生工CHIP-Seq，項(xiàng)目介紹：CHIP-SEQ 技術(shù)，即染色質(zhì)免疫共沉淀與高通量測(cè)序相結(jié)合的技術(shù)。它是研究體內(nèi)蛋白質(zhì)與DNA 相互作用的有力工具，還可以用來研究轉(zhuǎn)錄因子與基因表達(dá)的關(guān)系。通過高通量測(cè)序，可以一次性得到目的蛋白在整個(gè)基因組上的結(jié)合分布，得到目的蛋白精確的結(jié)合位點(diǎn)以及結(jié)合基序等信息。ChIP-Seq 的原理：首先通過染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)(ChIP）特異性地富集目的蛋白結(jié)合的DNA 的所屬片段，并對(duì)其進(jìn)行純化與文庫構(gòu)建；然后對(duì)富集得到的DNA的片段進(jìn)行高通量測(cè)序，將獲得的數(shù)百萬條序列標(biāo)簽精確定位到基因組上，從而獲得全基因組范圍內(nèi)與組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等互作的DNA 區(qū)段信息。Illum...

IlluminaHiSeq2500/4000可以運(yùn)行PE150/PE250模式，可以承擔(dān)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、人基因組重測(cè)序、外顯子捕獲測(cè)序、宏基因組測(cè)序、微生物分類測(cè)序等服務(wù)；IlluminaMiSeq運(yùn)行PE300模式，可以承擔(dān)細(xì)菌基因組重測(cè)序/Denovo測(cè)序、微生物分類測(cè)序、擴(kuò)增子測(cè)序、核酸適配體測(cè)序等服務(wù)；LifeIontorrentPGM運(yùn)行314、316、318芯片，可以承接擴(kuò)增子測(cè)序、靶區(qū)域測(cè)序、基因組重測(cè)序服務(wù)；PacBioSequel/RSII該測(cè)序平臺(tái)讀長(zhǎng)超長(zhǎng)，平均可達(dá)10kb以上，主要承接細(xì)菌基因組完成圖測(cè)序、***基因組精細(xì)圖測(cè)序、全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄本測(cè)序等服務(wù)；小RNA測(cè)測(cè)序不可采用常...

擴(kuò)增子測(cè)序，項(xiàng)目介紹：隨著基因編輯技術(shù)（尤其是CRISPR-cas9技術(shù)）的發(fā)展，科研人員使用傳統(tǒng)的Sanger測(cè)序技術(shù)無法快速有效鑒定基因編輯效率。但是，通過對(duì)靶基因區(qū)域附近設(shè)計(jì)引物，進(jìn)行PCR擴(kuò)增，并對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行高通量測(cè)序，可以快速高效的獲得目標(biāo)區(qū)域的突變頻率信息，尤其是對(duì)低頻突變的檢測(cè)效果遠(yuǎn)遠(yuǎn)優(yōu)于一代測(cè)序，性價(jià)比極高。16S全長(zhǎng)分類測(cè)序，項(xiàng)目介紹：16S全長(zhǎng)測(cè)序分析主要是對(duì) 16S rRNA基因全長(zhǎng)進(jìn)行擴(kuò)增，基于PacBio 測(cè)序平臺(tái)測(cè)序. 相比較二代測(cè)序只選擇 1-2 個(gè)高變區(qū)進(jìn)行測(cè)序，三代可以獲得全長(zhǎng)的 16S 序列，更多變異區(qū)信息可以提高物種鑒定的分辨率，還可以提高對(duì)于群落組成...

RNA樣品：1.請(qǐng)務(wù)必提供每個(gè)樣品具體的濃度、體積、制備時(shí)間以及物種來源。比較好附上電泳膠圖或者 Agilent Bioanalyzer 儀器檢測(cè)數(shù)據(jù)等；2.對(duì)于普通轉(zhuǎn)錄組樣品，請(qǐng)?zhí)峁舛取?00 ng/μl、總量≥2 μg 的總 RNA 樣品，樣品請(qǐng)去蛋白并進(jìn)行 DNase處理；一般情況下，普通轉(zhuǎn)錄組測(cè)序需要 RNA 樣品的 OD260/OD280為 2.0~2.2，Agilent Bioanalyzer 2100 器檢測(cè)獲得的總RNA 28S:18S≥1，RIN≥8；對(duì)于全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序樣品（ISO-seq）,請(qǐng)?zhí)峁舛却笥?00 ng/ul，總量大于5 μg的總RNA樣品。樣品請(qǐng)去蛋白并進(jìn)...

