生工高通量測序部擁有豐富的樣品處理經驗,日均處理樣品200余例,涵蓋污泥、糞便、海底沉泥、水體濾膜、植物組織、動物組織/細胞等樣品,省去您處理樣品的繁瑣過程。生物信息分析經驗豐富,可以滿足客戶標準分析到定制分析作圖的需求。且生工一直秉持只要生工已經標準化的分析內容(以生工分析報告模板為準),全部free。生工生物擁有生命科學領域較全的產品及服務體系,可以承接從分子到蛋白各個層級的實驗項目,一站式解決問題。同時生工生物單細胞團隊目前已同時擁有10xGenomicsChromiumController和ChromiumX雙平臺,可為您提供超高通量和低通量單細胞樣本雙重。PacBio Sequel/...
small RNA測序,項目簡介:Small RNA是一類重要的體內調節(jié)分子,長度在18-30 nt之間,主要包括miRNA、piRNA和siRNA。它的功能主要是誘導基因沉默,參與基因轉錄后調控,從而調節(jié)細胞生長、分化,以及個體發(fā)育、生殖等重要生物學過程。高通量測序技術可以對樣本中所有small RNA家族進行測序和表達定量,從而解析miRNA、siRNA、piRNA和其它非編碼RNA以及相應靶序列。測序使用Illumina Xten平臺,測序原始數據質控后,進行Clean reads 長度分布統(tǒng)計,small RNA注釋,已知 miRNA 注釋,已知piRNA注釋,ncRNA分析,新 mi...
單細胞測序是什么?單細胞測序是基于高通量測序(Next-generationsequencingtechnology,NGS)方法,檢測群體中單細胞基因組、單細胞轉錄組、單細胞表觀基因組及單細胞蛋白組,提供細胞間差異的高分辨率視圖,從分子水平揭示細胞奧秘。單細胞轉錄組測序(Single-cellRNA-Sequencing,ScRNA-Seq)指在單細胞水平上對mRNA進行高通量測序和分析的技術。單細胞轉錄組測序能獲得單個細胞內近萬個基因的表達信息,為辨別生物組織中各種細胞類型的轉錄組特征和全方面揭示細胞之間基因表達的異質性提供了有力的工具[3]。說到細胞異質性(Cellheterogenei...
AO/PI染色原理:吖啶橙(AO)是一種小分子染料,可以通過完整的細胞膜,嵌入所有細胞(活細胞和死細胞)的細胞核,呈現綠色熒光;碘化丙啶(PI)只能通過不完整的細胞膜,即死細胞的細胞膜,嵌入所有死細胞的細胞核,呈現紅色熒光,通過標記出的綠色熒光和紅色熒光就可以辨別出活細胞和死細胞,這種特異性染色的方法也可以排除無核細胞、雜質、碎片等的干擾。熒光細胞計數儀檢測結果可以讓我們直觀的看到:細胞濃度(總細胞,活細胞,死細胞)、細胞存活率(臺盼藍和雙熒光AO/PI染色)、細胞平均直徑、細胞聚團率、細胞直徑分布等結果的展示。生工高通量測序部擁有豐富的樣品處理經驗,日均處理樣品200余例。ITS高通量測序應...
擴增子測序,項目介紹:隨著基因編輯技術(尤其是CRISPR-cas9技術)的發(fā)展,科研人員使用傳統(tǒng)的Sanger測序技術無法快速有效鑒定基因編輯效率。但是,通過對靶基因區(qū)域附近設計引物,進行PCR擴增,并對PCR產物進行高通量測序,可以快速高效的獲得目標區(qū)域的突變頻率信息,尤其是對低頻突變的檢測效果遠遠優(yōu)于一代測序,性價比極高。16S全長分類測序,項目介紹:16S全長測序分析主要是對 16S rRNA基因全長進行擴增,基于PacBio 測序平臺測序. 相比較二代測序只選擇 1-2 個高變區(qū)進行測序,三代可以獲得全長的 16S 序列,更多變異區(qū)信息可以提高物種鑒定的分辨率,還可以提高對于群落組成...
