單細胞蛋白組學(xué)研究方法:2020年9月,加州大學(xué)的MinnieM.Sarwal課題組在FrontiersinMedicine發(fā)表的題為“Near-Single-CellProteomicsProfilingoftheProximalTubularandGlomerulusoftheNormalHumanKidney”的研究成果,通過單細胞蛋白組學(xué)研究方法,分析正常人近端腎小管和腎小球區(qū)域的腎臟細胞,研究為解開急性和慢性腎臟疾病病因和腎臟亞細胞功能擾動提供依據(jù)。中文標題:正常人腎臟近端腎小管和腎小球的單細胞蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究對象:人體腎臟組織發(fā)表期刊:FrontiersinMedicine影響因子:5.091發(fā)表時間:2020年9月運用重點組學(xué)技術(shù):單細胞蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)簡介及應(yīng)用場景。安徽shotgun蛋白組學(xué)
隨著質(zhì)譜技術(shù)的飛速發(fā)展,特別是離子淌度的引入,增加了一個新的分離維度,將蛋白質(zhì)組研究推進到全新的“4D蛋白質(zhì)組”層面,打破了基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)研究的瓶頸,大幅度的提高掃描速度和檢測靈敏度,帶來蛋白質(zhì)組學(xué)在鑒定深度、檢測周期、定量準確性等性能的***提升,可以更好的解決大隊列、復(fù)雜體系以及微量樣本的檢測。相比于timsTOF Pro,timsTOF Pro 2 配備了***一代雙TIMS分析器,離子容量可提高三倍。經(jīng)過簡化的離子透鏡比較大限度地提高了離子傳輸效率和靈敏度,為4D-多組學(xué)建立了新的標準。CCS 值的加入讓組學(xué)結(jié)果更精細,也使timsTOF Pro 2成為轉(zhuǎn)化組學(xué)應(yīng)用不可或缺的工具。timsTOF Pro 2 能夠?qū)崿F(xiàn)少量細胞群或生物穿刺樣本等低樣本量的蛋白組定量分析以及磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)分析,在短梯度下實現(xiàn)蛋白深度覆蓋。山東外泌體蛋白組學(xué)檢測蛋白組+代謝組+脂質(zhì)組-數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)。
作者通過泛素化蛋白組學(xué)分析鑒定了茶樹作根中的泛素化蛋白質(zhì)。中文標題:氮調(diào)節(jié)茶樹根中茶氨酸和黃酮類化合物的生物合成:多組學(xué)分析揭示的蛋白質(zhì)水平調(diào)節(jié)研究對象:茶樹根發(fā)表期刊:JournalofAgriculturalandFoodChemistry影響因子:5.279發(fā)表時間:2021年9月1日發(fā)表單位:安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)運用生物技術(shù):TMT蛋白質(zhì)組學(xué)、泛素化蛋白質(zhì)組學(xué)(其中部分數(shù)據(jù)分析由鹿明生物提供技術(shù)支持)。本文分析了氮缺乏下茶樹根部的茶氨酸和黃酮類代謝,通過蛋白質(zhì)組和泛素化蛋白質(zhì)組結(jié)合轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)探索了調(diào)節(jié)機制。本文的多組學(xué)數(shù)據(jù)整合分析思路值得借鑒。
本文為中國科學(xué)院海岸帶研究所趙建民課題組在ScienceoftheTotalEnvironment期刊發(fā)表了的文章,通過iTRAQ標記定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究弧菌***加劇了海洋酸化造成的牡蠣免疫抑制效應(yīng)。海洋酸化可能增加海洋軟體動物疾病加劇的風(fēng)險。從而將產(chǎn)生重大的經(jīng)濟和生態(tài)影響,因此本研究結(jié)果具有重要的指導(dǎo)意義。在本研究中,研究者將太平洋牡蠣暴露于酸化海水(約2000ppm)中28天,然后用金氏弧菌進行***處理,以此研究海洋酸化是否會影響牡蠣對病原菌***的免疫反應(yīng)。此外,利用基于iTRAQ的定量蛋白質(zhì)組學(xué)方法,對牡蠣鰓這一潛在的造血部位進行了研究,以分析對OA和金氏弧菌共同作用較敏感的生理過程。蛋白質(zhì)組學(xué),Label Free/iTRAQ/dia/MRM/PRM。
運用生物技術(shù):磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)(歐易鹿明提供):2022年1月,***醫(yī)學(xué)研究院生物工程研究所鐘輝研究員、魏從文副研究員和秦成峰研究員,廣西醫(yī)科大學(xué)附屬**醫(yī)院吳飛翔教授等為共同通訊作(一作:萬祿明、鄧永強、柯躍華、麻恩浩、楊歡、林浩天)在Nature Metabolism期刊發(fā)表的題為“GP73 is a glucogenic hormone contributing to SARS-CoV-2-induced hyperglycemia”的研究成果,通過磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)、LC-MS靶向代謝組學(xué)等研究方法,發(fā)現(xiàn)了一個全新的糖異生調(diào)控***——GP73,***會誘導(dǎo)GP73的產(chǎn)生和分泌,從而導(dǎo)致過度的糖異生。蛋白組學(xué)近期研究進展的盤點。江西tmt蛋白組學(xué)
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蛋白質(zhì)是生命活動的主要執(zhí)行者,而蛋白質(zhì)磷酸化修飾是生物體內(nèi)**重要的共價修飾方式之一,真核生物體內(nèi)有超過三分之一的蛋白可以發(fā)生磷酸化修飾。蛋白質(zhì)的磷酸化和去磷酸化這一可逆過程調(diào)節(jié)著包括細胞增殖、發(fā)育、分化、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、細胞凋亡、神經(jīng)活動、肌肉收縮及**發(fā)生等過程在內(nèi)的所有生命活動。單一的磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)只能解釋蛋白磷酸化水平發(fā)生的變化,而[黃金搭檔]——蛋白質(zhì)組與磷酸化蛋白質(zhì)組聯(lián)合分析,則在揭示疾病相關(guān)特性、篩選疾病生物標志物、尋找藥物靶點等方面發(fā)揮了更加重要的作用。安徽shotgun蛋白組學(xué)
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