微生物基因組重測(cè)序（有參）：目前越來越多的微生物基因組被解析出來了。從而使得科研工作者們可以對(duì)某些物種微生物進(jìn)行進(jìn)行物種進(jìn)化、種群特征、選擇壓力等研究。利用高通量測(cè)序技術(shù)，對(duì)有參考基因組微生物進(jìn)行多個(gè)體的基因組重測(cè)序，精細(xì)分析其與參考基因組的SNP、InDel、SV等變異信息。微生物基因組從頭測(cè)序（無參）：對(duì)于不斷分離培養(yǎng)微生物的客戶來說，要確定一個(gè)菌株是否是新菌株或者新菌種，較快捷的辦法就是，直接進(jìn)行基因組測(cè)序。利用高通量測(cè)序技術(shù)，對(duì)這些基因組進(jìn)行高深度測(cè)序，然后進(jìn)行基因組組裝，獲得基因組的框架圖或者精細(xì)圖甚至是完成圖。從而可以快速解析其基因組結(jié)構(gòu)、基因功能、進(jìn)化關(guān)系。生物信息分析經(jīng)驗(yàn)豐富，...

生工高通量測(cè)序樣品要求，RNA樣品：請(qǐng)?zhí)峁舛取?50 ng/μl、總量≥2μg的總RNA樣品，樣品請(qǐng)去蛋白并進(jìn)行DNase處理;請(qǐng)務(wù)必提供每個(gè)樣品具體的濃度、體積、制備時(shí)間以及物種來源。比較好附上QC數(shù)據(jù)，可以是電泳膠圖、分光光度值、Nanodrop儀器檢測(cè)數(shù)據(jù)或者Agilent Bioanalyzer儀器檢測(cè)數(shù)據(jù)等;一般情況下，轉(zhuǎn)錄組測(cè)序需要Agilent Bioanalyzer儀器檢測(cè)獲得的總RNA 28S:18S≥1，RIN≥7;小RNA測(cè)測(cè)序不可采用常規(guī)柱式總RNA提取試劑盒，可選擇傳統(tǒng)總RNA提取法（如乙醇沉淀、異丙醇沉淀等）或者選用專門的小RNA提取試劑盒;寄送RNA樣品請(qǐng)置于1...

核酸適配體測(cè)序，項(xiàng)目介紹：核酸適配體是一類能夠特異性地和靶物質(zhì)結(jié)合的寡核苷酸序列。它可作用于蛋白質(zhì)、金屬離子、小分子化合物、細(xì)胞膜表面受體等靶標(biāo)。其結(jié)合能力可與抗體相當(dāng)甚至更強(qiáng)，同時(shí)具有低免疫原性、 穩(wěn)定性好等特點(diǎn)，并可結(jié)合各種藥物及載體構(gòu)建多元復(fù)合靶向給藥系統(tǒng)用于tumour靶向treat, 在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域有潛在高價(jià)值。生工生物針對(duì)核酸適配體特殊結(jié)構(gòu)，結(jié)合Illumina MiSeq測(cè)序平臺(tái)，可以快速對(duì)核酸適配體文庫進(jìn)行大規(guī)模高通量測(cè)序，省去克隆測(cè)序的麻煩，提高測(cè)序深度，快速計(jì)算適配體序列頻率，方便科研客戶快速評(píng)估序列富集程度。生物信息分析經(jīng)驗(yàn)豐富，可以滿足客戶標(biāo)準(zhǔn)分析到定制分析作圖的需求。...

單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序中，制備高質(zhì)量的單細(xì)胞懸液至關(guān)重要。而懸液制備好后質(zhì)檢結(jié)果的判斷也是大家需要掌握的必備技能。單細(xì)胞懸液質(zhì)檢關(guān)卡究竟是怎樣運(yùn)作的呢？單細(xì)胞懸液質(zhì)控要求：?細(xì)胞濃度：700-1200cells/μl；?細(xì)胞活率>80%（當(dāng)細(xì)胞懸液活率低于70%時(shí)建議進(jìn)行去除死細(xì)胞處理）；細(xì)胞團(tuán)及碎片雜質(zhì)<5%（無細(xì)胞粘連，無明顯的細(xì)胞碎片和細(xì)胞團(tuán)，并保證細(xì)胞的完整性）；?細(xì)胞狀態(tài)：細(xì)胞直徑在7-40um之間（細(xì)胞直徑過大則建議進(jìn)行抽核處理）；?不存在逆轉(zhuǎn)錄抑制劑和非細(xì)胞的核酸分子。關(guān)鍵是KBSeq還可以省錢。上海地區(qū)生工生物 高通量測(cè)序服務(wù)AO/PI染色原理：吖啶橙（AO）是一種小分子染料，可以通...

