浙江蛋白組學(xué)數(shù)據(jù)庫

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-05-30

4D蛋白質(zhì)組學(xué)分析發(fā)現(xiàn),不同的病因和疾病的嚴(yán)重程度中蛋白表達(dá)存在差異。嚴(yán)重的疾病同急性期的蛋白的增加,補(bǔ)體系統(tǒng)蛋白及功能相關(guān)的蛋白相關(guān);通過COVID-19和健康組對比,發(fā)現(xiàn)了49%的差異分析物;和膿毒癥相比,G-CSF,IL-8等在嚴(yán)重的COVID-19患者中含量更低;蛋白和臨床相關(guān)性分析則發(fā)現(xiàn)臨床特征和某些蛋白呈強(qiáng)相關(guān)性。本研究通過4D蛋白組學(xué)技術(shù)結(jié)合其他組學(xué)技術(shù)及免疫技術(shù),確定了COVID-19免疫特征和宿主反應(yīng)等相關(guān)因素,并為進(jìn)一步COVID-19的***打下了良好的基礎(chǔ)。蛋白組學(xué)研究組織,血液,植物,尿液,動物,細(xì)胞樣品,酵母,微生物.。浙江蛋白組學(xué)數(shù)據(jù)庫

3篇經(jīng)典的蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)在水產(chǎn)動物中的研究。水產(chǎn)動物的研究不僅是保障我國海水養(yǎng)殖業(yè)的健康可持續(xù)發(fā)展,同時(shí)可為良種創(chuàng)制、海洋環(huán)境研究、生態(tài)研究等提供重要理論基礎(chǔ)和技術(shù)支撐~因此在水產(chǎn)生物研究方面蛋白組學(xué)、代謝組學(xué)在其中起到什么作用呢?期望這3篇經(jīng)典文章能給您思路~中文標(biāo)題:CO2誘導(dǎo)的海洋酸化損害了太平洋牡蠣對金氏弧菌的免疫功能:細(xì)胞和蛋白質(zhì)組學(xué)的綜合研究研究對象:牡蠣發(fā)表期刊:ScienceoftheTotalEnvironment影響因子:6.551合作單位:中國科學(xué)院海岸帶研究所運(yùn)用歐易/鹿明生物技術(shù):iTRAQ標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)(由鹿明生物提供技術(shù)支持)安徽dia蛋白組學(xué)價(jià)格蛋白質(zhì)組學(xué),修飾蛋白質(zhì)組,蛋白·修飾·代謝。

蛋白組學(xué)技術(shù)是以蛋白質(zhì)組為研究對象,研究細(xì)胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學(xué)。DIA作為一種新的質(zhì)譜數(shù)據(jù)采集方式穩(wěn)定性高,覆蓋度廣的優(yōu)點(diǎn)。DIA蛋白組學(xué)技術(shù)已經(jīng)越來越多的疾病研究中發(fā)揮重大作用。本研究通過DIA蛋白組學(xué)技術(shù)分析了8個(gè)SAPHO病人和8個(gè)健康人的蛋白表達(dá)譜。蛋白表達(dá)的相關(guān)性圖顯示組內(nèi)相關(guān)性良好,差異蛋白的PCA圖顯示兩組得到明顯的區(qū)分。蛋白質(zhì)組學(xué)通過研究生物樣本中蛋白質(zhì)組成和變化,從而推動疾病的病理機(jī)制研究,為臨床診斷和預(yù)后提供潛在生物標(biāo)志物。

