四川空間代謝組學(xué)商業(yè)應(yīng)用

來源: 發(fā)布時間:2023-04-03

空間代謝組學(xué):食道腺*是全球第八大崔常見的惡性**發(fā)病率正在持續(xù)上升,但存活率仍然很低,目前急需新的工具來提高早期診斷和精確***。脂質(zhì)代謝紊亂與**的發(fā)***展密切相關(guān),大多數(shù)脂質(zhì)以甘油磷脂(GPLs)的形式儲存在雙分子膜中,基于甘油磷脂具有較穩(wěn)定的物理化學(xué)性質(zhì),因此將其作為疾病診斷的生物標(biāo)志物具有重要意義。質(zhì)譜成像(MSI)可在幾分鐘內(nèi)對冷凍切片組織的**磷脂體量化并進行客觀診斷。然而,MSI是否能客觀識別原發(fā)性食管腺*目前尚不清楚,這是一個重大的挑戰(zhàn),因為該微環(huán)境復(fù)雜,組織類型的表型相似?!堵姑魃锟臻g代謝組學(xué)千萬醫(yī)學(xué)支持計劃。四川空間代謝組學(xué)商業(yè)應(yīng)用

空間代謝組學(xué)成像技術(shù)則是通過一些原位電離源,如DESI(解吸電噴霧電離源)、MALDI(基質(zhì)輔助激光解吸電離源),與質(zhì)譜相聯(lián),通過可視化的成像軟件,使得被檢測到的質(zhì)荷比根據(jù)含量不同通過不同強度的色彩呈現(xiàn),進而提供化合物“在哪里?”的信息。無需樣品處理實時成像——電噴霧電離技術(shù)DESI系列比較大的優(yōu)勢就在于無需樣品處理,DESI-MSI作為新型敞開式質(zhì)譜成像技術(shù),其突出的優(yōu)勢是在大氣壓條件且敞開式環(huán)境下,不需要進行復(fù)雜的樣品前處理和基質(zhì)輔助,可更真實反映樣品表面分子分布特征。浙江軟骨空間代謝組學(xué)空間代謝組學(xué) 技術(shù)咨詢中心。

空間代謝組學(xué):前列腺*組織樣本中的不同組織區(qū)域具有不同的代謝特征。使用空間代謝組學(xué)確定了關(guān)鍵分子過程中的代謝差異,例如NCE、基質(zhì)和**之間的脂質(zhì)代謝和前列腺分泌功能。在不同組織結(jié)構(gòu)中觀察到的代謝物水平差異,表明了空間信息及其測量方法的重要性。本實驗仍然存在一定的局限性,質(zhì)譜成像過程中存在分子離域,可能導(dǎo)致結(jié)果假陰性。歐易生物、鹿明生物五、軟著及**1、實驗檢測**1項2、空間代謝組定性及分析軟著5項3、空間代謝組與空間轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析軟著3項

1.AFADESI-MSI用于大腦中極性代謝物的定位如圖1所示,將大鼠大腦連續(xù)矢狀切面通過ESI探針對逐個像素進行掃描,并將解吸的代謝物離子傳輸?shù)礁叻直媛寿|(zhì)量分析儀進行分析。圖1E是大鼠腦部某個像素點的一個代表性質(zhì)譜圖,在該圖中可以觀察到數(shù)千個代謝物的峰。AFADESI-MSI圖像還表明腦部不同功能性區(qū)域中代謝物濃度的變化。圖1A-D顯示了代表性代謝產(chǎn)物圖像,在松果體、紋狀體、海馬、胼胝體和嗅球等亞區(qū)域具有特定分布。這些異質(zhì)代謝分布與大鼠腦的功能和結(jié)構(gòu)復(fù)雜性高度一致。實驗結(jié)果表明,AFADESI-MSI的空間分辨率小于100μm,代謝物質(zhì)量比較大差異為0.001Da,同一物質(zhì)的檢測動態(tài)范圍高達1000倍。如圖1所示,通過AFADESI-MSI可在大鼠腦部檢測到一些呈特征性分布有代表性的極性代謝物,其強度范圍從0到104甚至到106??臻g代謝組學(xué)哪家好,為各類科學(xué)領(lǐng)域提供線索和方向。

空間代謝組學(xué):質(zhì)譜成像方法提供了一種直接獲取代謝網(wǎng)絡(luò)信息的途徑,以系統(tǒng)地深入了解大腦的代謝活動?;贙EGG數(shù)據(jù)庫的Metaboanalyst軟件進行代謝網(wǎng)絡(luò)分析。共找到20條KEGG代謝通路,包含126個具有微區(qū)信息的代謝物,圖2顯示了涉及丙氨酸-天冬氨酸和谷氨酸代謝、花生四烯酸代謝、精氨酸和脯氨酸代謝、肌酸途徑、GABA能突觸、葡萄糖代謝、谷胱甘肽代謝、甘油磷脂代謝、甘氨酸-絲氨酸和蘇氨酸的代謝、組氨酸代謝、賴氨酸代謝、苯丙氨酸代謝、多胺代謝途徑、嘌呤代謝、嘧啶代謝和TCA循環(huán)、色氨酸代謝、酪氨酸代謝、纈氨酸-亮氨酸和異亮氨酸代謝和類固醇***合成途徑。曾經(jīng)錯過熱潮—空間轉(zhuǎn)錄組,別再錯過新秀—空間代謝組。湖北空間代謝組學(xué)圖片

一文讀懂空間代謝組學(xué):DESI-IMS與MALDI-IMS的區(qū)別。四川空間代謝組學(xué)商業(yè)應(yīng)用

作者進行了空間代謝組學(xué)(~50μm的空間分辨率),并根據(jù)m/z848.63和m/z844.52對主要的髓鞘標(biāo)志物進行了成像,推測它們分別屬于Cer(D18:1/24:1)和PC(38:6)(圖2G)。白質(zhì)和灰質(zhì)的代表性質(zhì)譜如圖2H所示。結(jié)果表明,使用拉曼光譜結(jié)構(gòu)信息和空間代謝組學(xué)對髓鞘中的脂質(zhì)進行特定的成分分析是可能的。對單個有髓組織成分光譜的分析證實,構(gòu)成有髓組織光譜的主要分子是脂質(zhì),包括腦苷脂、膽固醇、鞘磷脂、磷脂酰膽堿,以及程度較小的蛋白質(zhì)(圖2F)。四川空間代謝組學(xué)商業(yè)應(yīng)用

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