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IlluminaHiSeq2500/4000可以運(yùn)行PE150/PE250模式,可以承擔(dān)轉(zhuǎn)錄組測序、人基因組重測序、外顯子捕獲測序、宏基因組測序、微生物分類測序等服務(wù);IlluminaMiSeq運(yùn)行PE300模式,可以承擔(dān)細(xì)菌基因組重測序/Denovo測序、微生物分類測序、擴(kuò)增子測序、核酸適配體測序等服務(wù);LifeIontorrentPGM運(yùn)行314、316、318芯片,可以承接擴(kuò)增子測序、靶區(qū)域測序、基因組重測序服務(wù);PacBioSequel/RSII該測序平臺(tái)讀長超長,平均可達(dá)10kb以上,主要承接細(xì)菌基因組完成圖測序、***基因組精細(xì)圖測序、全長轉(zhuǎn)錄本測序等服務(wù);ChIP項(xiàng)目至少要求50ng DNA,以Qubit 2.0檢測為準(zhǔn)。其余具體咨詢生工高通量測序部。上海地區(qū)全質(zhì)粒測序高通量測序測序
高通量測序技術(shù)是可以平行對(duì)數(shù)百萬甚至數(shù)十億條序列測序的技術(shù)。在基因組測序、轉(zhuǎn)錄組測序、宏基因組測序、表觀遺傳測序、外顯子捕獲測序、靶區(qū)域測序等諸多科研及精細(xì)醫(yī)療檢測領(lǐng)域內(nèi)有普遍的運(yùn)用。生工生物工程(上海)股份有限公司自2011年成立高通量測序部以來,逐步引進(jìn)了Illumina,Life,PacBio等二代/三代測序平臺(tái)。建立了2000m2高標(biāo)準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)室(通過了國家ISO認(rèn)證)以及10PB級(jí)運(yùn)算能力的服務(wù)器集群,能滿足絕大多數(shù)科研客戶的研究需要。同時(shí),生工高通量測序團(tuán)隊(duì)建設(shè)也在不斷完善中,目前有50余專職員工,其中高級(jí)技術(shù)人員以及高級(jí)生物信息工程師占比50%以上,5年來,通過生工高通量測序結(jié)果發(fā)表的文章累計(jì)影響因子超過1000分以上。高通量測序公司一臺(tái)10xGenomics Chromium X儀器能夠在單次運(yùn)行中分析數(shù)百至數(shù)十萬個(gè)細(xì)胞,讓百萬級(jí)的細(xì)胞研究變得常規(guī)。
small RNA測序,項(xiàng)目簡介:Small RNA是一類重要的體內(nèi)調(diào)節(jié)分子,長度在18-30 nt之間,主要包括miRNA、piRNA和siRNA。它的功能主要是誘導(dǎo)基因沉默,參與基因轉(zhuǎn)錄后調(diào)控,從而調(diào)節(jié)細(xì)胞生長、分化,以及個(gè)體發(fā)育、生殖等重要生物學(xué)過程。高通量測序技術(shù)可以對(duì)樣本中所有small RNA家族進(jìn)行測序和表達(dá)定量,從而解析miRNA、siRNA、piRNA和其它非編碼RNA以及相應(yīng)靶序列。測序使用Illumina Xten平臺(tái),測序原始數(shù)據(jù)質(zhì)控后,進(jìn)行Clean reads 長度分布統(tǒng)計(jì),small RNA注釋,已知 miRNA 注釋,已知piRNA注釋,ncRNA分析,新 miRNA 預(yù)測(有參考基因組),差異基因可視化分析,miRNA 家族分析,差異表達(dá) miRNA 聚類分析,miRNA靶基因預(yù)測,靶基因GO、KEGG富集分析。
