單細(xì)胞懸液制備難于標(biāo)準(zhǔn)化。 基于酶學(xué)的樣本處理方法，大都會(huì)存在一定程度的解離偏好性，即不同的酶處理不同的組織往往會(huì)有不太一樣的「效果」，而這種效果不僅*反應(yīng)在細(xì)胞得率，細(xì)胞活性和細(xì)胞碎片等參數(shù)上，往往也會(huì)在**終細(xì)胞類型有所反映，比如可能會(huì)導(dǎo)致部分稀...

微生物組和代謝組學(xué)結(jié)果表明，高比例的直鏈淀粉/支鏈淀粉比例能夠調(diào)節(jié)消化和粘膜相關(guān)的盲腸微生物群落和代謝特征。三種比例中，喂養(yǎng)含有50%高直鏈淀粉的飲食具有更好的結(jié)果，因?yàn)槠涔采?xì)菌（如Akkermansia，Lactobacillus和Faecalibacte...

通過蛋白質(zhì)組學(xué)分析檢測了經(jīng)M-Exos處理的HBMECs的改變。外泌體***了HBMECs，在0、24和48小時(shí)各種基因的表達(dá)增加(圖2A)。此外，熱圖分析揭示了不同表達(dá)的功能基因，包括與炎癥、細(xì)胞增殖、免疫調(diào)節(jié)和血管生成相關(guān)的因素(圖2B-E)。時(shí)序分析表明...

蛋白組學(xué)技術(shù)是以蛋白質(zhì)組為研究對象，研究細(xì)胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學(xué)。DIA作為一種新的質(zhì)譜數(shù)據(jù)采集方式穩(wěn)定性高，覆蓋度廣的優(yōu)點(diǎn)。DIA蛋白組學(xué)技術(shù)已經(jīng)越來越多的疾病研究中發(fā)揮重大作用。本研究通過DIA蛋白組學(xué)技術(shù)分析了8個(gè)SAPHO病人和8...

蛋白質(zhì)組學(xué)、磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)研究案例：2021年12月30日復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院樊嘉院士、中國科學(xué)院上海藥物研究所周虎研究員、中國科學(xué)院分子細(xì)胞科學(xué)***創(chuàng)新中心高大明研究員、復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院**教授課題組合作在Cancer Cell上發(fā)表題為“Prote...

GC-MS非靶向代謝組學(xué)研究，2022年2月，上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所鮑大鵬研究員課題組在《Frontiers in Microbiology》期刊發(fā)表的題為“Oxidative Stress and Autophagy Are Important Pro...

GC-MS代謝組學(xué)和 LC-MS代謝組學(xué)研究：鹽度的變化會(huì)影響甲殼類動(dòng)物的生長、***和疾病狀態(tài)。文章作者通過非靶代謝組學(xué)對青蟹適應(yīng)鹽度急性下降過程中的代謝變化進(jìn)行了研究，利用GC-MS和LC-MS數(shù)據(jù)聯(lián)合分析了青蟹應(yīng)對鹽度急性下降情況的主要代謝途徑。研究結(jié)果...

作者通過泛素化蛋白組學(xué)分析鑒定了茶樹作根中的泛素化蛋白質(zhì)。中文標(biāo)題：氮調(diào)節(jié)茶樹根中茶氨酸和黃酮類化合物的生物合成：多組學(xué)分析揭示的蛋白質(zhì)水平調(diào)節(jié)研究對象：茶樹根發(fā)表期刊：JournalofAgriculturalandFoodChemistry影響因子：5.2...

本研究采用串聯(lián)質(zhì)量標(biāo)簽（TMT）標(biāo)記的蛋白質(zhì)組學(xué)和平行反應(yīng)監(jiān)測（PRM）技術(shù)，對蓮子脫水過程中的生理調(diào)控網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行了深入研究表明，碳水化合物代謝（包括糖酵解/糖異成、半乳糖代謝、淀粉和蔗糖代謝、磷酸戊糖途徑和細(xì)胞壁組織）、ER中的蛋白質(zhì)加工、DNA修復(fù)和抗氧化事...

代謝組學(xué)經(jīng)典研究：本篇小鹿將為各位看官推薦4篇使用代謝組學(xué)的經(jīng)典研究，***篇文章運(yùn)用LC-MS/GC-MS雙平臺(tái)代謝組學(xué)探究番茄果實(shí)成熟過程中的代謝變化。第二篇文章運(yùn)用16S rRNA測序+代謝組學(xué)技術(shù)研究不同分子量的PE顆粒干擾玉米生長和根際微環(huán)境的機(jī)制。...

