通過空間代謝組學(xué)測量了四種轉(zhuǎn)基因小鼠模型(肺*(LC)、RCC、HCC和T-ALL)中甘油磷脂(GPs)的含量,發(fā)現(xiàn)在不同的**中,MYC誘導(dǎo)改變了磷酸酰甘油(PGs)的豐度(圖 4A),能夠增加了大多數(shù)PG物質(zhì)。MYC失活后,PG豐度恢復(fù)到基礎(chǔ)水平(圖 4B)。PGs由磷脂酸(PA)通過向3-磷酸甘油中添加兩種FA形成,因此,PG誘導(dǎo)可以建立在MYC促進(jìn)的FA增加的基礎(chǔ)上。然而,在體內(nèi)PGs相對于其他GPs的相對優(yōu)先合成,這意味著MYC有除FA合成之外的其他方式調(diào)節(jié)脂肪生成。空間代謝組學(xué)的力量探究前列腺*。上??臻g代謝組學(xué)概念空間代謝組學(xué):中文標(biāo)題:MYC*基因與固醇調(diào)節(jié)元件結(jié)合蛋白協(xié)同調(diào)節(jié)...
如空間代謝組。研究中開發(fā)了一種新的基于拉曼光譜和空間代謝組學(xué)分析的脂質(zhì)組學(xué)(HSL)成像策略,用于分子表征和定量再髓鞘形成,并通過特定髓鞘蛋白的免疫標(biāo)記進(jìn)行了驗(yàn)證。利用拉曼和空間代謝組學(xué)數(shù)據(jù)生成了分子成像圖譜,用于體外組織的生物分子結(jié)構(gòu)和組成的關(guān)聯(lián)。將相關(guān)脂質(zhì)組成像方法應(yīng)用于局灶性脫髓鞘小鼠模型和多發(fā)性硬化癥死后腦標(biāo)本的髓鞘再分化研究。發(fā)現(xiàn)不僅在脫髓鞘腦組織和正常腦組織之間,在有髓鞘組織和正常有髓組織之間,脂質(zhì)成分皆存在差異??臻g代謝組產(chǎn)品齊全,價(jià)格低,高效專業(yè)。青??臻g代謝組學(xué)基本研究流程AFADESI-MSI空間代謝組學(xué):1、已落地執(zhí)行項(xiàng)目100+,其中包括藥物在組織中的分布、多種疾病類型...
AFADESI-MSI空間代謝組學(xué)分析了對照組和東莨菪堿***的大鼠矢狀腦切片,將發(fā)現(xiàn)的代謝物***映射代謝網(wǎng)絡(luò),并通過代謝組學(xué)分析發(fā)現(xiàn)空間代謝變化。不僅可以對藥物準(zhǔn)確定量,還可以檢測代謝網(wǎng)絡(luò)相關(guān)的數(shù)百種內(nèi)源性代謝物在大腦特定區(qū)域的分布。圖5顯示了代謝網(wǎng)絡(luò)中檢測到的各種代謝物,以及在不同大腦微區(qū)代謝物的明顯改變。如圖5A所示,找到三種代謝物(N-甲?;虬彼帷-色氨酸和5-羥色氨酸),屬于色氨酸代謝途徑,意味著東莨菪堿會干擾色氨酸的代謝過程。作者分析了東莨菪堿***組大鼠腦的十個微區(qū),發(fā)現(xiàn)腦橋中有16種表達(dá)異常的代謝產(chǎn)物,而在大腦皮層中發(fā)現(xiàn)了7種。表明在東莨菪堿***下,腦橋和大腦皮層可能是...