生工高通量測序樣品要求,RNA樣品:請?zhí)峁舛取?50 ng/μl、總量≥2μg的總RNA樣品,樣品請去蛋白并進行DNase處理;請務必提供每個樣品具體的濃度、體積、制備時間以及物種來源。比較好附上QC數據,可以是電泳膠圖、分光光度值、Nanodrop儀器檢測數據或者Agilent Bioanalyzer儀器檢測數據等;一般情況下,轉錄組測序需要Agilent Bioanalyzer儀器檢測獲得的總RNA 28S:18S≥1,RIN≥7;小RNA測測序不可采用常規(guī)柱式總RNA提取試劑盒,可選擇傳統(tǒng)總RNA提取法(如乙醇沉淀、異丙醇沉淀等)或者選用專門的小RNA提取試劑盒;寄送RNA樣品請置于1...
使用顯微鏡進行懸液質檢操作時應注意:1.使用血球計數板時,可以提前鏡檢觀察每小格計數室內是否潔凈無雜質。若有雜質灰層,則需要多次清洗,直至計數室潔凈無瑕;2.質檢前將懸液輕微震蕩或使用擴口gun頭吹打混勻;3.臺盼藍染色后需要盡快完成細胞計數,一般建議不要超過10分鐘;4.如果方格中細胞數目過多,難以數清,應當對細胞懸液進行稀釋以便于計數;5.對于壓在方格界線上的細胞應當計數同側相鄰兩邊上的細胞數,一般可采取“數上線不數下線,數左線不數右線”的原則處理,另兩邊不計數。PacBio Sequel/RSII 該測序平臺主要承接細菌基因組完成圖測序、fungus基因組精細圖測序、全長轉錄本測序服務。...
對于用RNA組織保存液寄送的樣品,請按照RNA組織保存液說明保存和寄送。請注意:1)樣品浸入組織保存液之前,對于動物組織樣品,須以建議快速度將樣品剪切成厚度小于0.5cm的碎塊;對于植物樣品,須以建議快速度將樣品剪切成厚度小于0.3cm的碎塊。2)鼠肝、腎和脾等小organ樣品和沒有蠟質保護層的植物樣品可不剪切直接放入保存液中保存,有蠟質保護層的植物樣品需要先將蠟表皮破壞。3)確保將樣品完全浸泡在保存液中,不讓其粘貼在管壁和蓋上。對于需要進行RNA抽提的部分特殊樣品,可以將組織在液氮中研磨后用TRIzol懸浮后用普通冰袋寄送。多重PCR高通量測序服務樣本寄送時,請將填寫完整的紙質版《高通量測序...
生工優(yōu)勢:1.生工高通量測序部擁有豐富的樣品處理經驗,日均處理樣品200余例,涵蓋污泥、糞便、海底沉泥、水體濾膜、植物組織、動物組織/細胞等樣品,省去您處理樣品的繁瑣過程。2.生物信息分析經驗豐富,可以滿足客戶標準分析到定制分析作圖的需求。且生工一直秉持只要生工已經標準化的分析內容(以生工分析報告模板為準),全部無費用。3.生工生物擁有生命科學領域較全的產品及服務體系,可以承接從分子到蛋白各個層級的實驗項目。一站式解決問題。請寄送樣本(尤其是細胞樣本)之前鑒定樣本所屬物種。上海16s高通量測序高通量使用顯微鏡進行懸液質檢操作時應注意:1.使用血球計數板時,可以提前鏡檢觀察每小格計數室內是否潔凈...
生工靶向捕獲測序,項目介紹:利用序列捕獲技術將基因組特定區(qū)域DNA捕捉并富集后進行高通量測序的基因組分析方法。全外顯子測序即通過對某一基因組中的所有外顯子進行測序從而獲得所有外顯子區(qū)域內的突變信息。由于該技術在臨床上的潛力,被《科學》雜志評為2010年科學進展之一。外顯子組測序可用于尋找單基因疾病、復雜疾?。ㄈ缣悄虿 ⒎逝职Y等代謝綜合癥)、甚至是cancer的致病基因或易感基因。生工生物采用Aglient SureSelect系列外顯子捕獲系統(tǒng),可以高效富集人全外顯子區(qū)域,并結合Illumina XTen測序平臺進行深度測序。后期可以完成SNP/InDel/CNV等變異檢測,形成完整的分析報告...
