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空間代謝組學(xué):a)小鼠腦冠狀切片圖像顯示亮場(chǎng)圖像和拉曼光譜圖像(b)脂質(zhì),蛋白質(zhì)和DNA的拉曼光譜覆蓋層(c)髓鞘結(jié)合蛋白(MBP)、Tuj1(III類β-微管蛋白)和4',6-二氨基-2-苯基吲哚(DAPI)的代表性染色(d)小鼠大腦感興趣區(qū)域的高分辨率顯微拉曼圖像(200×200μm),顯示與脂類(2885cm?1)、蛋白質(zhì)(2940cm?1)和DNA(3000cm?1)相關(guān)的拉曼光譜峰(e)K-means聚類(n=2個(gè)聚類)顯示不同的腦組織特征(f)與twok-means團(tuán)簇相關(guān)的**平均拉曼光譜(g)根據(jù)m/z848.63和m/z844.52,主要髓鞘的空間代謝組成像顯示灰質(zhì)和白質(zhì)分離,推測(cè)為Cer(D18:1/24:1)和PC(38:6)(h)灰質(zhì)和白質(zhì)的代表性的平均空間代謝質(zhì)譜圖(分別以綠色和紅色表示) 空間代謝組學(xué)所解決的科研問題。遼寧空間代謝組學(xué)茶葉
空間代謝組學(xué)能夠在復(fù)雜的EA微環(huán)境中區(qū)分組織類型,本文作者使用兩個(gè)隊(duì)列對(duì)食管腺*的甘油磷脂特征進(jìn)行了表征。**初運(yùn)用空間代謝組學(xué)對(duì)連續(xù)患者的成對(duì)手術(shù)切除活檢(EA和MHEE)進(jìn)行甘油磷脂差異分析;(樣本策略)選擇這種取樣方法的目的是為了進(jìn)行手術(shù)切緣分析,并通過取樣更大的樣本來克服**的區(qū)域代謝組學(xué)差異。接下來,采用內(nèi)窺鏡活檢對(duì)第二組人群進(jìn)行采樣。這樣就可以從健康的志愿者和Barrett化***育不良的患者身上獲得標(biāo)本。這樣還使作者能夠驗(yàn)證***個(gè)隊(duì)列的發(fā)現(xiàn),調(diào)查該技術(shù)在小樣本上的表現(xiàn),并演示在內(nèi)鏡套件中促進(jìn)診斷的第二次臨床應(yīng)用。重慶空間代謝組學(xué) 中藥活性成分鹿明生物購入空間代謝組學(xué),并構(gòu)建深度空間代謝組學(xué)的完整解決方案。
本研究應(yīng)用空間代謝組學(xué)能夠客觀地識(shí)別食管腺*。EA組磷脂富含長(zhǎng)鏈、多不飽和的PGs。并且,遺傳學(xué)研究表明,這一機(jī)制與脂肪酸從頭合成有關(guān)。這些結(jié)果表明,空間代謝組學(xué)可以區(qū)分惡性食管中的組織類型。在臨床應(yīng)用包括客觀診斷和術(shù)中切緣評(píng)估具有潛在價(jià)值。在獲得AFADESI平臺(tái)原創(chuàng)團(tuán)隊(duì)全力支持下,截止2021年9月,鹿明生物已經(jīng)完成共計(jì)近千例樣本經(jīng)驗(yàn),包括心臟、腦、**、腸道、肝臟、腎臟、皮膚等十幾種組織樣本空間代謝組學(xué)檢測(cè)及分析。
本文作者開發(fā)的一種基于敞開式空氣動(dòng)力輔助解吸電噴霧離子化質(zhì)譜成像(AFADESI-MSI)的空間代謝組學(xué)技術(shù),可以實(shí)現(xiàn)大腦功能區(qū)域小分子極性代謝物的檢測(cè),發(fā)掘微區(qū)特定代謝途徑的變化;結(jié)合代謝網(wǎng)絡(luò)映射方法,對(duì)大鼠腦的代謝網(wǎng)絡(luò)作圖,并用于東莨菪堿***的阿爾茨海默病模型大腦微區(qū)的病理過程解析。這篇文章證實(shí)了空間代謝組學(xué)技術(shù)在神經(jīng)學(xué)發(fā)展、行為與認(rèn)知、精神與退行性疾病以及腦**研究領(lǐng)域的廣泛應(yīng)用前景。大腦的結(jié)構(gòu)極為復(fù)雜,且主要功能區(qū)域的調(diào)節(jié)機(jī)制與小分子代謝物密切相關(guān)?;谏V-質(zhì)譜聯(lián)用的傳統(tǒng)代謝組學(xué)方法無法滿足大腦復(fù)雜微區(qū)代謝物的定性、定量和定位表征的需求??臻g代謝組學(xué),代謝組數(shù)據(jù)如何分析。