空間代謝組學(xué):質(zhì)譜成像技術(shù)近二十年來,隨著質(zhì)譜離子化技術(shù)的不斷發(fā)展,質(zhì)譜成像技術(shù)因其能夠直觀、快速、簡便地呈現(xiàn)出分子在細(xì)胞或組織中的結(jié)構(gòu)、空間與時(shí)間分布等信息,越來越受到大家的關(guān)注。并且質(zhì)譜成像技術(shù)也被***的用在**疾病研究、藥物前期發(fā)現(xiàn)等各領(lǐng)域的高質(zhì)量文章中,為生物標(biāo)志物的高靈敏度探測和藥物代謝精確成像研究奠定了基礎(chǔ),下面進(jìn)入到質(zhì)譜“畫”時(shí)代~是什么?有多少?在哪里?回答以上“靈魂”3問,首先需要了解他們之間的關(guān)系。質(zhì)譜是通過采集化合物的質(zhì)荷比,獲得定性和定量的信息,進(jìn)而去探究物質(zhì)本身包含的化合物“是什么?”和“有多少?”這兩個根本性問題。質(zhì)譜成像技術(shù)可以實(shí)現(xiàn)生物上千代謝物的定性。湖北空間...
空間代謝組學(xué):在大鼠腦繪制特定區(qū)域分布的極性代謝物圖譜使用AFADESI-MSI在正離子和負(fù)離子模式下分別獲得298個和372個微區(qū)輪廓清晰的代謝物離子圖像。使用精確分子量并結(jié)合同位素豐度,通過人類代謝組數(shù)據(jù)庫(HMDB)對離子圖像進(jìn)行識別,鑒定出多種內(nèi)源極性代謝物,包括氨基酸、核苷酸或核苷、碳水化合物、脂肪酸和神經(jīng)遞質(zhì)等。***系統(tǒng)(CNS)的特定功能和特定解剖區(qū)域相關(guān)。例如,乙酰膽堿在大腦皮層中高度表達(dá);γ-氨基丁酸是一種抑制性神經(jīng)遞質(zhì),其在大腦皮層的信號強(qiáng)度較低,在中腦、嗅球和下丘腦中的濃度較高??臻g代謝組通過質(zhì)譜成像技術(shù)。北京空間代謝組學(xué)概念A(yù)FADESI-MSI空間代謝組學(xué):1、已落...
1.樣本準(zhǔn)備Sprague-Dawley大鼠模型腹腔注射東莨菪堿后被殺死(處理組,3只),對照組大鼠(3只)也用同樣方法殺死。獲取大鼠整個大腦,在低溫下將大腦切成連續(xù)的矢狀切片(暴露出海馬和紋狀體),用于Nissl染色、H&E染色和質(zhì)譜成像檢測。2.空間代謝組實(shí)驗(yàn)使用AFADESI-MSI分析,代謝物質(zhì)量數(shù)范圍50-500Da,質(zhì)譜分辨率70,000。3.數(shù)據(jù)處理和代謝網(wǎng)絡(luò)分析原始數(shù)據(jù)經(jīng)過轉(zhuǎn)化,再使用自建MassImager軟件獲取成像結(jié)果;在獲取差異代謝物的高分辨率質(zhì)譜信息后,使用Metaboanalys在線數(shù)據(jù)挖掘軟件以褐家鼠(rattusnorvegicus)為參考完成代謝物高通量定性,...
質(zhì)譜成像(Mass Spectrometry Imaging, MSI)作為一種新型的分子影像技術(shù),能夠直接從生物組織中獲得大量已知或未知的內(nèi)源性代謝物和外源***物等分子的結(jié)構(gòu)、含量和空間分布信息。相對于其他成像方法(如熒光成像、放射性標(biāo)記成像等),該技術(shù)無需化學(xué)或放射性標(biāo)記、不需復(fù)雜樣品前處理,具有高特異性、高通量和空間信息保留的突出優(yōu)勢。質(zhì)譜成像技術(shù)可以實(shí)現(xiàn)生物組織中上千代謝物的定性、定量和定位分析,結(jié)合生物信息學(xué)分析,發(fā)展為空間代謝組學(xué)方法,可從生物組織原位發(fā)現(xiàn)差異代謝物,并識別其生物學(xué)功能??臻g代謝組學(xué)-靶向代謝組學(xué)服務(wù)-擅長多組學(xué)聯(lián)合分析。山西空間代謝組學(xué)與空間組學(xué)作者進(jìn)行了空間代...