樣本寄送時,請將填寫完整的紙質版《高通量測序送樣表》密封于塑料袋內,隨樣本一起寄出,紙質版的樣本信息單用于樣本接收人員在收到樣本后及時并正確的保存并錄入樣本,如無紙質版的樣本信息單可能會延誤項目周期;樣本管壁或管蓋上標明的樣本名稱需要與《高通量測序送樣表》里樣本名稱一致,這樣可以避免我們收到樣本后與您確認樣本編號而耽誤樣本質檢、提取實驗;如有特殊情況,請在《高通量測序送樣表》中注明;樣品編號請避免使用中文、羅馬數字、“-”以及特殊符號標示,避免分析的時候系統(tǒng)無法識別,導致分析無法完成;我們分析人員建議編號可以采用英文字母與阿拉伯數字結合的形式,字符比較好不要過長,避免繪制部分分析圖的時候難以全...
RNA類高通量測序樣品要求:對于需要進行 RNA 抽提的樣品,請使用新鮮取樣的實驗材料,當場分成小塊(動物樣品厚度需小于0.5 cm,植物樣品厚度需小于0.3 cm)后立即用液氮或干冰乙醇速凍,保存于-80°C 冰箱,埋于足量的干冰(根據經驗,在秋冬季節(jié),如果打包合適,5 公斤塊狀干冰可以維持 50 小時,而小塊的干冰能更好的包裹樣品,但需比塊狀干冰多加些)中用保溫箱寄送。一般組織樣品,送樣量至少200 mg/樣;如果樣品屬于孢子,送樣量至少500 mg/樣。生工生物已開展10x單細胞轉錄組測序(scRNA-seq)服務,如果正好您有需要,那就快快來call我們吧!上海地區(qū)基因組高通量測序測序...
生工高通量測序部擁有豐富的樣品處理經驗,日均處理樣品200余例,涵蓋污泥、糞便、海底沉泥、水體濾膜、植物組織、動物組織/細胞等樣品,省去您處理樣品的繁瑣過程。生物信息分析經驗豐富,可以滿足客戶標準分析到定制分析作圖的需求。且生工一直秉持只要生工已經標準化的分析內容(以生工分析報告模板為準),全部free。生工生物擁有生命科學領域較全的產品及服務體系,可以承接從分子到蛋白各個層級的實驗項目,一站式解決問題。同時生工生物單細胞團隊目前已同時擁有10xGenomicsChromiumController和ChromiumX雙平臺,可為您提供超高通量和低通量單細胞樣本雙重。組織材料樣品(提取RNA用)...
RNA樣品:1.請務必提供每個樣品具體的濃度、體積、制備時間以及物種來源。比較好附上電泳膠圖或者 Agilent Bioanalyzer 儀器檢測數據等;2.對于普通轉錄組樣品,請?zhí)峁舛取?00 ng/μl、總量≥2 μg 的總 RNA 樣品,樣品請去蛋白并進行 DNase處理;一般情況下,普通轉錄組測序需要 RNA 樣品的 OD260/OD280為 2.0~2.2,Agilent Bioanalyzer 2100 器檢測獲得的總RNA 28S:18S≥1,RIN≥8;對于全長轉錄組測序樣品(ISO-seq),請?zhí)峁舛却笥?00 ng/ul,總量大于5 μg的總RNA樣品。樣品請去蛋白并進...
怎樣通過血球計數板進行質檢操作呢?將血球計數板擦拭干凈,取干凈的蓋玻片蓋在計數板上;將細胞懸液混勻(或10μl臺盼藍+10μl細胞懸液),吸出10μl懸液至計數板上蓋玻片的一側使細胞核懸液鋪滿蓋玻片和計數板之間;在顯微鏡下分別對V1/V2/V3/V4四個計數區(qū)域進行計數;按細胞計數公式進行計算,計算公式:細胞總數={(V1+V2+V3+V4)/4}*10000*懸液體積*稀釋倍數,V1/V2/V3/V4為各個計數區(qū)的細胞數目,細胞活率=活細胞數目/總細胞數目*100%。生物信息分析經驗豐富,可以滿足客戶標準分析到定制分析作圖的需求。上海SNP高通量測序生工人線粒體基因組測序(多重擴增法),項目...
