1.AFADESI-MSI用于大腦中極性代謝物的定位如圖1所示,將大鼠大腦連續(xù)矢狀切面通過ESI探針對逐個像素進(jìn)行掃描,并將解吸的代謝物離子傳輸?shù)礁叻直媛寿|(zhì)量分析儀進(jìn)行分析。圖1E是大鼠腦部某個像素點的一個代表性質(zhì)譜圖,在該圖中可以觀察到數(shù)千個代謝物的峰。AFADESI-MSI圖像還表明腦部不同功能性區(qū)域中代謝物濃度的變化。圖1A-D顯示了代表性代謝產(chǎn)物圖像,在松果體、紋狀體、海馬、胼胝體和嗅球等亞區(qū)域具有特定分布。這些異質(zhì)代謝分布與大鼠腦的功能和結(jié)構(gòu)復(fù)雜性高度一致。實驗結(jié)果表明,AFADESI-MSI的空間分辨率小于100μm,代謝物質(zhì)量比較大差異為0.001Da,同一物質(zhì)的檢測動態(tài)范圍高達(dá)1000倍。如圖1所示,通過AFADESI-MSI可在大鼠腦部檢測到一些呈特征性分布有代表性的極性代謝物,其強度范圍從0到104甚至到106。歐易生物空間代謝組學(xué)為廣大研究者提供一站式服務(wù)。云南空間代謝組學(xué) 肝炎
空間代謝組學(xué)成像技術(shù)則是通過一些原位電離源,如DESI(解吸電噴霧電離源)、MALDI(基質(zhì)輔助激光解吸電離源),與質(zhì)譜相聯(lián),通過可視化的成像軟件,使得被檢測到的質(zhì)荷比根據(jù)含量不同通過不同強度的色彩呈現(xiàn),進(jìn)而提供化合物“在哪里?”的信息。無需樣品處理實時成像——電噴霧電離技術(shù)DESI系列比較大的優(yōu)勢就在于無需樣品處理,DESI-MSI作為新型敞開式質(zhì)譜成像技術(shù),其突出的優(yōu)勢是在大氣壓條件且敞開式環(huán)境下,不需要進(jìn)行復(fù)雜的樣品前處理和基質(zhì)輔助,可更真實反映樣品表面分子分布特征。陜西空間代謝組學(xué)基本研究流程空間代謝組學(xué)是廣大客戶的選擇,認(rèn)準(zhǔn)鹿明生物。
1.樣本準(zhǔn)備Sprague-Dawley大鼠模型腹腔注射東莨菪堿后被殺死(處理組,3只),對照組大鼠(3只)也用同樣方法殺死。獲取大鼠整個大腦,在低溫下將大腦切成連續(xù)的矢狀切片(暴露出海馬和紋狀體),用于Nissl染色、H&E染色和質(zhì)譜成像檢測。2.空間代謝組實驗使用AFADESI-MSI分析,代謝物質(zhì)量數(shù)范圍50-500Da,質(zhì)譜分辨率70,000。3.數(shù)據(jù)處理和代謝網(wǎng)絡(luò)分析原始數(shù)據(jù)經(jīng)過轉(zhuǎn)化,再使用自建MassImager軟件獲取成像結(jié)果;在獲取差異代謝物的高分辨率質(zhì)譜信息后,使用Metaboanalys在線數(shù)據(jù)挖掘軟件以褐家鼠(rattusnorvegicus)為參考完成代謝物高通量定性,并輸出代謝網(wǎng)絡(luò)信息。大腦中復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)可視化使用Cyctoscope軟件完成。
獲取空間代謝組學(xué)圖像。計算了負(fù)離子和正離子模式下的平均空間代謝質(zhì)譜(圖5D,G)以及平均差譜,以突出不同樣品的空間代謝質(zhì)譜之間的差異(圖5E,H)。制作的圖像顯示了屬于注射側(cè)(紅色)或非注射側(cè)(綠色)的后驗概率。該分析基本證實了拉曼光譜特征,與對側(cè)正常側(cè)(非注射側(cè))相比,再髓鞘損傷(注射側(cè))發(fā)生了高度特異性的分子變化,尤其是正離子模式(圖5F,I)。隨后通過串聯(lián)質(zhì)譜法確認(rèn)了區(qū)分胼胝體再髓鞘化和正常髓鞘化區(qū)域的*****峰,并在表1中報告。拉曼光譜和空間代謝組學(xué)表明,再髓鞘化區(qū)域的脂質(zhì)成分不同于原始髓鞘的脂質(zhì)成分。從小鼠模型獲得的結(jié)果證明了HSL成像可以有效地研究再髓鞘化病變的脂質(zhì)分布,這是脫髓鞘后新形成的髓鞘與正常髓鞘相比具有明顯的分子特征和相對脂質(zhì)成分差異的***個直接指標(biāo)。歐易生物空間代謝組學(xué)適合整體方案,助力科研,。
AFADESI-MSI空間代謝組學(xué):1、已落地執(zhí)行項目100+,其中包括藥物在組織中的分布、多種疾病類型和不同處理手段下組織中代謝物的空間成像檢測。2、檢測組織樣本類型20+。高準(zhǔn)性的定性算法通過物質(zhì)表達(dá)空間情況、加和離子及同位素峰表達(dá)強度相似性、同位素表達(dá)空間分布相似性進(jìn)行初步代謝物注釋,并可基于專屬物種組織類型數(shù)據(jù)庫或非靶質(zhì)譜數(shù)據(jù)基礎(chǔ)上在初步注釋結(jié)果基礎(chǔ)上進(jìn)一步獲得更加準(zhǔn)確定性的結(jié)果。已形成心、肝、腦等多個組織的空間代謝組專屬數(shù)據(jù)庫。空間代謝組分析測序服務(wù)。海南空間代謝組學(xué)優(yōu)勢
空間代謝組具有覆蓋范圍廣,靈敏度高,動態(tài)范圍寬。云南空間代謝組學(xué) 肝炎
空間代謝組學(xué):a)小鼠腦冠狀切片圖像顯示亮場圖像和拉曼光譜圖像(b)脂質(zhì),蛋白質(zhì)和DNA的拉曼光譜覆蓋層(c)髓鞘結(jié)合蛋白(MBP)、Tuj1(III類β-微管蛋白)和4',6-二氨基-2-苯基吲哚(DAPI)的代表性染色(d)小鼠大腦感興趣區(qū)域的高分辨率顯微拉曼圖像(200×200μm),顯示與脂類(2885cm?1)、蛋白質(zhì)(2940cm?1)和DNA(3000cm?1)相關(guān)的拉曼光譜峰(e)K-means聚類(n=2個聚類)顯示不同的腦組織特征(f)與twok-means團(tuán)簇相關(guān)的**平均拉曼光譜(g)根據(jù)m/z848.63和m/z844.52,主要髓鞘的空間代謝組成像顯示灰質(zhì)和白質(zhì)分離,推測為Cer(D18:1/24:1)和PC(38:6)(h)灰質(zhì)和白質(zhì)的代表性的平均空間代謝質(zhì)譜圖(分別以綠色和紅色表示) 云南空間代謝組學(xué) 肝炎
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