生工高通量測(cè)序樣品要求，組織/細(xì)胞樣品：請(qǐng)使用新鮮取樣的實(shí)驗(yàn)材料，當(dāng)場(chǎng)分成小塊后立即用液氮或干冰乙醇速凍，保存于-80°C冰箱，用足量的干冰（根據(jù)經(jīng)驗(yàn)，在秋冬季節(jié)，如果打包合適，3公斤塊狀干冰可以維持30-40小時(shí)）寄送;于微生物樣品，請(qǐng)客戶如實(shí)聲明所屬物種，對(duì)于可能致病的微生物，生工保留拒收的權(quán)利;對(duì)于需要進(jìn)行RNA抽提的樣品，可以但不建議將組織在液氮中研磨后用TRIzol懸浮后用普通冰袋寄送，具體情況請(qǐng)先取得溝通。特別申明：不能采用過柱離心的方法提取總RNA。宏全基因組高通量測(cè)序測(cè)序small RNA測(cè)序，項(xiàng)目簡(jiǎn)介：Small RNA是一類重要的體內(nèi)調(diào)節(jié)分子，長(zhǎng)度在18-30 nt之間，主...

全基因組測(cè)序是對(duì)未知基因組序列的物種進(jìn)行個(gè)體的基因組測(cè)序，其研究主要包括3個(gè)方面：第一種為不參考任何現(xiàn)有序列從頭組裝測(cè)序，是對(duì)未知基因組序列的物種進(jìn)行基因組測(cè)序，并綜合利用不同測(cè)序技術(shù)和生物信息學(xué)工具對(duì)研究物種進(jìn)行序列拼接和修正，進(jìn)而獲得該物種的基因組序列圖譜；第二種為常見的全基因組重測(cè)序，是對(duì)已知基因組序列的物種進(jìn)行個(gè)體或群體的測(cè)序研究，建立一個(gè)測(cè)序文庫進(jìn)行單個(gè)個(gè)體或不同個(gè)體混合池測(cè)序，發(fā)現(xiàn)遺傳變異標(biāo)記，進(jìn)行后續(xù)的研究；第三種是在已有參考基因組序列圖譜的基礎(chǔ)上，對(duì)不同品種的具有代表性個(gè)體建立多個(gè)文庫進(jìn)行全基因組從頭組裝測(cè)序，此方法能夠進(jìn)一步的進(jìn)行參考基因組的修補(bǔ)和發(fā)現(xiàn)短序列比對(duì)難以發(fā)現(xiàn)的遺傳...

單細(xì)胞測(cè)序是什么？單細(xì)胞測(cè)序是基于高通量測(cè)序（Next-generationsequencingtechnology，NGS）方法，檢測(cè)群體中單細(xì)胞基因組、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組、單細(xì)胞表觀基因組及單細(xì)胞蛋白組，提供細(xì)胞間差異的高分辨率視圖，從分子水平揭示細(xì)胞奧秘。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序（Single-cellRNA-Sequencing，ScRNA-Seq）指在單細(xì)胞水平上對(duì)mRNA進(jìn)行高通量測(cè)序和分析的技術(shù)。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序能獲得單個(gè)細(xì)胞內(nèi)近萬個(gè)基因的表達(dá)信息，為辨別生物組織中各種細(xì)胞類型的轉(zhuǎn)錄組特征和全方面揭示細(xì)胞之間基因表達(dá)的異質(zhì)性提供了有力的工具[3]。說到細(xì)胞異質(zhì)性（Cellheterogenei...