空間代謝組學(xué):前列腺*組織樣本中的不同組織區(qū)域具有不同的代謝特征。使用空間代謝組學(xué)確定了關(guān)鍵分子過程中的代謝差異,例如NCE、基質(zhì)和**之間的脂質(zhì)代謝和前列腺分泌功能。在不同組織結(jié)構(gòu)中觀察到的代謝物水平差異,表明了空間信息及其測量方法的重要性。本實(shí)驗(yàn)仍然存在一定的局限性,質(zhì)譜成像過程中存在分子離域,可能導(dǎo)致結(jié)果假陰性。歐易生物、鹿明生物五、軟著及**1、實(shí)驗(yàn)檢測**1項(xiàng)2、空間代謝組定性及分析軟著5項(xiàng)3、空間代謝組與空間轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析軟著3項(xiàng)空間代謝組突破傳統(tǒng)代謝組研究損失空間信息的瓶頸。甘肅空間代謝組學(xué)是什么空間代謝組學(xué):中文標(biāo)題:MYC*基因與固醇調(diào)節(jié)元件結(jié)合蛋白協(xié)同調(diào)節(jié)**生長所必需的脂...
1.樣本準(zhǔn)備Sprague-Dawley大鼠模型腹腔注射東莨菪堿后被殺死(處理組,3只),對照組大鼠(3只)也用同樣方法殺死。獲取大鼠整個大腦,在低溫下將大腦切成連續(xù)的矢狀切片(暴露出海馬和紋狀體),用于Nissl染色、H&E染色和質(zhì)譜成像檢測。2.空間代謝組實(shí)驗(yàn)使用AFADESI-MSI分析,代謝物質(zhì)量數(shù)范圍50-500Da,質(zhì)譜分辨率70,000。3.數(shù)據(jù)處理和代謝網(wǎng)絡(luò)分析原始數(shù)據(jù)經(jīng)過轉(zhuǎn)化,再使用自建MassImager軟件獲取成像結(jié)果;在獲取差異代謝物的高分辨率質(zhì)譜信息后,使用Metaboanalys在線數(shù)據(jù)挖掘軟件以褐家鼠(rattusnorvegicus)為參考完成代謝物高通量定性,...
空間代謝組學(xué):利用基質(zhì)進(jìn)行空間成像——MALDI質(zhì)譜分子成像技術(shù)MALDI-MSI分析中非常關(guān)鍵的一點(diǎn)是需要添加基質(zhì)來吸收激光能量,實(shí)現(xiàn)被測物的離子化,主要對脂質(zhì)類化合物具有較好的分析效果, 空間分辨率比較高可以達(dá)到數(shù)個微米。其中,MALDI和DESI成像技術(shù)目前屬于比較完善,使用范圍較廣的成像技術(shù)。這兩種技術(shù)與質(zhì)譜相連,使用范圍有一定的互補(bǔ)性。二者結(jié)合使用,可實(shí)現(xiàn)“全譜圖分子成像”,相信也有很多老師想要了解這二種成像方式有什么特點(diǎn)呢?空間代謝組學(xué)基于AFADESI-MSI的代謝物研究。甘肅空間代謝組學(xué)公司獲取空間代謝組學(xué)圖像。計(jì)算了負(fù)離子和正離子模式下的平均空間代謝質(zhì)譜(圖5D,G)以及平均...
空間代謝組學(xué):倫敦帝國理工學(xué)院George B Hanna教授團(tuán)隊(duì)及合作者在《Cancer Research》發(fā)表了題為“De novo lipogenesis alters the phospholipidome of esophageal adenocarcinoma"的研究成果,該研究整合磷脂代謝組學(xué)、空間代謝組學(xué)和遺傳學(xué)方法,旨在闡明食管腺*的磷脂代謝重編程,對探索與疾病診斷相關(guān)的磷脂生物標(biāo)志物具有重要意義。中文標(biāo)題:脂質(zhì)從頭合成改變食管腺*磷脂代謝研究對象:食管腺*發(fā)表期刊:CancerResearch影響因子:12.701發(fā)表單位:倫敦帝國理工學(xué)院運(yùn)用生物技術(shù):空間代謝組學(xué)一文讀懂...
