空間代謝組學(xué):a)小鼠腦冠狀切片圖像顯示亮場圖像和拉曼光譜圖像(b)脂質(zhì),蛋白質(zhì)和DNA的拉曼光譜覆蓋層(c)髓鞘結(jié)合蛋白(MBP)、Tuj1(III類β-微管蛋白)和4',6-二氨基-2-苯基吲哚(DAPI)的代表性染色(d)小鼠大腦感興趣區(qū)域的高分辨率顯微拉曼圖像(200×200μm),顯示與脂類(2885cm?1)、蛋白質(zhì)(2940cm?1)和DNA(3000cm?1)相關(guān)的拉曼光譜峰(e)K-means聚類(n=2個(gè)聚類)顯示不同的腦組織特征(f)與twok-means團(tuán)簇相關(guān)的**平均拉曼光譜(g)根據(jù)m/z848.63和m/z844.52,主要髓鞘的空間代謝組成像顯示灰質(zhì)和白質(zhì)...
在空間上的代謝變化表明,在東莨菪堿***后,大鼠腦微區(qū)的代謝網(wǎng)絡(luò)發(fā)生紊亂。但是代謝物和代謝酶是代謝網(wǎng)絡(luò)的關(guān)鍵因素,基于空間分辨的代謝組學(xué)信息為發(fā)現(xiàn)酶或基因異常提供了線索,但若要完成完整的代謝網(wǎng)絡(luò)分析必須進(jìn)一步驗(yàn)證蛋白質(zhì)和基因表達(dá)水平。本文作者開發(fā)了一種空間分辨代謝網(wǎng)絡(luò)作圖方法,通過無需衍生化、特定標(biāo)記或復(fù)雜樣品預(yù)處理的高通量AFADESI-MSI方法和代謝組學(xué)策略,在具有復(fù)雜結(jié)構(gòu)化腦組織中發(fā)現(xiàn)代謝分子變化。能檢測出多種極性內(nèi)源性代謝物,并繪制相關(guān)代謝網(wǎng)絡(luò),提供組織微區(qū)分布的圖譜。還將多種功能性小分子(例如核苷酸、多胺、肌酸、神經(jīng)酰胺代謝物)含量分布可視化。空間代謝組技術(shù)流程 。湖北花瓣空間代謝...
空間代謝組學(xué):前列腺*組織樣本中的不同組織區(qū)域具有不同的代謝特征。使用空間代謝組學(xué)確定了關(guān)鍵分子過程中的代謝差異,例如NCE、基質(zhì)和**之間的脂質(zhì)代謝和前列腺分泌功能。在不同組織結(jié)構(gòu)中觀察到的代謝物水平差異,表明了空間信息及其測量方法的重要性。本實(shí)驗(yàn)仍然存在一定的局限性,質(zhì)譜成像過程中存在分子離域,可能導(dǎo)致結(jié)果假陰性。歐易生物、鹿明生物五、軟著及**1、實(shí)驗(yàn)檢測**1項(xiàng)2、空間代謝組定性及分析軟著5項(xiàng)3、空間代謝組與空間轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析軟著3項(xiàng)空間代謝組特異性強(qiáng)等優(yōu)點(diǎn)。云南空間代謝組學(xué)AFADESI-MSI空間代謝組學(xué):1、已落地執(zhí)行項(xiàng)目100+,其中包括藥物在組織中的分布、多種疾病類型和不同處...
1.AFADESI-MSI用于大腦中極性代謝物的定位如圖1所示,將大鼠大腦連續(xù)矢狀切面通過ESI探針對逐個(gè)像素進(jìn)行掃描,并將解吸的代謝物離子傳輸?shù)礁叻直媛寿|(zhì)量分析儀進(jìn)行分析。圖1E是大鼠腦部某個(gè)像素點(diǎn)的一個(gè)代表性質(zhì)譜圖,在該圖中可以觀察到數(shù)千個(gè)代謝物的峰。AFADESI-MSI圖像還表明腦部不同功能性區(qū)域中代謝物濃度的變化。圖1A-D顯示了代表性代謝產(chǎn)物圖像,在松果體、紋狀體、海馬、胼胝體和嗅球等亞區(qū)域具有特定分布。這些異質(zhì)代謝分布與大鼠腦的功能和結(jié)構(gòu)復(fù)雜性高度一致。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,AFADESI-MSI的空間分辨率小于100μm,代謝物質(zhì)量比較大差異為0.001Da,同一物質(zhì)的檢測動(dòng)態(tài)范圍高達(dá)...
