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作者運用iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)對種子發(fā)育過程中蛋白質(zhì)表達的定量比較,同時進行GO和KEGG通路富集分析。結(jié)果表明所有鑒定的蛋白被分為29類,主要涉及翻譯和碳水化合物代謝。并且作者繪制了p值小于0.01的前20條KEGG通路的氣泡圖。在三對比較中,普遍富集的途徑包括脂肪酸降解、苯丙素生物合成和脂肪酸代謝。其中,參與α-亞麻酸代謝的DAPs在S3 vs. S1組和S4 vs. S1組中都非常活躍。為了評估轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組之間的一致性,以及了解轉(zhuǎn)錄后的mRNA在蛋白質(zhì)水平上是如何表現(xiàn)的,作者進行了RNA-seq和iTRAQ分析的聯(lián)合分析。證明DEGs和DAPs參與類黃酮的生物合成和脂肪酸代謝。TMT/iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué) 差異表達蛋白質(zhì)組分析研究。天津蝙蝠蛋白組學(xué)
隨著質(zhì)譜技術(shù)的飛速發(fā)展,特別是離子淌度的引入,增加了一個新的分離維度,將蛋白質(zhì)組研究推進到全新的“4D蛋白質(zhì)組”層面,打破了基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)研究的瓶頸,大幅度的提高掃描速度和檢測靈敏度,帶來蛋白質(zhì)組學(xué)在鑒定深度、檢測周期、定量準(zhǔn)確性等性能的***提升,可以更好的解決大隊列、復(fù)雜體系以及微量樣本的檢測。相比于timsTOF Pro,timsTOF Pro 2 配備了***一代雙TIMS分析器,離子容量可提高三倍。經(jīng)過簡化的離子透鏡比較大限度地提高了離子傳輸效率和靈敏度,為4D-多組學(xué)建立了新的標(biāo)準(zhǔn)。CCS 值的加入讓組學(xué)結(jié)果更精細(xì),也使timsTOF Pro 2成為轉(zhuǎn)化組學(xué)應(yīng)用不可或缺的工具。timsTOF Pro 2 能夠?qū)崿F(xiàn)少量細(xì)胞群或生物穿刺樣本等低樣本量的蛋白組定量分析以及磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)分析,在短梯度下實現(xiàn)蛋白深度覆蓋。安徽蛋白組學(xué) 中藥走近蛋白組學(xué)之蛋白組學(xué)常見問題答疑解惑。
通過蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜鑒定、PRM靶向鑒定、iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)等研究方法,發(fā)現(xiàn)了N-豆蔻?;诟闻K**發(fā)生中發(fā)揮重要作用,揭示了NMT1的N-豆蔻酰化抑制抗**發(fā)生的NDP,并通過干擾泛素化來刺激促**發(fā)生的NUP機制。為靶向N-豆蔻?;蚇MT1可能有助于***肝*提供了理論依據(jù)。中文標(biāo)題:NMT1依賴于POTEE發(fā)生N-豆蔻?;⑼ㄟ^差異調(diào)節(jié)靶標(biāo)的泛素化來刺激肝臟**的發(fā)生研究對象:細(xì)胞、小鼠、人**組織發(fā)表期刊:FrontiersinOncology影響因子:6.244發(fā)表時間:2021年5月合作單位:上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬上海兒童醫(yī)學(xué)中心運用生物技術(shù):iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)、PRM靶向驗證、質(zhì)譜鑒定、qRT-PCR、IHC、WB、IP文章中iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持