2021年11月1日,在這個(gè)平凡而又特殊的日子里,生工生物高通量測序部迎來了一位新成員——10xGenomics Chromium X!不要看我們個(gè)頭小,我們可是百萬級(jí)單細(xì)胞捕獲神器吆。X是如何實(shí)現(xiàn)單次運(yùn)行有這么高的吞吐量呢?多通道+高捕獲+10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù)。X儀器本身有16個(gè)通道(Controller為8通道),每個(gè)通道比較多捕獲20000個(gè)細(xì)胞(Controller為10000個(gè)細(xì)胞)。再結(jié)合10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù),每個(gè)通道比較多可捕獲60,000個(gè)細(xì)胞,去除雙細(xì)胞率后,每張芯片比較多可捕獲750,000個(gè)單細(xì)胞。小RNA測測序不可采用常規(guī)柱式總RNA提取試劑盒。
細(xì)胞質(zhì)檢時(shí)染料染色的原理:臺(tái)盼藍(lán)染色原理:臺(tái)盼藍(lán)不能透過活細(xì)胞正常完整的細(xì)胞膜,故活細(xì)胞不被染色。而死細(xì)胞的細(xì)胞膜透性增高,可使染料進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)而使死細(xì)胞染成淡藍(lán)色。AO/PI染色原理:吖啶橙(AO)是一種小分子染料,可以通過完整的細(xì)胞膜,嵌入所有細(xì)胞(活細(xì)胞和死細(xì)胞)的細(xì)胞核,呈現(xiàn)綠色熒光;碘化丙啶(PI)只能通過不完整的細(xì)胞膜,即死細(xì)胞的細(xì)胞膜,嵌入所有死細(xì)胞的細(xì)胞核,呈現(xiàn)紅色熒光,通過標(biāo)記出的綠色熒光和紅色熒光就可以辨別出活細(xì)胞和死細(xì)胞,這種特異性染色的方法也可以排除無核細(xì)胞、雜質(zhì)、碎片等的干擾。生工生物已開展10x單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序(scRNA-seq)服務(wù),如果正好您有需要,那就快快來call我們吧!上海地區(qū)ITS高通量測序測序
請(qǐng)注意選擇無RNA酶的容器盛放樣本,盡量避免RNA降解。上海地區(qū)全質(zhì)粒測序高通量測序測序
生工優(yōu)勢:1.生工高通量測序部擁有豐富的樣品處理經(jīng)驗(yàn),日均處理樣品200余例,涵蓋污泥、糞便、海底沉泥、水體濾膜、植物組織、動(dòng)物組織/細(xì)胞等樣品,省去您處理樣品的繁瑣過程。2.生物信息分析經(jīng)驗(yàn)豐富,可以滿足客戶標(biāo)準(zhǔn)分析到定制分析作圖的需求。且生工一直秉持只要生工已經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)化的分析內(nèi)容(以生工分析報(bào)告模板為準(zhǔn)),全部無費(fèi)用。3.生工生物擁有生命科學(xué)領(lǐng)域較全的產(chǎn)品及服務(wù)體系,可以承接從分子到蛋白各個(gè)層級(jí)的實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目。一站式解決問題。上海地區(qū)全質(zhì)粒測序高通量測序測序
生工生物工程(上海)股份有限公司致力于醫(yī)藥健康,是一家生產(chǎn)型公司。生工生物致力于為客戶提供良好的生化試劑,實(shí)驗(yàn)耗材,實(shí)驗(yàn)試劑,研發(fā),一切以用戶需求為中心,深受廣大客戶的歡迎。公司秉持誠信為本的經(jīng)營理念,在醫(yī)藥健康深耕多年,以技術(shù)為先導(dǎo),以自主產(chǎn)品為重點(diǎn),發(fā)揮人才優(yōu)勢,打造醫(yī)藥健康良好品牌。生工生物立足于全國市場,依托強(qiáng)大的研發(fā)實(shí)力,融合前沿的技術(shù)理念,及時(shí)響應(yīng)客戶的需求。