BiFC、體外GST-pulldown實(shí)驗(yàn)得以證實(shí)（圖c-e）。...

酵母雙雜交表明擬南芥AtBT2蛋白可以與AtRGA互作。與對(duì)照相比，擬南芥bt1/2雙突變體幼苗高度降低，而硝酸鹽處理可以進(jìn)一步抑制其生長(zhǎng)，外源施加GA可以回復(fù)其生長(zhǎng)缺陷。在擬南芥中異源表達(dá)MdBT2可以明顯提高植株高度，而PAC處理則會(huì)抑制這種生長(zhǎng)的促進(jìn)作用...

空間代謝組學(xué)：在大鼠腦繪制特定區(qū)域分布的極性代謝物圖譜使用AFADESI-MSI在正離子和負(fù)離子模式下分別獲得298個(gè)和372個(gè)微區(qū)輪廓清晰的代謝物離子圖像。使用精確分子量并結(jié)合同位素豐度，通過人類代謝組數(shù)據(jù)庫（HMDB）對(duì)離子圖像進(jìn)行識(shí)別，鑒定出多種內(nèi)源極性...

歐易酵母文庫助力小麥根研究,本研究克隆了小麥的 ERFs 轉(zhuǎn)錄因子家族 1 個(gè)成員 TaSRL1，它可以調(diào)控生長(zhǎng)素生物合成、轉(zhuǎn)運(yùn)和信號(hào)轉(zhuǎn)到相關(guān)基因的表達(dá)，并與生長(zhǎng)素轉(zhuǎn)運(yùn)基因 TaPIN2 啟動(dòng)子序列結(jié)合促進(jìn)其表達(dá)，進(jìn)而抑制根的生長(zhǎng)。此外，TaSRL1 可以與 ...

質(zhì)譜成像（Mass Spectrometry Imaging, MSI）作為一種新型的分子影像技術(shù)，能夠直接從生物組織中獲得大量已知或未知的內(nèi)源性代謝物和外源***物等分子的結(jié)構(gòu)、含量和空間分布信息。相對(duì)于其他成像方法（如熒光成像、放射性標(biāo)記成像等），該技術(shù)無...

酵母文庫：近日，上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物育種栽培研究所儲(chǔ)黃偉副研究員、曹黎明研究員為共同通訊作者，在Plant，Cell&Environment雜志（IF：7.228）在線發(fā)表了題為“Aconservedclathrin-coatedvesiclecomponen...

基于原位測(cè)序的空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)?；谠粶y(cè)序（ISS）的方法通過測(cè)序產(chǎn)生空間轉(zhuǎn)錄組信息，這種方法只依靠連接酶連接兩段DNA—一段已知序列的引物和一個(gè)探針與模板匹配，不匹配的探針就會(huì)被洗掉。2013年開發(fā)的ISS中，每個(gè)探針使用一個(gè)查詢堿基來測(cè)序基因條形碼。FIS...

美國腦計(jì)劃啟動(dòng)的 BICCN 項(xiàng)目，該項(xiàng)目將整合不同類型細(xì)胞的分子、解剖學(xué)和生理學(xué)特性，創(chuàng)建小鼠腦細(xì)胞 3D 參考圖譜，同時(shí)也將基于人類和非人類靈長(zhǎng)類腦組織樣本，繪制腦細(xì)胞參考圖譜 ，其涉及空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)主要包括 MERFISH 和 seqFISH。一些實(shí)現(xiàn)...

單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析的另一應(yīng)用領(lǐng)域是發(fā)現(xiàn)亞細(xì)胞成分的基因表達(dá)譜，例如對(duì)在神經(jīng)元的軸突或樹突部分特異表達(dá)的基因的轉(zhuǎn)錄組的分析，這些基因往往對(duì)細(xì)胞的生物學(xué)功能發(fā)揮著重要作用。但是，鑒于目前的技術(shù)手段，單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序仍然存在覆蓋率低的弊端，導(dǎo)致除mRNA以 外的長(zhǎng)非編...