使用TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析,與GFP-群體相比,在GFP+細(xì)胞中TM處理后,線粒體復(fù)合物IV的多個亞基被特異性下調(diào),對下調(diào)的蛋白質(zhì)進行基因本體 (GO)分析,顯示參與線粒體電子傳遞鏈 (ETC) 的通路富集。同時作者還分析了從人 LM2 細(xì)胞系中分選的 LM2 GFP+和 GFP- 細(xì)胞,在 TM 處理 48 小時后蛋白組學(xué)分析,揭示了GFP+細(xì)胞優(yōu)先富集,同時揭示了線粒體 ETC 相關(guān)的通路。因此,TM 處理特別影響具有更高細(xì)胞內(nèi)銅水平的 SOX2/OCT4+ 細(xì)胞中的線粒體 ETC 通路。蛋白質(zhì)組學(xué)分析確定了富含線粒體功能的途徑。細(xì)胞色素c氧化酶 (Complex IV) 是一種線粒體金屬酶,是線粒體ETC的終末酶。蛋白質(zhì)組學(xué)ppt 蛋白組學(xué)測序一個多少錢。
定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究:2022年2月,上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所鮑大鵬研究員課題組在《FrontiersinMicrobiology》期刊發(fā)表的題為“OxidativeStressandAutophagyAreImportantProcessesinPostRipenessandBrownFilmFormationinMyceliumofLentinulaedodes”的研究成果,通過iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)、GC-MS非靶向代謝組學(xué)等技術(shù)對香菇菌絲進行定量蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)氧化應(yīng)激和自噬是香菇菌絲后熟轉(zhuǎn)色重要過程,并對其在蛋白質(zhì)組和代謝組水平上的分子機制有了新的認(rèn)識。涉及的歐易/鹿明生物服務(wù)產(chǎn)品:iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)、GC-MS非靶向代謝組學(xué)蛋白組學(xué)方案為組學(xué)研究涉及的樣本獲取,前處理,數(shù)據(jù)采集到分析的各個環(huán)節(jié)提供自動化。上海itraq定量蛋白組學(xué)
單細(xì)胞蛋白組學(xué)之質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)。天津蝙蝠蛋白組學(xué)
隨著美國臨床蛋白質(zhì)組**分析項目(CPTAC)和中國人類蛋白質(zhì)組計劃(CNHPP)等大型蛋白質(zhì)組學(xué)研究計劃的推進,發(fā)表了一系列**的大規(guī)模人群多組學(xué)分析文章[2,3]。這些高分文章通過基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)、微生物組學(xué)等技術(shù),在上百例的病例樣本中***表征了某種**的分子特征。對比這些文章,可以發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)在多組學(xué)數(shù)據(jù)分析中逐漸成為**結(jié)果,且蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)分析有些共同特點,即:1)基于蛋白質(zhì)組進行**分子分型2)分析不同亞型患者的臨床特征3)免疫、代謝、突變、微生物等**領(lǐng)域研究熱點在不同亞型中的差別分析4)篩選亞型特征分子作為預(yù)后標(biāo)志物或潛在的藥靶進行驗證或機制研究該文是樊嘉院士/周虎研究員/高大明研究員/**教授團隊繼2019年Cell發(fā)表的肝細(xì)胞*多組學(xué)研究后,同樣基于蛋白質(zhì)組為**的多組學(xué)聯(lián)合分析策略,進一步闡釋了蛋白質(zhì)組學(xué)驅(qū)動精細(xì)醫(yī)學(xué)的優(yōu)勢,為**的發(fā)***展機制、分子分型、預(yù)后監(jiān)測和個性化***策略提供新思路。天津蝙蝠蛋白組學(xué)
上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司位于聯(lián)航路1188號25幢。公司自成立以來,以質(zhì)量為發(fā)展,讓匠心彌散在每個細(xì)節(jié),公司旗下科研服務(wù),科研檢測,學(xué)術(shù)研究,技術(shù)咨詢深受客戶的喜愛。公司注重以質(zhì)量為中心,以服務(wù)為理念,秉持誠信為本的理念,打造醫(yī)藥健康良好品牌。歐易生物憑借創(chuàng)新的產(chǎn)品、專業(yè)的服務(wù)、眾多的成功案例積累起來的聲譽和口碑,讓企業(yè)發(fā)展再上新高。