空間代謝組學(xué):前列腺*組織樣本中的不同組織區(qū)域具有不同的代謝特征。使用空間代謝組學(xué)確定了關(guān)鍵分子過程中的代謝差異,例如NCE、基質(zhì)和**之間的脂質(zhì)代謝和前列腺分泌功能。在不同組織結(jié)構(gòu)中觀察到的代謝物水平差異,表明了空間信息及其測量方法的重要性。本實(shí)驗(yàn)仍然存在一定的局限性,質(zhì)譜成像過程中存在分子離域,可能導(dǎo)致結(jié)果假陰性。歐易生物、鹿明生物五、軟著及**1、實(shí)驗(yàn)檢測**1項(xiàng)2、空間代謝組定性及分析軟著5項(xiàng)3、空間代謝組與空間轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析軟著3項(xiàng)空間代謝組學(xué)二維乃至三維的水平,極大拓展了對組學(xué)樣品信息的認(rèn)知。海南空間代謝組學(xué) 中藥活性成分本文作者開發(fā)的一種基于敞開式空氣動力輔助解吸電噴霧離子化質(zhì)譜...
本篇小鹿分享一篇空間代謝組學(xué)專業(yè)應(yīng)用技術(shù)文章,探究空間代謝組學(xué)如何進(jìn)行前列腺*診斷和預(yù)后生物標(biāo)志物的差異研究?該研究發(fā)現(xiàn)了前列腺*樣本中的特定組織區(qū)室的不同代謝特征,確定了幾種可能被進(jìn)一步開發(fā)為前列腺*的診斷和預(yù)后生物標(biāo)志物的差異代謝物和脂質(zhì)??臻g代謝組學(xué)能夠快速提供代謝物的水平差異和空間信息,是臨床上有潛力的創(chuàng)新診斷工具。免標(biāo)記、無需基質(zhì)噴涂、周期短、定位準(zhǔn)是AFADESI空間代謝組技術(shù)的主要特點(diǎn)。該技術(shù)作為一種新型的分子影像技術(shù),能夠獲得組織***中1000Da以下代謝物和藥物的定性、定量、定位三個維度的信息。定量和定位分析,結(jié)合生物信息學(xué)分析,發(fā)展為空間代謝組學(xué)方法。上??臻g代謝組學(xué)與空...
展示了空間代謝組成像技術(shù)的應(yīng)用。這一分析***表明脫髓鞘后新形成的髓鞘具有與正常髓鞘不同的脂質(zhì)成分。因此,這種HSL方法學(xué)可能**提高目前對多發(fā)性硬化癥再髓鞘形成的理解,并可能為多發(fā)性硬化癥研究中評估再髓鞘形成***提供一種新的策略。此外,HSL方法可以針對***的組織量身定做,為生物醫(yī)學(xué)科學(xué)中的脂質(zhì)結(jié)構(gòu)和成分提供至關(guān)重要的見解。該研究開發(fā)了一種基于拉曼光譜、解吸電噴霧電離質(zhì)譜(空間代謝組學(xué))和免疫熒光成像的相關(guān)脂質(zhì)組成像(HSL)方法,研究多發(fā)性硬化癥病變中的再髓鞘形成與正常髓鞘不同的脂質(zhì)成分。結(jié)果通過對脂質(zhì)結(jié)構(gòu)和成分的研究為再髓鞘化***提供可能性??臻g代謝組學(xué)-靶向代謝組學(xué)服務(wù)-擅長多組...
空間代謝組學(xué)研究作者對P493-6B細(xì)胞淋巴瘤系(BCL)進(jìn)行了全基因組表達(dá)譜、核突變和ChIP分析,發(fā)現(xiàn)MYC誘導(dǎo)增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相關(guān)蛋白在內(nèi)的脂肪酸(FA)合成基因的mRNA表達(dá),在MYC誘導(dǎo)的肝細(xì)胞*(HCC)、急性白血?。═-ALL)和腎細(xì)胞*(RCC)的三種體內(nèi)轉(zhuǎn)基因小鼠模型中也有類似表達(dá)。還發(fā)現(xiàn)MYC與這些FA合成基因的啟動子結(jié)合并啟動mRNA轉(zhuǎn)錄,如甲羥戊酸和膽固醇途徑基因的啟動子。為了了解MYC和SREBP1之間的相互作用,作者首先,對這兩種蛋白進(jìn)行ChIP和re-ChIP分析,證明MYC和SREBP1都可以發(fā)現(xiàn)與FA合成基因啟動子中的相同...