全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序（Total RNA-Seq），項(xiàng)目介紹：全轉(zhuǎn)錄組是指特定細(xì)胞在特定狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的總和，包括mRNA和非編碼RNA（non-coding RNA）。針對(duì)非編碼RNA的研究主要集中在具有調(diào)控作用的miRNA，lncRNA和circRNA?；诙鷾y(cè)序技術(shù)的全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序研究，同時(shí)分析同一樣本中的mRNA，lncRNA，circRNA和miRNA，并且通過關(guān)聯(lián)分析，使研究?jī)?nèi)容更加系統(tǒng)化，致力于深入挖掘生命現(xiàn)象背后的轉(zhuǎn)錄調(diào)控問題。組織樣品或者總 RNA， 樣品名稱清晰，干冰運(yùn)輸。DNA樣品建議用藍(lán)冰運(yùn)輸。上海地區(qū)生工高通量測(cè)序服務(wù)如果你的樣品是質(zhì)粒或者是菌液，那為什么不試...

土壤樣本請(qǐng)置于2 mL離心管里（多準(zhǔn)備幾管備用），為保護(hù)樣本管，樣本管置于保護(hù)用的50 mL離心管或其他類似容器里，并旋緊蓋子；如常溫采的樣品，可以采用藍(lán)冰運(yùn)輸；如果是高溫發(fā)酵罐或者樣品已經(jīng)凍存-80°C，需要用足量干冰運(yùn)輸； DNA樣品請(qǐng)用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封好，并安置于50 mL離心管內(nèi)或其他類似容器里，并旋緊蓋子；藍(lán)冰運(yùn)輸；RNA樣品請(qǐng)用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封好，并安置于50 mL離心管內(nèi)或其他類似容器里，并旋緊蓋子；用足量干冰運(yùn)輸。 生工生物接受客戶自備文庫測(cè)序項(xiàng)目。上海市轉(zhuǎn)錄組高通量測(cè)序原理使用顯微鏡進(jìn)行懸液質(zhì)檢操作時(shí)應(yīng)注意：1.使用血球計(jì)數(shù)板時(shí)，可以提...

對(duì)于微生物樣品，請(qǐng)客戶如實(shí)聲明所屬物種；對(duì)于可能致病的微生物，生工將拒收。以固體培養(yǎng)基培養(yǎng)的樣品，需將樣品從培養(yǎng)基上刮取下來，用干冰寄送；以液體培養(yǎng)基培養(yǎng)的樣品，需離心后棄培養(yǎng)液收集樣品，用RNA組織保存液（例如RNA-Be-Locker A）保存，以干冰或冰袋寄送；沒有RNA組織保存液的情況下，也可用液氮或干冰乙醇速凍，保存于-80°C 冰箱，埋于足量干冰寄送。***樣品送樣量需至少達(dá)到100 mg/樣；細(xì)菌樣品送樣量需至少達(dá)到107（10的7次方）數(shù)量級(jí)，同時(shí)，在與樣本一同寄送的送樣表上，標(biāo)明屬于革蘭氏陽性菌（G+）還是革蘭氏陰性菌（G-）。生工一直秉持只要生工已經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)化的分析內(nèi)容（以生工...

生工高通量測(cè)序樣品要求，環(huán)境樣品：如果是新鮮土壤/污泥樣品，可以以冰袋運(yùn)輸，不超過3天;如果是凍存過的樣品（-20°C或者-80°C冰箱保存），為避免反復(fù)凍融，建議用足量的干冰（根據(jù)經(jīng)驗(yàn)，在秋冬季節(jié)，如果打包合適，3公斤塊狀干冰可以維持30-40小時(shí)）寄送;如果是水體樣品，建議采用濾膜過濾后，將濾膜寄送來生工。生工不負(fù)責(zé)過濾。要求濾膜3張，冰袋運(yùn)輸，不超過3天。其余特殊環(huán)境樣品，具體咨詢生工高通量測(cè)序部。 DNA樣品：請(qǐng)?zhí)峁╇娪灸z圖，濃度>20 ng/μl，總量一般1～2 μg。乙醇沉淀DNA或凍干DNA，可冰袋運(yùn)輸，不超過3天。 準(zhǔn)確、迅速，可以說是KBSeq的代名詞了。ITS高通...

土壤樣本請(qǐng)置于2 mL離心管里（多準(zhǔn)備幾管備用），為保護(hù)樣本管，樣本管置于保護(hù)用的50 mL離心管或其他類似容器里，并旋緊蓋子；如常溫采的樣品，可以采用藍(lán)冰運(yùn)輸；如果是高溫發(fā)酵罐或者樣品已經(jīng)凍存-80°C，需要用足量干冰運(yùn)輸； DNA樣品請(qǐng)用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封好，并安置于50 mL離心管內(nèi)或其他類似容器里，并旋緊蓋子；藍(lán)冰運(yùn)輸；RNA樣品請(qǐng)用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封好，并安置于50 mL離心管內(nèi)或其他類似容器里，并旋緊蓋子；用足量干冰運(yùn)輸。 現(xiàn)在也有學(xué)者為了區(qū)分傳統(tǒng)測(cè)序和單細(xì)胞測(cè)序的區(qū)別，將傳統(tǒng)方法稱為批量測(cè)序。small RNA高通量測(cè)序平臺(tái)對(duì)于微生物樣品，請(qǐng)客...

