安徽蛋白組學(xué) 中藥

來源: 發(fā)布時間:2022-05-27

TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究案例:2021年12月威爾康奈爾醫(yī)學(xué)中心和紀(jì)念斯隆凱特琳**中心的Linda T. Vahdat 和 Vivek Mittal教授課題組在Nature Communications期刊發(fā)表的題為 “Copper depletion modulates mitochondrial oxidative phosphorylation to impair triple negative breast cancer metastasis”的研究成果,通過蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)研究方法,發(fā)現(xiàn)了高度轉(zhuǎn)移性 SOX2/OCT4+ 細(xì)胞的離散亞群表現(xiàn)出細(xì)胞內(nèi)銅水平升高特征,探究了TM 介導(dǎo)的復(fù)合物 IV 失活確定為 SOX2/OCT4+ 細(xì)胞群中的主要代謝缺陷,AMPK/mTORC1 能量傳感器為重要的下游途徑。描繪了銅-代謝-轉(zhuǎn)移軸,為高風(fēng)險三陰性乳腺*患者的下一代治療方法提供了理論依據(jù)。中文標(biāo)題:銅耗竭調(diào)節(jié)線粒體氧化磷酸化以損害三陰性乳腺*轉(zhuǎn)移研究對象:高風(fēng)險三陰性乳腺*(TNBC)發(fā)表期刊:NatureCommunications影響因子:14.919發(fā)表時間:2021年12月合作單位:紀(jì)念斯隆凱特琳**中心,Sandra和EdwardMeyer**中心運用關(guān)鍵生物技術(shù):TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)和靶向代謝組學(xué)蛋白驗證新技術(shù)-PRM,平行反應(yīng)監(jiān)視蛋白組學(xué)。安徽蛋白組學(xué) 中藥

蛋白組學(xué)技術(shù)是以蛋白質(zhì)組為研究對象,研究細(xì)胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學(xué)。DIA作為一種新的質(zhì)譜數(shù)據(jù)采集方式穩(wěn)定性高,覆蓋度廣的優(yōu)點。DIA蛋白組學(xué)技術(shù)已經(jīng)越來越多的疾病研究中發(fā)揮重大作用。本研究通過DIA蛋白組學(xué)技術(shù)分析了8個SAPHO病人和8個健康人的蛋白表達(dá)譜。蛋白表達(dá)的相關(guān)性圖顯示組內(nèi)相關(guān)性良好,差異蛋白的PCA圖顯示兩組得到明顯的區(qū)分。蛋白質(zhì)組學(xué)通過研究生物樣本中蛋白質(zhì)組成和變化,從而推動疾病的病理機制研究,為臨床診斷和預(yù)后提供潛在生物標(biāo)志物。安徽tmt標(biāo)記定量蛋白組學(xué)定量蛋白質(zhì)組學(xué) 蛋白質(zhì)進行質(zhì)譜檢測未知蛋白進行全檢測。

為了更好地了解DON對C2C12細(xì)胞分化的影響,作者進行了轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的整合分析。共鑒定了149個共同的***差異基因(co-DEG),其中91%被共下調(diào)(圖3A)。15%的co-DEG屬于真核細(xì)胞骨架,其中大部分屬于肌動蛋白絲,少數(shù)是中間絲和微管的成分。對co-DEG進行GO分析,生物學(xué)過程富集了“骨骼肌肌球蛋白粗絲組裝”和“快肌纖維收縮的正向調(diào)節(jié)”條目。細(xì)胞組分中富集的**個條目是“纖維蛋白原復(fù)合物”、“細(xì)胞外空間”、“細(xì)胞外基質(zhì)”、“細(xì)胞外區(qū)域”和“蛋白質(zhì)細(xì)胞外基質(zhì)”,這些都是細(xì)胞外成分(圖3B)。結(jié)果表明,DON主要影響肌肉成分的組成和功能以及多種細(xì)胞外成分的表達(dá)。通路富集分析富集到了“ECM-受體相互作用”、“蛋白質(zhì)消化和吸收”、“人**瘤病毒***”和“粘著斑”等通路。

蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法研究案例:2021年10月,中國科學(xué)院上海營養(yǎng)與健康研究所武愛波研究員課題組在Ecotoxicology and Environmental Safety發(fā)表了題為“Mycotoxin deoxynivalenol affects myoblast differentiation via downregulating cytoskeleton and ECM-integrin-FAK-RAC-PAK signaling pathway"的研究成果,通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法,探究了脫氧雪腐鐮刀菌烯醇(DON)對成肌細(xì)胞分化的影響,發(fā)現(xiàn)了DON處理使得細(xì)胞骨架蛋白和細(xì)胞外基質(zhì)蛋白表達(dá)下調(diào),并抑制ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信號通路的機理,為食品和飼料污染的防治提供了理論依據(jù)。蛋白質(zhì)組學(xué) 找歐易生物-生物標(biāo)志物、機制研究一站式服務(wù)。

iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)研究方法:2021年4月,南京林業(yè)大學(xué)喻方圓教授(一作:吳岐奎)課題組在JournaloftheScienceofFoodandAgriculture期刊發(fā)表了題為“ProteomicanalysisofmetabolicmechanismsassociatedwithfattyacidbiosynthesisduringStyraxtonkinensiskerneldevelopment”的研究成果,通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)+iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)研究方法,分析東京野茉莉種子發(fā)育過程中脂肪酸生物合成相關(guān)基因的表達(dá)趨勢,確定油脂積累的主要影響因子并構(gòu)建其調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。為野茉莉?qū)僦参锓N子油用研究和后續(xù)功能分析研究提供了一定的研究基礎(chǔ)。蛋白質(zhì)組與代謝組聯(lián)合分析。福建swath定量蛋白組學(xué)

蛋白組學(xué)近期研究進展的盤點。安徽蛋白組學(xué) 中藥

TMT標(biāo)記定量蛋白組學(xué)研究案例:2021年11月,南京中醫(yī)藥大學(xué)附屬醫(yī)院江蘇省中醫(yī)院單位(一作劉史佳研究員)及其課題組在MolecularMetabolism期刊發(fā)表的題為“Serumintegrativeomicsrevealsthelandscapeofhumandiabetickidneydisease”的研究成果,通過TMT標(biāo)記定量蛋白組學(xué)和GC-MS非靶代謝組學(xué)研究方法,發(fā)現(xiàn)了糖尿病腎?。―KD)特征,篩選了蛋白和代謝組合生物標(biāo)志物。為優(yōu)化糖尿病腎?。―KD)管理提供了豐富且開放訪問的數(shù)據(jù)資源。中文標(biāo)題:血清綜合組學(xué)揭示人類糖尿病腎病情況研究對象:人血清發(fā)表期刊:MolecularMetabolism影響因子:7.422發(fā)表時間:2021年11月1日合作單位:江蘇省中醫(yī)院運用生物技術(shù):TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)、GC-MS非靶向代謝組學(xué)(其中部分工作由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持)、ELISA安徽蛋白組學(xué) 中藥

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