空間代謝組學(xué):中文標(biāo)題:MYC*基因與固醇調(diào)節(jié)元件結(jié)合蛋白協(xié)同調(diào)節(jié)**生長所必需的脂肪生成研究對象:小鼠發(fā)表期刊:CellMetabolism影響因子:27.287合作單位:斯坦福大學(xué)運(yùn)用生物技術(shù):空間代謝組學(xué)、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等MYC是一種原*基因,在細(xì)胞增殖、凋亡、分化等多種細(xì)胞生物學(xué)過程中發(fā)揮作用,其易位、擴(kuò)增或表達(dá)異常常與多種**的發(fā)***展有關(guān)。本篇由斯坦福大學(xué)DeanW.Felsher課題組在CellMetabolism發(fā)表的研究成果,通過空間代謝組學(xué)、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等技術(shù)研究*基因MYC促進(jìn)**發(fā)生機(jī)制,發(fā)現(xiàn)MYC與膽固醇調(diào)節(jié)元件...
通過空間代謝組學(xué)檢測到正常腎臟與MYC誘導(dǎo)的**之間的GPs豐度(m/z:700–1000),發(fā)現(xiàn)兩組存在***差異,尤其是m/z在865的***增加。?;鶄?cè)鏈較短(18個碳或更少)的PG在MYC***的前15天呈現(xiàn)增加趨勢,然后開始減少,但酰基側(cè)鏈較長的PG含量持續(xù)增加(圖 5)。MYC失活后,這些差異在很大程度上是可逆的。通過體外實(shí)驗(yàn)證明,MYC的誘導(dǎo)和MYC失活能夠增加和降低了PG合成基因的mRNA(圖6C)。并且MYC活化還上調(diào)了FA延長酶ELOVL2和ELOVL6的mRNA表達(dá)豐度(圖6D)。結(jié)果顯示,MYC參與調(diào)節(jié)FA生成和相關(guān)基因的表達(dá)。空間代謝組技術(shù)流程 。黑龍江空間代謝組學(xué)的...
空間代謝組學(xué):食道腺*是全球第八大崔常見的惡性**發(fā)病率正在持續(xù)上升,但存活率仍然很低,目前急需新的工具來提高早期診斷和精確***。脂質(zhì)代謝紊亂與**的發(fā)***展密切相關(guān),大多數(shù)脂質(zhì)以甘油磷脂(GPLs)的形式儲存在雙分子膜中,基于甘油磷脂具有較穩(wěn)定的物理化學(xué)性質(zhì),因此將其作為疾病診斷的生物標(biāo)志物具有重要意義。質(zhì)譜成像(MSI)可在幾分鐘內(nèi)對冷凍切片組織的**磷脂體量化并進(jìn)行客觀診斷。然而,MSI是否能客觀識別原發(fā)性食管腺*目前尚不清楚,這是一個重大的挑戰(zhàn),因?yàn)樵撐h(huán)境復(fù)雜,組織類型的表型相似?!堵姑魃锟臻g代謝組學(xué)千萬醫(yī)學(xué)支持計(jì)劃。四川空間代謝組學(xué)商業(yè)應(yīng)用空間代謝組學(xué)成像技術(shù)則是通過一些原位...