鹿明生物空間代謝組學(xué)項(xiàng)目實(shí)測結(jié)果1、可實(shí)現(xiàn)代謝物定性數(shù)量:1000-3000個(gè)代謝物。2、定性代謝物類型:不噴涂基質(zhì),小分子物質(zhì)檢測不被基質(zhì)抑制,定性物質(zhì)約70%為700Da以下的小分子物質(zhì),30%為脂質(zhì)大分子。空間多組學(xué)聯(lián)合:空間代謝+空間轉(zhuǎn)錄2021年即擁有空間代謝組和空間轉(zhuǎn)錄組(歐易生物)兩個(gè)平臺(tái),已執(zhí)行空間代謝+空間轉(zhuǎn)錄聯(lián)合項(xiàng)目10+??臻g多組學(xué)檢測平臺(tái)2套AFADESI-MSI成像系統(tǒng),分別連接QE或者QE-HF高分辨質(zhì)譜儀。***套AFADESI成像系統(tǒng)(連接Thermo QE高分辨質(zhì)譜儀)第二套AFADESI成像系統(tǒng)系統(tǒng)(連接Thermo QE-HF高分辨質(zhì)譜儀)空間代謝組得到了...
空間代謝組學(xué):該技術(shù)解決了生物組織中低含量代謝物難檢測、覆蓋種類少和成像質(zhì)量差等技術(shù)難題,可實(shí)現(xiàn)生物組織中約1500個(gè)代謝物的成像分析,包括膽堿類、多胺類、氨基酸類、肉堿類、核苷類、核苷酸類、有機(jī)酸類、碳水化合物類、膽固醇類、膽酸類和脂質(zhì)類等,并精確表征與識(shí)別功能代謝物在組織亞區(qū)域的分布特征。在獲得AFADESI-MSI平臺(tái)原創(chuàng)團(tuán)隊(duì)全力支持下,經(jīng)過前期的研發(fā)以及1年時(shí)間的技術(shù)服務(wù)積累,鹿明生物已經(jīng)完成了心臟、腦、**、腸道、肝臟、腎臟、皮膚等二十幾種臨床/動(dòng)物/植物組織樣本的空間代謝組學(xué)檢測及分析,積累了豐富的樣本前處理經(jīng)驗(yàn)??臻g代謝組是基于質(zhì)譜成像技術(shù)發(fā)展而來的,免標(biāo)記、無需基質(zhì)、周期短。江...
質(zhì)譜成像(Mass Spectrometry Imaging, MSI)作為一種新型的分子影像技術(shù),能夠直接從生物組織中獲得大量已知或未知的內(nèi)源性代謝物和外源***物等分子的結(jié)構(gòu)、含量和空間分布信息。相對于其他成像方法(如熒光成像、放射性標(biāo)記成像等),該技術(shù)無需化學(xué)或放射性標(biāo)記、不需復(fù)雜樣品前處理,具有高特異性、高通量和空間信息保留的突出優(yōu)勢。質(zhì)譜成像技術(shù)可以實(shí)現(xiàn)生物組織中上千代謝物的定性、定量和定位分析,結(jié)合生物信息學(xué)分析,發(fā)展為空間代謝組學(xué)方法,可從生物組織原位發(fā)現(xiàn)差異代謝物,并識(shí)別其生物學(xué)功能??臻g代謝組學(xué),代謝組數(shù)據(jù)如何分析。山西空間代謝組學(xué)公司在空間上的代謝變化表明,在東莨菪堿***...
