基于原位測序的空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)?；谠粶y序（ISS）的方法通過測序產(chǎn)生空間轉(zhuǎn)錄組信息，這種方法只依靠連接酶連接兩段DNA—一段已知序列的引物和一個探針與模板匹配，不匹配的探針就會被洗掉。2013年開發(fā)的ISS中，每個探針使用一個查詢堿基來測序基因條形碼。FISSEQ和后來的EXeq使用了SOLiD，每個探針使用兩個查詢堿基來測序環(huán)化和RCA擴增的cDNAs。在STARmap中，基因條形碼由SEDAL測序，其中還使用了兩個類似固體的查詢堿基來避免錯誤。BARseq還用基因條形碼放大了RCA探針?；贗SS技術(shù)的優(yōu)勢包括：單細胞分辨率、亞細胞轉(zhuǎn)錄物定位和可應用于更大的組織區(qū)域。缺點是：檢測效率較低?？臻g轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果為未來人類心臟發(fā)育的研究提供重要的借鑒意義。山西歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組做什么
來自10X公司的Visium空間基因表達解決方案，提供了分析空間整體轉(zhuǎn)錄組的方法。通過將總mRNA基因表達數(shù)據(jù)與形態(tài)H&E染色的圖像相疊加，利用Visium，研究人員可以從整個組織切片和各種各樣的樣本類型中獲得整個轉(zhuǎn)錄組高通量基因表達分析結(jié)果。該解決方案使研究人員能夠揭示正常和患病組織的生物學結(jié)構(gòu)，并發(fā)現(xiàn)新的組織生物標志物?？臻g轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析的**是根據(jù)每個芯片上每個spot的基因表達信息進行聚類，然后將spot根據(jù)坐標位置序列放回到組織的圖像上，同時可以對每個gene在組織上表達的空間位置進行定位。品質(zhì)空間轉(zhuǎn)錄組價格該類工具的開發(fā)將簡化不同類型空間轉(zhuǎn)錄組學數(shù)據(jù)的整合和分析。
揭示了溫度影響稻瘟病發(fā)生的分子機制。歐易生物在本研究中承擔了空間轉(zhuǎn)錄組測序及分析工作。全球氣溫變暖對植物病害的發(fā)生有很大影響，可能導致其分布和流行發(fā)生變化。但對于溫度如何調(diào)控植物病原***的致病力，宿主植物尤其是作物如何響應溫度變化抵御病原***侵染的機理知之甚少。稻瘟病是由絲狀子囊***Magnaportheoryzae侵染引起的，是水稻**嚴重的病害之一，植物*****病害**。多年田間調(diào)查表明，24-26°C及以下稻瘟病容易流行，但當溫度達到28-30°C及以上時稻瘟病的發(fā)生***減少，但其分子機制尚不清楚。
10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組用于文庫構(gòu)建的每張載玻片上有四個捕獲區(qū)域，每個捕獲區(qū)域的大小為6.5x6.5mm，包含5000個被條形碼標記的點（barcoded spots），每個點的直徑為55 μm，點和點之間中心的距離為100 μm，并且每個點都有一個barcode序列。組織切片的細胞中會釋放出mRNA，遷移到每個spot的mRNA會被標記上相應的barcode序列，然后進行文庫構(gòu)建并進行測序。根據(jù)數(shù)據(jù)的條形碼信息對數(shù)據(jù)進行分析，以確定哪些數(shù)據(jù)來自哪個位置，從而實現(xiàn)空間基因表達的可視化。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項目執(zhí)行經(jīng)驗，致力通過高效的服務，助力各位科研工作者取得新的突破?？臻g轉(zhuǎn)錄組相關(guān)的顯微解剖技術(shù)通常分為兩類：機械和光學。