空間代謝組學(xué):食道腺*是全球第八大崔常見的惡性**發(fā)病率正在持續(xù)上升,但存活率仍然很低,目前急需新的工具來提高早期診斷和精確***。脂質(zhì)代謝紊亂與**的發(fā)***展密切相關(guān),大多數(shù)脂質(zhì)以甘油磷脂(GPLs)的形式儲存在雙分子膜中,基于甘油磷脂具有較穩(wěn)定的物理化學(xué)性質(zhì),因此將其作為疾病診斷的生物標(biāo)志物具有重要意義。質(zhì)譜成像(MSI)可在幾分鐘內(nèi)對冷凍切片組織的**磷脂體量化并進(jìn)行客觀診斷。然而,MSI是否能客觀識別原發(fā)性食管腺*目前尚不清楚,這是一個重大的挑戰(zhàn),因?yàn)樵撐h(huán)境復(fù)雜,組織類型的表型相似??臻g代謝組加速您的科研項(xiàng)目進(jìn)程.歡迎免費(fèi)咨詢!。黑龍江空間代謝組學(xué)商業(yè)應(yīng)用空間代謝組學(xué):中文標(biāo)題:糞...
獲取空間代謝組學(xué)圖像。計(jì)算了負(fù)離子和正離子模式下的平均空間代謝質(zhì)譜(圖5D,G)以及平均差譜,以突出不同樣品的空間代謝質(zhì)譜之間的差異(圖5E,H)。制作的圖像顯示了屬于注射側(cè)(紅色)或非注射側(cè)(綠色)的后驗(yàn)概率。該分析基本證實(shí)了拉曼光譜特征,與對側(cè)正常側(cè)(非注射側(cè))相比,再髓鞘損傷(注射側(cè))發(fā)生了高度特異性的分子變化,尤其是正離子模式(圖5F,I)。隨后通過串聯(lián)質(zhì)譜法確認(rèn)了區(qū)分胼胝體再髓鞘化和正常髓鞘化區(qū)域的*****峰,并在表1中報(bào)告。拉曼光譜和空間代謝組學(xué)表明,再髓鞘化區(qū)域的脂質(zhì)成分不同于原始髓鞘的脂質(zhì)成分。從小鼠模型獲得的結(jié)果證明了HSL成像可以有效地研究再髓鞘化病變的脂質(zhì)分布,這是脫髓...
本篇為2021年8月,國家**中心中國醫(yī)學(xué)院科學(xué)院**醫(yī)院崔巍研究員與專業(yè)多組學(xué)技術(shù)團(tuán)隊(duì)合作在醫(yī)學(xué)一區(qū)消化道領(lǐng)域國際期刊《GUT》期刊發(fā)表了題的研究成果,通過非靶向代謝組、靶向代謝組以及AFADESI-MSI空間代謝組學(xué)(研究方法,整合了宏基因組的數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)了可用于腺瘤及結(jié)直腸*診斷的代謝標(biāo)志物,建立的相關(guān)預(yù)測模型顯示出較高診斷準(zhǔn)確性,為結(jié)直腸*早期診斷奠定堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。在本研究中,作者對血清代謝組學(xué)和糞便宏基因組測序的結(jié)果進(jìn)行整合分析,確定了一組與腸道微生物群密切相關(guān)的CRC和腺瘤患者的血清代謝物,并基于代謝物研發(fā)了腸道微生物組相關(guān)血清代謝物 (GMSM) 策略,可準(zhǔn)確區(qū)分CRC和腺瘤患者(統(tǒng)稱...
2021年9月30日,國家自然科學(xué)基金委員會發(fā)布的《關(guān)于發(fā)布生命科學(xué)部2021年度指南引導(dǎo)類原創(chuàng)探索計(jì)劃項(xiàng)目指南的通告》中,也表達(dá)了對于空間多維組學(xué)的資助支持。2021年11月推出的“鹿明空間代謝組千萬醫(yī)學(xué)支持計(jì)劃(***期)”獲得了許多科研工作者的關(guān)注及參與?,F(xiàn)正式推出“鹿明空間代謝組千萬醫(yī)學(xué)支持計(jì)劃(第二期)”。本次“鹿明空間代謝組千萬醫(yī)學(xué)支持計(jì)劃(第二期)”采用的AFADESI空間代謝組平臺,是基于中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院藥物研究所再帕爾?阿不力孜教授與賀玖明教授團(tuán)隊(duì)經(jīng)過十年精心打磨,自主研發(fā)成功的AFAI-MSI儀器平臺。鹿明生物空間代謝組學(xué)。遼寧空間代謝組學(xué) 肝炎1.AFADESI-MSI用于...
