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空間代謝組學(xué):在大鼠腦繪制特定區(qū)域分布的極性代謝物圖譜使用AFADESI-MSI在正離子和負(fù)離子模式下分別獲得298個(gè)和372個(gè)微區(qū)輪廓清晰的代謝物離子圖像。使用精確分子量并結(jié)合同位素豐度,通過(guò)人類代謝組數(shù)據(jù)庫(kù)(HMDB)對(duì)離子圖像進(jìn)行識(shí)別,鑒定出多種內(nèi)源極性代謝物,包括氨基酸、核苷酸或核苷、碳水化合物、脂肪酸和神經(jīng)遞質(zhì)等。***系統(tǒng)(CNS)的特定功能和特定解剖區(qū)域相關(guān)。例如,乙酰膽堿在大腦皮層中高度表達(dá);γ-氨基丁酸是一種抑制性神經(jīng)遞質(zhì),其在大腦皮層的信號(hào)強(qiáng)度較低,在中腦、嗅球和下丘腦中的濃度較高??臻g代謝組相關(guān)技術(shù)服務(wù),經(jīng)驗(yàn)豐富。福建空間代謝組學(xué)技術(shù)怎么應(yīng)用
空間代謝組學(xué)研究作者對(duì)P493-6B細(xì)胞淋巴瘤系(BCL)進(jìn)行了全基因組表達(dá)譜、核突變和ChIP分析,發(fā)現(xiàn)MYC誘導(dǎo)增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相關(guān)蛋白在內(nèi)的脂肪酸(FA)合成基因的mRNA表達(dá),在MYC誘導(dǎo)的肝細(xì)胞*(HCC)、急性白血?。═-ALL)和腎細(xì)胞*(RCC)的三種體內(nèi)轉(zhuǎn)基因小鼠模型中也有類似表達(dá)。還發(fā)現(xiàn)MYC與這些FA合成基因的啟動(dòng)子結(jié)合并啟動(dòng)mRNA轉(zhuǎn)錄,如甲羥戊酸和膽固醇途徑基因的啟動(dòng)子。為了了解MYC和SREBP1之間的相互作用,作者首先,對(duì)這兩種蛋白進(jìn)行ChIP和re-ChIP分析,證明MYC和SREBP1都可以發(fā)現(xiàn)與FA合成基因啟動(dòng)子中的相同DNA分子結(jié)合(圖1)。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表達(dá),但不降低MYC基因的表達(dá)。其次,ChIP的MYC與啟動(dòng)子結(jié)合,不僅調(diào)節(jié)FA合成基因的表達(dá),還調(diào)節(jié)糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表達(dá)。因此,MYC似乎會(huì)依次調(diào)節(jié)參與脂質(zhì)合成的基因:首先誘導(dǎo)葡萄糖和谷氨酰胺,然后誘導(dǎo)FA合成相關(guān)基因。通過(guò)RNA測(cè)序(RNA-seq)發(fā)現(xiàn),增加MYC水平會(huì)引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成。福建空間代謝組學(xué)技術(shù)怎么應(yīng)用空間代謝組技術(shù)流程 。
空間代謝組學(xué):前列腺*組織的分子表征對(duì)于尋找新的生物標(biāo)志物、驗(yàn)證臨床生物標(biāo)志物和確定潛在的***靶點(diǎn)非常重要。然而,前列腺*組織樣本包含正常上皮、增生、基質(zhì)和**區(qū)域,具有高度異質(zhì)性,組織間固有的功能和分子差異導(dǎo)致常規(guī)的批量檢測(cè)方法有不同程度的信息丟失。質(zhì)譜成像(MSI)可以對(duì)組織切片不同區(qū)域中的潛在**標(biāo)志物進(jìn)行空間檢測(cè),有利于分析和比較不同組織類型的代謝組和脂質(zhì)組學(xué)特征。鹿明生物已形成心、肝、腦等多個(gè)組織的空間代謝組專屬數(shù)據(jù)庫(kù)。