空間代謝組學(xué)探究靶向納米技術(shù)促進(jìn)肝臟吸收機(jī)制研究。中文標(biāo)題:肝臟靶向納米技術(shù)促進(jìn)小檗堿改善心臟代謝疾病研究對象:小檗堿、小鼠發(fā)表期刊:NatureCommunications影響因子:14.919發(fā)表單位:中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院藥物研究所運(yùn)用生物技術(shù):AFADESI-MSI空間代謝組學(xué)、WesternBlotting、RT-PCR、Flowcytometry和ELISA等,心血管和代謝疾?。–MD)是引起全世界人口過早死的主要原因。CMD有較高的發(fā)病率和死亡率,且醫(yī)療成本越來越高。本篇由中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院藥物研究所蔣建東團(tuán)隊(duì)課題組在Nature Communications發(fā)表的研究成果,通過AFADES...
空間代謝組學(xué):中文標(biāo)題:MYC*基因與固醇調(diào)節(jié)元件結(jié)合蛋白協(xié)同調(diào)節(jié)**生長所必需的脂肪生成研究對象:小鼠發(fā)表期刊:CellMetabolism影響因子:27.287合作單位:斯坦福大學(xué)運(yùn)用生物技術(shù):空間代謝組學(xué)、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等MYC是一種原*基因,在細(xì)胞增殖、凋亡、分化等多種細(xì)胞生物學(xué)過程中發(fā)揮作用,其易位、擴(kuò)增或表達(dá)異常常與多種**的發(fā)***展有關(guān)。近年來關(guān)于MYC在脂質(zhì)代謝中的研究很多,據(jù)了解MYC與脂肪酸合成相關(guān)酶密切相關(guān);致*基因MYC刺激細(xì)胞生長需要脂質(zhì)來組裝新的細(xì)胞膜,但是否*由MYC調(diào)節(jié)還是與其他因素協(xié)同調(diào)節(jié)尚不清楚。因此本文主要是揭示MYC誘導(dǎo)的**...
空間代謝組學(xué):倫敦帝國理工學(xué)院George B Hanna教授團(tuán)隊(duì)及合作者在《Cancer Research》發(fā)表了題為“De novo lipogenesis alters the phospholipidome of esophageal adenocarcinoma"的研究成果,該研究整合磷脂代謝組學(xué)、空間代謝組學(xué)和遺傳學(xué)方法,旨在闡明食管腺*的磷脂代謝重編程,對探索與疾病診斷相關(guān)的磷脂生物標(biāo)志物具有重要意義。中文標(biāo)題:脂質(zhì)從頭合成改變食管腺*磷脂代謝研究對象:食管腺*發(fā)表期刊:CancerResearch影響因子:12.701發(fā)表單位:倫敦帝國理工學(xué)院運(yùn)用生物技術(shù):空間代謝組學(xué)鹿明生物...
作者進(jìn)行了空間代謝組學(xué)(~50μm的空間分辨率),并根據(jù)m/z848.63和m/z844.52對主要的髓鞘標(biāo)志物進(jìn)行了成像,推測它們分別屬于Cer(D18:1/24:1)和PC(38:6)(圖2G)。白質(zhì)和灰質(zhì)的代表性質(zhì)譜如圖2H所示。結(jié)果表明,使用拉曼光譜結(jié)構(gòu)信息和空間代謝組學(xué)對髓鞘中的脂質(zhì)進(jìn)行特定的成分分析是可能的。對單個(gè)有髓組織成分光譜的分析證實(shí),構(gòu)成有髓組織光譜的主要分子是脂質(zhì),包括腦苷脂、膽固醇、鞘磷脂、磷脂酰膽堿,以及程度較小的蛋白質(zhì)(圖2F)?!堵姑魃锟臻g代謝組學(xué)千萬醫(yī)學(xué)支持計(jì)劃。天津空間代謝組學(xué)與空間組學(xué)本篇小鹿分享一篇空間代謝組學(xué)專業(yè)應(yīng)用技術(shù)文章,探究空間代謝組學(xué)如何進(jìn)行前...