AFADESI-MSI空間代謝組學(xué)：中文標(biāo)題：肝臟靶向納米技術(shù)促進(jìn)小檗堿改善心臟代謝疾病研究對象：小檗堿、小鼠發(fā)表期刊：NatureCommunications影響因子：14.919發(fā)表單位：中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院藥物研究所運(yùn)用生物技術(shù)：AFADESI-MSI空間代謝...

蛋白組學(xué)技術(shù)是以蛋白質(zhì)組為研究對象，研究細(xì)胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學(xué)。DIA作為一種新的質(zhì)譜數(shù)據(jù)采集方式穩(wěn)定性高，覆蓋度廣的優(yōu)點(diǎn)。DIA蛋白組學(xué)技術(shù)已經(jīng)越來越多的疾病研究中發(fā)揮重大作用。本研究通過DIA蛋白組學(xué)技術(shù)分析了8個(gè)SAPHO病人和8...

采用RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析和DIA蛋白質(zhì)組學(xué)分析，研究了AC和AL對db/db小鼠的影響。轉(zhuǎn)錄組分析共鑒定出16812種不同的蛋白質(zhì)編碼轉(zhuǎn)錄本。其中，2837個(gè)（約16.9%）在正常組和對照組之間有***差異，表明db/db小鼠在轉(zhuǎn)錄水平上與野生型小鼠**...

土壤代謝物可以間接反映微生物代謝過程的變化，使用基于GC-MS的非靶向代謝組學(xué)，在土壤樣品***鑒定272種代謝物并對其進(jìn)行非靶向代謝組學(xué)定量，定量結(jié)果表明AgNPs暴露***改變了土壤代謝物的分布。通過參數(shù)VIP>1.5，在土壤中鑒定出20種具有重要變化的代...

通過蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜鑒定、PRM靶向鑒定、iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)等研究方法，發(fā)現(xiàn)了N-豆蔻?；诟闻K**發(fā)生中發(fā)揮重要作用，揭示了NMT1的N-豆蔻酰化抑制抗**發(fā)生的NDP，并通過干擾泛素化來刺激促**發(fā)生的NUP機(jī)制。為靶向N-豆蔻?；蚇MT1可能有助...

代謝組學(xué)+轉(zhuǎn)錄組學(xué)，中文標(biāo)題：基于代謝組學(xué)分析的百菌清、多菌靈、咪鮮胺及其二元和三元混合物對斑馬魚胚胎和仔魚的健康風(fēng)險(xiǎn)研究對象：斑馬魚胚胎和仔魚發(fā)表期刊：JournalofHazardousMaterials影響因子：10.588運(yùn)用生物技術(shù)：代謝組學(xué)環(huán)境毒理...

非靶向代謝組學(xué)研究：2022年5月，歐易/鹿明生物合作客戶甘肅省農(nóng)業(yè)科學(xué)院程鴻團(tuán)隊(duì)和中國農(nóng)業(yè)大學(xué)林濤團(tuán)隊(duì)在Frontiers in Plant Science期刊發(fā)表的題為 “Identification of Key Gene Networks Contro...

代謝組學(xué)數(shù)據(jù)提供了COVID-19患者各階段循環(huán)代謝物特征的綜合觀點(diǎn)，并確定了葡萄糖代謝和尿素循環(huán)的代謝重編程是COVID-19的潛在病理機(jī)制。在****病程的不同階段，靶向宿主代謝可能是一種可行的方法。非靶向代謝組學(xué)分析中，發(fā)現(xiàn)隊(duì)列中的樣品共鑒定出2466個(gè)...

為了確定TMT AD蛋白網(wǎng)絡(luò)模塊是否也存在于其他的隊(duì)列和大腦區(qū)域，使用 TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)多個(gè)隊(duì)列的所有組織，為每個(gè)隊(duì)列生成蛋白質(zhì)共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)，并評(píng)估了 AD 網(wǎng)絡(luò)模塊是否保留在每個(gè)隊(duì)列和大腦區(qū)域中。發(fā)現(xiàn)幾乎所有的 TMT AD 網(wǎng)絡(luò)模塊都保留在隊(duì)列和大腦...