鹿明生物空間代謝組學(xué)項(xiàng)目實(shí)測結(jié)果1、可實(shí)現(xiàn)代謝物定性數(shù)量:1000-3000個代謝物。2、定性代謝物類型:不噴涂基質(zhì),小分子物質(zhì)檢測不被基質(zhì)抑制,定性物質(zhì)約70%為700Da以下的小分子物質(zhì),30%為脂質(zhì)大分子??臻g多組學(xué)聯(lián)合:空間代謝+空間轉(zhuǎn)錄2021年即擁有空間代謝組和空間轉(zhuǎn)錄組(歐易生物)兩個平臺,已執(zhí)行空間代謝+空間轉(zhuǎn)錄聯(lián)合項(xiàng)目10+。空間多組學(xué)檢測平臺2套AFADESI-MSI成像系統(tǒng),分別連接QE或者QE-HF高分辨質(zhì)譜儀。***套AFADESI成像系統(tǒng)(連接Thermo QE高分辨質(zhì)譜儀)第二套AFADESI成像系統(tǒng)系統(tǒng)(連接Thermo QE-HF高分辨質(zhì)譜儀)鹿明生物空間代謝...
作者使用NMR對C原子進(jìn)行示蹤實(shí)驗(yàn),發(fā)現(xiàn)MYC驅(qū)動葡萄糖和谷氨酰胺的C參與脂肪生成(圖3)。采用空間代謝組學(xué)檢測小鼠模型以及人BCL細(xì)胞中的FA,發(fā)現(xiàn)MYC**中不飽和脂肪酸(FA(18:1))的豐度增加。進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)13C-油酸酯在MYC誘導(dǎo)的BCL細(xì)胞未發(fā)生代謝,而13C-葡萄糖增加了不飽和FA中的標(biāo)記碳。當(dāng)MYC失活時(shí),細(xì)胞中3H標(biāo)記的棕櫚酸酯氧化速率明顯變高。MYC-ON和MYC-OFF的BCL細(xì)胞中的油酸酯均未被氧化。因此,MYC可能在抑制FA氧化的同時(shí)上調(diào)FA的合成??臻g代謝組學(xué):一種高靈敏、高覆蓋質(zhì)譜成像技術(shù)新技術(shù)。廣西空間代謝組學(xué)優(yōu)勢收集了15名前列腺*患者共計(jì)45份新鮮冷凍組織...
鹿明生物空間代謝組學(xué)項(xiàng)目實(shí)測結(jié)果1、可實(shí)現(xiàn)代謝物定性數(shù)量:1000-3000個代謝物。2、定性代謝物類型:不噴涂基質(zhì),小分子物質(zhì)檢測不被基質(zhì)抑制,定性物質(zhì)約70%為700Da以下的小分子物質(zhì),30%為脂質(zhì)大分子??臻g多組學(xué)聯(lián)合:空間代謝+空間轉(zhuǎn)錄2021年即擁有空間代謝組和空間轉(zhuǎn)錄組(歐易生物)兩個平臺,已執(zhí)行空間代謝+空間轉(zhuǎn)錄聯(lián)合項(xiàng)目10+??臻g多組學(xué)檢測平臺2套AFADESI-MSI成像系統(tǒng),分別連接QE或者QE-HF高分辨質(zhì)譜儀。***套AFADESI成像系統(tǒng)(連接Thermo QE高分辨質(zhì)譜儀)第二套AFADESI成像系統(tǒng)系統(tǒng)(連接Thermo QE-HF高分辨質(zhì)譜儀)空間代謝組技術(shù)流...