IlluminaHiSeq2500/4000可以運(yùn)行PE150/PE250模式，可以承擔(dān)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、人基因組重測(cè)序、外顯子捕獲測(cè)序、宏基因組測(cè)序、微生物分類測(cè)序等服務(wù)；IlluminaMiSeq運(yùn)行PE300模式，可以承擔(dān)細(xì)菌基因組重測(cè)序/Denovo測(cè)序、微生物分類測(cè)序、擴(kuò)增子測(cè)序、核酸適配體測(cè)序等服務(wù)；LifeIontorrentPGM運(yùn)行314、316、318芯片，可以承接擴(kuò)增子測(cè)序、靶區(qū)域測(cè)序、基因組重測(cè)序服務(wù)；PacBioSequel/RSII該測(cè)序平臺(tái)讀長(zhǎng)超長(zhǎng)，平均可達(dá)10kb以上，主要承接細(xì)菌基因組完成圖測(cè)序、***基因組精細(xì)圖測(cè)序、全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄本測(cè)序等服務(wù)；ChIP項(xiàng)目至少要求50...

對(duì)于細(xì)胞樣品，送樣量需達(dá)到 5 × 106（5乘10的6次方）數(shù)量級(jí)。富集后置于 2 ml Ep管中，用 1 ml TRIzol 重懸，注意取樣后立即用液氮或干冰乙醇速凍，保存于-80°C 冰箱，埋于足量的干冰中用保溫箱寄送。強(qiáng)烈建議細(xì)胞樣品先做細(xì)胞鑒定及支原體/衣原體污染之后，再送出來。對(duì)于血液樣本，只接收未凍存過的抗凝血新鮮樣本?？鼓齽┎豢墒褂酶嗡剽c，可用EDTA或ACD抗凝劑，取血后以冰袋保存，切記不能使血液凍結(jié)，從取血之時(shí)開始計(jì)算，須在48小時(shí)之內(nèi)送達(dá)生工上海總部高通量測(cè)序部。如果不能提供新鮮樣本，則請(qǐng)?zhí)峁难褐刑崛〉目俁NA樣本。備樣要求詳見B、RNA 樣品。ChIP項(xiàng)目至少要求5...

如果你的樣品是質(zhì)?；蛘呤蔷海菫槭裁床辉囋囄覀兊腒BSeq呢？準(zhǔn)確、迅速，可以說是KBSeq的代名詞了，關(guān)鍵是還可以省錢，估計(jì)這是很多小伙伴們一定會(huì)說，你這個(gè)服務(wù)單價(jià)可比Sanger貴多了，怎么可能會(huì)省錢呢？Sanger測(cè)序的價(jià)格：常規(guī)的一代測(cè)序基本上要每800 bp就測(cè)一個(gè)反應(yīng)，那我們來算一下14000/800=17.5，那基本上就要測(cè)18個(gè)反應(yīng)了，按照現(xiàn)在生工官方的價(jià)格區(qū)間，這個(gè)屬于反應(yīng)數(shù)在10-49個(gè)反應(yīng)之間的，那每個(gè)反應(yīng)的價(jià)格為26元，這樣算下來18*26=468元，還要加上引物合成的費(fèi)用，實(shí)驗(yàn)周期的話大概率是要超過15天的。KBSeq全質(zhì)粒測(cè)序的價(jià)格：序列長(zhǎng)度屬于6-15 kb之間...

