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生工高通量測序樣品要求,組織/細(xì)胞樣品:請使用新鮮取樣的實驗材料,當(dāng)場分成小塊后立即用液氮或干冰乙醇速凍,保存于-80°C冰箱,用足量的干冰(根據(jù)經(jīng)驗,在秋冬季節(jié),如果打包合適,3公斤塊狀干冰可以維持30-40小時)寄送;于微生物樣品,請客戶如實聲明所屬物種,對于可能致病的微生物,生工保留拒收的權(quán)利;對于需要進行RNA抽提的樣品,可以但不建議將組織在液氮中研磨后用TRIzol懸浮后用普通冰袋寄送,具體情況請先取得溝通。特別申明:不能采用過柱離心的方法提取總RNA。宏全基因組高通量測序測序
small RNA測序,項目簡介:Small RNA是一類重要的體內(nèi)調(diào)節(jié)分子,長度在18-30 nt之間,主要包括miRNA、piRNA和siRNA。它的功能主要是誘導(dǎo)基因沉默,參與基因轉(zhuǎn)錄后調(diào)控,從而調(diào)節(jié)細(xì)胞生長、分化,以及個體發(fā)育、生殖等重要生物學(xué)過程。高通量測序技術(shù)可以對樣本中所有small RNA家族進行測序和表達(dá)定量,從而解析miRNA、siRNA、piRNA和其它非編碼RNA以及相應(yīng)靶序列。測序使用Illumina Xten平臺,測序原始數(shù)據(jù)質(zhì)控后,進行Clean reads 長度分布統(tǒng)計,small RNA注釋,已知 miRNA 注釋,已知piRNA注釋,ncRNA分析,新 miRNA 預(yù)測(有參考基因組),差異基因可視化分析,miRNA 家族分析,差異表達(dá) miRNA 聚類分析,miRNA靶基因預(yù)測,靶基因GO、KEGG富集分析。上海地區(qū)有參轉(zhuǎn)錄組高通量測序產(chǎn)品準(zhǔn)確、迅速,可以說是KBSeq的代名詞了。
使用顯微鏡進行懸液質(zhì)檢操作時應(yīng)注意:1.使用血球計數(shù)板時,可以提前鏡檢觀察每小格計數(shù)室內(nèi)是否潔凈無雜質(zhì)。若有雜質(zhì)灰層,則需要多次清洗,直至計數(shù)室潔凈無瑕;2.質(zhì)檢前將懸液輕微震蕩或使用擴口gun頭吹打混勻;3.臺盼藍(lán)染色后需要盡快完成細(xì)胞計數(shù),一般建議不要超過10分鐘;4.如果方格中細(xì)胞數(shù)目過多,難以數(shù)清,應(yīng)當(dāng)對細(xì)胞懸液進行稀釋以便于計數(shù);5.對于壓在方格界線上的細(xì)胞應(yīng)當(dāng)計數(shù)同側(cè)相鄰兩邊上的細(xì)胞數(shù),一般可采取“數(shù)上線不數(shù)下線,數(shù)左線不數(shù)右線”的原則處理,另兩邊不計數(shù)。
真核/原核有參mRNA-Seq,項目介紹:轉(zhuǎn)錄組(transcriptome)廣義上指某一生理條件下,細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的gather,狹義上指所有mRNA的gather。轉(zhuǎn)錄組是研究基因表達(dá)的主要手段,是連接基因組遺傳信息與生物功能的蛋白質(zhì)組的紐帶。轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控是生物體重要的調(diào)控方式,通過轉(zhuǎn)錄組測序分析轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控,是目前運用較多的研究方式。測序使用Illumina Xten平臺,測序原始數(shù)據(jù)經(jīng)過質(zhì)控后,mapping至參考基因組序列,對mapping到基因上的reads進行計數(shù),計算基因的表達(dá)量后,進行基因表達(dá)差異及差異基因GO、KOG(原核生物為COG)、KEGG功能富集分析,KEGG pathway等分析。對于多個樣本,可進行重復(fù)相關(guān)性檢查、共表達(dá)分析、PCA主成分分析。另外,依據(jù)參考基因組,可進行諸如基因覆蓋度、測序飽和度等驗證性分析;可變剪切分析、SNP/InDel分析、新轉(zhuǎn)錄本預(yù)測以及聯(lián)合miRNA數(shù)據(jù)進行關(guān)聯(lián)分析等分析。另外,還可以進行基因功能互作、蛋白網(wǎng)絡(luò)互作等分析,深入研究基因功能,進一步揭示基因間互作網(wǎng)絡(luò)等信息,為研究網(wǎng)絡(luò)調(diào)控機理提供方向。請合理安排樣品寄送時間,避免樣本在周六、周日或法定節(jié)假日到達(dá)生工生物。
