江西蛋白組學(xué)

蛋白質(zhì)組學(xué)、磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)研究案例：2021年12月30日復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院樊嘉院士、中國(guó)科學(xué)院上海藥物研究所周虎研究員、中國(guó)科學(xué)院分子細(xì)胞科學(xué)***創(chuàng)新中心高大明研究員、復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院**教授課題組合作在Cancer Cell上發(fā)表題為“Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究論文，通過基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)、微生物組學(xué)研究方法對(duì)262例肝內(nèi)膽管*（iCCA）患者的配對(duì)**和*旁組織進(jìn)行了分析，通過繪制肝內(nèi)膽管*的多維分子圖譜為進(jìn)一步鑒定iCCA的分子發(fā)病機(jī)制、分子分型、預(yù)后等提供了寶貴的資源。研究機(jī)構(gòu),提供蛋白組學(xué)聯(lián)合分析,技術(shù)咨詢服務(wù)。江西蛋白組學(xué)

采用TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)對(duì)三個(gè)脫水特殊階段（21、27和40DAP）的新鮮蓮種胎進(jìn)行了蛋白質(zhì)組學(xué)分析，共鑒定了5,477個(gè)蛋白質(zhì)。對(duì)測(cè)試樣本進(jìn)行了PCA分析，結(jié)果顯示，不同組間樣品具有很好的區(qū)分，每組的三個(gè)重復(fù)樣本被聚集在一起。PCA的前兩個(gè)成分占總方差的70％以上（圖2A）。三個(gè)試驗(yàn)組之間共有815個(gè)差異表達(dá)蛋白。其中，198個(gè)（32%）和198個(gè)（26%）蛋白質(zhì)豐度增加，而420個(gè)（68%）和558個(gè)（74%）蛋白質(zhì)豐度在27DAP和40DAP組分別下降（圖2B）。只有30個(gè)蛋白質(zhì)的豐度在27DAP和40DAP組之間具有***變化（圖2C）。江西蛋白組學(xué)服務(wù)蛋白組學(xué)檢測(cè)一個(gè)樣多少錢。

蛋白質(zhì)是生命活動(dòng)的主要執(zhí)行者，而蛋白質(zhì)磷酸化修飾是生物體內(nèi)**重要的共價(jià)修飾方式之一，真核生物體內(nèi)有超過三分之一的蛋白可以發(fā)生磷酸化修飾。蛋白質(zhì)的磷酸化和去磷酸化這一可逆過程調(diào)節(jié)著包括細(xì)胞增殖、發(fā)育、分化、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞凋亡、神經(jīng)活動(dòng)、肌肉收縮及**發(fā)生等過程在內(nèi)的所有生命活動(dòng)。單一的磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)只能解釋蛋白磷酸化水平發(fā)生的變化，而[黃金搭檔]——蛋白質(zhì)組與磷酸化蛋白質(zhì)組聯(lián)合分析，則在揭示疾病相關(guān)特性、篩選疾病生物標(biāo)志物、尋找藥物靶點(diǎn)等方面發(fā)揮了更加重要的作用。

通過蛋白質(zhì)組學(xué)分析檢測(cè)了經(jīng)M-Exos處理的HBMECs的改變。外泌體***了HBMECs，在0、24和48小時(shí)各種基因的表達(dá)增加(圖2A)。此外，熱圖分析揭示了不同表達(dá)的功能基因，包括與炎癥、細(xì)胞增殖、免疫調(diào)節(jié)和血管生成相關(guān)的因素(圖2B-E)。時(shí)序分析表明，HBMECs中標(biāo)記基因的上調(diào)與炎癥因子IL3RA有關(guān)，增殖相關(guān)蛋白CD40和免疫調(diào)節(jié)因子TNFRSF10C(圖2F-H)。作者主要研究外泌體是否促進(jìn)人腦微血管內(nèi)皮細(xì)胞的血管生成能力，因此初步驗(yàn)證了M-Exos***后血管生成相關(guān)基因的表達(dá)。蛋白質(zhì)印跡結(jié)果顯示血管生成相關(guān)基因FlK1和ANGPT1的表達(dá)明顯增強(qiáng)(圖2I)。綜上所述，結(jié)果證實(shí)了M-Exos誘導(dǎo)了人腦微血管內(nèi)皮細(xì)胞的功能改變。靶向蛋白質(zhì)組學(xué)，信號(hào)通路蛋白靶點(diǎn)高通量分析。

本文為了探究其潛在的分子機(jī)制，作者運(yùn)用RNA測(cè)序（RNA-seq）和iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)，對(duì)不同成熟度水平的油脂種子進(jìn)行了研究。不僅揭示了關(guān)鍵候選基因和蛋白質(zhì)的時(shí)間特異性表達(dá)，而且為該樹種的遺傳改良提供了科學(xué)依據(jù)。中文標(biāo)題：基于iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)聯(lián)合分析揭示油茶種子成熟過程中油質(zhì)相關(guān)的關(guān)鍵代謝產(chǎn)物的積累研究對(duì)象：油茶種子發(fā)表期刊：HorticultureResearch影響因子：6.793發(fā)表時(shí)間：2021.07.01發(fā)表單位：海南大學(xué)園藝園林學(xué)院運(yùn)用生物技術(shù)：RNA測(cè)序(RNA-seq)和iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白組學(xué)文章中iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持走近蛋白組學(xué)之蛋白組學(xué)常見問題答疑解惑。遼寧蛋白組學(xué) 價(jià)格 大概多少錢

蛋白組學(xué)常見研究模式 | 蛋白質(zhì)組專題_鹿明生物。江西蛋白組學(xué)

采用RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析和DIA蛋白質(zhì)組學(xué)分析，研究了AC和AL對(duì)db/db小鼠的影響。轉(zhuǎn)錄組分析共鑒定出16812種不同的蛋白質(zhì)編碼轉(zhuǎn)錄本。其中，2837個(gè)（約16.9%）在正常組和對(duì)照組之間有***差異，表明db/db小鼠在轉(zhuǎn)錄水平上與野生型小鼠***不同。與對(duì)照組相比，共有3749個(gè)基因因攝入AC而發(fā)生***改變（2201個(gè)下調(diào)，1548個(gè)上調(diào)），560個(gè)基因（430個(gè)下調(diào)，130個(gè)上調(diào)）因攝入AL而發(fā)生***改變（圖3B）。DIA蛋白質(zhì)組學(xué)分析鑒定出2729種蛋白質(zhì)。正常組和對(duì)照組之間共發(fā)現(xiàn)1059個(gè)（約占總鑒定蛋白質(zhì)的38.8%）DEPs，AC處理有230個(gè)蛋白質(zhì)發(fā)生***變化（109個(gè)上調(diào)，121個(gè)下調(diào)），AL處理有211個(gè)蛋白質(zhì)發(fā)生***變化（116個(gè)上調(diào)，95個(gè)下調(diào)）。江西蛋白組學(xué)

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