1.樣本準(zhǔn)備Sprague-Dawley大鼠模型腹腔注射東莨菪堿后被殺死(處理組,3只),對照組大鼠(3只)也用同樣方法殺死。獲取大鼠整個(gè)大腦,在低溫下將大腦切成連續(xù)的矢狀切片(暴露出海馬和紋狀體),用于Nissl染色、H&E染色和質(zhì)譜成像檢測。2.空間代謝組實(shí)驗(yàn)使用AFADESI-MSI分析,代謝物質(zhì)量數(shù)范圍50-500Da,質(zhì)譜分辨率70,000。3.數(shù)據(jù)處理和代謝網(wǎng)絡(luò)分析原始數(shù)據(jù)經(jīng)過轉(zhuǎn)化,再使用自建MassImager軟件獲取成像結(jié)果;在獲取差異代謝物的高分辨率質(zhì)譜信息后,使用Metaboanalys在線數(shù)據(jù)挖掘軟件以褐家鼠(rattusnorvegicus)為參考完成代謝物高通量定性,...
空間代謝組學(xué)探究靶向納米技術(shù)促進(jìn)肝臟吸收機(jī)制研究。中文標(biāo)題:肝臟靶向納米技術(shù)促進(jìn)小檗堿改善心臟代謝疾病研究對象:小檗堿、小鼠發(fā)表期刊:NatureCommunications影響因子:14.919發(fā)表單位:中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院藥物研究所運(yùn)用生物技術(shù):AFADESI-MSI空間代謝組學(xué)、WesternBlotting、RT-PCR、Flowcytometry和ELISA等,心血管和代謝疾?。–MD)是引起全世界人口過早死的主要原因。CMD有較高的發(fā)病率和死亡率,且醫(yī)療成本越來越高。本篇由中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院藥物研究所蔣建東團(tuán)隊(duì)課題組在Nature Communications發(fā)表的研究成果,通過AFADES...
鹿明生物引入Thermo ScientificTM Q Exactive HFTM將會(huì)在2022年對空間代謝組學(xué)研究帶來更高效的產(chǎn)能及更多的探索。截止2022年1月10日,鹿明生物已擁有2臺(tái)空間代謝組學(xué)**研究設(shè)備(見下方圖片)。相信鹿明生物的2022將幫助各位科研學(xué)者提供更加快速、質(zhì)量的研究。請期待鹿明生物2022給您帶來的"極速"體驗(yàn)~基于AFADESI-MSI平臺(tái)代謝物廣覆蓋度的優(yōu)點(diǎn),在臨床樣本以及動(dòng)物樣本中同時(shí)檢測到膽堿類、多胺類、氨基酸類、肉堿類、核苷類、核苷酸類、有機(jī)酸類、碳水化合物類、膽固醇類、膽酸類、脂質(zhì)類等多種類代謝物,真正意義上滿足了“空間代謝組學(xué)”的研究需求??臻g代謝組得...
質(zhì)譜成像(Mass Spectrometry Imaging, MSI)作為一種新型的分子影像技術(shù),能夠直接從生物組織中獲得大量已知或未知的內(nèi)源性代謝物和外源***物等分子的結(jié)構(gòu)、含量和空間分布信息。相對于其他成像方法(如熒光成像、放射性標(biāo)記成像等),該技術(shù)無需化學(xué)或放射性標(biāo)記、不需復(fù)雜樣品前處理,具有高特異性、高通量和空間信息保留的突出優(yōu)勢。質(zhì)譜成像技術(shù)可以實(shí)現(xiàn)生物組織中上千代謝物的定性、定量和定位分析,結(jié)合生物信息學(xué)分析,發(fā)展為空間代謝組學(xué)方法,可從生物組織原位發(fā)現(xiàn)差異代謝物,并識(shí)別其生物學(xué)功能。歐易生物空間代謝組學(xué)為廣大研究者提供一站式服務(wù)。河北3d空間代謝組學(xué)研究表明,MYC對磷脂酰肌...
1.AFADESI-MSI用于大腦中極性代謝物的定位如圖1所示,將大鼠大腦連續(xù)矢狀切面通過ESI探針對逐個(gè)像素進(jìn)行掃描,并將解吸的代謝物離子傳輸?shù)礁叻直媛寿|(zhì)量分析儀進(jìn)行分析。圖1E是大鼠腦部某個(gè)像素點(diǎn)的一個(gè)代表性質(zhì)譜圖,在該圖中可以觀察到數(shù)千個(gè)代謝物的峰。AFADESI-MSI圖像還表明腦部不同功能性區(qū)域中代謝物濃度的變化。圖1A-D顯示了代表性代謝產(chǎn)物圖像,在松果體、紋狀體、海馬、胼胝體和嗅球等亞區(qū)域具有特定分布。這些異質(zhì)代謝分布與大鼠腦的功能和結(jié)構(gòu)復(fù)雜性高度一致。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,AFADESI-MSI的空間分辨率小于100μm,代謝物質(zhì)量比較大差異為0.001Da,同一物質(zhì)的檢測動(dòng)態(tài)范圍高達(dá)...
