黑龍江空間代謝組學(xué)的質(zhì)譜成像

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2023-04-03

通過(guò)空間代謝組學(xué)檢測(cè)到正常腎臟與MYC誘導(dǎo)的**之間的GPs豐度(m/z:700–1000),發(fā)現(xiàn)兩組存在***差異,尤其是m/z在865的***增加。酰基側(cè)鏈較短(18個(gè)碳或更少)的PG在MYC***的前15天呈現(xiàn)增加趨勢(shì),然后開始減少,但?;鶄?cè)鏈較長(zhǎng)的PG含量持續(xù)增加(圖 5)。MYC失活后,這些差異在很大程度上是可逆的。通過(guò)體外實(shí)驗(yàn)證明,MYC的誘導(dǎo)和MYC失活能夠增加和降低了PG合成基因的mRNA(圖6C)。并且MYC活化還上調(diào)了FA延長(zhǎng)酶ELOVL2和ELOVL6的mRNA表達(dá)豐度(圖6D)。結(jié)果顯示,MYC參與調(diào)節(jié)FA生成和相關(guān)基因的表達(dá)??臻g代謝組技術(shù)流程 。黑龍江空間代謝組學(xué)的質(zhì)譜成像

空間代謝組學(xué)研究作者對(duì)P493-6B細(xì)胞淋巴瘤系(BCL)進(jìn)行了全基因組表達(dá)譜、核突變和ChIP分析,發(fā)現(xiàn)MYC誘導(dǎo)增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相關(guān)蛋白在內(nèi)的脂肪酸(FA)合成基因的mRNA表達(dá),在MYC誘導(dǎo)的肝細(xì)胞*(HCC)、急性白血病(T-ALL)和腎細(xì)胞*(RCC)的三種體內(nèi)轉(zhuǎn)基因小鼠模型中也有類似表達(dá)。還發(fā)現(xiàn)MYC與這些FA合成基因的啟動(dòng)子結(jié)合并啟動(dòng)mRNA轉(zhuǎn)錄,如甲羥戊酸和膽固醇途徑基因的啟動(dòng)子。為了了解MYC和SREBP1之間的相互作用,作者首先,對(duì)這兩種蛋白進(jìn)行ChIP和re-ChIP分析,證明MYC和SREBP1都可以發(fā)現(xiàn)與FA合成基因啟動(dòng)子中的相同DNA分子結(jié)合(圖1)。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表達(dá),但不降低MYC基因的表達(dá)。其次,ChIP的MYC與啟動(dòng)子結(jié)合,不僅調(diào)節(jié)FA合成基因的表達(dá),還調(diào)節(jié)糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表達(dá)。因此,MYC似乎會(huì)依次調(diào)節(jié)參與脂質(zhì)合成的基因:首先誘導(dǎo)葡萄糖和谷氨酰胺,然后誘導(dǎo)FA合成相關(guān)基因。通過(guò)RNA測(cè)序(RNA-seq)發(fā)現(xiàn),增加MYC水平會(huì)引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成。安徽植物空間代謝組學(xué)定量和定位分析,結(jié)合生物信息學(xué)分析,發(fā)展為空間代謝組學(xué)方法。

空間代謝組學(xué):繪制了不同代謝物在組織內(nèi)濃度的圖像,直觀顯示了代謝物在NCE細(xì)胞、基質(zhì)細(xì)胞和**細(xì)胞的濃度差異。在正離子和負(fù)離子模式下檢測(cè)到的質(zhì)量分別用紅色加號(hào)和藍(lán)色減號(hào)表示。組織邊緣用黑色邊框勾勒出輪廓,但**區(qū)域還包含一些無(wú)法單獨(dú)注釋的*細(xì)胞與基質(zhì)的區(qū)域。ADP=二磷酸腺苷,ATP=三磷酸腺苷,GPEA=甘油磷酰乙醇胺,HBCt=羥基丁酰肉堿,HE=蘇木精和伊紅,LPC=溶血磷脂酰膽堿,NAA=N-乙酰天冬氨酸,PE=磷脂酰乙醇胺,PI=磷脂酰肌醇

