使用TMT標記定量蛋白質(zhì)組學分析,與GFP-群體相比,在GFP+細胞中TM處理后,線粒體復合物IV的多個亞基被特異性下調(diào),對下調(diào)的蛋白質(zhì)進行基因本體 (GO)分析,顯示參與線粒體電子傳遞鏈 (ETC) 的通路富集。同時作者還分析了從人 LM2 細胞系中分選的 LM2 GFP+和 GFP- 細胞,在 TM 處理 48 小時后蛋白組學分析,揭示了GFP+細胞優(yōu)先富集,同時揭示了線粒體 ETC 相關的通路。因此,TM 處理特別影響具有更高細胞內(nèi)銅水平的 SOX2/OCT4+ 細胞中的線粒體 ETC 通路。蛋白質(zhì)組學分析確定了富含線粒體功能的途徑。細胞色素c氧化酶 (Complex IV) 是一種線粒體金屬酶,是線粒體ETC的終末酶。蛋白組學翻譯后修飾篩選,檢測,鑒定,定性,定量。江西蛋白組學非標記定量
作者通過泛素化蛋白組學分析鑒定了茶樹作根中的泛素化蛋白質(zhì)。中文標題:氮調(diào)節(jié)茶樹根中茶氨酸和黃酮類化合物的生物合成:多組學分析揭示的蛋白質(zhì)水平調(diào)節(jié)研究對象:茶樹根發(fā)表期刊:JournalofAgriculturalandFoodChemistry影響因子:5.279發(fā)表時間:2021年9月1日發(fā)表單位:安徽農(nóng)業(yè)大學運用生物技術:TMT蛋白質(zhì)組學、泛素化蛋白質(zhì)組學(其中部分數(shù)據(jù)分析由鹿明生物提供技術支持)。本文分析了氮缺乏下茶樹根部的茶氨酸和黃酮類代謝,通過蛋白質(zhì)組和泛素化蛋白質(zhì)組結合轉錄組數(shù)據(jù)探索了調(diào)節(jié)機制。本文的多組學數(shù)據(jù)整合分析思路值得借鑒。山東蛋白組學 數(shù)據(jù)分析靶向蛋白質(zhì)組學,信號通路蛋白靶點高通量分析。
iTRAQ標記定量蛋白組學研究方法:2021年4月,南京林業(yè)大學喻方圓教授(一作:吳岐奎)課題組在JournaloftheScienceofFoodandAgriculture期刊發(fā)表了題為“ProteomicanalysisofmetabolicmechanismsassociatedwithfattyacidbiosynthesisduringStyraxtonkinensiskerneldevelopment”的研究成果,通過轉錄組學+iTRAQ標記定量蛋白組學研究方法,分析東京野茉莉種子發(fā)育過程中脂肪酸生物合成相關基因的表達趨勢,確定油脂積累的主要影響因子并構建其調(diào)控網(wǎng)絡。為野茉莉屬植物種子油用研究和后續(xù)功能分析研究提供了一定的研究基礎。
定量蛋白質(zhì)組學研究:2022年2月,上海市農(nóng)業(yè)科學院食用菌研究所鮑大鵬研究員課題組在《FrontiersinMicrobiology》期刊發(fā)表的題為“OxidativeStressandAutophagyAreImportantProcessesinPostRipenessandBrownFilmFormationinMyceliumofLentinulaedodes”的研究成果,通過iTRAQ標記定量蛋白組學、GC-MS非靶向代謝組學等技術對香菇菌絲進行定量蛋白質(zhì)組學和代謝組學分析,發(fā)現(xiàn)氧化應激和自噬是香菇菌絲后熟轉色重要過程,并對其在蛋白質(zhì)組和代謝組水平上的分子機制有了新的認識。涉及的歐易/鹿明生物服務產(chǎn)品:iTRAQ標記定量蛋白組學、GC-MS非靶向代謝組學修飾蛋白質(zhì)組試-蛋白質(zhì)組學 解決方案。
4D蛋白質(zhì)組學:2022年3月,牛津大學Julian C. Knight教授課題組在cell發(fā)表的題為“A blood atlas of COVID-19 defines hallmarks of disease severity and specificity”的研究成果,通過4D蛋白質(zhì)組學、轉錄組技術、流式技術、單細胞測序技術等研究方法,為不同COVID-19嚴重程度的患者提供了一個綜合的多組圖譜,并將其與流感和敗血癥患者與健康志愿者進行了綜合比較,將支持未來的COVID-19藥物開發(fā)、臨床試驗設計和個性化藥物方法。中文標題:COVID-19的血液圖譜定義了疾病嚴重程度和特異性的特征研究對象:血液發(fā)表期刊:Cell影響因子:41.582發(fā)表時間:2022.3運用生物技術:4D蛋白組學技術蛋白組學近期研究進展的盤點。福建植物蛋白組學研究
蛋白質(zhì)組學的特點蛋白質(zhì)組和蛋白質(zhì)組學的概念。江西蛋白組學非標記定量
蛋白組學研究實用案例:東南大學醫(yī)學院院長劉必成教授領導的腎臟病研究所在Science advances期刊發(fā)表了題為“Extracellular vesicle–encapsulated IL-10 as novel nanotherapeutics against ischemic AKI"的研究成果,通過蛋白組學+多層組學研究方法,建立IL-10細胞囊泡高表達模型的構建,提出并驗證了IL-10細胞外囊泡的靶向缺血性腎損傷的假說,探究了IL-10細胞外囊泡作為新型納米藥物的機理。中文標題:細胞外囊泡包裹的IL-10作為抗缺血性急性腎損傷的新型納米療法研究方向:新藥研發(fā)及其機制研究發(fā)表期刊:Scienceadvances影響因子:14.136發(fā)表單位:中國南京東南大學附屬中大醫(yī)院腎內(nèi)科運用生物技術:LC-MS/MS蛋白組學(由鹿明生物提供技術支持)江西蛋白組學非標記定量
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