代謝組學(xué)經(jīng)典研究：本篇小鹿將為各位看官推薦4篇使用代謝組學(xué)的經(jīng)典研究，***篇文章運(yùn)用LC-MS/GC-MS雙平臺(tái)代謝組學(xué)探究番茄果實(shí)成熟過程中的代謝變化。第二篇文章運(yùn)用16S rRNA測序+代謝組學(xué)技術(shù)研究不同分子量的PE顆粒干擾玉米生長和根際微環(huán)境的機(jī)制。...

空間代謝組學(xué)：在大鼠腦繪制特定區(qū)域分布的極性代謝物圖譜使用AFADESI-MSI在正離子和負(fù)離子模式下分別獲得298個(gè)和372個(gè)微區(qū)輪廓清晰的代謝物離子圖像。使用精確分子量并結(jié)合同位素豐度，通過人類代謝組數(shù)據(jù)庫（HMDB）對離子圖像進(jìn)行識(shí)別，鑒定出多種內(nèi)源極性...

代謝組學(xué)+轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究：2022年2月，中國海洋大學(xué)食品科學(xué)與工程學(xué)院劉尊英教授課題組在《Foods》期刊發(fā)表的題為“Dissecting of the AI-2/LuxS Mediated Growth Characteristics and Bacteri...

尿液代謝組學(xué)研究案例，空氣中PM和生物氣溶膠共同暴露的尿液代謝組學(xué)特征采用LC-MS+GC-MS雙平臺(tái)代謝組學(xué)方法對尿液樣品進(jìn)行分析，其中GC-MS檢測102種代謝物，LC-MS檢測到1271種。作者通過使用亞組來分析差異代謝物是否具有性別或季節(jié)性，結(jié)果表明性...

GC-MS代謝組學(xué)和 LC-MS代謝組學(xué)研究：鹽度的變化會(huì)影響甲殼類動(dòng)物的生長、***和疾病狀態(tài)。文章作者通過非靶代謝組學(xué)對青蟹適應(yīng)鹽度急性下降過程中的代謝變化進(jìn)行了研究，利用GC-MS和LC-MS數(shù)據(jù)聯(lián)合分析了青蟹應(yīng)對鹽度急性下降情況的主要代謝途徑。研究結(jié)果...

酵母文庫實(shí)驗(yàn)由歐易生物完成。2021 年 3 月，山東農(nóng)業(yè)大學(xué)郝玉金教授為通訊作者，在 Plant Physiology 雜志（IF: 6.902）在線發(fā)表了題為“Interaction of BTB-TAZ protein MdBT2 and DELLA p...

空間代謝組學(xué)主要從事質(zhì)譜成像新技術(shù)、空間分辨代謝組學(xué)新方法及其在生物醫(yī)藥應(yīng)用研究和臨床前新藥代謝研究。近年來在質(zhì)譜成像空間分辨代謝組學(xué)領(lǐng)域取得重要突破，并**國際前沿發(fā)展。目前，承擔(dān)著國家自然科學(xué)基金、醫(yī)科院創(chuàng)新工程等多項(xiàng)課題，科研經(jīng)費(fèi)充足；擁有先進(jìn)的液質(zhì)聯(lián)用...

酵母文庫：近日，上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物育種栽培研究所儲(chǔ)黃偉副研究員、曹黎明研究員為共同通訊作者，在Plant，Cell&Environment雜志（IF：7.228）在線發(fā)表了題為“Aconservedclathrin-coatedvesiclecomponen...

為了更好地了解DON對C2C12細(xì)胞分化的影響，作者進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的整合分析。共鑒定了149個(gè)共同的***差異基因（co-DEG），其中91%被共下調(diào)（圖3A）。15%的co-DEG屬于真核細(xì)胞骨架，其中大部分屬于肌動(dòng)蛋白絲，少數(shù)是中間絲和微管的成...

單細(xì)胞蛋白組學(xué)研究方法：2020年9月，加州大學(xué)的MinnieM.Sarwal課題組在FrontiersinMedicine發(fā)表的題為“Near-Single-CellProteomicsProfilingoftheProximalTubularandGlom...

酵母文庫實(shí)驗(yàn):MAPK級(jí)聯(lián)***是植物防御病原體入侵信號(hào)傳導(dǎo)過程中的關(guān)鍵事件，MAPKs靶向并磷酸化調(diào)節(jié)下游基因轉(zhuǎn)錄的轉(zhuǎn)錄因子，**終響應(yīng)病原菌的侵入。WRKYs轉(zhuǎn)錄因子是MAPK級(jí)聯(lián)的重要目標(biāo)，在植物對各種病原體的抗性中起著關(guān)鍵作用。蘋果如何響應(yīng)炭疽菌入侵，...