AFADESI-MSI空間代謝組學(xué):1、已落地執(zhí)行項(xiàng)目100+,其中包括藥物在組織中的分布、多種疾病類型和不同處理手段下組織中代謝物的空間成像檢測。2、檢測組織樣本類型20+。高準(zhǔn)性的定性算法通過物質(zhì)表達(dá)空間情況、加和離子及同位素峰表達(dá)強(qiáng)度相似性、同位素表達(dá)空間分布相似性進(jìn)行初步代謝物注釋,并可基于專屬物種組織類型數(shù)據(jù)庫或非靶質(zhì)譜數(shù)據(jù)基礎(chǔ)上在初步注釋結(jié)果基礎(chǔ)上進(jìn)一步獲得更加準(zhǔn)確定性的結(jié)果。已形成心、肝、腦等多個(gè)組織的空間代謝組專屬數(shù)據(jù)庫。鹿明生物購入空間代謝組學(xué),并構(gòu)建深度空間代謝組學(xué)的完整解決方案。云南空間代謝組學(xué)商業(yè)應(yīng)用研究表明,MYC對磷脂酰肌醇(PI)代謝具有組織特異性。作者通過空間代...
空間代謝組學(xué):前列腺*組織的分子表征對于尋找新的生物標(biāo)志物、驗(yàn)證臨床生物標(biāo)志物和確定潛在的***靶點(diǎn)非常重要。然而,前列腺*組織樣本包含正常上皮、增生、基質(zhì)和**區(qū)域,具有高度異質(zhì)性,組織間固有的功能和分子差異導(dǎo)致常規(guī)的批量檢測方法有不同程度的信息丟失。質(zhì)譜成像(MSI)可以對組織切片不同區(qū)域中的潛在**標(biāo)志物進(jìn)行空間檢測,有利于分析和比較不同組織類型的代謝組和脂質(zhì)組學(xué)特征。鹿明生物已形成心、肝、腦等多個(gè)組織的空間代謝組專屬數(shù)據(jù)庫??臻g代謝組加速您的科研項(xiàng)目進(jìn)程.歡迎免費(fèi)咨詢!。湖北空間代謝組學(xué)鹿明AFADESI-MSI空間代謝組學(xué):1、已落地執(zhí)行項(xiàng)目100+,其中包括藥物在組織中的分布、多種...
AFADESI-MSI空間代謝組學(xué):生物組織**能代謝物的空間分布可以更深層次的理解組織特異性分子組織學(xué)和病理學(xué)。問題的**在于開發(fā)一種非靶向、高靈敏度、高覆蓋和高特異性的成像方法,能夠可視化大量代謝產(chǎn)物在其自然狀態(tài)下的空間分布。將功能代謝物的空間和時(shí)間變化與組織結(jié)構(gòu)和生物功能聯(lián)系起來,從根本上解釋組織在分子水平上發(fā)生了什么。AFADESI-MSI 是一種高靈敏、高覆蓋、寬動(dòng)態(tài)范圍、強(qiáng)特異性的組織代謝物成像分析技術(shù),靈敏度可達(dá)到 pg 級(jí),且代謝物含量動(dòng)態(tài)范圍跨越 3 個(gè)數(shù)量級(jí),實(shí)現(xiàn)了組織微區(qū)的精確表征和質(zhì)量數(shù)相近代謝物的準(zhǔn)確識(shí)別,可對組織大小為 1 mm×1 mm~1.5 cm×3.5 cm...
