上海市靶向捕獲高通量測序NGS

全基因組測序是對(duì)未知基因組序列的物種進(jìn)行個(gè)體的基因組測序，其研究主要包括3個(gè)方面：第一種為不參考任何現(xiàn)有序列從頭組裝測序，是對(duì)未知基因組序列的物種進(jìn)行基因組測序，并綜合利用不同測序技術(shù)和生物信息學(xué)工具對(duì)研究物種進(jìn)行序列拼接和修正，進(jìn)而獲得該物種的基因組序列圖譜；第二種為常見的全基因組重測序，是對(duì)已知基因組序列的物種進(jìn)行個(gè)體或群體的測序研究，建立一個(gè)測序文庫進(jìn)行單個(gè)個(gè)體或不同個(gè)體混合池測序，發(fā)現(xiàn)遺傳變異標(biāo)記，進(jìn)行后續(xù)的研究；第三種是在已有參考基因組序列圖譜的基礎(chǔ)上，對(duì)不同品種的具有代表性個(gè)體建立多個(gè)文庫進(jìn)行全基因組從頭組裝測序，此方法能夠進(jìn)一步的進(jìn)行參考基因組的修補(bǔ)和發(fā)現(xiàn)短序列比對(duì)難以發(fā)現(xiàn)的遺傳變異。生工生物擁有眾多生物信息分析人才，可進(jìn)行專業(yè)的項(xiàng)目分析，為客戶提供個(gè)性化服務(wù)。近年來，隨著高通量測序技術(shù)的發(fā)展和普及，單細(xì)胞測序技術(shù)發(fā)展十分迅速。上海市靶向捕獲高通量測序NGS

生工CHIP-Seq，項(xiàng)目介紹：CHIP-SEQ 技術(shù)，即染色質(zhì)免疫共沉淀與高通量測序相結(jié)合的技術(shù)。它是研究體內(nèi)蛋白質(zhì)與DNA 相互作用的有力工具，還可以用來研究轉(zhuǎn)錄因子與基因表達(dá)的關(guān)系。通過高通量測序，可以一次性得到目的蛋白在整個(gè)基因組上的結(jié)合分布，得到目的蛋白精確的結(jié)合位點(diǎn)以及結(jié)合基序等信息。ChIP-Seq 的原理：首先通過染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)(ChIP）特異性地富集目的蛋白結(jié)合的DNA 的所屬片段，并對(duì)其進(jìn)行純化與文庫構(gòu)建；然后對(duì)富集得到的DNA的片段進(jìn)行高通量測序，將獲得的數(shù)百萬條序列標(biāo)簽精確定位到基因組上，從而獲得全基因組范圍內(nèi)與組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等互作的DNA 區(qū)段信息。上海市ITS高通量測序生物信息分析經(jīng)驗(yàn)豐富，可以滿足客戶標(biāo)準(zhǔn)分析到定制分析作圖的需求。

KBSeq全質(zhì)粒測序跟一代測序相比有什么優(yōu)點(diǎn)呢？一代測序：1.數(shù)據(jù)質(zhì)量，套峰，雙峰等情況，需要人工分析校對(duì)。2.測序長度，1 kb。3.成本，低。4.樣本用量，100 ng。5.精確度，70-90%。6.測序能力，需要測序引物，只能測測序引物間的片段序列。7.通量低，（與讀長有關(guān)）。8.實(shí)驗(yàn)周期，如果片段長度超過5K，測通可能需要15天左右。對(duì)于測序長度較長，如果我們用Sanger測序往往需要花費(fèi)大量的時(shí)間，而我們KBSeq全質(zhì)粒測序則只需要5-7天，就可以測通片段長度小于30kb以下的片段。KBSeq全質(zhì)粒測序?qū)τ跇颖镜牧?，要求的也比較少，比如質(zhì)粒我們的樣本要求DNA的濃度需≥ 1 ng/μl, 體積需≥5 μl，如果比較珍貴的樣本或者是樣本比較難提取的，KBSeq就更為適合了。

真核/原核有參mRNA-Seq，項(xiàng)目介紹：轉(zhuǎn)錄組（transcriptome）廣義上指某一生理?xiàng)l件下，細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的gather，狹義上指所有mRNA的gather。轉(zhuǎn)錄組是研究基因表達(dá)的主要手段，是連接基因組遺傳信息與生物功能的蛋白質(zhì)組的紐帶。轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控是生物體重要的調(diào)控方式，通過轉(zhuǎn)錄組測序分析轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控，是目前運(yùn)用較多的研究方式。測序使用Illumina Xten平臺(tái)，測序原始數(shù)據(jù)經(jīng)過質(zhì)控后，mapping至參考基因組序列，對(duì)mapping到基因上的reads進(jìn)行計(jì)數(shù)，計(jì)算基因的表達(dá)量后，進(jìn)行基因表達(dá)差異及差異基因GO、KOG（原核生物為COG）、KEGG功能富集分析，KEGG pathway等分析。對(duì)于多個(gè)樣本，可進(jìn)行重復(fù)相關(guān)性檢查、共表達(dá)分析、PCA主成分分析。另外，依據(jù)參考基因組，可進(jìn)行諸如基因覆蓋度、測序飽和度等驗(yàn)證性分析；可變剪切分析、SNP/InDel分析、新轉(zhuǎn)錄本預(yù)測以及聯(lián)合miRNA數(shù)據(jù)進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析等分析。另外，還可以進(jìn)行基因功能互作、蛋白網(wǎng)絡(luò)互作等分析，深入研究基因功能，進(jìn)一步揭示基因間互作網(wǎng)絡(luò)等信息，為研究網(wǎng)絡(luò)調(diào)控機(jī)理提供方向。ChIP項(xiàng)目至少要求50ng DNA，以Qubit 2.0檢測為準(zhǔn)。其余具體咨詢生工高通量測序部。

