廣西3d空間代謝組學(xué)

來源: 發(fā)布時間:2023-04-05

1.樣本準(zhǔn)備Sprague-Dawley大鼠模型腹腔注射東莨菪堿后被殺死(處理組,3只),對照組大鼠(3只)也用同樣方法殺死。獲取大鼠整個大腦,在低溫下將大腦切成連續(xù)的矢狀切片(暴露出海馬和紋狀體),用于Nissl染色、H&E染色和質(zhì)譜成像檢測。2.空間代謝組實驗使用AFADESI-MSI分析,代謝物質(zhì)量數(shù)范圍50-500Da,質(zhì)譜分辨率70,000。3.數(shù)據(jù)處理和代謝網(wǎng)絡(luò)分析原始數(shù)據(jù)經(jīng)過轉(zhuǎn)化,再使用自建MassImager軟件獲取成像結(jié)果;在獲取差異代謝物的高分辨率質(zhì)譜信息后,使用Metaboanalys在線數(shù)據(jù)挖掘軟件以褐家鼠(rattusnorvegicus)為參考完成代謝物高通量定性,并輸出代謝網(wǎng)絡(luò)信息。大腦中復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)可視化使用Cyctoscope軟件完成??臻g代謝組技術(shù)特點。廣西3d空間代謝組學(xué)

結(jié)果表明,原*基因MYC與SERBP蛋白共同調(diào)節(jié)**生長所必需的脂肪生成,MYC誘導(dǎo)SREBP1,然后二者共同***脂肪酸合成并利用葡萄糖和谷氨酰胺促進脂肪鏈的延伸。小鹿推薦通過空間代謝組學(xué)技術(shù),能夠觀察到MYC誘導(dǎo)后不同**的體內(nèi)脂質(zhì)組學(xué)變化,準(zhǔn)確地繪制MYC特異性脂質(zhì)代謝的位置,因此可以利用這一**的致命弱點,用于新的抗脂質(zhì)藥物研究開發(fā)。在獲得空間代謝組學(xué)AFADESI平臺原創(chuàng)團隊全力支持下,截止2021年9月,鹿明生物已經(jīng)完成共計近千例樣本經(jīng)驗,包括心臟、腦、**、腸道、肝臟、腎臟、皮膚等十幾種組織樣本空間代謝組學(xué)檢測及分析,檢測物質(zhì)涵蓋膽堿類、多胺類、氨基酸類、肉堿類、核苷類、核苷酸類、有機酸類、碳水化合物類、膽固醇類、膽酸類、脂質(zhì)類等多種類代謝物。上海質(zhì)譜成像空間代謝組學(xué)空間代謝組三個維度的分析。

進行了相關(guān)的空間代謝組學(xué)研究來自同一患者的正常白質(zhì)組織,旨在獲得與患者再髓鞘病變相關(guān)的特定脂質(zhì)譜(圖6D?1)。通過串聯(lián)質(zhì)譜法確認(rèn)鑒定的脂質(zhì),并在表2中報告。正如在小鼠組織分析中所觀察到的,再髓鞘化區(qū)域主要在PC和PE脂質(zhì)群的組成上不同。結(jié)果表明,HSL成像可以有效地用于多發(fā)性硬化患者死后病變的脂質(zhì)譜分析,并表明多發(fā)性硬化患者再髓鞘化過程中產(chǎn)生的髓鞘與附近正常出現(xiàn)的白質(zhì)相比具有改變的脂質(zhì)譜。(a)正常白質(zhì)(NAWM)和有髓鞘病變的平均拉曼光譜±1標(biāo)準(zhǔn)差(SD)。(b)平均差譜±1SD(NAWM?再髓鞘損傷)在結(jié)構(gòu)水平顯示再髓鞘過程。(c)基于有髓損傷的拉曼光譜的P***A后驗概率圖像突出NAWM(綠色)和有髓組織(紅色)。

空間代謝組學(xué):在大鼠腦繪制特定區(qū)域分布的極性代謝物圖譜使用AFADESI-MSI在正離子和負(fù)離子模式下分別獲得298個和372個微區(qū)輪廓清晰的代謝物離子圖像。使用精確分子量并結(jié)合同位素豐度,通過人類代謝組數(shù)據(jù)庫(HMDB)對離子圖像進行識別,鑒定出多種內(nèi)源極性代謝物,包括氨基酸、核苷酸或核苷、碳水化合物、脂肪酸和神經(jīng)遞質(zhì)等。***系統(tǒng)(CNS)的特定功能和特定解剖區(qū)域相關(guān)。例如,乙酰膽堿在大腦皮層中高度表達(dá);γ-氨基丁酸是一種抑制性神經(jīng)遞質(zhì),其在大腦皮層的信號強度較低,在中腦、嗅球和下丘腦中的濃度較高。空間代謝組具有覆蓋范圍廣,靈敏度高,動態(tài)范圍寬。

空間代謝組的成像。生成空間代謝組譜圖和拉曼相關(guān)圖,從而能夠?qū)⒄駝庸庾V檢測到的結(jié)構(gòu)特征分配給通過質(zhì)譜檢測到的單個分子物種(圖3D,E)。一般說來,數(shù)據(jù)顯示了與多種不同脂質(zhì)相關(guān)的拉曼振動峰之間的高度相關(guān)性。由于可以獲得很好的相關(guān)性,作者隨后對拉曼光譜和質(zhì)譜進行了PLS多元回歸。用作為例子,作者回歸了m/z844.52pC(38:6)的拉曼光譜?;貧w載體顯示高度特異的脂峰,表明對磷脂酰膽堿具有特異性(圖3F)?;貧w分析表明,可建立高度線性關(guān)系(校正R2=0.825)(圖3G)。假設(shè)在一級近似下質(zhì)譜與濃度的線性關(guān)系,這個基于拉曼的模型可以作為復(fù)雜組織中特定脂質(zhì)種類的預(yù)測因子。這些結(jié)果**了使用基于結(jié)構(gòu)和生物分子信息的互補光譜模式的脂肪組譜的新證明??臻g代謝組支持個性化定制。河南空間代謝組學(xué)基本研究流程

空間代謝組技術(shù)流程 。廣西3d空間代謝組學(xué)

空間代謝組學(xué):利用基質(zhì)進行空間成像——MALDI質(zhì)譜分子成像技術(shù)MALDI-MSI分析中非常關(guān)鍵的一點是需要添加基質(zhì)來吸收激光能量,實現(xiàn)被測物的離子化,主要對脂質(zhì)類化合物具有較好的分析效果, 空間分辨率比較高可以達(dá)到數(shù)個微米。其中,MALDI和DESI成像技術(shù)目前屬于比較完善,使用范圍較廣的成像技術(shù)。這兩種技術(shù)與質(zhì)譜相連,使用范圍有一定的互補性。二者結(jié)合使用,可實現(xiàn)“全譜圖分子成像”,相信也有很多老師想要了解這二種成像方式有什么特點呢?廣西3d空間代謝組學(xué)

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