黑龍江空間代謝組學的質譜成像

來源: 發(fā)布時間:2023-04-03

通過空間代謝組學檢測到正常腎臟與MYC誘導的**之間的GPs豐度(m/z:700–1000),發(fā)現兩組存在***差異,尤其是m/z在865的***增加。?;鶄孺溳^短(18個碳或更少)的PG在MYC***的前15天呈現增加趨勢,然后開始減少,但?;鶄孺溳^長的PG含量持續(xù)增加(圖 5)。MYC失活后,這些差異在很大程度上是可逆的。通過體外實驗證明,MYC的誘導和MYC失活能夠增加和降低了PG合成基因的mRNA(圖6C)。并且MYC活化還上調了FA延長酶ELOVL2和ELOVL6的mRNA表達豐度(圖6D)。結果顯示,MYC參與調節(jié)FA生成和相關基因的表達??臻g代謝組技術流程 。黑龍江空間代謝組學的質譜成像

空間代謝組學研究作者對P493-6B細胞淋巴瘤系(BCL)進行了全基因組表達譜、核突變和ChIP分析,發(fā)現MYC誘導增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相關蛋白在內的脂肪酸(FA)合成基因的mRNA表達,在MYC誘導的肝細胞*(HCC)、急性白血?。═-ALL)和腎細胞*(RCC)的三種體內轉基因小鼠模型中也有類似表達。還發(fā)現MYC與這些FA合成基因的啟動子結合并啟動mRNA轉錄,如甲羥戊酸和膽固醇途徑基因的啟動子。為了了解MYC和SREBP1之間的相互作用,作者首先,對這兩種蛋白進行ChIP和re-ChIP分析,證明MYC和SREBP1都可以發(fā)現與FA合成基因啟動子中的相同DNA分子結合(圖1)。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表達,但不降低MYC基因的表達。其次,ChIP的MYC與啟動子結合,不僅調節(jié)FA合成基因的表達,還調節(jié)糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表達。因此,MYC似乎會依次調節(jié)參與脂質合成的基因:首先誘導葡萄糖和谷氨酰胺,然后誘導FA合成相關基因。通過RNA測序(RNA-seq)發(fā)現,增加MYC水平會引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成。安徽植物空間代謝組學定量和定位分析,結合生物信息學分析,發(fā)展為空間代謝組學方法。

空間代謝組學:繪制了不同代謝物在組織內濃度的圖像,直觀顯示了代謝物在NCE細胞、基質細胞和**細胞的濃度差異。在正離子和負離子模式下檢測到的質量分別用紅色加號和藍色減號表示。組織邊緣用黑色邊框勾勒出輪廓,但**區(qū)域還包含一些無法單獨注釋的*細胞與基質的區(qū)域。ADP=二磷酸腺苷,ATP=三磷酸腺苷,GPEA=甘油磷酰乙醇胺,HBCt=羥基丁酰肉堿,HE=蘇木精和伊紅,LPC=溶血磷脂酰膽堿,NAA=N-乙酰天冬氨酸,PE=磷脂酰乙醇胺,PI=磷脂酰肌醇

鹿明生物AFADESI-MSI空間代謝組技術作為一種新型的分子影像技術,能夠獲得組織***中1000Da以下代謝物和藥物的定性、定量、定位三個維度的信息。具有免標記、無需基質、周期短、定位準的特點。在獲得AFADESI-MSI平臺原創(chuàng)團隊全力支持下,經過前期的研發(fā)以及1年時間的技術服務積累,鹿明生物已經完成了心臟、腦、**、腸道、肝臟、腎臟、皮膚等二十幾種臨床/動物/植物組織樣本的空間代謝組學檢測及分析,積累了豐富的樣本前處理經驗?!犊臻g代謝組科研應用手冊》是一本集聚空間代謝組學的由來、發(fā)展、原理及應用的科研專業(yè)讀物。

空間代謝組學:中文標題:MYC*基因與固醇調節(jié)元件結合蛋白協(xié)同調節(jié)**生長所必需的脂肪生成研究對象:小鼠發(fā)表期刊:CellMetabolism影響因子:27.287合作單位:斯坦福大學運用生物技術:空間代謝組學、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等MYC是一種原*基因,在細胞增殖、凋亡、分化等多種細胞生物學過程中發(fā)揮作用,其易位、擴增或表達異常常與多種**的發(fā)***展有關。本篇由斯坦福大學DeanW.Felsher課題組在CellMetabolism發(fā)表的研究成果,通過空間代謝組學、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等技術研究*基因MYC促進**發(fā)生機制,發(fā)現MYC與膽固醇調節(jié)元件結合蛋白(SREBP1)協(xié)同調節(jié)脂質生成,從而促進疾病的發(fā)生??臻g代謝組特異性強等優(yōu)點。湖北花瓣空間代謝組學

空間代謝組是基于質譜成像技術發(fā)展而來的,免標記、無需基質、周期短。黑龍江空間代謝組學的質譜成像

空間代謝組學主要從事質譜成像新技術、空間分辨代謝組學新方法及其在生物醫(yī)藥應用研究和臨床前新藥代謝研究。近年來在質譜成像空間分辨代謝組學領域取得重要突破,并**國際前沿發(fā)展。目前,承擔著國家自然科學基金、醫(yī)科院創(chuàng)新工程等多項課題,科研經費充足;擁有先進的液質聯(lián)用儀器和質譜成像儀器數臺,建立了新藥研發(fā)質量管理規(guī)范體系,實驗條件完備。具有分析化學、或藥物分析、或生物學等相關專業(yè)的博士學位。2、具有以下研究經驗或能力之一:質譜分析;代謝組學研究;與新藥或疾病相關的分子生物學研究;生物信息學等。黑龍江空間代謝組學的質譜成像

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