樣本寄送時(shí)，請(qǐng)將填寫完整的紙質(zhì)版《高通量測序送樣表》密封于塑料袋內(nèi)，隨樣本一起寄出，紙質(zhì)版的樣本信息單用于樣本接收人員在收到樣本后及時(shí)并正確的保存并錄入樣本，如無紙質(zhì)版的樣本信息單可能會(huì)延誤項(xiàng)目周期；樣本管壁或管蓋上標(biāo)明的樣本名稱需要與《高通量測序送樣表》里樣本名稱一致，這樣可以避免我們收到樣本后與您確認(rèn)樣本編號(hào)而耽誤樣本質(zhì)檢、提取實(shí)驗(yàn)；如有特殊情況，請(qǐng)?jiān)凇陡咄繙y序送樣表》中注明；樣品編號(hào)請(qǐng)避免使用中文、羅馬數(shù)字、“-”以及特殊符號(hào)標(biāo)示，避免分析的時(shí)候系統(tǒng)無法識(shí)別，導(dǎo)致分析無法完成；我們分析人員建議編號(hào)可以采用英文字母與阿拉伯?dāng)?shù)字結(jié)合的形式，字符比較好不要過長，避免繪制部分分析圖的時(shí)候難以全部展示。10xGenomics Chromium X多通道+高捕獲+10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù)。上海宏全基因組高通量測序應(yīng)用

DNA樣品請(qǐng)?zhí)峁╇娪灸z圖，濃度>20 ng/μl，總量一般1～2 μg。乙醇沉淀DNA或凍干DNA，可冰袋運(yùn)輸，不超過3天。上海市靶向捕獲高通量測序NGS

我國高度重視生化試劑，實(shí)驗(yàn)耗材，實(shí)驗(yàn)試劑，研發(fā)的供應(yīng)保證工作，推動(dòng)研發(fā)和供應(yīng)保證也是深化醫(yī)藥衛(wèi)生體制改進(jìn)的重要任務(wù)。醫(yī)藥相關(guān)部門多次發(fā)布政策文件，鼓勵(lì)生化試劑，實(shí)驗(yàn)耗材，實(shí)驗(yàn)試劑，研發(fā)的研發(fā)和生產(chǎn)，提高醫(yī)藥的供應(yīng)保證能力。健康科技行業(yè)前景光明。硅谷銀行聯(lián)合浦發(fā)硅谷銀行發(fā)布《健康科技：新興行業(yè)洞察》。該報(bào)告根據(jù)各股份有限公司公司的科技賦能解決方案將其歸類分組為醫(yī)藥機(jī)構(gòu)運(yùn)營、臨床試驗(yàn)賦能、醫(yī)藥導(dǎo)航、用藥管理、精神健康與醫(yī)藥教育六大領(lǐng)域，并對(duì)美國耗費(fèi)巨大的醫(yī)藥健康行業(yè)支出相關(guān)問題進(jìn)行分析，由此衡量收入和退出情況。隨著2020年離我們已經(jīng)越來越近，遵循政策導(dǎo)向，調(diào)整企業(yè)布局將成為未來企業(yè)戰(zhàn)略布局的重中之重。隨著我國醫(yī)藥健康深入推進(jìn)、“兩票制”進(jìn)一步推行，以及各項(xiàng)行業(yè)政策的出臺(tái)，使得我國冷鏈物流市場規(guī)模不斷擴(kuò)大。對(duì)于冷鏈物流行業(yè)而言，“十三五”規(guī)劃時(shí)期是冷鏈物流調(diào)整和發(fā)展的關(guān)鍵時(shí)期。隨著西方健康服務(wù)理念的進(jìn)入及國內(nèi)需求市場的飛速增長，國內(nèi)以體檢為重點(diǎn)的股份有限公司得到了飛速發(fā)展，尤其是近年來，健康服務(wù)機(jī)構(gòu)飛速發(fā)展。盡管中國老年健康服務(wù)目前仍處于初始發(fā)展階段，但近年來我國出臺(tái)了一些扶持政策，市場空間逐漸打開。上海市靶向捕獲高通量測序NGS

生工生物工程（上海）股份有限公司主要經(jīng)營范圍是醫(yī)藥健康，擁有一支專業(yè)技術(shù)團(tuán)隊(duì)和良好的市場口碑。生工生物致力于為客戶提供良好的生化試劑，實(shí)驗(yàn)耗材，實(shí)驗(yàn)試劑，研發(fā)，一切以用戶需求為中心，深受廣大客戶的歡迎。公司秉持誠信為本的經(jīng)營理念，在醫(yī)藥健康深耕多年，以技術(shù)為先導(dǎo)，以自主產(chǎn)品為重點(diǎn)，發(fā)揮人才優(yōu)勢，打造醫(yī)藥健康良好品牌。生工生物立足于全國市場，依托強(qiáng)大的研發(fā)實(shí)力，融合前沿的技術(shù)理念，及時(shí)響應(yīng)客戶的需求。