空間代謝組學：在大鼠腦繪制特定區(qū)域分布的極性代謝物圖譜使用AFADESI-MSI在正離子和負離子模式下分別獲得298個和372個微區(qū)輪廓清晰的代謝物離子圖像。使用精確分子量并結(jié)合同位素豐度，通過人類代謝組數(shù)據(jù)庫（HMDB）對離子圖像進行識別，鑒定出多種內(nèi)源極性代謝物，包括氨基酸、核苷酸或核苷、碳水化合物、脂肪酸和神經(jīng)遞質(zhì)等。***系統(tǒng)（CNS）的特定功能和特定解剖區(qū)域相關(guān)。例如，乙酰膽堿在大腦皮層中高度表達；γ-氨基丁酸是一種抑制性神經(jīng)遞質(zhì)，其在大腦皮層的信號強度較低，在中腦、嗅球和下丘腦中的濃度較高。空間代謝組通過質(zhì)譜成像技術(shù)。北京空間代謝組學概念
AFADESI-MSI空間代謝組學：1、已落地執(zhí)行項目100+，其中包括藥物在組織中的分布、多種疾病類型和不同處理手段下組織中代謝物的空間成像檢測。2、檢測組織樣本類型20+。高準性的定性算法通過物質(zhì)表達空間情況、加和離子及同位素峰表達強度相似性、同位素表達空間分布相似性進行初步代謝物注釋，并可基于專屬物種組織類型數(shù)據(jù)庫或非靶質(zhì)譜數(shù)據(jù)基礎上在初步注釋結(jié)果基礎上進一步獲得更加準確定性的結(jié)果。已形成心、肝、腦等多個組織的空間代謝組專屬數(shù)據(jù)庫。廣西植物冷凍切片與空間代謝組學空間代謝組技術(shù)原理 。
AFADESI-MSI空間代謝組學：中文標題：一種基于分子組織學的高靈敏高覆蓋質(zhì)譜成像方法用于檢測功能性代謝物研究對象：大鼠腎臟，大鼠腦和人食道*組織發(fā)表期刊：AdvancedScience影響因子：16.806運用生物技術(shù)：AFADESI-MSI空間代謝組學2018年11月中國醫(yī)學科學院藥物研究所再帕爾·阿不力孜教授、賀玖明研究員課題組在Advanced Science發(fā)表的研究論文，通過優(yōu)化的空氣動力輔助解吸電噴霧質(zhì)譜成像（AFADESI-MSI）技術(shù)，繪制了生物樣本中超過1500種代謝物的空間分布圖譜，將功能代謝物的時空變化與組織結(jié)構(gòu)和生物功能聯(lián)系起來。本研究開發(fā)了一種靈敏且覆蓋度廣的AFADESI-MSI方法，用于原位分析組織上的代謝物并發(fā)現(xiàn)特異性生物標志物。通過非靶向分析，在大鼠腦、腎臟和人食道*組織中觀察到數(shù)千種代謝物，為分子組織學研究提供了有力的分析工具。
空間代謝組學研究作者對P493-6B細胞淋巴瘤系（BCL）進行了全基因組表達譜、核突變和ChIP分析，發(fā)現(xiàn)MYC誘導增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相關(guān)蛋白在內(nèi)的脂肪酸（FA）合成基因的mRNA表達，在MYC誘導的肝細胞*（HCC）、急性白血?。═-ALL）和腎細胞*（RCC）的三種體內(nèi)轉(zhuǎn)基因小鼠模型中也有類似表達。還發(fā)現(xiàn)MYC與這些FA合成基因的啟動子結(jié)合并啟動mRNA轉(zhuǎn)錄，如甲羥戊酸和膽固醇途徑基因的啟動子。為了了解MYC和SREBP1之間的相互作用，作者首先，對這兩種蛋白進行ChIP和re-ChIP分析，證明MYC和SREBP1都可以發(fā)現(xiàn)與FA合成基因啟動子中的相同DNA分子結(jié)合（圖1）。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表達，但不降低MYC基因的表達。其次，ChIP的MYC與啟動子結(jié)合，不僅調(diào)節(jié)FA合成基因的表達，還調(diào)節(jié)糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表達。因此，MYC似乎會依次調(diào)節(jié)參與脂質(zhì)合成的基因：首先誘導葡萄糖和谷氨酰胺，然后誘導FA合成相關(guān)基因。通過RNA測序（RNA-seq）發(fā)現(xiàn)，增加MYC水平會引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成?？臻g代謝組性價比高.擁有專業(yè)技術(shù)團隊。
以上結(jié)果表明，AFADESI-MSI方法可以直接檢測極性代謝產(chǎn)物，并具有高特異性，能呈現(xiàn)其在大腦微區(qū)分布的圖像。3.在大鼠腦中繪制微區(qū)代謝網(wǎng)絡圖要了解大腦的結(jié)構(gòu)區(qū)域發(fā)生的復雜代謝過程，不僅應準確表征代謝物，還要研究其相關(guān)性。從大鼠腦微區(qū)中提取代謝譜進行代謝網(wǎng)絡重建。從15個微區(qū)提取的MSI數(shù)據(jù)進行峰挑選和峰對齊（圖1F），包括松果體、中腦導水管、腦橋、梨狀皮質(zhì)、延髓、丘腦、紋狀體、海馬、胼胝體、嗅球、大腦皮層、小腦皮層、穹窿、小腦延髓和丘腦?？臻g代謝組學又有什么用呢？。重慶空間代謝組學是什么
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通過空間代謝組學測量了四種轉(zhuǎn)基因小鼠模型（肺*（LC）、RCC、HCC和T-ALL）中甘油磷脂（GPs）的含量，發(fā)現(xiàn)在不同的**中，MYC誘導改變了磷酸酰甘油（PGs）的豐度（圖 4A），能夠增加了大多數(shù)PG物質(zhì)。MYC失活后，PG豐度恢復到基礎水平（圖 4B）。PGs由磷脂酸(PA)通過向3-磷酸甘油中添加兩種FA形成，因此，PG誘導可以建立在MYC促進的FA增加的基礎上。然而，在體內(nèi)PGs相對于其他GPs的相對優(yōu)先合成，這意味著MYC有除FA合成之外的其他方式調(diào)節(jié)脂肪生成。北京空間代謝組學概念
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