通過顯微鏡使用血球計(jì)數(shù)板質(zhì)檢能觀察到懸液背景質(zhì)量和細(xì)胞數(shù)目及活性的評(píng)估。讓我們?cè)賮砘仡櫼幌屡_(tái)盼藍(lán)染色原理：臺(tái)盼藍(lán)染色原理：臺(tái)盼藍(lán)不能透過活細(xì)胞正常完整的細(xì)胞膜，故活細(xì)胞不被染色。而死細(xì)胞的細(xì)胞膜透性增高，可使染料進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)而使死細(xì)胞染成淡藍(lán)色。怎樣通過血球計(jì)數(shù)板進(jìn)行質(zhì)檢操作呢？將血球計(jì)數(shù)板擦拭干凈，取干凈的蓋玻片蓋在計(jì)數(shù)板上；將細(xì)胞懸液混勻（或10μl臺(tái)盼藍(lán)+10μl細(xì)胞懸液），吸出10μl懸液至計(jì)數(shù)板上蓋玻片的一側(cè)使細(xì)胞核懸液鋪滿蓋玻片和計(jì)數(shù)板之間；在顯微鏡下分別對(duì)V1/V2/V3/V4四個(gè)計(jì)數(shù)區(qū)域進(jìn)行計(jì)數(shù)；按細(xì)胞計(jì)數(shù)公式進(jìn)行計(jì)算，計(jì)算公式：細(xì)胞總數(shù)={(V1+V2+V3+V4)/4}*10...

生工高通量測(cè)序樣品要求，組織/細(xì)胞樣品：請(qǐng)使用新鮮取樣的實(shí)驗(yàn)材料，當(dāng)場(chǎng)分成小塊后立即用液氮或干冰乙醇速凍，保存于-80°C冰箱，用足量的干冰（根據(jù)經(jīng)驗(yàn)，在秋冬季節(jié)，如果打包合適，3公斤塊狀干冰可以維持30-40小時(shí)）寄送;于微生物樣品，請(qǐng)客戶如實(shí)聲明所屬物種，對(duì)于可能致病的微生物，生工保留拒收的權(quán)利;對(duì)于需要進(jìn)行RNA抽提的樣品，可以但不建議將組織在液氮中研磨后用TRIzol懸浮后用普通冰袋寄送，具體情況請(qǐng)先取得溝通。一臺(tái)10xGenomics Chromium X儀器能夠在單次運(yùn)行中分析數(shù)百至數(shù)十萬個(gè)細(xì)胞，讓百萬級(jí)的細(xì)胞研究變得常規(guī)。16s高通量測(cè)序單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序中，制備高質(zhì)量的單細(xì)胞懸液...

真核/原核無參mRNA-Seq，項(xiàng)目介紹；測(cè)序使用Illumina Xten平臺(tái)，測(cè)序原始數(shù)據(jù)質(zhì)控后進(jìn)行拼接，并進(jìn)一步對(duì)拼接所得轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行功能注釋、CDD、CDS分析，SNP分析，SSR標(biāo)記開發(fā)等分析。在計(jì)算基因的表達(dá)量后，進(jìn)行基因表達(dá)差異及差異基因GO、KOG（原核生物為COG）、KEGG功能富集分析，KEGG pathway等分析。對(duì)于多個(gè)樣本，可進(jìn)行重復(fù)相關(guān)性檢查、共表達(dá)分析、PCA主成分分析。另外，還可以進(jìn)行基因功能互作、蛋白網(wǎng)絡(luò)互作等分析，深入研究基因功能，進(jìn)一步揭示基因間互作網(wǎng)絡(luò)等信息，為研究網(wǎng)絡(luò)調(diào)控機(jī)理提供方向。 組織材料樣品（提取RNA用），請(qǐng)預(yù)先用液氮速凍，然后轉(zhuǎn)移到干冰...

全基因組測(cè)序是對(duì)未知基因組序列的物種進(jìn)行個(gè)體的基因組測(cè)序，其研究主要包括3個(gè)方面：第一種為不參考任何現(xiàn)有序列從頭組裝測(cè)序，是對(duì)未知基因組序列的物種進(jìn)行基因組測(cè)序，并綜合利用不同測(cè)序技術(shù)和生物信息學(xué)工具對(duì)研究物種進(jìn)行序列拼接和修正，進(jìn)而獲得該物種的基因組序列圖譜；第二種為常見的全基因組重測(cè)序，是對(duì)已知基因組序列的物種進(jìn)行個(gè)體或群體的測(cè)序研究，建立一個(gè)測(cè)序文庫進(jìn)行單個(gè)個(gè)體或不同個(gè)體混合池測(cè)序，發(fā)現(xiàn)遺傳變異標(biāo)記，進(jìn)行后續(xù)的研究；第三種是在已有參考基因組序列圖譜的基礎(chǔ)上，對(duì)不同品種的具有代表性個(gè)體建立多個(gè)文庫進(jìn)行全基因組從頭組裝測(cè)序，此方法能夠進(jìn)一步的進(jìn)行參考基因組的修補(bǔ)和發(fā)現(xiàn)短序列比對(duì)難以發(fā)現(xiàn)的遺傳...

