酵母單雜交篩選技術(shù):關(guān)于HIV想必大家都不陌生,***HIV病毒后潛伏周期長,且目前沒有完全的***方法。為了徹底***HIV,不讓其發(fā)病就要從2方面入手:要么消除潛伏***的細(xì)胞,要么防止?jié)摲《镜募?xì)胞被***。也就是需要抑制HIV病毒的轉(zhuǎn)錄。但是關(guān)于HIV在人細(xì)胞中的復(fù)制、轉(zhuǎn)錄和潛伏期調(diào)控的分子網(wǎng)絡(luò)仍不完全確定,所以目前HIV仍不能被**。為了幫助解決這個問題,波士頓大學(xué)的研究者,使用酵母單雜交篩選技術(shù),以HIV-1,HIV-2的LTR(啟動子和增強(qiáng)子)為誘餌,篩選了人的轉(zhuǎn)錄因子文庫(包含1086個人的轉(zhuǎn)錄因子),**終繪制了調(diào)節(jié)HIV-1和HIV-2的轉(zhuǎn)錄網(wǎng)絡(luò)圖譜,結(jié)果發(fā)表在2021年的PNAS雜志上。酵母生長速度快且容易操作的特點酵母文庫。海南歐易生物酵母文庫
通過酵母雙雜交進(jìn)行篩選,結(jié)果顯示 SWC6 可以在藍(lán)光下與 CRY1 相互作用(圖 A-C)。同樣,酵母雙雜交實驗顯示 CRY2 也可以在藍(lán)光下與 SWC6 相互作用(圖 D)。并通過 pull-down、split-LUC、semi-in vivo pull-down、Co-IP 實驗(圖 E-L)證實 CRY1、CRY2 與 SWC6 的結(jié)合是藍(lán)光依賴性的。SWC6 是真核生物中已報道的 SWR1 復(fù)合物亞基,負(fù)責(zé)催化 H2A.Z 在染色質(zhì)上的替換。已報道 SWR1 復(fù)合物中 SWC6 可以與 ARP6 亞基結(jié)合。Pull-down、split-LUC、semi-in vivo pull-down、Co-IP 實驗(圖 A-H)顯示,CRY1、CRY2 可以藍(lán)光依賴性與 ARP6 結(jié)合。海南歐易生物酵母文庫酵母單雙雜交服務(wù)促銷季技術(shù)服務(wù)。
本研究利用水稻轉(zhuǎn)錄因子文庫篩選,繪制了水稻轉(zhuǎn)錄因子和菌根共生相關(guān)基因之間的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。該網(wǎng)絡(luò)受到保守的磷感應(yīng)途徑統(tǒng)一控制,以磷酸鹽饑餓響應(yīng)因子(PHR)為中心。PHRs 是菌根共生所必需的,通過 P1BS 順式作用元件調(diào)控菌根共生相關(guān)基因表達(dá)。高磷條件下,SPX蛋白抑制 OsPHR2 介導(dǎo)的對菌根共生相關(guān)基因表達(dá)的調(diào)控,進(jìn)而抑制菌根共生。過表達(dá) OsPHR2 可以部分拮抗磷介導(dǎo)的對菌根共生的抑制作用。本研究發(fā)現(xiàn),植物直接營養(yǎng)吸收和通過菌根共生的間接營養(yǎng)吸收,都受到相同的磷信號網(wǎng)絡(luò)統(tǒng)一調(diào)控。本研究將有助于高效用磷植株的培育。
酵母雙雜交技術(shù),自創(chuàng)建以來被廣泛應(yīng)用于蛋白互作研究領(lǐng)域,在生命科學(xué)的基礎(chǔ)探秘研究中起著重要作用。然而該技術(shù)設(shè)計初衷,*是斯坦利先生為了完成申請學(xué)校經(jīng)費的目的。該技術(shù)設(shè)計巧妙,它的許多優(yōu)點在設(shè)計之初并未顯現(xiàn),反而在這么多年的高頻使用和進(jìn)一步開發(fā)利用過程中越發(fā)明顯。(引用自MarcVidal&StanleyFields的“Theyeasttwo-hybridassay:stillfindingconnectionsafter25years”):(1)盡管酵母雜交技術(shù)揭示了蛋白質(zhì)結(jié)合位點的詳細(xì)信息,但操作簡單。