使用顯微鏡進行懸液質檢操作時應注意:1.使用血球計數板時,可以提前鏡檢觀察每小格計數室內是否潔凈無雜質。若有雜質灰層,則需要多次清洗,直至計數室潔凈無瑕;2.質檢前將懸液輕微震蕩或使用擴口***頭吹打混勻;3.臺盼藍染色后需要盡快完成細胞計數,一般建議不要超過10分鐘;4.如果方格中細胞數目過多,難以數清,應當對細胞懸液進行稀釋以便于計數;5.對于壓在方格界線上的細胞應當計數同側相鄰兩邊上的細胞數,一般可采取“數上線不數下線,數左線不數右線”的原則處理,另兩邊不計數。于微生物樣品,請客戶如實聲明所屬物種,對于可能致病的微生物,生工保留拒收的權利。上海宏基因組高通量測序平臺樣本寄送時,請將填寫完...
微生物基因組重測序(有參):目前越來越多的微生物基因組被解析出來了。從而使得科研工作者們可以對某些物種微生物進行進行物種進化、種群特征、選擇壓力等研究。利用高通量測序技術,對有參考基因組微生物進行多個體的基因組重測序,精細分析其與參考基因組的SNP、InDel、SV等變異信息。微生物基因組從頭測序(無參):對于不斷分離培養(yǎng)微生物的客戶來說,要確定一個菌株是否是新菌株或者新菌種,較快捷的辦法就是,直接進行基因組測序。利用高通量測序技術,對這些基因組進行高深度測序,然后進行基因組組裝,獲得基因組的框架圖或者精細圖甚至是完成圖。從而可以快速解析其基因組結構、基因功能、進化關系。在運輸前將所有樣品管固...
RNA樣品:1.請務必提供每個樣品具體的濃度、體積、制備時間以及物種來源。比較好附上電泳膠圖或者 Agilent Bioanalyzer 儀器檢測數據等;2.對于普通轉錄組樣品,請?zhí)峁舛取?00 ng/μl、總量≥2 μg 的總 RNA 樣品,樣品請去蛋白并進行 DNase處理;一般情況下,普通轉錄組測序需要 RNA 樣品的 OD260/OD280為 2.0~2.2,Agilent Bioanalyzer 2100 器檢測獲得的總RNA 28S:18S≥1,RIN≥8;對于全長轉錄組測序樣品(ISO-seq),請?zhí)峁舛却笥?00 ng/ul,總量大于5 μg的總RNA樣品。樣品請去蛋白并進...
RNA樣品:1.請務必提供每個樣品具體的濃度、體積、制備時間以及物種來源。比較好附上電泳膠圖或者 Agilent Bioanalyzer 儀器檢測數據等;2.對于普通轉錄組樣品,請?zhí)峁舛取?00 ng/μl、總量≥2 μg 的總 RNA 樣品,樣品請去蛋白并進行 DNase處理;一般情況下,普通轉錄組測序需要 RNA 樣品的 OD260/OD280為 2.0~2.2,Agilent Bioanalyzer 2100 器檢測獲得的總RNA 28S:18S≥1,RIN≥8;對于全長轉錄組測序樣品(ISO-seq),請?zhí)峁舛却笥?00 ng/ul,總量大于5 μg的總RNA樣品。樣品請去蛋白并進...
全轉錄組測序(Total RNA-Seq),項目介紹:全轉錄組是指特定細胞在特定狀態(tài)下所能轉錄出來的所有RNA的總和,包括mRNA和非編碼RNA(non-coding RNA)。針對非編碼RNA的研究主要集中在具有調控作用的miRNA,lncRNA和circRNA。基于二代測序技術的全轉錄組測序研究,同時分析同一樣本中的mRNA,lncRNA,circRNA和miRNA,并且通過關聯分析,使研究內容更加系統(tǒng)化,致力于深入挖掘生命現象背后的轉錄調控問題。組織樣品或者總 RNA, 樣品名稱清晰,干冰運輸。如果你的樣品是質?;蛘呤蔷海菫槭裁床辉囋囄覀兊腒BSeq呢?上海地區(qū)靶向捕獲高通量測序公司...