樣本寄送時(shí)，請(qǐng)將填寫完整的紙質(zhì)版《高通量測(cè)序送樣表》密封于塑料袋內(nèi)，隨樣本一起寄出，紙質(zhì)版的樣本信息單用于樣本接收人員在收到樣本后及時(shí)并正確的保存并錄入樣本，如無紙質(zhì)版的樣本信息單可能會(huì)延誤項(xiàng)目周期；樣本管壁或管蓋上標(biāo)明的樣本名稱需要與《高通量測(cè)序送樣表》里樣本名稱一致，這樣可以避免我們收到樣本后與您確認(rèn)樣本編號(hào)而耽誤樣本質(zhì)檢、提取實(shí)驗(yàn)；如有特殊情況，請(qǐng)?jiān)凇陡咄繙y(cè)序送樣表》中注明；樣品編號(hào)請(qǐng)避免使用中文、羅馬數(shù)字、“-”以及特殊符號(hào)標(biāo)示，避免分析的時(shí)候系統(tǒng)無法識(shí)別，導(dǎo)致分析無法完成；我們分析人員建議編號(hào)可以采用英文字母與阿拉伯?dāng)?shù)字結(jié)合的形式，字符比較好不要過長(zhǎng)，避免繪制部分分析圖的時(shí)候難以全...

什么是KBSeq全質(zhì)粒測(cè)序？它基于第二代測(cè)序技術(shù)，一次性對(duì)大量質(zhì)粒（比較多可達(dá)6000個(gè)樣本）進(jìn)行并行測(cè)序，利用生物信息學(xué)分析，對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行序列組裝并獲得每一個(gè)質(zhì)粒的完整序列信息。所以我們也稱它為，可以部分替代一代測(cè)序的高通量測(cè)序技術(shù)。測(cè)序長(zhǎng)度：對(duì)于測(cè)序長(zhǎng)度較長(zhǎng)，如果我們用Sanger測(cè)序往往需要花費(fèi)大量的時(shí)間，而我們KBSeq全質(zhì)粒測(cè)序則只需要5-7天，就可以測(cè)通片段長(zhǎng)度小于30kb以下的片段。樣本用量：KBSeq全質(zhì)粒測(cè)序?qū)τ跇颖镜牧?，要求的也比較少，比如質(zhì)粒我們的樣本要求DNA的濃度需≥ 1 ng/μl, 體積需≥5 μl，如果比較珍貴的樣本或者是樣本比較難提取的，KBSeq就更為適合了。...

為什么要用單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)？細(xì)胞是生物體結(jié)構(gòu)和功能的基本單位，在生物體生長(zhǎng)發(fā)育的過程中，因細(xì)胞類型、外界環(huán)境以及內(nèi)部調(diào)節(jié)因素的不同，其轉(zhuǎn)錄組信息也不盡相同。由于基因組和表觀遺傳的重編程，以及在細(xì)胞分裂和分化過程中出現(xiàn)的誤差造成來自同一細(xì)胞系或個(gè)體的細(xì)胞呈現(xiàn)出不同的基因組、轉(zhuǎn)錄組和表觀基因組[4]。這就是我們上面提到的細(xì)胞異質(zhì)性。細(xì)胞異質(zhì)性是生物組織和生物系統(tǒng)的普遍特征[5]。但是我們常規(guī)的二代測(cè)序檢測(cè)的是一個(gè)細(xì)胞群體的基因組、轉(zhuǎn)錄組的信息，如培養(yǎng)的大量細(xì)胞、動(dòng)植物組織甚至是整個(gè)生物體。在過去的20多年中，人們對(duì)轉(zhuǎn)錄組的人數(shù)仍然局限在群體水平[6]。這種方法可以為我們提供大量的基因組或轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，...

