酵母雙雜交文庫(kù)：本研究通過(guò)7個(gè)樹(shù)齡的油松樣品轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，鑒定到一個(gè)與年齡信號(hào)***相關(guān)的基因模塊，該模塊包含33個(gè)轉(zhuǎn)錄因子，包括SOC1-like、DAL1等。油松和晚坐果白皮松突變體中的基因表達(dá)模式分析顯示，PtMADS11與生殖能力之間存在緊密相關(guān)性。酵母...

TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究案例：2021年12月威爾康奈爾醫(yī)學(xué)中心和紀(jì)念斯隆凱特琳**中心的Linda T. Vahdat 和 Vivek Mittal教授課題組在Nature Communications期刊發(fā)表的題為 “Copper depletion ...

歐易生物酵母文庫(kù)技術(shù)發(fā)表的又一篇高水平研究論文。植物***茉莉酸(JA)參與植物許多發(fā)育過(guò)程的調(diào)控。JAZ蛋白是茉莉酸信號(hào)反應(yīng)的阻遏物，通過(guò)抑制JA轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)劑來(lái)負(fù)向調(diào)節(jié)JA信號(hào)。花青素和原花青素是種子、葉、花和果實(shí)中重要的植物次生代謝產(chǎn)物，可充當(dāng)抗氧化劑，幫助...

使用TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析，與GFP-群體相比，在GFP+細(xì)胞中TM處理后，線粒體復(fù)合物IV的多個(gè)亞基被特異性下調(diào)，對(duì)下調(diào)的蛋白質(zhì)進(jìn)行基因本體 (GO)分析，顯示參與線粒體電子傳遞鏈 (ETC) 的通路富集。同時(shí)作者還分析了從人 LM2 細(xì)胞系中分選的 ...

如空間代謝組。研究中開(kāi)發(fā)了一種新的基于拉曼光譜和空間代謝組學(xué)分析的脂質(zhì)組學(xué)(HSL)成像策略，用于分子表征和定量再髓鞘形成，并通過(guò)特定髓鞘蛋白的免疫標(biāo)記進(jìn)行了驗(yàn)證。利用拉曼和空間代謝組學(xué)數(shù)據(jù)生成了分子成像圖譜，用于體外組織的生物分子結(jié)構(gòu)和組成的關(guān)聯(lián)。將相關(guān)脂質(zhì)...

4D蛋白質(zhì)組學(xué)分析發(fā)現(xiàn)，不同的病因和疾病的嚴(yán)重程度中蛋白表達(dá)存在差異。嚴(yán)重的疾病同急性期的蛋白的增加，補(bǔ)體系統(tǒng)蛋白及功能相關(guān)的蛋白相關(guān)；通過(guò)COVID-19和健康組對(duì)比，發(fā)現(xiàn)了49%的差異分析物；和膿毒癥相比，G-CSF，IL-8等在嚴(yán)重的COVID-19患者...

運(yùn)用生物技術(shù)：TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)、PRM蛋白靶向驗(yàn)證由鹿明生物提供技術(shù)支持：2021年12月，上海交通大學(xué)張荻課題組在Frontiers in Plant Science發(fā)表題為 TMT-Based Quantitative Proteomic Anal...

空間代謝組學(xué)：該技術(shù)解決了生物組織中低含量代謝物難檢測(cè)、覆蓋種類(lèi)少和成像質(zhì)量差等技術(shù)難題，可實(shí)現(xiàn)生物組織中約1500個(gè)代謝物的成像分析，包括膽堿類(lèi)、多胺類(lèi)、氨基酸類(lèi)、肉堿類(lèi)、核苷類(lèi)、核苷酸類(lèi)、有機(jī)酸類(lèi)、碳水化合物類(lèi)、膽固醇類(lèi)、膽酸類(lèi)和脂質(zhì)類(lèi)等，并精確表征與識(shí)別...

鹿明生物空間代謝組學(xué)項(xiàng)目實(shí)測(cè)結(jié)果1、可實(shí)現(xiàn)代謝物定性數(shù)量：1000-3000個(gè)代謝物。2、定性代謝物類(lèi)型：不噴涂基質(zhì)，小分子物質(zhì)檢測(cè)不被基質(zhì)抑制，定性物質(zhì)約70%為700Da以下的小分子物質(zhì)，30%為脂質(zhì)大分子。空間多組學(xué)聯(lián)合：空間代謝+空間轉(zhuǎn)錄2021年即擁...

目前已在動(dòng)物組織單細(xì)胞測(cè)序中有所應(yīng)用，那么能不能把轉(zhuǎn)錄抑制劑也應(yīng)用于植物原生質(zhì)體解離及測(cè)序中呢？雖然植物和動(dòng)物都是生物組織，但在物種生理特性、理化特性上都有極大的差異，適用于動(dòng)物細(xì)胞的方法并不一定能簡(jiǎn)單適用于植物原生質(zhì)體。基于這種想法及想解決問(wèn)題的決心，我...