空間代謝組學(xué)研究作者對P493-6B細(xì)胞淋巴瘤系(BCL)進(jìn)行了全基因組表達(dá)譜、核突變和ChIP分析,發(fā)現(xiàn)MYC誘導(dǎo)增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相關(guān)蛋白在內(nèi)的脂肪酸(FA)合成基因的mRNA表達(dá),在MYC誘導(dǎo)的肝細(xì)胞*(HCC)、急性白血病(T-ALL)和腎細(xì)胞*(RCC)的三種體內(nèi)轉(zhuǎn)基因小鼠模型中也有類似表達(dá)。還發(fā)現(xiàn)MYC與這些FA合成基因的啟動子結(jié)合并啟動mRNA轉(zhuǎn)錄,如甲羥戊酸和膽固醇途徑基因的啟動子。為了了解MYC和SREBP1之間的相互作用,作者首先,對這兩種蛋白進(jìn)行ChIP和re-ChIP分析,證明MYC和SREBP1都可以發(fā)現(xiàn)與FA合成基因啟動子中的相同...
分子成像技術(shù)是研究大腦中DNA、RNA、蛋白質(zhì)和代謝產(chǎn)物的強(qiáng)大工具。質(zhì)譜成像技術(shù)(MSI)是一種檢測大腦中蛋白質(zhì)、代謝物和脂質(zhì)物質(zhì)的高靈敏度和高通量分子成像技術(shù),在**邊緣診斷、**生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)、藥物分布和機(jī)理闡述等領(lǐng)域有***的應(yīng)用。本文作者開發(fā)了一種基于敞開式空氣動力輔助解吸電噴霧離子化質(zhì)譜成像(AFADESI-MSI)技術(shù)的代謝網(wǎng)絡(luò)映射方法,對大鼠腦不同極性的小分子代謝物(m/z50-500Da)進(jìn)行微區(qū)分布研究,不僅鑒定出腦部幾乎所有重要的代謝物,還繪制了包含神經(jīng)遞質(zhì)、嘌呤,有機(jī)酸,多胺,膽堿、碳水化合物和脂類等20條通路的代謝網(wǎng)絡(luò),并使用這種代謝網(wǎng)絡(luò)映射質(zhì)譜成像方法解析了東莨菪堿致...
AFADESI-MSI空間代謝組學(xué):生物組織**能代謝物的空間分布可以更深層次的理解組織特異性分子組織學(xué)和病理學(xué)。問題的**在于開發(fā)一種非靶向、高靈敏度、高覆蓋和高特異性的成像方法,能夠可視化大量代謝產(chǎn)物在其自然狀態(tài)下的空間分布。將功能代謝物的空間和時(shí)間變化與組織結(jié)構(gòu)和生物功能聯(lián)系起來,從根本上解釋組織在分子水平上發(fā)生了什么。AFADESI-MSI 是一種高靈敏、高覆蓋、寬動態(tài)范圍、強(qiáng)特異性的組織代謝物成像分析技術(shù),靈敏度可達(dá)到 pg 級,且代謝物含量動態(tài)范圍跨越 3 個數(shù)量級,實(shí)現(xiàn)了組織微區(qū)的精確表征和質(zhì)量數(shù)相近代謝物的準(zhǔn)確識別,可對組織大小為 1 mm×1 mm~1.5 cm×3.5 cm...
如空間代謝組。研究中開發(fā)了一種新的基于拉曼光譜和空間代謝組學(xué)分析的脂質(zhì)組學(xué)(HSL)成像策略,用于分子表征和定量再髓鞘形成,并通過特定髓鞘蛋白的免疫標(biāo)記進(jìn)行了驗(yàn)證。利用拉曼和空間代謝組學(xué)數(shù)據(jù)生成了分子成像圖譜,用于體外組織的生物分子結(jié)構(gòu)和組成的關(guān)聯(lián)。將相關(guān)脂質(zhì)組成像方法應(yīng)用于局灶性脫髓鞘小鼠模型和多發(fā)性硬化癥死后腦標(biāo)本的髓鞘再分化研究。發(fā)現(xiàn)不僅在脫髓鞘腦組織和正常腦組織之間,在有髓鞘組織和正常有髓組織之間,脂質(zhì)成分皆存在差異。質(zhì)譜成像空間代謝組學(xué)方法及其應(yīng)用研究進(jìn)展。青海空間代謝組學(xué)是什么空間代謝組學(xué)能夠在復(fù)雜的EA微環(huán)境中區(qū)分組織類型,本文作者使用兩個隊(duì)列對食管腺*的甘油磷脂特征進(jìn)行了表征。...