生工其他PCR產(chǎn)物測序,項目介紹:隨著基因編輯技術(shù)(尤其是CRISPR-cas9技術(shù))的發(fā)展,科研人員使用傳統(tǒng)的Sanger測序無法快速有效鑒定基因編輯效率。但是,通過對靶基因區(qū)域附近設(shè)計引物,進行PCR擴增,并對PCR產(chǎn)物進行高通量測序,可以快速高效的獲得目標(biāo)區(qū)域的突變頻率信息,尤其是對低頻突變的檢測效果遠(yuǎn)遠(yuǎn)優(yōu)于一代測序,性價比極高??侱NA 或者包裝完好的原始樣品(如土壤、糞便、 水體和口腔物);樣品名稱清晰,冷藏運輸。如有對照與實驗樣品的區(qū)分,標(biāo)明正常樣品與實驗樣品,如有分組,詳細(xì)描述分組分析信息,以及分組比較的分析需求信息。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序指在單細(xì)胞水平上對 mRNA 進行高通量測序和分析的技術(shù)。上海市l(wèi)ncRNA高通量測序產(chǎn)品
如果是水體樣品,建議采用濾膜過濾后,將濾膜寄送來生工。宏全基因組高通量測序測序
對于微生物樣品,請客戶如實聲明所屬物種;對于可能致病的微生物,生工將拒收。以固體培養(yǎng)基培養(yǎng)的樣品,需將樣品從培養(yǎng)基上刮取下來,用干冰寄送;以液體培養(yǎng)基培養(yǎng)的樣品,需離心后棄培養(yǎng)液收集樣品,用RNA組織保存液(例如RNA-Be-Locker A)保存,以干冰或冰袋寄送;沒有RNA組織保存液的情況下,也可用液氮或干冰乙醇速凍,保存于-80°C 冰箱,埋于足量干冰寄送。***樣品送樣量需至少達(dá)到100 mg/樣;細(xì)菌樣品送樣量需至少達(dá)到107(10的7次方)數(shù)量級,同時,在與樣本一同寄送的送樣表上,標(biāo)明屬于革蘭氏陽性菌(G+)還是革蘭氏陰性菌(G-)。宏全基因組高通量測序測序
生工生物工程(上海)股份有限公司是一家研發(fā)、生產(chǎn)化學(xué)試劑、生化試劑、生物試劑、耗材、小型儀器及生物工程相關(guān)產(chǎn)品(以上經(jīng)營涉及位險化學(xué)品的只有分裝業(yè)務(wù)),銷售公司自產(chǎn)產(chǎn)品并提供售后技術(shù)服務(wù);從事上述產(chǎn)品的同類商品(危險化學(xué)品限許可證規(guī)定范圍)的進出口、批發(fā)、傭金代理(拍實除外)及相關(guān)配套服務(wù);提供生物工程技術(shù)服務(wù)、技術(shù)開發(fā)、技術(shù)咨詢。:提供倉儲業(yè)務(wù)。 【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項目。經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動】的公司,致力于發(fā)展為創(chuàng)新務(wù)實、誠實可信的企業(yè)。生工生物深耕行業(yè)多年,始終以客戶的需求為向?qū)?,為客戶提供高質(zhì)量的生化試劑,實驗耗材,實驗試劑,研發(fā)。生工生物不斷開拓創(chuàng)新,追求出色,以技術(shù)為先導(dǎo),以產(chǎn)品為平臺,以應(yīng)用為重點,以服務(wù)為保證,不斷為客戶創(chuàng)造更高價值,提供更優(yōu)服務(wù)。生工生物創(chuàng)始人王啟松,始終關(guān)注客戶,創(chuàng)新科技,竭誠為客戶提供良好的服務(wù)。