使用顯微鏡進行懸液質檢操作時應注意:1.使用血球計數板時,可以提前鏡檢觀察每小格計數室內是否潔凈無雜質。若有雜質灰層,則需要多次清洗,直至計數室潔凈無瑕;2.質檢前將懸液輕微震蕩或使用擴口gun頭吹打混勻;3.臺盼藍染色后需要盡快完成細胞計數,一般建議不要超過10分鐘;4.如果方格中細胞數目過多,難以數清,應當對細胞懸液進行稀釋以便于計數;5.對于壓在方格界線上的細胞應當計數同側相鄰兩邊上的細胞數,一般可采取“數上線不數下線,數左線不數右線”的原則處理,另兩邊不計數。關鍵是KBSeq還可以省錢。羥甲基化測序高通量測序應用生工人線粒體基因組測序(多重擴增法),項目介紹:生工生物高通量測序部采用多...
生工人線粒體基因組測序(多重擴增法),項目介紹:生工生物高通量測序部采用多重擴增技術,對人線粒體基因組進行擴增捕獲,并進一步采用Illumina測序平臺進行高通量測序。該技術方案可以快速擴增到幾乎線粒體全長,并進行高深度測序,下游提供常規(guī)比對篩查突變等生物信息分析??蛻籼峁悠奉愋停?.人來源DNA,濃度大于1ng/ul,總量大于20ng,以Qubit檢測結果為準2.運輸條件:冰袋運輸。交付信息:1.測序原始數據交付實驗報告2.測序原始數據3.突變分析結果。準確、迅速,可以說是KBSeq的代名詞了。SNP高通量測序NGS對于細胞樣品,送樣量需達到 5 × 106(5乘10的6次方)數量級。富集...
RNA類高通量測序樣品要求:對于需要進行 RNA 抽提的樣品,請使用新鮮取樣的實驗材料,當場分成小塊(動物樣品厚度需小于0.5 cm,植物樣品厚度需小于0.3 cm)后立即用液氮或干冰乙醇速凍,保存于-80°C 冰箱,埋于足量的干冰(根據經驗,在秋冬季節(jié),如果打包合適,5 公斤塊狀干冰可以維持 50 小時,而小塊的干冰能更好的包裹樣品,但需比塊狀干冰多加些)中用保溫箱寄送。一般組織樣品,送樣量至少200 mg/樣;如果樣品屬于孢子,送樣量至少500 mg/樣。請寄送樣本(尤其是細胞樣本)之前鑒定樣本所屬物種。18s高通量測序公司單細胞轉錄組測序中,制備高質量的單細胞懸液至關重要。而懸液制備好后...
small RNA測序,項目簡介:Small RNA是一類重要的體內調節(jié)分子,長度在18-30 nt之間,主要包括miRNA、piRNA和siRNA。它的功能主要是誘導基因沉默,參與基因轉錄后調控,從而調節(jié)細胞生長、分化,以及個體發(fā)育、生殖等重要生物學過程。高通量測序技術可以對樣本中所有small RNA家族進行測序和表達定量,從而解析miRNA、siRNA、piRNA和其它非編碼RNA以及相應靶序列。測序使用Illumina Xten平臺,測序原始數據質控后,進行Clean reads 長度分布統(tǒng)計,small RNA注釋,已知 miRNA 注釋,已知piRNA注釋,ncRNA分析,新 mi...
生工靶向捕獲測序,項目介紹:利用序列捕獲技術將基因組特定區(qū)域DNA捕捉并富集后進行高通量測序的基因組分析方法。全外顯子測序即通過對某一基因組中的所有外顯子進行測序從而獲得所有外顯子區(qū)域內的突變信息。由于該技術在臨床上的潛力,被《科學》雜志評為2010年科學進展之一。外顯子組測序可用于尋找單基因疾病、復雜疾?。ㄈ缣悄虿 ⒎逝职Y等代謝綜合癥)、甚至是cancer的致病基因或易感基因。生工生物采用Aglient SureSelect系列外顯子捕獲系統(tǒng),可以高效富集人全外顯子區(qū)域,并結合Illumina XTen測序平臺進行深度測序。后期可以完成SNP/InDel/CNV等變異檢測,形成完整的分析報告...
