small RNA高通量測序平臺

來源: 發(fā)布時間:2022-08-12

土壤樣本請置于2 mL離心管里(多準備幾管備用),為保護樣本管,樣本管置于保護用的50 mL離心管或其他類似容器里,并旋緊蓋子;如常溫采的樣品,可以采用藍冰運輸;如果是高溫發(fā)酵罐或者樣品已經(jīng)凍存-80°C,需要用足量干冰運輸; DNA樣品請用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封好,并安置于50 mL離心管內(nèi)或其他類似容器里,并旋緊蓋子;藍冰運輸;RNA樣品請用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封好,并安置于50 mL離心管內(nèi)或其他類似容器里,并旋緊蓋子;用足量干冰運輸。 現(xiàn)在也有學者為了區(qū)分傳統(tǒng)測序和單細胞測序的區(qū)別,將傳統(tǒng)方法稱為批量測序。small RNA高通量測序平臺

對于微生物樣品,請客戶如實聲明所屬物種;對于可能致病的微生物,生工將拒收。以固體培養(yǎng)基培養(yǎng)的樣品,需將樣品從培養(yǎng)基上刮取下來,用干冰寄送;以液體培養(yǎng)基培養(yǎng)的樣品,需離心后棄培養(yǎng)液收集樣品,用RNA組織保存液(例如RNA-Be-Locker A)保存,以干冰或冰袋寄送;沒有RNA組織保存液的情況下,也可用液氮或干冰乙醇速凍,保存于-80°C 冰箱,埋于足量干冰寄送。***樣品送樣量需至少達到100 mg/樣;細菌樣品送樣量需至少達到107(10的7次方)數(shù)量級,同時,在與樣本一同寄送的送樣表上,標明屬于革蘭氏陽性菌(G+)還是革蘭氏陰性菌(G-)。上海地區(qū)SNP高通量測序DNA樣品請用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封好,并安置于50 mL離心管內(nèi)或其他類似容器里,并旋緊蓋子。

微生物基因組重測序(有參):目前越來越多的微生物基因組被解析出來了。從而使得科研工作者們可以對某些物種微生物進行進行物種進化、種群特征、選擇壓力等研究。利用高通量測序技術(shù),對有參考基因組微生物進行多個體的基因組重測序,精細分析其與參考基因組的SNP、InDel、SV等變異信息。微生物基因組從頭測序(無參):對于不斷分離培養(yǎng)微生物的客戶來說,要確定一個菌株是否是新菌株或者新菌種,較快捷的辦法就是,直接進行基因組測序。利用高通量測序技術(shù),對這些基因組進行高深度測序,然后進行基因組組裝,獲得基因組的框架圖或者精細圖甚至是完成圖。從而可以快速解析其基因組結(jié)構(gòu)、基因功能、進化關(guān)系。

為什么要用單細胞測序技術(shù)?細胞是生物體結(jié)構(gòu)和功能的基本單位,在生物體生長發(fā)育的過程中,因細胞類型、外界環(huán)境以及內(nèi)部調(diào)節(jié)因素的不同,其轉(zhuǎn)錄組信息也不盡相同。由于基因組和表觀遺傳的重編程,以及在細胞分裂和分化過程中出現(xiàn)的誤差造成來自同一細胞系或個體的細胞呈現(xiàn)出不同的基因組、轉(zhuǎn)錄組和表觀基因組[4]。這就是我們上面提到的細胞異質(zhì)性。細胞異質(zhì)性是生物組織和生物系統(tǒng)的普遍特征[5]。但是我們常規(guī)的二代測序檢測的是一個細胞群體的基因組、轉(zhuǎn)錄組的信息,如培養(yǎng)的大量細胞、動植物組織甚至是整個生物體。在過去的20多年中,人們對轉(zhuǎn)錄組的人數(shù)仍然局限在群體水平[6]。這種方法可以為我們提供大量的基因組或轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),卻無法揭示細胞的異質(zhì)性。傳統(tǒng)方法得到的是細胞群的平均基因組,而單細胞測序測量的是細胞群中單個細胞的基因組[7]?,F(xiàn)在也有學者為了區(qū)分傳統(tǒng)測序和單細胞測序的區(qū)別,將傳統(tǒng)方法稱為批量測序。請注意選擇無RNA酶的容器盛放樣本,盡量避免RNA降解。

生工靶向捕獲測序,項目介紹:利用序列捕獲技術(shù)將基因組特定區(qū)域DNA捕捉并富集后進行高通量測序的基因組分析方法。全外顯子測序即通過對某一基因組中的所有外顯子進行測序從而獲得所有外顯子區(qū)域內(nèi)的突變信息。由于該技術(shù)在臨床上的潛力,被《科學》雜志評為2010年科學進展之一。外顯子組測序可用于尋找單基因疾病、復雜疾?。ㄈ缣悄虿?、肥胖癥等代謝綜合癥)、甚至是cancer的致病基因或易感基因。生工生物采用Aglient SureSelect系列外顯子捕獲系統(tǒng),可以高效富集人全外顯子區(qū)域,并結(jié)合Illumina XTen測序平臺進行深度測序。后期可以完成SNP/InDel/CNV等變異檢測,形成完整的分析報告。對于需要進行RNA抽提的部分特殊樣品,可以將組織在液氮中研磨后用TRIzol懸浮后用普通冰袋寄送。上海lncRNA高通量測序技術(shù)

請?zhí)峁╇娪灸z圖,濃度>20 ng/μl,總量一般1~2 μg。乙醇沉淀DNA或凍干DNA,可冰袋運輸,不超過3天。small RNA高通量測序平臺

核酸適配體測序,項目介紹:核酸適配體是一類能夠特異性地和靶物質(zhì)結(jié)合的寡核苷酸序列。它可作用于蛋白質(zhì)、金屬離子、小分子化合物、細胞膜表面受體等靶標。其結(jié)合能力可與抗體相當甚至更強,同時具有低免疫原性、 穩(wěn)定性好等特點,并可結(jié)合各種藥物及載體構(gòu)建多元復合靶向給藥系統(tǒng)用于tumour靶向treat, 在生物醫(yī)學領(lǐng)域有潛在高價值。生工生物針對核酸適配體特殊結(jié)構(gòu),結(jié)合Illumina MiSeq測序平臺,可以快速對核酸適配體文庫進行大規(guī)模高通量測序,省去克隆測序的麻煩,提高測序深度,快速計算適配體序列頻率,方便科研客戶快速評估序列富集程度。small RNA高通量測序平臺

生工生物工程(上海)股份有限公司致力于醫(yī)藥健康,是一家生產(chǎn)型的公司。公司業(yè)務分為生化試劑,實驗耗材,實驗試劑,研發(fā)等,目前不斷進行創(chuàng)新和服務改進,為客戶提供良好的產(chǎn)品和服務。公司從事醫(yī)藥健康多年,有著創(chuàng)新的設(shè)計、強大的技術(shù),還有一批專業(yè)化的隊伍,確保為客戶提供良好的產(chǎn)品及服務。在社會各界的鼎力支持下,持續(xù)創(chuàng)新,不斷鑄造高質(zhì)量服務體驗,為客戶成功提供堅實有力的支持。

標簽: 高通量測序