鹿明生物引入Thermo ScientificTM Q Exactive HFTM將會(huì)在2022年對空間代謝組學(xué)研究帶來更高效的產(chǎn)能及更多的探索。截止2022年1月10日,鹿明生物已擁有2臺(tái)空間代謝組學(xué)**研究設(shè)備(見下方圖片)。相信鹿明生物的2022將幫助各位科研學(xué)者提供更加快速、質(zhì)量的研究。請期待鹿明生物2022給您帶來的"極速"體驗(yàn)~基于AFADESI-MSI平臺(tái)代謝物廣覆蓋度的優(yōu)點(diǎn),在臨床樣本以及動(dòng)物樣本中同時(shí)檢測到膽堿類、多胺類、氨基酸類、肉堿類、核苷類、核苷酸類、有機(jī)酸類、碳水化合物類、膽固醇類、膽酸類、脂質(zhì)類等多種類代謝物,真正意義上滿足了“空間代謝組學(xué)”的研究需求。空間代謝組學(xué)...
空間代謝組學(xué):倫敦帝國理工學(xué)院George B Hanna教授團(tuán)隊(duì)及合作者在《Cancer Research》發(fā)表了題為“De novo lipogenesis alters the phospholipidome of esophageal adenocarcinoma"的研究成果,該研究整合磷脂代謝組學(xué)、空間代謝組學(xué)和遺傳學(xué)方法,旨在闡明食管腺*的磷脂代謝重編程,對探索與疾病診斷相關(guān)的磷脂生物標(biāo)志物具有重要意義。中文標(biāo)題:脂質(zhì)從頭合成改變食管腺*磷脂代謝研究對象:食管腺*發(fā)表期刊:CancerResearch影響因子:12.701發(fā)表單位:倫敦帝國理工學(xué)院運(yùn)用生物技術(shù):空間代謝組學(xué)空間代謝...
空間代謝組學(xué):質(zhì)譜成像技術(shù)近二十年來,隨著質(zhì)譜離子化技術(shù)的不斷發(fā)展,質(zhì)譜成像技術(shù)因其能夠直觀、快速、簡便地呈現(xiàn)出分子在細(xì)胞或組織中的結(jié)構(gòu)、空間與時(shí)間分布等信息,越來越受到大家的關(guān)注。并且質(zhì)譜成像技術(shù)也被***的用在**疾病研究、藥物前期發(fā)現(xiàn)等各領(lǐng)域的高質(zhì)量文章中,為生物標(biāo)志物的高靈敏度探測和藥物代謝精確成像研究奠定了基礎(chǔ),下面進(jìn)入到質(zhì)譜“畫”時(shí)代~是什么?有多少?在哪里?回答以上“靈魂”3問,首先需要了解他們之間的關(guān)系。質(zhì)譜是通過采集化合物的質(zhì)荷比,獲得定性和定量的信息,進(jìn)而去探究物質(zhì)本身包含的化合物“是什么?”和“有多少?”這兩個(gè)根本性問題??臻g代謝組學(xué),代謝組數(shù)據(jù)庫。遼寧植物空間代謝組學(xué) ...
進(jìn)行了相關(guān)的空間代謝組學(xué)研究來自同一患者的正常白質(zhì)組織,旨在獲得與患者再髓鞘病變相關(guān)的特定脂質(zhì)譜(圖6D?1)。通過串聯(lián)質(zhì)譜法確認(rèn)鑒定的脂質(zhì),并在表2中報(bào)告。正如在小鼠組織分析中所觀察到的,再髓鞘化區(qū)域主要在PC和PE脂質(zhì)群的組成上不同。結(jié)果表明,HSL成像可以有效地用于多發(fā)性硬化患者死后病變的脂質(zhì)譜分析,并表明多發(fā)性硬化患者再髓鞘化過程中產(chǎn)生的髓鞘與附近正常出現(xiàn)的白質(zhì)相比具有改變的脂質(zhì)譜。(a)正常白質(zhì)(NAWM)和有髓鞘病變的平均拉曼光譜±1標(biāo)準(zhǔn)差(SD)。(b)平均差譜±1SD(NAWM?再髓鞘損傷)在結(jié)構(gòu)水平顯示再髓鞘過程。(c)基于有髓損傷的拉曼光譜的P***A后驗(yàn)概率圖像突出NAW...