通過顯微鏡使用血球計數板質檢能觀察到懸液背景質量和細胞數目及活性的評估。讓我們再來回顧一下臺盼藍染色原理:臺盼藍染色原理:臺盼藍不能透過活細胞正常完整的細胞膜,故活細胞不被染色。而死細胞的細胞膜透性增高,可使染料進入細胞內而使死細胞染成淡藍色。怎樣通過血球計數板進行質檢操作呢?將血球計數板擦拭干凈,取干凈的蓋玻片蓋在計數板上;將細胞懸液混勻(或10μl臺盼藍+10μl細胞懸液),吸出10μl懸液至計數板上蓋玻片的一側使細胞核懸液鋪滿蓋玻片和計數板之間;在顯微鏡下分別對V1/V2/V3/V4四個計數區(qū)域進行計數;按細胞計數公式進行計算,計算公式:細胞總數={(V1+V2+V3+V4)/4}*10...
單細胞測序技術的應用:單細胞測序技術可以檢測復雜組織中單個細胞不同的生物學特性,這可以極大的幫助我們進一步了解細胞與細胞之間的差異。"這幾乎就像通過幾顆星星看到了整個宇宙。"哈佛大學分子和細胞生物學教授 Alexander Schier的這句話應用在這里也是很合適了。這幅圖正是來自于在2018年4月 Science 雜志發(fā)表的三篇[8-10]來自哈佛醫(yī)學院和哈佛大學的研究人員關于單細胞基因測序文章中的一幅結果圖,Alexander Schier教授也是其中一篇文章的作者。這幾篇文章使用多種檢測技術組合,其中包括對數千個發(fā)育中的斑馬魚和青蛙胚胎單細胞測序,在胚胎發(fā)育建議初的24小時內追蹤單個細胞...
通過顯微鏡使用血球計數板質檢能觀察到懸液背景質量和細胞數目及活性的評估。讓我們再來回顧一下臺盼藍染色原理:臺盼藍染色原理:臺盼藍不能透過活細胞正常完整的細胞膜,故活細胞不被染色。而死細胞的細胞膜透性增高,可使染料進入細胞內而使死細胞染成淡藍色。怎樣通過血球計數板進行質檢操作呢?將血球計數板擦拭干凈,取干凈的蓋玻片蓋在計數板上;將細胞懸液混勻(或10μl臺盼藍+10μl細胞懸液),吸出10μl懸液至計數板上蓋玻片的一側使細胞核懸液鋪滿蓋玻片和計數板之間;在顯微鏡下分別對V1/V2/V3/V4四個計數區(qū)域進行計數;按細胞計數公式進行計算,計算公式:細胞總數={(V1+V2+V3+V4)/4}*10...
單細胞懸液質檢方法,在進行單細胞懸液質檢時,需要用到以下兩大質檢利器的輔助:熒光細胞計數儀(主要使用臺盼藍和雙熒光AO/PI染色法)進行質檢。首先我們先要了解一下細胞質檢時染料染色的原理:臺盼藍染色原理:臺盼藍不能透過活細胞正常完整的細胞膜,故活細胞不被染色。而死細胞的細胞膜透性增高,可使染料進入細胞內而使死細胞染成淡藍色。熒光細胞計數儀檢測結果可以讓我們直觀的看到:細胞濃度(總細胞,活細胞,死細胞)、細胞存活率(臺盼藍和雙熒光AO/PI染色)、細胞平均直徑、細胞聚團率、細胞直徑分布等結果的展示。DNA樣品請用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封好,并安置于50 mL離心管內或其他類似容器里,并...
使用顯微鏡進行懸液質檢操作時應注意:1.使用血球計數板時,可以提前鏡檢觀察每小格計數室內是否潔凈無雜質。若有雜質灰層,則需要多次清洗,直至計數室潔凈無瑕;2.質檢前將懸液輕微震蕩或使用擴口gun頭吹打混勻;3.臺盼藍染色后需要盡快完成細胞計數,一般建議不要超過10分鐘;4.如果方格中細胞數目過多,難以數清,應當對細胞懸液進行稀釋以便于計數;5.對于壓在方格界線上的細胞應當計數同側相鄰兩邊上的細胞數,一般可采取“數上線不數下線,數左線不數右線”的原則處理,另兩邊不計數。生工生物接受客戶自備文庫測序項目。上?;蚪M高通量測序NGS 真核/原核無參mRNA-Seq,項目介紹;測序使用Illumin...