單細(xì)胞測(cè)序并非**對(duì)一個(gè)細(xì)胞進(jìn)行測(cè)序，而是對(duì)單一細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行捕獲和檢測(cè)，可以理解為單細(xì)胞水平上的測(cè)序，能同時(shí)測(cè)序成千上萬(wàn)個(gè)細(xì)胞。單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的出現(xiàn)和應(yīng)用，能夠完全反映組織里不同細(xì)胞群體的異質(zhì)性信息，幫助獲得許多嶄新的科研見(jiàn)解，帶領(lǐng)生物學(xué)研究進(jìn)入了一個(gè)新次...

食管鱗狀細(xì)胞* (ESCC) 占全世界食管*病例的90%。雖然新輔助化療 (NACT-ESCC) 提高了ESCC患者的生存率，但患者的5年生存率仍然較低，約13.9%的ESCC患者在接受NACT聯(lián)合手術(shù)方案后出現(xiàn)復(fù)發(fā)和遠(yuǎn)端***轉(zhuǎn)移，表明ESCC復(fù)雜性。因此，...

單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)的背景噪聲大。單個(gè)細(xì)胞 RNA 含量很少，擴(kuò)增和捕獲效率的微小變化，就可能在細(xì)胞間產(chǎn)生與生物學(xué)無(wú)關(guān)的巨大差異。批次效應(yīng)處理是單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析中必須考慮的因素之一。在不同日期制備的相似樣本，可能會(huì)因?yàn)榧兇獾募夹g(shù)原因而不盡相同，矯正和過(guò)矯正也仍是數(shù)據(jù)處...

過(guò)去 5 年里，單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的快速發(fā)展極大地加速了生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的相關(guān)研究，讓科研人員以更廣的維度來(lái)研究生命的本質(zhì)。隨著 2013 年單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)被 Nature Methods 雜志評(píng)選為年度技術(shù)；2019 年單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)再次被 Nature Met...

在這個(gè)飛速發(fā)展的測(cè)序時(shí)代，DNA和RNA測(cè)序已經(jīng)逐漸成為“實(shí)驗(yàn)室中的家常菜”。若要評(píng)選出目前很受歡迎的一道菜，那恐怕非單細(xì)胞RNA測(cè)序莫屬。以往，研究人員通常利用RNA測(cè)序（RNA-seq）來(lái)檢測(cè)樣本中的所有RNA轉(zhuǎn)錄本，以發(fā)現(xiàn)新型RNA，或開(kāi)展基因表達(dá)分析。...

單細(xì)胞RNA-seq能夠**地提供每個(gè)細(xì)胞的RNA表達(dá)譜，并鑒定異質(zhì)細(xì)胞群中的稀有細(xì)胞。盡管**異質(zhì)性可歸因于累積突變，但即使是遺傳上相同的細(xì)胞在相同環(huán)境下也可能表現(xiàn)出基因和蛋白表達(dá)水平的差異，從而導(dǎo)致耐藥性的產(chǎn)生。單細(xì)胞RNA-seq就能夠發(fā)現(xiàn)這些稀有個(gè)體。...

歐易生物是國(guó)內(nèi)少數(shù)具備10×Genomics和BD RhapsodyTM單細(xì)胞測(cè)序雙平臺(tái)的機(jī)構(gòu)之一，在醫(yī)學(xué)和農(nóng)林方向提供專(zhuān)業(yè)的單細(xì)胞建庫(kù)測(cè)序及分析服務(wù)，包括5’端和3’端基因表達(dá)分析、免疫組庫(kù)分析（TCR/BCR）、ATAC分析和表面蛋白分析等。歐易生物單...

食管鱗狀細(xì)胞* (ESCC) 占全世界食管*病例的90%。雖然新輔助化療 (NACT-ESCC) 提高了ESCC患者的生存率，但患者的5年生存率仍然較低，約13.9%的ESCC患者在接受NACT聯(lián)合手術(shù)方案后出現(xiàn)復(fù)發(fā)和遠(yuǎn)端***轉(zhuǎn)移，表明ESCC復(fù)雜性。因此，...

2021年12月，南京農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)學(xué)院楊倩教授及生命科學(xué)學(xué)院林建副教授，于Cell＆Bioscience(IF:7.133) 在線發(fā)表了IBDV ***雞法氏囊的單細(xì)胞測(cè)序的***研究成果。研究工作內(nèi)容的主要承擔(dān)者為Abid Ullah Shah博士。歐易...