只需2個質(zhì)粒+1個菌株即可完成,且有不同體系方便選擇。(2)該技術(shù)利用比較好的DNA結(jié)合位點,有效的***結(jié)構(gòu)域和友好的報告基因系統(tǒng),可以放大弱互作的信號。(3)該技術(shù)可用于各種物種的蛋白互作檢測,具有物種普適性,尤其是人類蛋白。(4)衍生技術(shù)具有更***的應(yīng)用,可擴(kuò)展到檢測蛋白質(zhì)與DNA、蛋白質(zhì)與RNA、蛋白質(zhì)與小分子以及其他組合之間的相互作用,甚至可實現(xiàn)將生理相互作用與表型數(shù)據(jù)直接關(guān)聯(lián)。當(dāng)然,做過酵母雜交實驗的小伙伴應(yīng)該都了解,互作結(jié)果的判斷,往往要等酵母生長好幾天才能看出來(當(dāng)然,小歐認(rèn)為這在偉大的科研事業(yè)過程中算不上啥),互作強(qiáng)弱也是主觀判斷性較強(qiáng),存在假陽性。酵母文庫產(chǎn)品線由7個實驗室組成,分別有RNA抽提室,RNA質(zhì)檢室、酵母建庫室、篩庫室等。
歐易酵母文庫助力小麥根長抑制分子機(jī)制研究,近日,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所景蕊蓮研究員、河南農(nóng)業(yè)大學(xué)王翔副教授為共同通訊作者,在 Journal of Experimental Botany 雜志(IF: 6.992)在線發(fā)表了題為“Wheat SHORT ROOT LENGTH 1 gene TaSRL1 regulates root length in an auxin-dependent pathway”的研究論文,報道了小麥 TaSRL1 轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控根長的分子機(jī)制。文章中酵母雙雜交文庫由歐易生物完成。根系是植物從土壤中吸收水分、養(yǎng)分和感知環(huán)境刺激的獨特***。根系結(jié)構(gòu)的優(yōu)化有助于提高植株的抗逆性和產(chǎn)量。ERF(ETHYLENERESPONSIVEFACTOR)是植物特有的轉(zhuǎn)錄因子家族之一,與植物的多種發(fā)育過程和抗逆性有關(guān)。ERFs在擬南芥和水稻根系發(fā)育中的作用已經(jīng)多有報道,但小麥ERFs在根系發(fā)育中的作用尚待研究。酵母文庫技術(shù)服務(wù)歐易生物對每一個結(jié)果負(fù)責(zé)。海南歐易生物酵母文庫
酵母文庫構(gòu)建的目的酵母的做法。海南歐易生物酵母文庫
目前,歐易生物負(fù)責(zé)該水稻轉(zhuǎn)錄因子文庫的維護(hù)和保存工作,并對廣大水稻科研工作者提供轉(zhuǎn)錄因子篩選服務(wù)。如去年歐易生物助力中國科學(xué)院分子植物科學(xué)***創(chuàng)新中心的王二濤老師應(yīng)用該文庫對水稻-叢枝菌根進(jìn)行了深入研究,成功構(gòu)建了水稻-叢枝菌轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò),結(jié)果發(fā)表于《Cell》封面。截至文章發(fā)表,該文庫已收錄了1683個水稻轉(zhuǎn)錄因子,隸屬于54個家族,覆蓋預(yù)測的水稻轉(zhuǎn)錄因子總量的70%。文庫中水稻轉(zhuǎn)錄因子的a基因信息來源于PlantTFDB和KOME數(shù)據(jù)庫。文庫載體使用pGADT7,酵母菌株使用Y187,每一個轉(zhuǎn)錄因子菌株**保存于96孔板中。海南歐易生物酵母文庫
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