湖北花瓣空間代謝組學

來源: 發(fā)布時間:2022-09-13

在空間上的代謝變化表明,在東莨菪堿***后,大鼠腦微區(qū)的代謝網(wǎng)絡發(fā)生紊亂。但是代謝物和代謝酶是代謝網(wǎng)絡的關鍵因素,基于空間分辨的代謝組學信息為發(fā)現(xiàn)酶或基因異常提供了線索,但若要完成完整的代謝網(wǎng)絡分析必須進一步驗證蛋白質和基因表達水平。本文作者開發(fā)了一種空間分辨代謝網(wǎng)絡作圖方法,通過無需衍生化、特定標記或復雜樣品預處理的高通量AFADESI-MSI方法和代謝組學策略,在具有復雜結構化腦組織中發(fā)現(xiàn)代謝分子變化。能檢測出多種極性內(nèi)源性代謝物,并繪制相關代謝網(wǎng)絡,提供組織微區(qū)分布的圖譜。還將多種功能性小分子(例如核苷酸、多胺、肌酸、神經(jīng)酰胺代謝物)含量分布可視化??臻g代謝組技術流程 。湖北花瓣空間代謝組學

AFADESI空間代謝組技術:免標記、無需基質噴涂、周期短、定位準是AFADESI空間代謝組技術的主要特點。該技術作為一種新型的分子影像技術,能夠獲得組織***中1000Da以下代謝物和藥物的定性、定量、定位三個維度的信息。在獲得AFADESI平臺原創(chuàng)團隊全力支持下,經(jīng)過2021年一整年的研發(fā)及項目運營落地,鹿明生物積贊了如下優(yōu)勢。一、**支持AFADESI-MSI原創(chuàng)團隊****-賀玖明教授(中國醫(yī)學科學院北京協(xié)和醫(yī)學院藥物研究所PI)全力支持,參與的基于AFADESI平臺發(fā)表的方法學及應用文章篇已在Gut、PNAS、Theranostics、AdvancedScience、Analyticalchemistry、AnalyticaChimicaActa等期刊上發(fā)表10+篇。云南深度空間代謝組學是靶向代謝組嗎空間代謝組技術特點。

在獲得AFADESI平臺原創(chuàng)團隊全力支持下,截止2021年9月,鹿明生物已經(jīng)完成共計近千例樣本經(jīng)驗,包括心臟、腦、**、腸道、肝臟、腎臟、皮膚等十幾種組織樣本空間代謝組學檢測及分析,檢測物質涵蓋膽堿類、多胺類、氨基酸類、肉堿類、核苷類、核苷酸類、有機酸類、碳水化合物類、膽固醇類、膽酸類、脂質類等多種類代謝物。歡迎各老師咨詢~空間多組學檢測平臺2套AFADESI-MSI成像系統(tǒng),分別連接QE或者QE-HF高分辨質譜儀。歐易生物、鹿明生物2021年即擁有空間代謝組和空間轉錄組(歐易生物)兩個平臺,已執(zhí)行空間代謝+空間轉錄聯(lián)合項目10+。

空間代謝組學:該技術解決了生物組織中低含量代謝物難檢測、覆蓋種類少和成像質量差等技術難題,可實現(xiàn)生物組織中約1500個代謝物的成像分析,包括膽堿類、多胺類、氨基酸類、肉堿類、核苷類、核苷酸類、有機酸類、碳水化合物類、膽固醇類、膽酸類和脂質類等,并精確表征與識別功能代謝物在組織亞區(qū)域的分布特征。在獲得AFADESI-MSI平臺原創(chuàng)團隊全力支持下,經(jīng)過前期的研發(fā)以及1年時間的技術服務積累,鹿明生物已經(jīng)完成了心臟、腦、**、腸道、肝臟、腎臟、皮膚等二十幾種臨床/動物/植物組織樣本的空間代謝組學檢測及分析,積累了豐富的樣本前處理經(jīng)驗。鹿明生物空間代謝組學。

空間代謝組學成像技術則是通過一些原位電離源,如DESI(解吸電噴霧電離源)、MALDI(基質輔助激光解吸電離源),與質譜相聯(lián),通過可視化的成像軟件,使得被檢測到的質荷比根據(jù)含量不同通過不同強度的色彩呈現(xiàn),進而提供化合物“在哪里?”的信息。無需樣品處理實時成像——電噴霧電離技術DESI系列比較大的優(yōu)勢就在于無需樣品處理,DESI-MSI作為新型敞開式質譜成像技術,其突出的優(yōu)勢是在大氣壓條件且敞開式環(huán)境下,不需要進行復雜的樣品前處理和基質輔助,可更真實反映樣品表面分子分布特征。一文讀懂空間代謝組學:DESI-IMS與MALDI-IMS的區(qū)別。遼寧空間代謝組學茶葉

空間代謝組學又有什么用呢?。湖北花瓣空間代謝組學

空間代謝組學研究作者對P493-6B細胞淋巴瘤系(BCL)進行了全基因組表達譜、核突變和ChIP分析,發(fā)現(xiàn)MYC誘導增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相關蛋白在內(nèi)的脂肪酸(FA)合成基因的mRNA表達,在MYC誘導的肝細胞*(HCC)、急性白血?。═-ALL)和腎細胞*(RCC)的三種體內(nèi)轉基因小鼠模型中也有類似表達。還發(fā)現(xiàn)MYC與這些FA合成基因的啟動子結合并啟動mRNA轉錄,如甲羥戊酸和膽固醇途徑基因的啟動子。為了了解MYC和SREBP1之間的相互作用,作者首先,對這兩種蛋白進行ChIP和re-ChIP分析,證明MYC和SREBP1都可以發(fā)現(xiàn)與FA合成基因啟動子中的相同DNA分子結合(圖1)。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表達,但不降低MYC基因的表達。其次,ChIP的MYC與啟動子結合,不僅調(diào)節(jié)FA合成基因的表達,還調(diào)節(jié)糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表達。因此,MYC似乎會依次調(diào)節(jié)參與脂質合成的基因:首先誘導葡萄糖和谷氨酰胺,然后誘導FA合成相關基因。通過RNA測序(RNA-seq)發(fā)現(xiàn),增加MYC水平會引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成。湖北花瓣空間代謝組學

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