鹿明生物AFADESI-MSI空間代謝組技術(shù)作為一種新型的分子影像技術(shù),能夠獲得組織***中1000Da以下代謝物和藥物的定性、定量、定位三個(gè)維度的信息。具有免標(biāo)記、無(wú)需基質(zhì)、周期短、定位準(zhǔn)的特點(diǎn)。在獲得AFADESI-MSI平臺(tái)原創(chuàng)團(tuán)隊(duì)全力支持下,經(jīng)過(guò)前期的研發(fā)以及1年時(shí)間的技術(shù)服務(wù)積累,鹿明生物已經(jīng)完成了心臟、腦、**、腸道、肝臟、腎臟、皮膚等二十幾種臨床/動(dòng)物/植物組織樣本的空間代謝組學(xué)檢測(cè)及分析,積累了豐富的樣本前處理經(jīng)驗(yàn)?!犊臻g代謝組科研應(yīng)用手冊(cè)》是一本集聚空間代謝組學(xué)的由來(lái)、發(fā)展、原理及應(yīng)用的科研專業(yè)讀物。

空間代謝組學(xué):中文標(biāo)題:MYC*基因與固醇調(diào)節(jié)元件結(jié)合蛋白協(xié)同調(diào)節(jié)**生長(zhǎng)所必需的脂肪生成研究對(duì)象:小鼠發(fā)表期刊:CellMetabolism影響因子:27.287合作單位:斯坦福大學(xué)運(yùn)用生物技術(shù):空間代謝組學(xué)、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等MYC是一種原*基因,在細(xì)胞增殖、凋亡、分化等多種細(xì)胞生物學(xué)過(guò)程中發(fā)揮作用,其易位、擴(kuò)增或表達(dá)異常常與多種**的發(fā)***展有關(guān)。本篇由斯坦福大學(xué)DeanW.Felsher課題組在CellMetabolism發(fā)表的研究成果,通過(guò)空間代謝組學(xué)、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等技術(shù)研究*基因MYC促進(jìn)**發(fā)生機(jī)制,發(fā)現(xiàn)MYC與膽固醇調(diào)節(jié)元件結(jié)合蛋白(SREBP1)協(xié)同調(diào)節(jié)脂質(zhì)生成,從而促進(jìn)疾病的發(fā)生??臻g代謝組特異性強(qiáng)等優(yōu)點(diǎn)。湖北花瓣空間代謝組學(xué)

空間代謝組是基于質(zhì)譜成像技術(shù)發(fā)展而來(lái)的,免標(biāo)記、無(wú)需基質(zhì)、周期短。黑龍江空間代謝組學(xué)的質(zhì)譜成像

空間代謝組學(xué)主要從事質(zhì)譜成像新技術(shù)、空間分辨代謝組學(xué)新方法及其在生物醫(yī)藥應(yīng)用研究和臨床前新藥代謝研究。近年來(lái)在質(zhì)譜成像空間分辨代謝組學(xué)領(lǐng)域取得重要突破,并**國(guó)際前沿發(fā)展。目前,承擔(dān)著國(guó)家自然科學(xué)基金、醫(yī)科院創(chuàng)新工程等多項(xiàng)課題,科研經(jīng)費(fèi)充足;擁有先進(jìn)的液質(zhì)聯(lián)用儀器和質(zhì)譜成像儀器數(shù)臺(tái),建立了新藥研發(fā)質(zhì)量管理規(guī)范體系,實(shí)驗(yàn)條件完備。具有分析化學(xué)、或藥物分析、或生物學(xué)等相關(guān)專業(yè)的博士學(xué)位。2、具有以下研究經(jīng)驗(yàn)或能力之一:質(zhì)譜分析;代謝組學(xué)研究;與新藥或疾病相關(guān)的分子生物學(xué)研究;生物信息學(xué)等。黑龍江空間代謝組學(xué)的質(zhì)譜成像

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