空間代謝組學(xué):在大鼠腦繪制特定區(qū)域分布的極性代謝物圖譜使用AFADESI-MSI在正離子和負(fù)離子模式下分別獲得298個(gè)和372個(gè)微區(qū)輪廓清晰的代謝物離子圖像。使用精確分子量并結(jié)合同位素豐度,通過人類代謝組數(shù)據(jù)庫(HMDB)對離子圖像進(jìn)行識(shí)別,鑒定出多種內(nèi)源極性代謝物,包括氨基酸、核苷酸或核苷、碳水化合物、脂肪酸和神經(jīng)遞質(zhì)等。***系統(tǒng)(CNS)的特定功能和特定解剖區(qū)域相關(guān)。例如,乙酰膽堿在大腦皮層中高度表達(dá);γ-氨基丁酸是一種抑制性神經(jīng)遞質(zhì),其在大腦皮層的信號(hào)強(qiáng)度較低,在中腦、嗅球和下丘腦中的濃度較高。曾經(jīng)錯(cuò)過熱潮—空間轉(zhuǎn)錄組,別再錯(cuò)過新秀—空間代謝組。遼寧空間代謝組學(xué)在醫(yī)學(xué)本篇為2021年8...
本文作者開發(fā)的一種基于敞開式空氣動(dòng)力輔助解吸電噴霧離子化質(zhì)譜成像(AFADESI-MSI)的空間代謝組學(xué)技術(shù),可以實(shí)現(xiàn)大腦功能區(qū)域小分子極性代謝物的檢測,發(fā)掘微區(qū)特定代謝途徑的變化;結(jié)合代謝網(wǎng)絡(luò)映射方法,對大鼠腦的代謝網(wǎng)絡(luò)作圖,并用于東莨菪堿***的阿爾茨海默病模型大腦微區(qū)的病理過程解析。這篇文章證實(shí)了空間代謝組學(xué)技術(shù)在神經(jīng)學(xué)發(fā)展、行為與認(rèn)知、精神與退行性疾病以及腦**研究領(lǐng)域的廣泛應(yīng)用前景。大腦的結(jié)構(gòu)極為復(fù)雜,且主要功能區(qū)域的調(diào)節(jié)機(jī)制與小分子代謝物密切相關(guān)?;谏V-質(zhì)譜聯(lián)用的傳統(tǒng)代謝組學(xué)方法無法滿足大腦復(fù)雜微區(qū)代謝物的定性、定量和定位表征的需求??臻g代謝組學(xué),代謝組數(shù)據(jù)如何分析。云南空間代...
1.AFADESI-MSI用于大腦中極性代謝物的定位如圖1所示,將大鼠大腦連續(xù)矢狀切面通過ESI探針對逐個(gè)像素進(jìn)行掃描,并將解吸的代謝物離子傳輸?shù)礁叻直媛寿|(zhì)量分析儀進(jìn)行分析。圖1E是大鼠腦部某個(gè)像素點(diǎn)的一個(gè)代表性質(zhì)譜圖,在該圖中可以觀察到數(shù)千個(gè)代謝物的峰。AFADESI-MSI圖像還表明腦部不同功能性區(qū)域中代謝物濃度的變化。圖1A-D顯示了代表性代謝產(chǎn)物圖像,在松果體、紋狀體、海馬、胼胝體和嗅球等亞區(qū)域具有特定分布。這些異質(zhì)代謝分布與大鼠腦的功能和結(jié)構(gòu)復(fù)雜性高度一致。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,AFADESI-MSI的空間分辨率小于100μm,代謝物質(zhì)量比較大差異為0.001Da,同一物質(zhì)的檢測動(dòng)態(tài)范圍高達(dá)...
