上海市基因組高通量測序NGS

來源: 發(fā)布時間:2022-08-10

如果你的樣品是質(zhì)粒或者是菌液,那為什么不試試我們的KBSeq呢?準(zhǔn)確、迅速,可以說是KBSeq的代名詞了,關(guān)鍵是還可以省錢,估計這是很多小伙伴們一定會說,你這個服務(wù)單價可比Sanger貴多了,怎么可能會省錢呢?Sanger測序的價格:常規(guī)的一代測序基本上要每800 bp就測一個反應(yīng),那我們來算一下14000/800=17.5,那基本上就要測18個反應(yīng)了,按照現(xiàn)在生工官方的價格區(qū)間,這個屬于反應(yīng)數(shù)在10-49個反應(yīng)之間的,那每個反應(yīng)的價格為26元,這樣算下來18*26=468元,還要加上引物合成的費用,實驗周期的話大概率是要超過15天的。KBSeq全質(zhì)粒測序的價格:序列長度屬于6-15 kb之間,159元,實驗的周期大概在5-7天左右。什么是KBSeq全質(zhì)粒測序?上海市基因組高通量測序NGS

16s/18s/ITS微生物分類測序,項目介紹:環(huán)境微生物是自然界中分布建議廣、種類建議多、數(shù)量比較大的生物類群,其群落結(jié)構(gòu)及多樣性和微生物的功能及代謝機(jī)理是微生物生態(tài)學(xué)的研究熱點,對于我們研究微生物與環(huán)境的關(guān)系、環(huán)境治理和微生物資源的利用以及人類醫(yī)療健康有著重要的理論和現(xiàn)實意義。隨著高通量測序技術(shù)的發(fā)展以及大量序列數(shù)據(jù)的積累,通用引物擴(kuò)增結(jié)合高通量測序技術(shù),可以快速檢索環(huán)境內(nèi)微生物的群落結(jié)構(gòu)。這項運用我們稱之為微生物分類測序。如Illumina公司的MiSeq高通量測序平臺不僅可實現(xiàn)對多樣品的多個可變區(qū)同時測序,而且在測序速度和測序通量上都有進(jìn)一步提升,目前此平臺已在微生物多樣性群落結(jié)構(gòu)研究方面受到了廣大學(xué)者的認(rèn)可。上海市羥甲基化測序高通量測序NGS組織材料樣品(提取RNA用)建議將標(biāo)簽用膠帶貼到管壁,干冰運輸。

通過顯微鏡使用血球計數(shù)板質(zhì)檢能觀察到懸液背景質(zhì)量和細(xì)胞數(shù)目及活性的評估。讓我們再來回顧一下臺盼藍(lán)染色原理:臺盼藍(lán)染色原理:臺盼藍(lán)不能透過活細(xì)胞正常完整的細(xì)胞膜,故活細(xì)胞不被染色。而死細(xì)胞的細(xì)胞膜透性增高,可使染料進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)而使死細(xì)胞染成淡藍(lán)色。怎樣通過血球計數(shù)板進(jìn)行質(zhì)檢操作呢?將血球計數(shù)板擦拭干凈,取干凈的蓋玻片蓋在計數(shù)板上;將細(xì)胞懸液混勻(或10μl臺盼藍(lán)+10μl細(xì)胞懸液),吸出10μl懸液至計數(shù)板上蓋玻片的一側(cè)使細(xì)胞核懸液鋪滿蓋玻片和計數(shù)板之間;在顯微鏡下分別對V1/V2/V3/V4四個計數(shù)區(qū)域進(jìn)行計數(shù);按細(xì)胞計數(shù)公式進(jìn)行計算,計算公式:細(xì)胞總數(shù)={(V1+V2+V3+V4)/4}*10000*懸液體積*稀釋倍數(shù),V1/V2/V3/V4為各個計數(shù)區(qū)的細(xì)胞數(shù)目,細(xì)胞活率=活細(xì)胞數(shù)目/總細(xì)胞數(shù)目*100%。

生工高通量測序部擁有豐富的樣品處理經(jīng)驗,日均處理樣品200余例,涵蓋污泥、糞便、海底沉泥、水體濾膜、植物組織、動物組織/細(xì)胞等樣品,省去您處理樣品的繁瑣過程。生物信息分析經(jīng)驗豐富,可以滿足客戶標(biāo)準(zhǔn)分析到定制分析作圖的需求。且生工一直秉持只要生工已經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)化的分析內(nèi)容(以生工分析報告模板為準(zhǔn)),全部free。生工生物擁有生命科學(xué)領(lǐng)域較全的產(chǎn)品及服務(wù)體系,可以承接從分子到蛋白各個層級的實驗項目,一站式解決問題。同時生工生物單細(xì)胞團(tuán)隊目前已同時擁有10xGenomicsChromiumController和ChromiumX雙平臺,可為您提供超高通量和低通量單細(xì)胞樣本雙重。近年來,隨著高通量測序技術(shù)的發(fā)展和普及,單細(xì)胞測序技術(shù)發(fā)展十分迅速。

RNA樣品:1.請務(wù)必提供每個樣品具體的濃度、體積、制備時間以及物種來源。比較好附上電泳膠圖或者 Agilent Bioanalyzer 儀器檢測數(shù)據(jù)等;2.對于普通轉(zhuǎn)錄組樣品,請?zhí)峁舛取?00 ng/μl、總量≥2 μg 的總 RNA 樣品,樣品請去蛋白并進(jìn)行 DNase處理;一般情況下,普通轉(zhuǎn)錄組測序需要 RNA 樣品的 OD260/OD280為 2.0~2.2,Agilent Bioanalyzer 2100 器檢測獲得的總RNA 28S:18S≥1,RIN≥8;對于全長轉(zhuǎn)錄組測序樣品(ISO-seq),請?zhí)峁舛却笥?00 ng/ul,總量大于5 μg的總RNA樣品。樣品請去蛋白并進(jìn)行 DNase 處理;全長轉(zhuǎn)錄組測序需要 RNA 樣品的 OD260/OD280 為 2.0~2.2,2.3Agilent Bioanalyzer 2100 器檢測獲得的總RNA 28S:18S≥1,RIN≥8.5;PacBio Sequel/RSII 該測序平臺讀長超長,平均可達(dá)10 kb以上。上海地區(qū)宏基因組高通量測序技術(shù)

PacBio Sequel/RSII 該測序平臺主要承接細(xì)菌基因組完成圖測序、fungus基因組精細(xì)圖測序、全長轉(zhuǎn)錄本測序服務(wù)。上海市基因組高通量測序NGS

單細(xì)胞測序是什么?單細(xì)胞測序是基于高通量測序(Next-generationsequencingtechnology,NGS)方法,檢測群體中單細(xì)胞基因組、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組、單細(xì)胞表觀基因組及單細(xì)胞蛋白組,提供細(xì)胞間差異的高分辨率視圖,從分子水平揭示細(xì)胞奧秘。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序(Single-cellRNA-Sequencing,ScRNA-Seq)指在單細(xì)胞水平上對mRNA進(jìn)行高通量測序和分析的技術(shù)。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序能獲得單個細(xì)胞內(nèi)近萬個基因的表達(dá)信息,為辨別生物組織中各種細(xì)胞類型的轉(zhuǎn)錄組特征和全方面揭示細(xì)胞之間基因表達(dá)的異質(zhì)性提供了有力的工具[3]。說到細(xì)胞異質(zhì)性(Cellheterogeneity),就要說到我們?yōu)槭裁匆脝渭?xì)胞測序技術(shù)了。上海市基因組高通量測序NGS

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標(biāo)簽: 高通量測序