2021年9月30日,國家自然科學(xué)基金委員會發(fā)布的《關(guān)于發(fā)布生命科學(xué)部2021年度指南引導(dǎo)類原創(chuàng)探索計劃項目指南的通告》中,也表達(dá)了對于空間多維組學(xué)的資助支持。2021年11月推出的“鹿明空間代謝組千萬醫(yī)學(xué)支持計劃(***期)”獲得了許多科研工作者的關(guān)注及參與?,F(xiàn)正式推出“鹿明空間代謝組千萬醫(yī)學(xué)支持計劃(第二期)”。本次“鹿明空間代謝組千萬醫(yī)學(xué)支持計劃(第二期)”采用的AFADESI空間代謝組平臺,是基于中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院藥物研究所再帕爾?阿不力孜教授與賀玖明教授團(tuán)隊經(jīng)過十年精心打磨,自主研發(fā)成功的AFAI-MSI儀器平臺。鹿明生物空間代謝組學(xué)。遼寧空間代謝組學(xué) 肝炎
1.AFADESI-MSI用于大腦中極性代謝物的定位如圖1所示,將大鼠大腦連續(xù)矢狀切面通過ESI探針對逐個像素進(jìn)行掃描,并將解吸的代謝物離子傳輸?shù)礁叻直媛寿|(zhì)量分析儀進(jìn)行分析。圖1E是大鼠腦部某個像素點(diǎn)的一個代表性質(zhì)譜圖,在該圖中可以觀察到數(shù)千個代謝物的峰。AFADESI-MSI圖像還表明腦部不同功能性區(qū)域中代謝物濃度的變化。圖1A-D顯示了代表性代謝產(chǎn)物圖像,在松果體、紋狀體、海馬、胼胝體和嗅球等亞區(qū)域具有特定分布。這些異質(zhì)代謝分布與大鼠腦的功能和結(jié)構(gòu)復(fù)雜性高度一致。實(shí)驗結(jié)果表明,AFADESI-MSI的空間分辨率小于100μm,代謝物質(zhì)量比較大差異為0.001Da,同一物質(zhì)的檢測動態(tài)范圍高達(dá)1000倍。如圖1所示,通過AFADESI-MSI可在大鼠腦部檢測到一些呈特征性分布有代表性的極性代謝物,其強(qiáng)度范圍從0到104甚至到106。福建空間代謝組學(xué)的質(zhì)譜成像空間代謝組學(xué)二維乃至三維的水平,極大拓展了對組學(xué)樣品信息的認(rèn)知。
通過空間代謝組學(xué)檢測到正常腎臟與MYC誘導(dǎo)的**之間的GPs豐度(m/z:700–1000),發(fā)現(xiàn)兩組存在***差異,尤其是m/z在865的***增加。酰基側(cè)鏈較短(18個碳或更少)的PG在MYC***的前15天呈現(xiàn)增加趨勢,然后開始減少,但?;鶄?cè)鏈較長的PG含量持續(xù)增加(圖 5)。MYC失活后,這些差異在很大程度上是可逆的。通過體外實(shí)驗證明,MYC的誘導(dǎo)和MYC失活能夠增加和降低了PG合成基因的mRNA(圖6C)。并且MYC活化還上調(diào)了FA延長酶ELOVL2和ELOVL6的mRNA表達(dá)豐度(圖6D)。結(jié)果顯示,MYC參與調(diào)節(jié)FA生成和相關(guān)基因的表達(dá)。
空間代謝組學(xué):前列腺*組織的分子表征對于尋找新的生物標(biāo)志物、驗證臨床生物標(biāo)志物和確定潛在的***靶點(diǎn)非常重要。然而,前列腺*組織樣本包含正常上皮、增生、基質(zhì)和**區(qū)域,具有高度異質(zhì)性,組織間固有的功能和分子差異導(dǎo)致常規(guī)的批量檢測方法有不同程度的信息丟失。質(zhì)譜成像(MSI)可以對組織切片不同區(qū)域中的潛在**標(biāo)志物進(jìn)行空間檢測,有利于分析和比較不同組織類型的代謝組和脂質(zhì)組學(xué)特征。鹿明生物已形成心、肝、腦等多個組織的空間代謝組專屬數(shù)據(jù)庫。空間代謝組技術(shù)原理 。
鹿明生物空間代謝組學(xué)項目實(shí)測結(jié)果1、可實(shí)現(xiàn)代謝物定性數(shù)量:1000-3000個代謝物。2、定性代謝物類型:不噴涂基質(zhì),小分子物質(zhì)檢測不被基質(zhì)抑制,定性物質(zhì)約70%為700Da以下的小分子物質(zhì),30%為脂質(zhì)大分子。空間多組學(xué)聯(lián)合:空間代謝+空間轉(zhuǎn)錄2021年即擁有空間代謝組和空間轉(zhuǎn)錄組(歐易生物)兩個平臺,已執(zhí)行空間代謝+空間轉(zhuǎn)錄聯(lián)合項目10+??臻g多組學(xué)檢測平臺2套AFADESI-MSI成像系統(tǒng),分別連接QE或者QE-HF高分辨質(zhì)譜儀。***套AFADESI成像系統(tǒng)(連接Thermo QE高分辨質(zhì)譜儀)第二套AFADESI成像系統(tǒng)系統(tǒng)(連接Thermo QE-HF高分辨質(zhì)譜儀)空間代謝組具有覆蓋范圍廣,靈敏度高,動態(tài)范圍寬。海南空間代謝組學(xué)英文
歐易生物空間代謝組學(xué)適合整體方案,助力科研,。遼寧空間代謝組學(xué) 肝炎
1.樣本準(zhǔn)備Sprague-Dawley大鼠模型腹腔注射東莨菪堿后被殺死(處理組,3只),對照組大鼠(3只)也用同樣方法殺死。獲取大鼠整個大腦,在低溫下將大腦切成連續(xù)的矢狀切片(暴露出海馬和紋狀體),用于Nissl染色、H&E染色和質(zhì)譜成像檢測。2.空間代謝組實(shí)驗使用AFADESI-MSI分析,代謝物質(zhì)量數(shù)范圍50-500Da,質(zhì)譜分辨率70,000。3.數(shù)據(jù)處理和代謝網(wǎng)絡(luò)分析原始數(shù)據(jù)經(jīng)過轉(zhuǎn)化,再使用自建MassImager軟件獲取成像結(jié)果;在獲取差異代謝物的高分辨率質(zhì)譜信息后,使用Metaboanalys在線數(shù)據(jù)挖掘軟件以褐家鼠(rattusnorvegicus)為參考完成代謝物高通量定性,并輸出代謝網(wǎng)絡(luò)信息。大腦中復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)可視化使用Cyctoscope軟件完成。遼寧空間代謝組學(xué) 肝炎
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