單細胞空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析可視化平臺 目前， 8種空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)，這些數(shù)據(jù)來自5個物種，包括人類、小鼠、果蠅、秀麗隱桿蟲線和斑馬魚。研究團隊針對這些數(shù)據(jù)集進行了整合中統(tǒng)計描述的轉(zhuǎn)錄組技術(shù)研究團隊從論文中提取了每種技術(shù)的簡要說明和示意圖，并研讀了每個數(shù)據(jù)集的原始論文，提取相應的元數(shù)據(jù)，包括出版信息、數(shù)據(jù)描述、實驗設計、樣本和數(shù)據(jù)可用性等。單細胞空間轉(zhuǎn)錄組于數(shù)據(jù)集中來自不同組織、處理方法的樣本或生物技術(shù)復制品，研究團隊將其手動劃分為305個子數(shù)據(jù)集。所有收集的數(shù)據(jù)集和研究結(jié)果均有文章發(fā)表?？捎糜诳梢暬捅容^空間分辨下的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。該數(shù)據(jù)庫提供的空間差異表達基因及豐富的功能注釋，有助于進一步數(shù)據(jù)分析。組織細胞的空間結(jié)構(gòu)提供了一個資源庫，并為了解疾病中的細胞微環(huán)境帶來新的見解。目前，空間轉(zhuǎn)錄組可從獲得，無需注冊或登錄。人類細胞圖譜計劃的主要目標之一是表征所有細胞類型的空間關(guān)系，同時基于表達特征在空間上映射多種細胞類型可能的相互作用。空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)在進行 HE 染色的同時需要保證獲取組織基因表達信息。江西生物技術(shù)空間轉(zhuǎn)錄組
在未來的5-10年里，空間轉(zhuǎn)錄組學妥妥的是技術(shù)熱點。山西歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組做什么
單細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)的如火如荼，伴隨著空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)的蓬勃發(fā)展，可以看到，在現(xiàn)有的高通量檢測技術(shù)領(lǐng)域，這兩種技術(shù)已為科學研究的發(fā)展提供了前所未有的技術(shù)支撐。從2019年單細胞多組學被評為《Nature Methods》年度技術(shù)進展，到2020年空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)也被評為年度技術(shù)進展，相信在接下來的時間里，單細胞轉(zhuǎn)錄組和空間轉(zhuǎn)錄組將為生命科學的發(fā)展做出極其重要的貢獻。單細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)的特點在于提供詳實的每個細胞的轉(zhuǎn)錄表達信息，但是缺失了來源組織的空間組成信息?，F(xiàn)有商用空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)的特點在于提供了完整的組織空間位置信息，但是每個捕獲spot的信息無法達到單細胞分辨率（10個左右細胞）。因此，這兩個技術(shù)的存在是天然互補的，而將兩者的結(jié)合也是水到渠成，完美結(jié)合。山西歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組做什么
上海歐易生物醫(yī)學科技有限公司總部位于聯(lián)航路1188號25幢，是一家檢驗檢測服務。（依法須經(jīng)批準的項目，經(jīng)相關(guān)部門批準后方可開展經(jīng)營活動，具體經(jīng)營項目以相關(guān)部門批準文件或許可證件為準）一般項目：生物醫(yī)藥產(chǎn)品、生化產(chǎn)品的研發(fā)，醫(yī)藥中間體、化工原料及產(chǎn)品（除危險品化學品、監(jiān)控化學品、易制毒化學品）的研發(fā)、銷售，儀器儀表的銷售，并提供相關(guān)技術(shù)咨詢、技術(shù)服務，會務服務，企業(yè)管理咨詢。的公司。歐易生物擁有一支經(jīng)驗豐富、技術(shù)創(chuàng)新的專業(yè)研發(fā)團隊，以高度的專注和執(zhí)著為客戶提供科研服務，科研檢測，學術(shù)研究，技術(shù)咨詢。歐易生物繼續(xù)堅定不移地走高質(zhì)量發(fā)展道路，既要實現(xiàn)基本面穩(wěn)定增長，又要聚焦關(guān)鍵領(lǐng)域，實現(xiàn)轉(zhuǎn)型再突破。歐易生物始終關(guān)注醫(yī)藥健康行業(yè)。滿足市場需求，提高產(chǎn)品價值，是我們前行的力量。