上海地區(qū)無參轉錄組高通量測序服務

RNA樣品：1.請務必提供每個樣品具體的濃度、體積、制備時間以及物種來源。比較好附上電泳膠圖或者 Agilent Bioanalyzer 儀器檢測數(shù)據(jù)等；2.對于普通轉錄組樣品，請?zhí)峁舛取?00 ng/μl、總量≥2 μg 的總 RNA 樣品，樣品請去蛋白并進行 DNase處理；一般情況下，普通轉錄組測序需要 RNA 樣品的 OD260/OD280為 2.0~2.2，Agilent Bioanalyzer 2100 器檢測獲得的總RNA 28S:18S≥1，RIN≥8；對于全長轉錄組測序樣品（ISO-seq）,請?zhí)峁舛却笥?00 ng/ul，總量大于5 μg的總RNA樣品。樣品請去蛋白并進行 DNase 處理；全長轉錄組測序需要 RNA 樣品的 OD260/OD280 為 2.0~2.2，2.3Agilent Bioanalyzer 2100 器檢測獲得的總RNA 28S:18S≥1，RIN≥8.5；小RNA測測序不可采用常規(guī)柱式總RNA提取試劑盒。上海地區(qū)無參轉錄組高通量測序服務

生工高通量測序樣品要求，組織/細胞樣品：請使用新鮮取樣的實驗材料，當場分成小塊后立即用液氮或干冰乙醇速凍，保存于-80°C冰箱，用足量的干冰（根據(jù)經(jīng)驗，在秋冬季節(jié)，如果打包合適，3公斤塊狀干冰可以維持30-40小時）寄送;于微生物樣品，請客戶如實聲明所屬物種，對于可能致病的微生物，生工保留拒收的權利;對于需要進行RNA抽提的樣品，可以但不建議將組織在液氮中研磨后用TRIzol懸浮后用普通冰袋寄送，具體情況請先取得溝通。上海地區(qū)生工生物 高通量測序項目如果問現(xiàn)在什么技術是測序屆的寵兒，那么單細胞測序則是我們不得不提及的技術了。

單細胞測序是什么？單細胞測序是基于高通量測序（Next-generationsequencingtechnology，NGS）方法，檢測群體中單細胞基因組、單細胞轉錄組、單細胞表觀基因組及單細胞蛋白組，提供細胞間差異的高分辨率視圖，從分子水平揭示細胞奧秘。單細胞轉錄組測序（Single-cellRNA-Sequencing，ScRNA-Seq）指在單細胞水平上對mRNA進行高通量測序和分析的技術。單細胞轉錄組測序能獲得單個細胞內(nèi)近萬個基因的表達信息，為辨別生物組織中各種細胞類型的轉錄組特征和全方面揭示細胞之間基因表達的異質(zhì)性提供了有力的工具[3]。說到細胞異質(zhì)性（Cellheterogeneity)，就要說到我們?yōu)槭裁匆脝渭毎麥y序技術了。

高通量測序技術是可以平行對數(shù)百萬甚至數(shù)十億條序列測序的技術。在基因組測序、轉錄組測序、宏基因組測序、表觀遺傳測序、外顯子捕獲測序、靶區(qū)域測序等諸多科研及精細醫(yī)療檢測領域內(nèi)有普遍的運用。生工生物工程（上海）股份有限公司自2011年成立高通量測序部以來，逐步引進了Illumina，Life，PacBio等二代/三代測序平臺。建立了2000m2高標準實驗室（通過了國家ISO認證）以及10PB級運算能力的服務器集群，能滿足絕大多數(shù)科研客戶的研究需要。同時，生工高通量測序團隊建設也在不斷完善中，目前有50余專職員工，其中高級技術人員以及高級生物信息工程師占比50%以上，5年來，通過生工高通量測序結果發(fā)表的文章累計影響因子超過1000分以上。特別申明：不能采用過柱離心的方法提取總RNA。

使用顯微鏡進行懸液質(zhì)檢操作時應注意：1.使用血球計數(shù)板時，可以提前鏡檢觀察每小格計數(shù)室內(nèi)是否潔凈無雜質(zhì)。若有雜質(zhì)灰層，則需要多次清洗，直至計數(shù)室潔凈無瑕；2.質(zhì)檢前將懸液輕微震蕩或使用擴口***頭吹打混勻；3.臺盼藍染色后需要盡快完成細胞計數(shù)，一般建議不要超過10分鐘；4.如果方格中細胞數(shù)目過多，難以數(shù)清，應當對細胞懸液進行稀釋以便于計數(shù)；5.對于壓在方格界線上的細胞應當計數(shù)同側相鄰兩邊上的細胞數(shù)，一般可采取“數(shù)上線不數(shù)下線，數(shù)左線不數(shù)右線”的原則處理，另兩邊不計數(shù)。PacBio Sequel/RSII 該測序平臺主要承接細菌基因組完成圖測序、fungus基因組精細圖測序、全長轉錄本測序服務。上海市16s高通量測序項目

DNA樣品請用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封好，并安置于50 mL離心管內(nèi)或其他類似容器里，并旋緊蓋子。上海地區(qū)無參轉錄組高通量測序服務

真核/原核有參mRNA-Seq，項目介紹：轉錄組（transcriptome）廣義上指某一生理條件下，細胞內(nèi)所有轉錄產(chǎn)物的gather，狹義上指所有mRNA的gather。轉錄組是研究基因表達的主要手段，是連接基因組遺傳信息與生物功能的蛋白質(zhì)組的紐帶。轉錄水平的調(diào)控是生物體重要的調(diào)控方式，通過轉錄組測序分析轉錄水平的調(diào)控，是目前運用較多的研究方式。測序使用Illumina Xten平臺，測序原始數(shù)據(jù)經(jīng)過質(zhì)控后，mapping至參考基因組序列，對mapping到基因上的reads進行計數(shù)，計算基因的表達量后，進行基因表達差異及差異基因GO、KOG（原核生物為COG）、KEGG功能富集分析，KEGG pathway等分析。對于多個樣本，可進行重復相關性檢查、共表達分析、PCA主成分分析。另外，依據(jù)參考基因組，可進行諸如基因覆蓋度、測序飽和度等驗證性分析；可變剪切分析、SNP/InDel分析、新轉錄本預測以及聯(lián)合miRNA數(shù)據(jù)進行關聯(lián)分析等分析。另外，還可以進行基因功能互作、蛋白網(wǎng)絡互作等分析，深入研究基因功能，進一步揭示基因間互作網(wǎng)絡等信息，為研究網(wǎng)絡調(diào)控機理提供方向。上海地區(qū)無參轉錄組高通量測序服務

生工生物工程（上海）股份有限公司在同行業(yè)領域中，一直處在一個不斷銳意進取，不斷制造創(chuàng)新的市場高度，多年以來致力于發(fā)展富有創(chuàng)新價值理念的產(chǎn)品標準，在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康中始終保持良好的商業(yè)口碑，成績讓我們喜悅，但不會讓我們止步，殘酷的市場磨煉了我們堅強不屈的意志，和諧溫馨的工作環(huán)境，富有營養(yǎng)的公司土壤滋養(yǎng)著我們不斷開拓創(chuàng)新，勇于進取的無限潛力，生工生物工程供應攜手大家一起走向共同輝煌的未來，回首過去，我們不會因為取得了一點點成績而沾沾自喜，相反的是面對競爭越來越激烈的市場氛圍，我們更要明確自己的不足，做好迎接新挑戰(zhàn)的準備，要不畏困難，激流勇進，以一個更嶄新的精神面貌迎接大家，共同走向輝煌回來！