空間代謝組學(xué):中文標(biāo)題:MYC*基因與固醇調(diào)節(jié)元件結(jié)合蛋白協(xié)同調(diào)節(jié)**生長(zhǎng)所必需的脂肪生成研究對(duì)象:小鼠發(fā)表期刊:CellMetabolism影響因子:27.287合作單位:斯坦福大學(xué)運(yùn)用生物技術(shù):空間代謝組學(xué)、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等MYC是一種原*基因,在細(xì)胞增殖、凋亡、分化等多種細(xì)胞生物學(xué)過程中發(fā)揮作用,其易位、擴(kuò)增或表達(dá)異常常與多種**的發(fā)***展有關(guān)。近年來關(guān)于MYC在脂質(zhì)代謝中的研究很多,據(jù)了解MYC與脂肪酸合成相關(guān)酶密切相關(guān);致*基因MYC刺激細(xì)胞生長(zhǎng)需要脂質(zhì)來組裝新的細(xì)胞膜,但是否*由MYC調(diào)節(jié)還是與其他因素協(xié)同調(diào)節(jié)尚不清楚。因此本文主要是揭示MYC誘導(dǎo)的**中脂質(zhì)生成的機(jī)制。曾經(jīng)錯(cuò)過熱潮—空間轉(zhuǎn)錄組,別再錯(cuò)過新秀—空間代謝組。湖北花瓣空間代謝組學(xué)
空間代謝組三個(gè)維度的分析。遼寧空間代謝組學(xué)茶葉
空間代謝組學(xué)研究作者對(duì)P493-6B細(xì)胞淋巴瘤系(BCL)進(jìn)行了全基因組表達(dá)譜、核突變和ChIP分析,發(fā)現(xiàn)MYC誘導(dǎo)增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相關(guān)蛋白在內(nèi)的脂肪酸(FA)合成基因的mRNA表達(dá),在MYC誘導(dǎo)的肝細(xì)胞*(HCC)、急性白血病(T-ALL)和腎細(xì)胞*(RCC)的三種體內(nèi)轉(zhuǎn)基因小鼠模型中也有類似表達(dá)。還發(fā)現(xiàn)MYC與這些FA合成基因的啟動(dòng)子結(jié)合并啟動(dòng)mRNA轉(zhuǎn)錄,如甲羥戊酸和膽固醇途徑基因的啟動(dòng)子。為了了解MYC和SREBP1之間的相互作用,作者首先,對(duì)這兩種蛋白進(jìn)行ChIP和re-ChIP分析,證明MYC和SREBP1都可以發(fā)現(xiàn)與FA合成基因啟動(dòng)子中的相同DNA分子結(jié)合(圖1)。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表達(dá),但不降低MYC基因的表達(dá)。其次,ChIP的MYC與啟動(dòng)子結(jié)合,不僅調(diào)節(jié)FA合成基因的表達(dá),還調(diào)節(jié)糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表達(dá)。因此,MYC似乎會(huì)依次調(diào)節(jié)參與脂質(zhì)合成的基因:首先誘導(dǎo)葡萄糖和谷氨酰胺,然后誘導(dǎo)FA合成相關(guān)基因。通過RNA測(cè)序(RNA-seq)發(fā)現(xiàn),增加MYC水平會(huì)引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成。遼寧空間代謝組學(xué)茶葉
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