單細(xì)胞技術(shù)已經(jīng)應(yīng)用于研究機(jī)體各個(gè)***和組織的發(fā)育和疾病機(jī)理。目前大家關(guān)注較多的是單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)，單細(xì)胞層面多組學(xué)，如基因組、表觀組、蛋白組和代謝組等目前還存在一定的瓶頸，未來技術(shù)和設(shè)備的升級(jí)，勢(shì)必會(huì)擴(kuò)大單細(xì)胞技術(shù)的應(yīng)用范圍。單細(xì)胞測(cè)序也是實(shí)現(xiàn)精細(xì)醫(yī)療的重要工...

單細(xì)胞生物學(xué)**近幾年是非常熱門的研究方向。在這一領(lǐng)域中，**前沿的則是單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)。傳統(tǒng)測(cè)序方法一次處理成千上萬個(gè)細(xì)胞，得到的變異水平也是成千上萬個(gè)細(xì)胞的平均后水平。但是，就如同世界上沒有完全相同的兩片樹葉一樣，沒有兩個(gè)細(xì)胞是完全相同的。所以，單細(xì)胞測(cè)序?qū)?..

歐易生物單細(xì)胞測(cè)序近期高分文章不斷，在接下來的幾篇單細(xì)胞文獻(xiàn)解讀軟文里，我們將為大家持續(xù)送上近期合作發(fā)表的單細(xì)胞文獻(xiàn)解讀。本篇文章為大家解讀今年5月由上海交通大學(xué)附屬上海市第一人民醫(yī)院劉堃團(tuán)隊(duì)在Diabetes(IF9.461)期刊發(fā)表的關(guān)于2型糖尿病小鼠...

歐易生物是國內(nèi)早期開展單細(xì)胞測(cè)序分析的公司之一。目前擁有10x Genomics及BD Rhapsody兩個(gè)單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)，以及完整、系統(tǒng)的生物信息學(xué)分析技術(shù)和流程。除了能夠進(jìn)行常規(guī)的scRNA-seq（single-cell RNA sequencing），...

歐易生物是國內(nèi)少數(shù)具備10×Genomics和BD RhapsodyTM單細(xì)胞測(cè)序雙平臺(tái)的機(jī)構(gòu)之一，在醫(yī)學(xué)和農(nóng)林方向提供專業(yè)的單細(xì)胞建庫測(cè)序及分析服務(wù)，包括5’端和3’端基因表達(dá)分析、免疫組庫分析（TCR/BCR）、ATAC分析和表面蛋白分析等。歐易生物單...

（2）基因檢出率低當(dāng)前主流的單細(xì)胞平臺(tái)對(duì)基因的捕獲效率較低，常見的臨床標(biāo)本，可檢測(cè)到的基因中位值在1-5k不等，占總基因數(shù)的10-20%。低豐度的基因往往捕獲不到。 （3）測(cè)序數(shù)據(jù)的高背景單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)的背景噪聲大。單個(gè)細(xì)胞RNA含量很少，擴(kuò)增和捕獲...

單細(xì)胞技術(shù)就是以單個(gè)細(xì)胞為單位，研究單個(gè)細(xì)胞的基因組或轉(zhuǎn)錄組，提供細(xì)胞間變異的高分辨視圖。探索復(fù)雜組織中單個(gè)細(xì)胞的不同生物學(xué)特性，了解細(xì)胞亞群對(duì)環(huán)境因素的反應(yīng)，有助于研究細(xì)胞功能，細(xì)胞分化，增殖和**發(fā)生的機(jī)制。正式由于其在生命科學(xué)研究中的發(fā)揮了重要作用，目...

單細(xì)胞測(cè)序并非**對(duì)一個(gè)細(xì)胞進(jìn)行測(cè)序，而是對(duì)單一細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行捕獲和檢測(cè)，可以理解為單細(xì)胞水平上的測(cè)序，能同時(shí)測(cè)序成千上萬個(gè)細(xì)胞。單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的出現(xiàn)和應(yīng)用，能夠完全反映組織里不同細(xì)胞群體的異質(zhì)性信息，幫助獲得許多嶄新的科研見解，帶領(lǐng)生物學(xué)研究進(jìn)入了一個(gè)新次...