空間代謝組學(xué)主要從事質(zhì)譜成像新技術(shù)、空間分辨代謝組學(xué)新方法及其在生物醫(yī)藥應(yīng)用研究和臨床前新藥代謝研究。近年來在質(zhì)譜成像空間分辨代謝組學(xué)領(lǐng)域取得重要突破,并**國際前沿發(fā)展。目前,承擔(dān)著國家自然科學(xué)基金、醫(yī)科院創(chuàng)新工程等多項(xiàng)課題,科研經(jīng)費(fèi)充足;擁有先進(jìn)的液質(zhì)聯(lián)用儀器和質(zhì)譜成像儀器數(shù)臺(tái),建立了新藥研發(fā)質(zhì)量管理規(guī)范體系,實(shí)驗(yàn)條件完備。具有分析化學(xué)、或藥物分析、或生物學(xué)等相關(guān)專業(yè)的博士學(xué)位。2、具有以下研究經(jīng)驗(yàn)或能力之一:質(zhì)譜分析;代謝組學(xué)研究;與新藥或疾病相關(guān)的分子生物學(xué)研究;生物信息學(xué)等。蛋白質(zhì)組學(xué)的研究方法。河南空間代謝組學(xué)英文空間代謝組學(xué):在大鼠腦繪制特定區(qū)域分布的極性代謝物圖譜使用AFADE...
隊(duì)列1:收集手術(shù)切除的食管腺*(EA)組織和與之匹配的健康食管上皮組織(MHEE)。隊(duì)列2:收集健康食管上皮組織(來自健康志愿者,HEE)和未經(jīng)***的食管炎(IEE)、巴雷特化生(BM)、巴雷特增生(BD)和食管腺*(EA)活檢樣本,用于發(fā)現(xiàn)食管腺*發(fā)展進(jìn)程中甘油磷脂的變化,以及隊(duì)列1的外部驗(yàn)證。樣本制備:樣本制成冰凍組織切片,并結(jié)合H&E染色。研究方法:空間代謝組學(xué);qPCR檢測甘油磷脂合成通路中基因的表達(dá);細(xì)胞轉(zhuǎn)染沉默ACYL基因;免疫組化用于分析隊(duì)列1樣本中脂肪酸從頭合成通路關(guān)鍵酶的表達(dá)。代謝組學(xué)分析、空間轉(zhuǎn)錄組測序價(jià)格、代謝組學(xué)分析。安徽空間代謝組學(xué)在醫(yī)學(xué) 本研究應(yīng)用空間代謝組學(xué)能...
空間代謝組學(xué):該技術(shù)解決了生物組織中低含量代謝物難檢測、覆蓋種類少和成像質(zhì)量差等技術(shù)難題,可實(shí)現(xiàn)生物組織中約1500個(gè)代謝物的成像分析,包括膽堿類、多胺類、氨基酸類、肉堿類、核苷類、核苷酸類、有機(jī)酸類、碳水化合物類、膽固醇類、膽酸類和脂質(zhì)類等,并精確表征與識(shí)別功能代謝物在組織亞區(qū)域的分布特征。在獲得AFADESI-MSI平臺(tái)原創(chuàng)團(tuán)隊(duì)全力支持下,經(jīng)過前期的研發(fā)以及1年時(shí)間的技術(shù)服務(wù)積累,鹿明生物已經(jīng)完成了心臟、腦、**、腸道、肝臟、腎臟、皮膚等二十幾種臨床/動(dòng)物/植物組織樣本的空間代謝組學(xué)檢測及分析,積累了豐富的樣本前處理經(jīng)驗(yàn)??臻g代謝組支持個(gè)性化定制。重慶空間代謝組學(xué)技術(shù)空間代謝組學(xué):中文標(biāo)題...
空間代謝組學(xué):前列腺*組織的分子表征對于尋找新的生物標(biāo)志物、驗(yàn)證臨床生物標(biāo)志物和確定潛在的***靶點(diǎn)非常重要。然而,前列腺*組織樣本包含正常上皮、增生、基質(zhì)和**區(qū)域,具有高度異質(zhì)性,組織間固有的功能和分子差異導(dǎo)致常規(guī)的批量檢測方法有不同程度的信息丟失。質(zhì)譜成像(MSI)可以對組織切片不同區(qū)域中的潛在**標(biāo)志物進(jìn)行空間檢測,有利于分析和比較不同組織類型的代謝組和脂質(zhì)組學(xué)特征。鹿明生物已形成心、肝、腦等多個(gè)組織的空間代謝組專屬數(shù)據(jù)庫。什么是空間代謝組學(xué)?。青??臻g代謝組學(xué)是什么空間代謝組學(xué):前列腺*組織樣本中的不同組織區(qū)域具有不同的代謝特征。使用空間代謝組學(xué)確定了關(guān)鍵分子過程中的代謝差異,例如N...