獲取空間代謝組學(xué)圖像。計(jì)算了負(fù)離子和正離子模式下的平均空間代謝質(zhì)譜(圖5D,G)以及平均差譜,以突出不同樣品的空間代謝質(zhì)譜之間的差異(圖5E,H)。制作的圖像顯示了屬于注射側(cè)(紅色)或非注射側(cè)(綠色)的后驗(yàn)概率。該分析基本證實(shí)了拉曼光譜特征,與對(duì)側(cè)正常側(cè)(非注射側(cè))相比,再髓鞘損傷(注射側(cè))發(fā)生了高度特異性的分子變化,尤其是正離子模式(圖5F,I)。隨后通過(guò)串聯(lián)質(zhì)譜法確認(rèn)了區(qū)分胼胝體再髓鞘化和正常髓鞘化區(qū)域的*****峰,并在表1中報(bào)告。拉曼光譜和空間代謝組學(xué)表明,再髓鞘化區(qū)域的脂質(zhì)成分不同于原始髓鞘的脂質(zhì)成分。從小鼠模型獲得的結(jié)果證明了HSL成像可以有效地研究再髓鞘化病變的脂質(zhì)分布,這是脫髓鞘后新形成的髓鞘與正常髓鞘相比具有明顯的分子特征和相對(duì)脂質(zhì)成分差異的***個(gè)直接指標(biāo)??臻g代謝組性價(jià)比高.擁有專業(yè)技術(shù)團(tuán)隊(duì)。
進(jìn)行了相關(guān)的空間代謝組學(xué)研究來(lái)自同一患者的正常白質(zhì)組織,旨在獲得與患者再髓鞘病變相關(guān)的特定脂質(zhì)譜(圖6D?1)。通過(guò)串聯(lián)質(zhì)譜法確認(rèn)鑒定的脂質(zhì),并在表2中報(bào)告。正如在小鼠組織分析中所觀察到的,再髓鞘化區(qū)域主要在PC和PE脂質(zhì)群的組成上不同。結(jié)果表明,HSL成像可以有效地用于多發(fā)性硬化患者死后病變的脂質(zhì)譜分析,并表明多發(fā)性硬化患者再髓鞘化過(guò)程中產(chǎn)生的髓鞘與附近正常出現(xiàn)的白質(zhì)相比具有改變的脂質(zhì)譜。(a)正常白質(zhì)(NAWM)和有髓鞘病變的平均拉曼光譜±1標(biāo)準(zhǔn)差(SD)。(b)平均差譜±1SD(NAWM?再髓鞘損傷)在結(jié)構(gòu)水平顯示再髓鞘過(guò)程。(c)基于有髓損傷的拉曼光譜的P***A后驗(yàn)概率圖像突出NAWM(綠色)和有髓組織(紅色)。蛋白質(zhì)組學(xué)的研究方法。安徽空間代謝組學(xué)公司
空間代謝組得到了廣大醫(yī)學(xué)領(lǐng)域科研工作者的信任。福建空間代謝組學(xué)技術(shù)怎么應(yīng)用
空間代謝組學(xué)(AFADESI-MSI):中文標(biāo)題:使用敞開(kāi)式質(zhì)譜成像技術(shù)及代謝組學(xué)繪制大鼠腦代謝網(wǎng)絡(luò)圖研究對(duì)象:大鼠腦發(fā)表期刊:AnalyticalChemistry影響因子:6.986發(fā)表時(shí)間:2021年4月23日研究單位:中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院藥物研究所天然藥物活性物質(zhì)與功能國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室運(yùn)用生物技術(shù):空間代謝組學(xué)(AFADESI-MSI)。大腦是結(jié)構(gòu)**復(fù)雜的***之一,主要功能與其微區(qū)的分子相互作用密切相關(guān)。大腦的小分子調(diào)節(jié)機(jī)制對(duì)理解***功能、精神疾病機(jī)理和藥物研發(fā)有很大的幫助。動(dòng)物的認(rèn)知過(guò)程和行為控制均依賴于腦部強(qiáng)大的***網(wǎng)絡(luò)——神經(jīng)連接體??茖W(xué)家進(jìn)行了很多研究,但是對(duì)腦部小分子網(wǎng)絡(luò)的研究仍有不足。福建空間代謝組學(xué)技術(shù)怎么應(yīng)用
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