空間代謝組學(xué)研究作者對P493-6B細(xì)胞淋巴瘤系(BCL)進(jìn)行了全基因組表達(dá)譜、核突變和ChIP分析,發(fā)現(xiàn)MYC誘導(dǎo)增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相關(guān)蛋白在內(nèi)的脂肪酸(FA)合成基因的mRNA表達(dá),在MYC誘導(dǎo)的肝細(xì)胞*(HCC)、急性白血?。═-ALL)和腎細(xì)胞*(RCC)的三種體內(nèi)轉(zhuǎn)基因小鼠模型中也有類似表達(dá)。還發(fā)現(xiàn)MYC與這些FA合成基因的啟動子結(jié)合并啟動mRNA轉(zhuǎn)錄,如甲羥戊酸和膽固醇途徑基因的啟動子。為了了解MYC和SREBP1之間的相互作用,作者首先,對這兩種蛋白進(jìn)行ChIP和re-ChIP分析,證明MYC和SREBP1都可以發(fā)現(xiàn)與FA合成基因啟動子中的相同DNA分子結(jié)合(圖1)。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表達(dá),但不降低MYC基因的表達(dá)。其次,ChIP的MYC與啟動子結(jié)合,不僅調(diào)節(jié)FA合成基因的表達(dá),還調(diào)節(jié)糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表達(dá)。因此,MYC似乎會依次調(diào)節(jié)參與脂質(zhì)合成的基因:首先誘導(dǎo)葡萄糖和谷氨酰胺,然后誘導(dǎo)FA合成相關(guān)基因。通過RNA測序(RNA-seq)發(fā)現(xiàn),增加MYC水平會引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成??臻g代謝組學(xué)一個樣本多少錢。海南空間代謝組學(xué)英文
通過空間代謝組學(xué)檢測到正常腎臟與MYC誘導(dǎo)的**之間的GPs豐度(m/z:700–1000),發(fā)現(xiàn)兩組存在***差異,尤其是m/z在865的***增加。酰基側(cè)鏈較短(18個碳或更少)的PG在MYC***的前15天呈現(xiàn)增加趨勢,然后開始減少,但酰基側(cè)鏈較長的PG含量持續(xù)增加(圖 5)。MYC失活后,這些差異在很大程度上是可逆的。通過體外實驗證明,MYC的誘導(dǎo)和MYC失活能夠增加和降低了PG合成基因的mRNA(圖6C)。并且MYC活化還上調(diào)了FA延長酶ELOVL2和ELOVL6的mRNA表達(dá)豐度(圖6D)。結(jié)果顯示,MYC參與調(diào)節(jié)FA生成和相關(guān)基因的表達(dá)。海南空間代謝組學(xué)英文空間代謝組學(xué)哪家好,為各類科學(xué)領(lǐng)域提供線索和方向。
AFADESI-MSI空間代謝組學(xué):中文標(biāo)題:一種基于分子組織學(xué)的高靈敏高覆蓋質(zhì)譜成像方法用于檢測功能性代謝物研究對象:大鼠腎臟,大鼠腦和人食道*組織發(fā)表期刊:AdvancedScience影響因子:16.806運用生物技術(shù):AFADESI-MSI空間代謝組學(xué)2018年11月中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院藥物研究所再帕爾·阿不力孜教授、賀玖明研究員課題組在Advanced Science發(fā)表的研究論文,通過優(yōu)化的空氣動力輔助解吸電噴霧質(zhì)譜成像(AFADESI-MSI)技術(shù),繪制了生物樣本中超過1500種代謝物的空間分布圖譜,將功能代謝物的時空變化與組織結(jié)構(gòu)和生物功能聯(lián)系起來。本研究開發(fā)了一種靈敏且覆蓋度廣的AFADESI-MSI方法,用于原位分析組織上的代謝物并發(fā)現(xiàn)特異性生物標(biāo)志物。通過非靶向分析,在大鼠腦、腎臟和人食道*組織中觀察到數(shù)千種代謝物,為分子組織學(xué)研究提供了有力的分析工具。
空間代謝組學(xué):利用基質(zhì)進(jìn)行空間成像——MALDI質(zhì)譜分子成像技術(shù)MALDI-MSI分析中非常關(guān)鍵的一點是需要添加基質(zhì)來吸收激光能量,實現(xiàn)被測物的離子化,主要對脂質(zhì)類化合物具有較好的分析效果, 空間分辨率比較高可以達(dá)到數(shù)個微米。其中,MALDI和DESI成像技術(shù)目前屬于比較完善,使用范圍較廣的成像技術(shù)。這兩種技術(shù)與質(zhì)譜相連,使用范圍有一定的互補性。二者結(jié)合使用,可實現(xiàn)“全譜圖分子成像”,相信也有很多老師想要了解這二種成像方式有什么特點呢?質(zhì)譜成像技術(shù)可以實現(xiàn)生物組織中上千代謝物的定性。
隊列1:收集手術(shù)切除的食管腺*(EA)組織和與之匹配的健康食管上皮組織(MHEE)。隊列2:收集健康食管上皮組織(來自健康志愿者,HEE)和未經(jīng)***的食管炎(IEE)、巴雷特化生(BM)、巴雷特增生(BD)和食管腺*(EA)活檢樣本,用于發(fā)現(xiàn)食管腺*發(fā)展進(jìn)程中甘油磷脂的變化,以及隊列1的外部驗證。樣本制備:樣本制成冰凍組織切片,并結(jié)合H&E染色。研究方法:空間代謝組學(xué);qPCR檢測甘油磷脂合成通路中基因的表達(dá);細(xì)胞轉(zhuǎn)染沉默ACYL基因;免疫組化用于分析隊列1樣本中脂肪酸從頭合成通路關(guān)鍵酶的表達(dá)。空間代謝組學(xué),代謝組數(shù)據(jù)庫。安徽空間代謝組學(xué)的n要多少
空間代謝組學(xué)的力量探究前列腺*。海南空間代謝組學(xué)英文
本篇小鹿分享一篇空間代謝組學(xué)專業(yè)應(yīng)用技術(shù)文章,探究空間代謝組學(xué)如何進(jìn)行前列腺*診斷和預(yù)后生物標(biāo)志物的差異研究?該研究發(fā)現(xiàn)了前列腺*樣本中的特定組織區(qū)室的不同代謝特征,確定了幾種可能被進(jìn)一步開發(fā)為前列腺*的診斷和預(yù)后生物標(biāo)志物的差異代謝物和脂質(zhì)??臻g代謝組學(xué)能夠快速提供代謝物的水平差異和空間信息,是臨床上有潛力的創(chuàng)新診斷工具。免標(biāo)記、無需基質(zhì)噴涂、周期短、定位準(zhǔn)是AFADESI空間代謝組技術(shù)的主要特點。該技術(shù)作為一種新型的分子影像技術(shù),能夠獲得組織***中1000Da以下代謝物和藥物的定性、定量、定位三個維度的信息。海南空間代謝組學(xué)英文
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