作者通過泛素化蛋白組學(xué)分析鑒定了茶樹作根中的泛素化蛋白質(zhì)。中文標(biāo)題:氮調(diào)節(jié)茶樹根中茶氨酸和黃酮類化合物的生物合成:多組學(xué)分析揭示的蛋白質(zhì)水平調(diào)節(jié)研究對象:茶樹根發(fā)表期刊:JournalofAgriculturalandFoodChemistry影響因子:5.279發(fā)表時(shí)間:2021年9月1日發(fā)表單位:安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)運(yùn)用生物技術(shù):TMT蛋白質(zhì)組學(xué)、泛素化蛋白質(zhì)組學(xué)(其中部分?jǐn)?shù)據(jù)分析由鹿明生物提供技術(shù)支持)。本文分析了氮缺乏下茶樹根部的茶氨酸和黃酮類代謝,通過蛋白質(zhì)組和泛素化蛋白質(zhì)組結(jié)合轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)探索了調(diào)節(jié)機(jī)制。本文的多組學(xué)數(shù)據(jù)整合分析思路值得借鑒。一站式服務(wù),研究不同生物體在不同時(shí)刻/狀態(tài)下蛋白質(zhì)表達(dá)的變化。

轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)分析作者通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)分析暴露于DON的C2C12細(xì)胞的差異基因(DEG)。轉(zhuǎn)錄組學(xué)鑒定了2387個(gè)DEG,其中72%被下調(diào)。蛋白質(zhì)組學(xué)鑒定出402個(gè)DEG,其中74%被下調(diào)。GO和KEGG通路富集分析表明,轉(zhuǎn)錄組學(xué)DEGs參與了“男性主要性征的發(fā)育”、“骨骼肌肌球蛋白粗絲組裝”和“骨骼肌收縮的調(diào)節(jié)”等生物學(xué)過程。**富集的通路是“ECM-受體相互作用”、“人**瘤病毒***”和“蛋白質(zhì)消化吸收”。蛋白質(zhì)組學(xué)分析中,富集到了“肌肉收縮”、“中間絲解聚”和“脂質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)”等生物學(xué)過程。細(xì)胞成分中富集到“細(xì)胞骨架”、“細(xì)胞外基質(zhì)”和“整合素”。KEGG通路富集到“新霉素、卡那霉素和慶大霉素生物合成”、“系統(tǒng)性紅斑狼瘡”、“ECM-受體相互作用”和“蛋白質(zhì)消化和吸收”。前兩條通路與上調(diào)的DEG相關(guān),而后兩條通路與下調(diào)的DEG相關(guān),這與轉(zhuǎn)錄組學(xué)結(jié)果一致。歐易生物鹿明生物蛋白組學(xué)聯(lián)合分析。福建蛋白組學(xué)代謝組學(xué)關(guān)聯(lián)分析

質(zhì)譜技術(shù),生物信息學(xué)方法,提供蛋白質(zhì)組學(xué) 。浙江蛋白組學(xué)數(shù)據(jù)庫

隨著美國臨床蛋白質(zhì)組**分析項(xiàng)目(CPTAC)和中國人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃(CNHPP)等大型蛋白質(zhì)組學(xué)研究計(jì)劃的推進(jìn),發(fā)表了一系列**的大規(guī)模人群多組學(xué)分析文章[2,3]。這些高分文章通過基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)、微生物組學(xué)等技術(shù),在上百例的病例樣本中***表征了某種**的分子特征。對比這些文章,可以發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)在多組學(xué)數(shù)據(jù)分析中逐漸成為**結(jié)果,且蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)分析有些共同特點(diǎn),即:1)基于蛋白質(zhì)組進(jìn)行**分子分型2)分析不同亞型患者的臨床特征3)免疫、代謝、突變、微生物等**領(lǐng)域研究熱點(diǎn)在不同亞型中的差別分析4)篩選亞型特征分子作為預(yù)后標(biāo)志物或潛在的藥靶進(jìn)行驗(yàn)證或機(jī)制研究該文是樊嘉院士/周虎研究員/高大明研究員/**教授團(tuán)隊(duì)繼2019年Cell發(fā)表的肝細(xì)胞*多組學(xué)研究后,同樣基于蛋白質(zhì)組為**的多組學(xué)聯(lián)合分析策略,進(jìn)一步闡釋了蛋白質(zhì)組學(xué)驅(qū)動精細(xì)醫(yī)學(xué)的優(yōu)勢,為**的發(fā)***展機(jī)制、分子分型、預(yù)后監(jiān)測和個(gè)性化***策略提供新思路。浙江蛋白組學(xué)數(shù)據(jù)庫

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