有機(jī)酸靶向代謝組學(xué)研究：中文標(biāo)題：通過(guò)代謝和轉(zhuǎn)錄組分析的綜合分析鑒定控制東方甜瓜果實(shí)發(fā)育過(guò)程中可溶性糖和有機(jī)酸代謝的關(guān)鍵基因網(wǎng)絡(luò)研究對(duì)象：甜瓜發(fā)表期刊：Front.PlantSci.影響因子：5.753發(fā)表時(shí)間：2022年5月12日合作單位:甘肅省農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬...

作者使用通過(guò)單細(xì)胞蛋白組學(xué)產(chǎn)生的數(shù)據(jù)來(lái)觀察在腎小球細(xì)胞或近端腎小管中***豐富的蛋白質(zhì)細(xì)胞。208個(gè)Glom富集區(qū)蛋白富含囊泡中間運(yùn)輸和細(xì)胞成分組織調(diào)節(jié)作為其**重要的生物學(xué)過(guò)程，細(xì)胞骨架蛋白結(jié)合和肌動(dòng)蛋白結(jié)合是**重要的分子功能，肌動(dòng)蛋白細(xì)胞骨架是**豐富的...

GC-MS非靶向代謝組，標(biāo)題：銀納米顆粒改變種植和未種植黃瓜土壤中的微生物群落組成和代謝物譜期刊：EnvironmentalScience&Technology影響因子：9.028發(fā)表時(shí)間：2020年2月合作單位：南京大學(xué)環(huán)境學(xué)院運(yùn)用生物技術(shù)：16SrRNA基...

4D蛋白組學(xué)：tims TOF Pro2依賴于雙捕集離子淌度（TIMS）和同步累積連續(xù)碎裂（PASEF）數(shù)據(jù)采集模式兩大創(chuàng)新技術(shù)，可實(shí)現(xiàn)快速采集、更高的靈敏度和特異性。同時(shí)，其配備了***一代雙 TIMS 分析器，離子容量可提高三倍，比較大限度地提高了離子傳輸...

蛋白質(zhì)組學(xué)、磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)研究案例：2021年12月30日復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院樊嘉院士、中國(guó)科學(xué)院上海藥物研究所周虎研究員、中國(guó)科學(xué)院分子細(xì)胞科學(xué)***創(chuàng)新中心高大明研究員、復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院**教授課題組合作在Cancer Cell上發(fā)表題為“Prote...

尿液代謝組學(xué)研究案例，空氣中PM和生物氣溶膠共同暴露的尿液代謝組學(xué)特征采用LC-MS+GC-MS雙平臺(tái)代謝組學(xué)方法對(duì)尿液樣品進(jìn)行分析，其中GC-MS檢測(cè)102種代謝物，LC-MS檢測(cè)到1271種。作者通過(guò)使用亞組來(lái)分析差異代謝物是否具有性別或季節(jié)性，結(jié)果表明性...

非靶向代謝組學(xué)研究：對(duì)于代謝物分析，作者對(duì)非靶代謝組學(xué)測(cè)定，共檢測(cè)到4,346種代謝物。根據(jù)所有檢測(cè)到的代謝物的投影中變量重要性（VIP）>1和p<0.05的篩選標(biāo)準(zhǔn)，在不同的比較組***研究了961種差異累積代謝物（DAM）（表1）。在A果實(shí)(AF)與B果實(shí)...

蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)研究案例：作為一種常見(jiàn)的******，脫氧雪腐鐮刀菌烯醇(DON)在田間或加工和儲(chǔ)存過(guò)程中會(huì)污染谷物和飼料。DON在動(dòng)物中會(huì)引起厭食和生長(zhǎng)遲緩在內(nèi)的一系列不良反應(yīng)。本文作者使用轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)對(duì)鼠C2C12細(xì)胞進(jìn)行了研究，分析DON對(duì)成肌...

LC-MS靶向代謝組學(xué)研究本篇文章通過(guò)LC-MS靶向代謝組學(xué)和16S rRNA基因序列分析，探究谷物在加工傳統(tǒng)飲料ogi過(guò)程中******的減少和細(xì)菌群落的動(dòng)態(tài)變化。同時(shí)，從糧食安全方面考慮，谷物的污染水平低、較安全，又優(yōu)于玉米，可以代替受******污染的玉...

**靶向代謝組學(xué)研究，中文標(biāo)題：代謝組學(xué)分析揭示了COVID-19新的發(fā)展特征研究對(duì)象：****患者發(fā)表期刊：EuropeanRespiratoryJournal影響因子：16.671發(fā)表時(shí)間：2021.7.21運(yùn)用生物技術(shù)：LC-MS非靶代謝組學(xué)+靶向代謝組...

代謝組學(xué)+轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究：2022年2月，中國(guó)海洋大學(xué)食品科學(xué)與工程學(xué)院劉尊英教授課題組在《Foods》期刊發(fā)表的題為“Dissecting of the AI-2/LuxS Mediated Growth Characteristics and Bacteri...