如果你的樣品是質(zhì)?；蛘呤蔷海菫槭裁床辉囋囄覀兊腒BSeq呢？準(zhǔn)確、迅速，可以說是KBSeq的代名詞了，關(guān)鍵是還可以省錢，估計(jì)這是很多小伙伴們一定會(huì)說，你這個(gè)服務(wù)單價(jià)可比Sanger貴多了，怎么可能會(huì)省錢呢？Sanger測(cè)序的價(jià)格：常規(guī)的一代測(cè)序基本上要每800 bp就測(cè)一個(gè)反應(yīng)，那我們來算一下14000/800=17.5，那基本上就要測(cè)18個(gè)反應(yīng)了，按照現(xiàn)在生工官方的價(jià)格區(qū)間，這個(gè)屬于反應(yīng)數(shù)在10-49個(gè)反應(yīng)之間的，那每個(gè)反應(yīng)的價(jià)格為26元，這樣算下來18*26=468元，還要加上引物合成的費(fèi)用，實(shí)驗(yàn)周期的話大概率是要超過15天的。KBSeq全質(zhì)粒測(cè)序的價(jià)格：序列長(zhǎng)度屬于6-15 kb之間...

AO/PI染色原理：吖啶橙（AO）是一種小分子染料，可以通過完整的細(xì)胞膜，嵌入所有細(xì)胞（活細(xì)胞和死細(xì)胞）的細(xì)胞核，呈現(xiàn)綠色熒光；碘化丙啶（PI）只能通過不完整的細(xì)胞膜，即死細(xì)胞的細(xì)胞膜，嵌入所有死細(xì)胞的細(xì)胞核，呈現(xiàn)紅色熒光，通過標(biāo)記出的綠色熒光和紅色熒光就可以辨別出活細(xì)胞和死細(xì)胞，這種特異性染色的方法也可以排除無核細(xì)胞、雜質(zhì)、碎片等的干擾。熒光細(xì)胞計(jì)數(shù)儀檢測(cè)結(jié)果可以讓我們直觀的看到：細(xì)胞濃度（總細(xì)胞，活細(xì)胞，死細(xì)胞）、細(xì)胞存活率（臺(tái)盼藍(lán)和雙熒光AO/PI染色）、細(xì)胞平均直徑、細(xì)胞聚團(tuán)率、細(xì)胞直徑分布等結(jié)果的展示。請(qǐng)?zhí)峁╇娪灸z圖，濃度>20 ng/μl，總量一般1～2 μg。乙醇沉淀DNA或凍干...

對(duì)于微生物樣品，請(qǐng)客戶如實(shí)聲明所屬物種；對(duì)于可能致病的微生物，生工將拒收。以固體培養(yǎng)基培養(yǎng)的樣品，需將樣品從培養(yǎng)基上刮取下來，用干冰寄送；以液體培養(yǎng)基培養(yǎng)的樣品，需離心后棄培養(yǎng)液收集樣品，用RNA組織保存液（例如RNA-Be-Locker A）保存，以干冰或冰袋寄送；沒有RNA組織保存液的情況下，也可用液氮或干冰乙醇速凍，保存于-80°C 冰箱，埋于足量干冰寄送。***樣品送樣量需至少達(dá)到100 mg/樣；細(xì)菌樣品送樣量需至少達(dá)到107（10的7次方）數(shù)量級(jí)，同時(shí)，在與樣本一同寄送的送樣表上，標(biāo)明屬于革蘭氏陽性菌（G+）還是革蘭氏陰性菌（G-）。DNA樣品請(qǐng)用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封...

生工人線粒體基因組測(cè)序（多重?cái)U(kuò)增法），項(xiàng)目介紹：生工生物高通量測(cè)序部采用多重?cái)U(kuò)增技術(shù)，對(duì)人線粒體基因組進(jìn)行擴(kuò)增捕獲，并進(jìn)一步采用Illumina測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行高通量測(cè)序。該技術(shù)方案可以快速擴(kuò)增到幾乎線粒體全長(zhǎng)，并進(jìn)行高深度測(cè)序，下游提供常規(guī)比對(duì)篩查突變等生物信息分析。客戶提供樣品類型：1.人來源DNA，濃度大于1ng/ul，總量大于20ng，以Qubit檢測(cè)結(jié)果為準(zhǔn)2.運(yùn)輸條件：冰袋運(yùn)輸。交付信息：1.測(cè)序原始數(shù)據(jù)交付實(shí)驗(yàn)報(bào)告2.測(cè)序原始數(shù)據(jù)3.突變分析結(jié)果。KBSeq全質(zhì)粒測(cè)序只能測(cè)菌液和質(zhì)粒，像PCR產(chǎn)物什么的還是送一代測(cè)序吧。有參轉(zhuǎn)錄組高通量測(cè)序平臺(tái)單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用：?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序技術(shù)可以...